спиновые эффекты в ферментативных реакциях окисления

advertisement
Êîáçåâ Ã.È.
Îðåíáóðãñêèé ãîñóäàðñòâåííûé óíèâåðñèòåò
ÑÏÈÍÎÂÛÅ ÝÔÔÅÊÒÛ Â ÔÅÐÌÅÍÒÀÒÈÂÍÛÕ ÐÅÀÊÖÈßÕ ÎÊÈÑËÅÍÈß
ÑÓÁÑÒÐÀÒÎÂ ÊÈÑËÎÐÎÄÎÌ
Íà îñíîâå íåýìïèðè÷åñêèõ è ïîëóýìïèðè÷åñêèõ ðàñ÷åòîâ îáñóæäàþòñÿ èçìåíåíèÿ ýëåêòðîííûõ è
ñïèíîâûõ õàðàêòåðèñòèê â ìîäåëüíûõ êîìïëåêñàõ êèñëîðîä - ñóáñòðàò, êèñëîðîä – ôëàâèíîâûé êîôåðìåíò. Ïîêàçàíî, ÷òî ïðè ñáëèæåíèè êèñëîðîäà ñ ïàðòíåðîì âîçíèêàþò ñòàöèîíàðíûå òî÷êè, â êîòîðûõ
óâåëè÷åíà âåðîÿòíîñòü îáðàçîâàíèÿ ñèíãëåòíîãî êèñëîðîäà. Ïðè ýòîì ïðîèñõîäèò èçìåíåíèå ãåîìåòðè÷åñêèõ ïàðàìåòðîâ ñèñòåì è ìèãðàöèÿ ëîêàëüíûõ ñïèíîâûõ ïëîòíîñòåé ìåæäó àòîìàìè â ìîëåêóëàõ,
÷òî ìîæåò îáåñïå÷èâàòü ñïåöèôè÷íîñòü ðåàêöèè è ÷àñòè÷íóþ àêòèâàöèþ ìîëåêóëÿðíîãî êèñëîðîäà.
Èçó÷åíèå ôåðìåíòàòèâíîé ðåàêöèè ïðåäïîëàãàåò âûÿñíåíèå îòäåëüíûõ ñòàäèé ðåàêöèè,
èäåíòèôèêàöèþ àìèíîêèñëîò, ó÷àñòâóþùèõ â
ñâÿçûâàíèè ñóáñòðàòà è â ðåàêöèÿõ îáðàçîâàíèÿ èëè ðàçðûâà ñâÿçåé, îïðåäåëåíèå îòíîñèòåëüíîãî ïðîñòðàíñòâåííîãî ðàñïîëîæåíèÿ
ýòèõ àìèíîêèñëîò, ðàçðàáîòêó ãèïîòåòè÷åñêîãî ìåõàíèçìà ðåàêöèè, ïîçâîëÿþùåãî îáúÿñíèòü ïîðÿäîê ñêîðîñòè ðåàêöèè [1].
Èçó÷åíèå ìåõàíèçìà ðåàêöèè òðåáóåò âûÿñíåíèÿ ñòðóêòóðû ïåðåõîäíîãî ñîñòîÿíèÿ, ïðèðîäû ïðîìåæóòî÷íûõ ïðîäóêòîâ è ïîñòðîåíèÿ ñå÷åíèÿ ÏÏÝ. Âàæíî îòìåòèòü, ÷òî ñòðóêòóðà ïåðåõîäíîãî ñîñòîÿíèÿ ôåðìåíòàòèâíîé ðåàêöèè çàâèñèò íå òîëüêî îò ãåîìåòðèè ìîëåêóëû ñóáñòðàòà, íî è – òðåõìåðíîé êîíôîðìàöèè ôåðìåíòà, ïîñêîëüêó íåñêîëüêî ôóíêöèîíàëüíûõ ãðóïï, ðàñïîëîæåííûõ â ðàçíûõ ÷àñòÿõ ôåðìåíòà, ìîãóò
îïðåäåëÿòü ñïåöèôè÷íîñòü è âûñîêóþ ýôôåêòèâíîñòü êàòàëèòè÷åñêîãî ïðîöåññà [2]. Áîëüøèå ðàçìåðû ôåðìåíòîâ è ñëîæíîñòü êàòàëèòè÷åñêèõ
ïðîöåññîâ íå ïîçâîëÿþò â íàñòîÿùåå âðåìÿ ïîëíîñòüþ ðåøèòü ïåðå÷èñëåííûå çàäà÷è è çà÷àñòóþ
– ïîñòðîèòü ñòðóêòóðó ïåðåõîäíîãî ñîñòîÿíèÿ.
Ìîëåêóëû ñóáñòðàòà, ó÷àñòâóþùèå â áîëüøèíñòâå ôåðìåíòàòèâíûõ ðåàêöèé, èìåþò ìàëûå
ðàçìåðû ïî ñðàâíåíèþ ñ ìîëåêóëàìè ôåðìåíòà.
