Соглашение 14.604.21.0117

14.604.21.0117
<Номер постера>
Федеральная целевая программа
«Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического
комплекса России на 2014—2020 годы»
Науки о жизни
Тема: Разработка тест-систем для идентификации структурных перестроек генома опухолевых клеток и молекулярногенетических характеристик пациента, определяющих выбор терапии и прогноз при острых лейкозах у детей
Соглашение 14.604.21.0117
на период 2014 - 2015 гг.
Руководитель проекта: ведущий научный сотрудник
Наседкина Татьяна Васильевна
Получатель субсидии: Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт молекулярной биологии им В.А.
Энгельгардта Российской академии наук
Цели и задачи проекта
Основной целью проекта является повышение эффективности диагностики и лечения острых лейкозов у детей в результате разработки и внедрения
высокотехнологичных методов молекулярно-генетического анализа.
Задачи проекта включают разработку методов идентификации молекулярно-генетических маркеров, определяющих выбор персонифицированной
терапии при острых лейкозах у детей, и создание тест-систем для определения генетических нарушений в опухолевых клетках и молекулярногенетических характеристик пациента при острых лейкозах у детей с целью индивидуализации терапии.
Ожидаемые результаты проекта
•Методики идентификации химерных генов в опухолевых клетках и полиморфных маркеров в генах метаболизма лекарственных препаратов и генах
иммунного ответа. Макеты тест-систем для индивидуализации терапии острых лейкозов у детей: 1) на основе идентификации химерных генов в
опухолевых клетках; 2) на основе идентификации полиморфных маркеров в генах метаболизма лекарственных препаратов и генах иммунного ответа
(фармако- и иммуногенетический профили пациента). Техническая документация на макеты тест-систем.
•По сравнению с аналогичными разработками мирового уровня: 1)оптимизированные панели информативных генетических маркеров, 2) высокая
мультиплексность по сравнению с другими рутинными диагностическими тестами, 3) простота и надежность выполнения анализа, 4) экономичность
Перспективы практического использования
•Разрабатываемые тест-системы могут быть использованы в диагностических лабораториях медицинских центров таких, как ФНКЦ ДГОИ им. Дмитрия
Рогачева, РОНЦ им. Н.Н.Блохина, РДКБ, в региональных медицинских учреждения онко- и гематологического профиля, для проведения научных
исследований в области онкологии и онкогематологии. Дальнейшая коммерциализация возможна на базе ООО «БИОЧИП-ИМБ», которое является
индустриальным партером проекта.
•Результаты исследований могут быть использованы в оптимизации диагностических и лечебных мероприятий. Социально-экономический эффект
определяется повышением эффективности диагностики и лечения острых лейкозов у детей.
Результаты исследовательской работы, полученные в 2015 г.
Исследован транскриптом опухолевых клеток при лейкозах с использованием высокопроизводительного секвенирования, выявлены редкие химерные
транскрипты (MLL-SEPT6, OAZ1-PTMA, ETV6-MECOM), которые могут быть включены в диагностическую панель (рис. 1). Разработана эскизная
конструкторская документация (ЭКД) на макет тест-системы для идентификации химерных генов в опухолевых клетках (рис. 2). Сформирована
коллекция контрольных образцов РНК с различными уровнями экспрессии химерных транскриптов (25 образцов) для определения аналитической
чувствительности тест-системы. Выбраны информативные маркеры в генах метаболизма лекарственных препаратов и в генах иммунного ответа,
определяющих чувствительность к терапии и риск развития тяжелых осложнений (рис. 3). Сформирована коллекция клинических образцов крови
пациентов с разным ответом на лечение (50 образцов). По результатам таргетного секвенирования образцов пациентов с осложнениями в ходе
лечения выявлены предиктивные маркеры в генах PTPN22, CARD9, NLRP3, TLR1, NOD2 и др. Разработана ЭКД на макет тест-системы для выявления
молекулярно-генетических характеристик пациента, влияющих на чувствительность к терапии и развитие тяжелых осложнений
•Полученные результаты соответствуют мировому уровню исследований и разработок в области онкогематологии.
Партнеры проекта
• Индустриальный партнер ООО БИОЧИП-ИМБ за счет собственных средств выполняет работы по экспериментальной проверке и оптимизации работы
макетов тест-систем.
Внебюджетное финансирование по проекту - 0,5 млн.руб.
• Соисполнитель - Федеральное государственное бюджетное учреждение «Федеральный научно-клинический центр детской гематологии, онкологии и
иммунологии имени Дмитрия Рогачева» Министерства здравоохранения Российской Федерации (ФГБУ «ФНКЦ ДГОИ им. Дмитрия Рогачева»).
Формирование и характеристика коллекций клинических образцов за счет средств субсидии - 4,3 млн. руб. и за счет собственных средств – 4,3 млн.руб.
14.604.21.0117
<Номер постера>