Поиск новых молекулярно-генетических маркеров наследственного рака

Поиск новых молекулярно-генетических маркеров наследственного рака
молочной железы с помощью массового параллельного секвенирования (NGS).
Е.И. Новикова, Г.П. Снигирева
ФГБУ «РНЦ Рентгенорадиологии» Министерства здравоохранения РФ, Москва
E-mail: e.novikova.rncrr@mail.ru, тел.: 8(495)334-92-88
Введение.
Только 20-30% случаев семейного рака молочной железы (РМЖ) обусловлены наличием
известных мутаций в "горячих" точках генов предрасположенности BRCA1/2. Поэтому на
сегодняшний день одной из актуальных задач является поиск и идентификация других
молекулярно-генетических маркеров для оценки риска возникновения онкологической
патологии с целью предупреждения и ранней диагностики заболевания, а также выбора
адекватной тактики лечения.
Цель работы.
Молекулярно-генетическое исследование спектра и частоты наследственных мутаций в
генах, ассоциированных с повышенным риском развития рака молочной железы, в группе
пациентов с клиническими признаками наследственного заболевания.
Материалы и методы.
82 пациента с диагнозом рак молочной железы и клиническими признаками
наследственного заболевания в возрасте от 30 до 50 лет были предварительно отобраны по
признаку отсутствия мутаций в "горячих" точках генов предрасположенности BRCA1/2,
CHEK2 (BRCA1: 185delAG, 5382insC, 4153delA, 3819delGTAAA , 3875delGTCT, 300T>G,
2080delA; BRCA2: 6174delT; CHEK2: 1100delC).
Исследование включало следующие этапы: выделение ДНК из периферической крови,
подготовка проб с помощью панели TruSight Cancer ("Illumina"), секвенирование
полученных библиотек на приборе MiSeq ("Illumina"), анализ полученных данных и их
интерпретация с помощью программного обеспечения VariantStudio v2.1 ("Illumina").
Результаты работы и обсуждение.
В результате молекулярно-генетического исследования было получено
порядка 300
генетических вариантов для каждого пациента в 94 генах, ассоциированных с
повышенным
риском
возникновения
онкологической
патологии.
При
анализе
генетических вариантов в генах предрасположенности к РМЖ (BRCA1, BRCA2, RAD51,
TP53, STK11, NBN, PTEN, CHEK2, PALB2, BRIP1, ATM, MLH1, MSH2, MSH6) у 20%
обследуемых пациентов были выявлены патогенные мутации в генах: BRCA1, BRCA2,
CHEK2, NBN, у 28% - потенциально клинически значимые варианты в генах
предрасположенности.
Выводы.
Молекулярно-генетическое исследование с помощью секвенирования "нового поколения"
(NGS) дополнительно выявило у 48% пациентов из обследуемой группы клинически
значимые и потенциально клинически значимые мутации в генах, ассоциированных с
повышенным риском возникновения РМЖ. Полученные данные позволяют более
корректно подходить к выбору тактики лечения, а также служат основанием для
проведения генетического тестирования среди здоровых родственников пациентов с
семейным РМЖ.