Ñ÷èòàþò, ÷òî ïðè îáðàçîâàíèè ôåðìåíò-ñóáñòðàòíîãî êîìïëåêñà ìîæíî âûäåëèòü àêòèâíûé öåíòð
ôåðìåíòà, âêëþ÷àþùèé â ñåáÿ íåêîòîðûå áîêîâûå öåïè è ïåïòèäíûå ñâÿçè, íàõîäÿùèåñÿ â íåïîñðåäñòâåííîì êîíòàêòå ñ ìîëåêóëîé ñóáñòðàòà
(âîçìîæíî, ïðè ïîñðåäñòâå ìîëåêóë âîäû), à òàêæå áîêîâûå öåïè è ïåïòèäíûå ñâÿçè, íå èìåþùèå
ïðÿìîãî êîíòàêòà ñ ñóáñòðàòîì, íî òåì íå ìåíåå
ïðèíèìàþùèå íåïîñðåäñòâåííîå ó÷àñòèå â êàòàëèòè÷åñêîì àêòå. Îñòàëüíàÿ ÷àñòü ïîëèïåïòèäíîé
öåïè îáåñïå÷èâàåò æåñòêîå âçàèìíîå ðàñïîëîæåíèå îòäåëüíûõ êîìïîíåíòîâ àêòèâíîãî öåíòðà â
ïðîñòðàíñòâå, êîòîðîå íåîáõîäèìî äëÿ îñóùåñòâëåíèÿ ñïåöèôè÷åñêîé êàòàëèòè÷åñêîé ðåàêöèè [3].
Èçìåíåíèÿ ñòðóêòóðíîé îñíîâû, íàïðèìåð êîí-
ôîðìàöèîííûå èçìåíåíèÿ áåëêîâîé ÷àñòè ôåðìåíòà ïîä âëèÿíèåì äåíàòóðèðóþùèõ ôàêòîðîâ
(òåïëî, ìî÷åâèíà, îðãàíè÷åñêèå ðàñòâîðèòåëè),
î÷åíü ÷àñòî ïðèâîäÿò ê ðåçêîìó èçìåíåíèþ êàòàëèòè÷åñêîé àêòèâíîñòè. Äîïóñêàåòñÿ òàêæå, ÷òî
êàêàÿ-òî ÷àñòü ìîëåêóëû ôåðìåíòà íå ïðèíèìàåò
ó÷àñòèÿ â êàòàëèòè÷åñêîì ïðîöåññå.
Ìíîãî÷èñëåííûå èññëåäîâàíèÿ â äàííîé îáëàñòè ïîçâîëÿþò ïîëàãàòü, ÷òî ñïåöèôè÷íîñòü
ôåðìåíòà è åãî ñïîñîáíîñòü êàòàëèçèðîâàòü ðåàêöèè ðàçðûâà è îáðàçîâàíèÿ ñâÿçåé çàâèñèò îò
ðàçíûõ, íî ãðóïïèðóþùèõñÿ îêîëî ñóáñòðàòà
àìèíîêèñëîòíûõ îñòàòêîâ. Îäíàêî äàæå âûÿâëåíèå àìèíîêèñëîò, ïðèíèìàþùèõ ó÷àñòèå â êàòàëèòè÷åñêîì ïðîöåññå, íå ìîæåò îáúÿñíèòü, ïî÷åìó â íåêîòîðûõ ñëó÷àÿõ ôåðìåíòàòèâíûå ðåàêöèè
ïðèâîäÿò ê èíàêòèâàöèè ôåðìåíòà – áëîêèðóþòñÿ ëè ðåàêöèîííûå öåíòðû ãðóïï àêòèâíîãî öåíòðà èëè êîíôîðìàöèÿ ãðóïïû àìèíîêèñëîòíîãî
îñòàòêà ïîëèïåïòèäíîé öåïè â êàêîì-òî äðóãîì
ìåñòå êàðêàñà áåëêîâîé ìîëåêóëû ïðèâîäèò ê
ïîòåðå êàòàëèòè÷åñêèõ ñâîéñòâ ôåðìåíòà.
Íè äëÿ îäíîãî èç ôåðìåíòîâ íå óäàëîñü ïîêà
âûÿñíèòü ïðîñòðàíñòâåííîãî ðàñïîëîæåíèÿ
àìèíîêèñëîò, âõîäÿùèõ â àêòèâíûé öåíòð. Íåèçâåñòíî äàæå, ñïåöèôè÷íà ëè òðåõìåðíàÿ êîíôîðìàöèÿ àìèíîêèñëîò àêòèâíîãî öåíòðà â îòñóòñòâèå ñóáñòðàòà è ñîîòâåòñòâóåò ëè äàííàÿ
êîíôîðìàöèÿ êàòàëèòè÷åñêîé àêòèâíîñòè [3].
Ãèïîòåçà «êëþ÷à è çàìêà» Ôèøåðà íå íàõîäèòñÿ â ïðîòèâîâåñå ñ «òåîðèåé èíäóöèðîâàííîãî ñîîòâåòñòâèÿ» Êîøëàíäà [3], ñîãëàñíî ïîñòóëàòàì êîòîðîé:
à) ïðèñîåäèíåíèå ñóáñòðàòà ê àêòèâíîìó
öåíòðó âûçûâàåò çíà÷èòåëüíûå èçìåíåíèÿ â ãåîìåòðèè áåëêà;
á) äëÿ äåéñòâèÿ ôåðìåíòà íåîáõîäèìà òî÷íàÿ îðèåíòàöèÿ êàòàëèòè÷åñêèõ ãðóïï;
â) ñóáñòðàò èíäóöèðóåò ýòó òðåáóåìóþ îðèåíòàöèþ, èçìåíÿÿ ãåîìåòðèþ áåëêà.
Åäèíñòâî îáåèõ òåîðèé îáåñïå÷èâàåòñÿ òåì,
÷òî ïðè ñâÿçûâàíèè ñóáñòðàòà ìåæìîëåêóëÿðÂÅÑÒÍÈÊ ÎÃÓ 9`2005
141
Åñòåñòâåííûå íàóêè
íûå îáìåííûå âçàèìîäåéñòâèÿ âûçûâàþò íóæíóþ ïåðåîðèåíòàöèþ ôðàãìåíòîâ áåëêîâîé ÷àñòè, îáåñïå÷èâàÿ æåñòêóþ êîíôîðìàöèþ, îáëàäàþùóþ êàòàëèòè÷åñêîé àêòèâíîñòüþ, èçìåíåíèå êîòîðîé ìîæåò ïðèâåñòè ê ïîòåðå êàòàëèòè÷åñêèõ ñâîéñòâ ôåðìåíòà.
Íåáîëüøóþ íåáåëêîâóþ ïðîñòåòè÷åñêóþ
ãðóïïó, áîëåå èëè ìåíåå ïðî÷íî ñâÿçàííóþ ñ
áåëêîâîé ÷àñòüþ äâóõ èëè áîëåå ôåðìåíòîâ,
íåîáõîäèìóþ äëÿ áîëåå ýôôåêòèâíîãî êàòàëèòè÷åñêîãî äåéñòâèÿ è áëàãîäàðÿ êîòîðîé ìîæåò
ïðîèñõîäèòü ïåðåíîñ ãðóïï, îáû÷íî íàçûâàþò
êîôåðìåíòîì.  ôåðìåíòàòèâíûõ ðåàêöèÿõ ðàçëè÷èÿ ìåæäó ñóáñòðàòîì è êîôåðìåíòîì íå âñåãäà ÿñíû, ïîñêîëüêó êîôåðìåíò â ïðîöåññå ñâÿçûâàíèÿ ìîæåò ïðåòåðïåâàòü ñòðóêòóðíûå èçìåíåíèÿ, êàê è ñóáñòðàò, íî â õîäå äàëüíåéøèõ
ðåàêöèé âîññòàíàâëèâàåò ñâîþ ñòðóêòóðó. Êðîìå òîãî, âî ìíîãèõ êîôåðìåíò-çàâèñèìûõ ðåàêöèÿõ ñóáñòðàò-ôåðìåíòàòèâíîìó âçàèìîäåéñòâèþ îáÿçàòåëüíî ïðåäøåñòâóåò ñâÿçûâàíèå
êîôåðìåíòà ñ ôåðìåíòîì [3]. Áîëüøèíñòâî êîôåðìåíòîâ èãðàþò ðîëü ïðîìåæóòî÷íûõ ïåðåíîñ÷èêîâ â ðåàêöèÿõ ïåðåíîñà ãðóïï. Èç ïèðèäèíîâûõ íóêëåîòèäîâ, âûïîëíÿþùèõ ðîëü êîôåðìåíòîâ, ìîæíî îòìåòèòü òàêèå, êàê íèêîòèíàìèäàäåíèíäèíóêëåîòèä (ÍÀÄ) (ñòàðîå íàçâàíèå ÊîI), íèêîòèíàìèäàäåíèíäèíóêëåîòèäôîñôàò (ÍÀÄÔ) (ñòàðîå íàçâàíèå ÊîII).
ÍÀÄ è ÍÀÄÔ â êà÷åñòâå êîôåðìåíòîâ ó÷àñòâóþò âî ìíîãèõ îêèñëèòåëüíî-âîññòàíîâèòåëüíûõ ðåàêöèÿõ, êàòàëèçèðóåìûõ äåãèäðîãåíàçàìè. Âîññòàíîâëåíèå ÍÀÄ+ â ÍÀÄ•Í ñîïðîâîæäàåòñÿ çàìåòíûì èçìåíåíèåì ñïåêòðàëüíûõ
õàðàêòåðèñòèê êîôåðìåíòà (ïîãëîùåíèå 260 íì
çíà÷èòåëüíî óìåíüøàåòñÿ, ïîÿâëÿåòñÿ íîâûé
ìàêñèìóì ïðè 320 íì, õàðàêòåðíûé äëÿ äèãèäðîíèêîòèíàìèäà).  ðåàêöèÿõ îêèñëåíèÿ – âîññòàíîâëåíèÿ ïðèíèìàåò ó÷àñòèå íèêîòèíàìèäíûé ôðàãìåíò ýòèõ êîôåðìåíòîâ. Óñòàíîâëåíî,
÷òî âîññòàíîâëåíèå ïðîèñõîäèò â îïðåäåëåííîå
ïîëîæåíèå [4]. Ýêñïåðèìåíòû ïî âîññòàíîâëåíèþ ÍÀÄ â ïðèñóòñòâèè ôåðìåíòîâ ÀÄÃ (àëêîãîëüäåãèäðîãåíàçà) è ËÄÃ (ëàêòàòäåãèäðîãåíàçà) ïîêàçàëè, ÷òî ìåæäó ñóáñòðàòîì è êîôåðìåíòîì ïðîèñõîäèò ïðÿìîé ïåðåíîñ âîäîðîäà,
ïðè ýòîì çàòðàãèâàåòñÿ îäèí è òîò æå ó÷àñòîê
ìîëåêóëû ÍÀÄ (À-ôîðìà).
Ê ôëàâèíîâûì êîôåðìåíòàì îòíîñÿò ðèáîôëàâèí, êîòîðûé ïðåäñòàâëÿåò ñîáîé çàìåùåííûé èçîàëëîêñàçèí, ñâÿçàííûé ñ D-ðèáèòîëîì. Â 1938 ã. Âàðáóðãîì áûëî îáíàðóæåíî, ÷òî ôåðìåíò, êàòàëèçèðóþùèé îêèñëåíèå
142
ÂÅÑÒÍÈÊ ÎÃÓ 9`2005
D-àìèíîêèñëîò ìîëåêóëÿðíûì êèñëîðîäîì
(îêñèäàçà D-àìèíîêèñëîò), ÿâëÿåòñÿ ôëàâîïðîòåèäîì è ñîäåðæèò â êà÷åñòâå ïðîñòåòè÷åñêîé
ãðóïïû íîâûé êîôåðìåíò, íàçâàííûé ôëàâèíàäåíèíäèíóêëåîòèä (ÔÀÄ). ×èñëî èçâåñòíûõ
ôëàâîïðîòåèäîâ, èñïîëüçóþùèõ â êà÷åñòâå
êîôåðìåíòà ÔÀÄ, äîñòàòî÷íî âåëèêî, è òàêèå
ôåðìåíòû øèðîêî ðàñïðîñòðàíåíû â ïðèðîäå.
Ôëàâîïðîòåèäû êàòàëèçèðóþò ðåàêöèè äåãèäðèðîâàíèÿ. Òèïè÷íûìè ñóáñòðàòàìè äëÿ íèõ
ñëóæàò ïèðèäèíîâûå íóêëåîòèäû, á-îêñèêèñëîòû, àëüäåãèäû, à òàêæå ñîåäèíåíèÿ, ñîäåðæàùèå íàñûùåííûå óãëåðîä-óãëåðîäíûå ñâÿçè (ýòè ñîåäèíåíèÿ ïðåâðàùàþòñÿ â îëåôèíû).
Êàæäûé ôëàâîïðîòåèä ïðèíèìàåò ýëåêòðîíû
îò îêèñëÿåìîãî ñóáñòðàòà è ïåðåíîñèò ýëåêòðîíû ê äðóãîìó ñóáñòðàòó – îêèñëèòåëþ. Â
ïðîöåññå îêèñëåíèÿ èçîàëëîêñàçèíîâàÿ öèêëè÷åñêàÿ ñèñòåìà ñîîòâåòñòâóþùåãî êîôåðìåíòà ÔÀÄ ïðåòåðïåâàåò âîññòàíîâëåíèå, à ñóáñòðàò èç âîññòàíîâëåííîé ôîðìû ïåðåõîäèò â
îêèñëåííóþ. Âîññòàíîâëåííûå ôîðìû ôëàâîïðîòåèäîâ ñàìè â ñâîþ î÷åðåäü ñòàíîâÿòñÿ ñóáñòðàòàìè â ðåàêöèÿõ ñ äðóãèìè àêöåïòîðàìè
ýëåêòðîíîâ (òàêèìè, êàê ìåòèëåíîâûé ñèíèé,
èíäîôåíîë, ôåíàçèí, ìîëåêóëÿðíûé êèñëîðîä), áëàãîäàðÿ ÷åìó îêèñëåííàÿ ôîðìà êîôåðìåíòà ðåãåíåðèðóåò [5].
Îêèñëåíèå óãëåâîäîðîäîâ, áåëêîâ, ëèïèäîâ
ÿâëÿåòñÿ ýêçîòåðìè÷åñêèì, íî çàïðåùàþùèì ïî
ñïèíó ïðîöåññîì è ñîïðîâîæäàåòñÿ îòùåïëåíèåì àòîìîâ âîäîðîäà èëè ýëåêòðîíîâ îò ïèùåâûõ ñóáñòðàòîâ [6].
Ñëîæíåéøèé ôåðìåíòàòèâíûé ïðîöåññ
âêëþ÷àåò â ñåáÿ ìíîæåñòâî ñòàäèé, â êîòîðûõ
ó÷àñòâóþò ðàçëè÷íûå ïî ñâîèì ýëåêòðîííûì
è ñïèíîâûì ñâîéñòâàì âåùåñòâà. Àêöåïòîðàìè ýëåêòðîíîâ è ïðîòîíîâ ìîãóò âûñòóïàòü öèòîõðîìû, êîôåðìåíòû, êèñëîðîä, êîòîðûå ðàáîòàþò ñîïðÿæåííî ñ äðóãèìè ôåðìåíòàìè
äåãèäðîãåíàç, âêëþ÷àþùèìè NADF è NAD â
êà÷åñòâå êîôåðìåíòà. FAD ïðåäñòàâëÿåò ñîáîé
ñëîæíîå ñîåäèíåíèå, âêëþ÷àþùåå äëèííóþ
öåïü ÍÑÎÍ ãðóïï, à òàêæå îáúåìíûå ôîñôàòíûå ãðóïïû, çàíèìàþùèå äîñòàòî÷íî ìíîãî
ìåñòà â áåëêîâîé îáîëî÷êå ôåðìåíòà (ðèñ. 1).
Ñòåðè÷åñêèå íàïðÿæåíèÿ ïðè âçàèìîäåéñòâèè ñ îêðóæàþùèìè àìèíîêèñëîòàìè è ìîëåêóëàìè âîäû íå ìîãóò ïîâëèÿòü íà ïðîñòðàíñòâåííóþ ñòðóêòóðó ýòèõ öåïåé, ÷òî ïðîâåðåíî ìîäåëüíûìè ðàñ÷åòàìè [7], ïîýòîìó êîôåðìåíò ìîæíî
ìîäåëèðîâàòü íàèáîëåå çíà÷èìîé ÷àñòüþ àêòèâíîãî öåíòðà – ëþìèôëàâèíîì, âêëþ÷àþùèì èçî-
Êîáçåâ Ã.È.
Ñïèíîâûå ýôôåêòû â ôåðìåíòàòèâíûõ ðåàêöèÿõ îêèñëåíèÿ ñóáñòðàòîâ êèñëîðîäîì
Ðèñóíîê 1. Ïðîñòðàíñòâåííàÿ ñòðóêòóðà FAD
àëëîêñàçèíîâîå êîëüöî ôëàâèíà, à ôåðìåíò – áåëêîâîé ÷àñòüþ ïðîòîíèðîâàííîãî His516+.
Îêñèäàçû ÿâëÿþòñÿ ñàìûìè ïðîñòûìè èç
ôëàâîïðîòåèäîâ; â íèõ ïîëíîñòüþ âîññòàíîâëåííàÿ ôîðìà ÔÀÄÍ2 îêèñëÿåòñÿ êèñëîðîäîì
ñ îáðàçîâàíèåì Í2Î2 (ñì. ðåàêöèþ (1)). Ìåõàíèçì äåéñòâèÿ ãëþêîçîîêñèäàçû ðàññìîòðåí
íåäàâíî â ðàáîòàõ [8, 9]. Â ôëàâèíîâîì ôåðìåíòå ìîëåêóëà Î2 ïîñëå ïðèñîåäèíåíèÿ ýëåêòðîíà (êàê ïðàâèëî, îò ìîëåêóëû ÔÀÄÍ2) ïðåâðàùàåòñÿ â ñóïåðîêñèä-èîí Î2- è òåì ñàìûì àêòèâèðóåòñÿ [8-10]:
ÔÀÄÍ2 + Î2→ [ÔÀÄÍ2 – Î2]→
→[ÔÀÄÍ2+…Î2-]→ ÔÀÄÍ2+ + Î2-
(4)
Èçâåñòíî, ÷òî (4) ïðåäñòàâëÿåò ñîáîé ìåäëåííóþ ñòàäèþ, çà êîòîðîé îáû÷íî ñëåäóþò
ïðîöåññû ïåðåíîñà ïðîòîíîâ è âòîðîãî ýëåêòðîíà ñ ó÷àñòèåì áåëêà è ïîëóîêèñëåííîãî ðàäèêàëà ÔÀÄÍ2+. [2,11,12]:
Î 2−⋅
+
+Í →
ÍÎ.2 ,
ÍÎ2. +Í + + å → Í 2Î 2
(5)
(6)
Ïîëàãàþò [2, 11], ÷òî ñïèíîâûé çàïðåò äëÿ
ôåðìåíòàòèâíûõ ðåàêöèé ñ ó÷àñòèåì òðèïëåòíîãî ìîëåêóëÿðíîãî êèñëîðîäà (4)-(6) ñíèìàåòñÿ çà ñ÷åò ïîñëåäîâàòåëüíîãî äîáàâëåíèÿ îäèíî÷íûõ ýëåêòðîíîâ. Ïðè ýòîì ïðåäïîëàãàþò,
÷òî ïðåîäîëåíèå çàïðåòà ïî ñïèíó â ðåàêöèÿõ
(4)-(6) ïðîèñõîäèò çà ñ÷åò ïîÿâëåíèÿ ïåðâûõ
ðàäèêàëîâ (4) ïî àíàëîãèè ñ ðàäèêàëüíî-öåïíûì îêèñëåíèåì, ãäå ñïèíîâûé çàïðåò ìîæåò
áûòü ñíÿò â äóáëåòíîì êàíàëå.
Ìèíàåâ Á.Ô. [7] îòìåòèë ãëóáîêóþ ðàçíèöó
ìåæäó ðàäèêàëüíûìè ðåàêöèÿìè (4)-(6) â îêñèäàçàõ è ðàäèêàëüíûìè öåïíûìè ïðîöåññàìè
îêèñëåíèÿ (ãîðåíèÿ). Ïî ìíåíèþ àâòîðà, â ïîñëåäíåì ñëó÷àå ðàäèêàëû óõîäÿò â îáúåì ðàñòâîðà (èëè â îáúåì ïëàçìû ïëàìåíè) è òåðÿþò «ñïèíîâóþ ïàìÿòü» î ñâîèõ ïðåäøåñòâåííèêàõ. Â
ôåðìåíòàòèâíûõ ðåàêöèÿõ (4)-(6) â îêñèäàçàõ
êèñëîðîä è ïåðåíîñ÷èêè çàðÿäîâ (ÔÀÄ è
ÔÀÄÍ2) ïðî÷íî ñâÿçàíû ñ áåëêàìè âíóòðè àêòèâíîãî öåíòðà ôåðìåíòà. Ïðè ïåðåíîñå êèñëîðîäà ãåìîãëîáèíîì ìîëåêóëà Î2 ïîñòóïàåò ÷åðåç êëåòî÷íûå ìåìáðàíû â îïðåäåëåííûå ïîçèöèè, îïðåäåëÿåìûå ýëåêòðîñòàòè÷åñêèìè ïîòåíöèàëàìè ìîëåêóë âîäû, áåëêîâûõ ôðàãìåíòîâ è
èçîàëëîêñàçèíîâîé ÷àñòüþ ôåðìåíòà ÔÀÄ. Ïåðåäàâàÿ ýëåêòðîíû è ïðîòîíû âî âðåìÿ ïðîòåêàíèÿ ðåàêöèé (4)-(6), ðåàãåíòû òîëüêî êîëåáëþòñÿ [7-9] îòíîñèòåëüíî çàêðåïëåííûõ ïîçèöèé
âíóòðè àêòèâíîãî öåíòðà. (Ñþäà æå îòíîñèòñÿ è
çàòîðìîæåííîå âíóòðåííåå âðàùåíèå O2- â ïîëîñòè áåëêîâ.) Òàêèì îáðàçîì, ïðè ïåðåíîñå ýëåêòðîíîâ îò FADÍ2 ê Î2 ðàäèêàëû íå óõîäÿò â
îáúåì êëåòêè è ñïèíû ýëåêòðîíà îñòàþòñÿ êîððåëèðîâàííûìè, ò. å. êîìïëåêñ, â êîòîðîì ñôîðìèðîâàëñÿ O2-, òàêæå îñòàåòñÿ òðèïëåòíûì, ÷òî
ìîæíî ñõåìàòè÷íî èçîáðàçèòü â âèäå [7]
3
[FADH
]→ [FADH ...O ]
]→ FADH + O
.... + O
↑↑ πg
↑↓
2 .. + O 2
1
[
COB
→ FADH +2 ↑
3
+↑
2
−↓ πg
2
−↑ πg
2
+
2
−
2
(7)
Ýêñïåðèìåíòàëüíûå èññëåäîâàíèÿ Êëèíìàí ïîêàçàëè, ÷òî ëèìèòèðóþùåé ñòàäèåé ïðîöåññîâ (4)-(6) ÿâëÿåòñÿ ïåðåíîñ íå òÿæåëîé ÷àñòèöû – ïðîòîíà, à ëåãêîé ÷àñòèöû – ýëåêòðîíà
[11]. Îáúÿñíåíèå ïàðàäîêñà ïðåäëîæåíî Ìèíàåâûì, êîòîðûé óêàçàë íà íåîáõîäèìîñòü ïåðåâîðîòà ñïèíà â ñóïåðîêñèäå äëÿ ôîðìèðîâàíèÿ
ñèíãëåòíîãî ñîñòîÿíèÿ áèìîëåêóëÿðíîãî êîì1
ïëåêñà FADH 2+ ↑ .... + O 2− ↓ πg çà ñ÷åò ñèëüíîãî ñïèíîðáèòàëüíîãî âçàèìîäåéñòâèÿ. Âåëè÷èíà ðàññ÷èòàííîãî ìàòðè÷íîãî ýëåìåíòà ÑΠðàâíà
<3ÐÏ |Hso|1ÐÏ> = 0,01ý [7-9]. Ïîñëå ìåäëåííîãî ïðîöåññà – ïåðåâîðîòà ñïèíà â ñóïåðîêñèä-àíèîíå ðåàêöèÿ áóäåò ðàçðåøåíà ïî ñïèíó,
è ïåðîêñèä âîäîðîäà (ñì. ðåàêöèþ (6)) ïîêèíåò
àêòèâíûé öåíòð îêñèäàçû, à äàëüíåéøåå åãî
âîññòàíîâëåíèå äî âîäû ÿâëÿåòñÿ ðàçðåøåííûì
ïî ñïèíó ïðîöåññîì.
Ñëåäóåò çàìåòèòü, ÷òî ìåõàíèçì ñíÿòèÿ ñïèíîâîãî çàïðåòà ïðè êàòàëèòè÷åñêîì îêèñëåíèè
(4)-(6) ìîæåò áûòü îáúÿñíåí íå òîëüêî ïåðåâîðîòîì ñïèíà â ñóïåðîêñèä-àíèîíå, íî è âîçíèêíîâåíèåì ñïåöèôè÷åñêèõ ñïèíîâûõ ñîñòîÿíèé
ìîëåêóëû êèñëîðîäà ïðè åå îïðåäåëåííûõ ïîçèöèÿõ îòíîñèòåëüíî ôåðìåíòà è ñóáñòðàòà [13].
 ðàáîòàõ [14, 15] ïîêàçàíî, ÷òî ïîä âëèÿíèåì îêðóæåíèÿ ïåðåõîä à (1 ∆ g ) → Õ (3 ∑ g ), îòâåòñòâåííûé çà äåçàêòèâàöèþ êèñëîðîäà, óñèëèâàåòñÿ è çàèìñòâóåò ñâîþ èíòåíñèâíîñòü èç èíäó-
[
]
ÂÅÑÒÍÈÊ ÎÃÓ 9`2005
143
Åñòåñòâåííûå íàóêè
öèðîâàííîãî â ïðîöåññå ñòîëêíîâåíèÿ ýëåêòðîäèïîëüíîãî ïåðåõîäà b(1 ∑ + ) → a (1 ∆ g ). Ñëåäîâàòåëüíî, ìîëåêóëû, îêðóæàþùèå êèñëîðîä, ìîãóò ðàñïðåäåëÿòüñÿ â òàêèå ïîçèöèè, êîãäà íå
òîëüêî äåçàêòèâàöèÿ, íî è àêòèâàöèÿ êèñëîðîäà áóäåò îáëåã÷åíà [16].  ðàáîòàõ [17-21] ïðîàíàëèçèðîâàíà çàâèñèìîñòü Ì(b–a) îò íàáîðà
âîçáóæäåííûõ êîíôèãóðàöèé, ó÷èòûâàåìûõ ìåòîäîì êîíôèãóðàöèîííîãî âçàèìîäåéñòâèÿ (ÊÂ)
â êèñëîðîäå, ñåíñèáèëèçàòîðå è ìîëåêóëå ðàñòâîðèòåëÿ äëÿ áè- è òðèìîëåêóëÿðíûõ êèñëîðîäíûõ
êîìïëåêñîâ. Âàæíûì ðåçóëüòàòîì äëÿ òðîéíûõ
êîìïëåêñîâ ñòîëêíîâåíèÿ Î2+Ì+Ý (Ý – ýòèëåí,
Ì = Í2, N2, NÍ3, ÑÎ2, Í2Î, ÑÍ3ÎÍ, CCl4) ÿâëÿåòñÿ çíà÷èòåëüíàÿ çàâèñèìîñòü âåëè÷èí Ì(b–a)
è M(a–Õ) îò ýôôåêòîâ îáìåííîé ýëåêòðîííîé
êîððåëÿöèè â êèñëîðîäå. Âîçáóæäåíèÿ òîëüêî â
êèñëîðîäå äëÿ äâîéíûõ è òðîéíûõ êîìïëåêñîâ
ïðèâîäÿò ê âîçðàñòàíèþ Ì(b–a). Äîïîëíèòåëüíûé ó÷åò âîçáóæäåííûõ ñîñòîÿíèé â ýòèëåíå, â
ìîëåêóëå ðàñòâîðèòåëÿ (ðàñøèðåíèå ÊÂ) êîìïåíñèðóåò ýòî óâåëè÷åíèå è äàæå óìåíüøàåò âåëè÷èíó Ì(b–a), ïîëó÷åííóþ íà îñíîâå ðàñ÷åòà
ìåòîäîì ñàìîñîãëàñîâàííîãî ïîëÿ (ÑÑÏ) áåç
ó÷åòà ýëåêòðîííîé êîððåëÿöèè (Ìbaññï). Òàêèì
îáðàçîì, âîçðàñòàíèå âåëè÷èíû Ì(b–a) ïðè ó÷åòå îáìåííûõ âçàèìîäåéñòâèé è ýëåêòðîííîé êîððåëÿöèè (â ïîëèìîëåêóëÿðíûõ êèñëîðîäíûõ
êîìïëåêñàõ äëÿ çàäàííûõ ôèêñèðîâàííûõ ìåæìîëåêóëÿðíûõ ðàññòîÿíèé) ìîæåò îáåñïå÷èâàòüñÿ òîëüêî ðàñøèðåíèåì Ê â ìîëåêóëå êèñëîðîäà [22]. Êðîìå òîãî, âîçáóæäåíèÿ â êèñëîðîäå, â
ïðîöåññå ñáëèæåíèÿ ýòèëåíà è ìîëåêóëû, ïðèâîäÿò ê èíäóöèðîâàíèþ íå òîëüêî Ì(b – a), íî è
ê èçëó÷åíèþ â òåìíîâóþ êîìïîíåíòó ñîñòîÿíèÿ
a’, òî åñòü ê èíäóöèðîâàíèþ ýëåêòðîäèïîëüíîãî ïåðåõîäà Ì(b–a’) è, ñëåäîâàòåëüíî, ê èíäóöèðîâàíèþ òåìíîâîé êîìïîíåíòû ñèíãëåò-òðèïëåòíîãî ïåðåõîäà (a’–X). Âîçáóæäåíèÿ æå â ýòèëåíå ïðè ñáëèæåíèè Ñ2Í4 è Ì ïîëíîñòüþ ãàñÿò
Ì(b-a’) òåìíîâóþ êîìïîíåíòó (a’–X) è ñòàáèëèçèðóþò çíà÷åíèÿ Ì(b – a). Îòñþäà ñî âñåé î÷åâèäíîñòüþ ñëåäóåò, ÷òî ìàêñèìàëüíîå çíà÷åíèå
Ì(b–a) áóäåò âîçíèêàòü â îïðåäåëåííûõ ìåæìîëåêóëÿðíûõ ïîçèöèÿõ, äëÿ êîòîðûõ îáìåííîêîððåëÿöèîííûé ïîòåíöèàë ìèíèìàëåí äëÿ ñèñòåìû, íî ìàêñèìàëåí äëÿ êèñëîðîäà, ÷òî ðàâíîñèëüíî áîëüøîìó Ê â êèñëîðîäå [23].  ðàñ÷åòàõ áîëüøèõ êèñëîðîäñîäåðæàùèõ ñèñòåì (íàïðèìåð, ïðè ìîäåëèðîâàíèè ôåðìåíòàòèâíûõ
ðåàêöèé, âêëþ÷àþùèõ êèñëîðîä) ýòî áóäåò ïðîÿâëÿòüñÿ â ñòàöèîíàðíûõ òî÷êàõ, ñîîòâåòñòâóþg
144
ÂÅÑÒÍÈÊ ÎÃÓ 9`2005
ùèõ ñïåöèôè÷åñêîìó ðàñïîëîæåíèþ ôðàãìåíòîâ, â êîòîðûõ îáìåííî-êîððåëÿöèîííûé ïîòåíöèàë áóäåò ìàêñèìàëåí è ñâÿçàí ñ Î2(X3Óg¯), â òî
âðåìÿ êàê íà îòäåëüíûõ ôðàãìåíòàõ åãî âåëè÷èíà îñòàíåòñÿ íåáîëüøîé.  òàêèõ òî÷êàõ âåëè÷èíà Ì(b–a) áóäåò ìàêñèìàëüíîé èç âñåõ âîçìîæíûõ è ãåíåðàöèÿ à(1Äg) â ïðîöåññå ïåðåõîäà
X(3Óg¯)?à(1Äg) áóäåò îáëåã÷åíà. ×òî æå ýòî çà ñòàöèîíàðíûå òî÷êè è êàêîâà â íèõ ïîëíàÿ ýëåêòðîííàÿ ýíåðãèÿ? Ïðè èçìåíåíèè êîîðäèíàöèè
ìîëåêóëû êèñëîðîäà îòíîñèòåëüíî ôðàãìåíòîâ
ðàçíûå âîçáóæäåííûå êîíôèãóðàöèè îáåñïå÷èâàþò âêëàä â ïîëíóþ ýíåðãèþ ñèñòåìû. Ïîýòîìó âíîâü âîçíèêíåò ñòàöèîíàðíàÿ òî÷êà (íîâûå
ôèêñèðîâàííûå ìåæìîëåêóëÿðíûå ðàññòîÿíèÿ)
â êîòîðîé îáìåííî-êîððåëÿöèîííûé ïîòåíöèàë
áóäåò ìàêñèìàëåí è ñâÿçàí ñ Î2(X3Óg¯). Èç âñåõ
âîçìîæíûõ êîîðäèíàöèé êèñëîðîäà (ñ ñîîòâåòñòâóþùèìè ýòîìó ñëó÷àþ ôèêñèðîâàííûìè
ìåæìîëåêóëÿðíûìè ðàññòîÿíèÿìè äî ôðàãìåíòîâ) òîëüêî îäíà òî÷êà áóäåò ñîîòâåòñòâîâàòü
ìèíèìóìó ïîëíîé ýíåðãèè ñèñòåìû. Òàêèì îáðàçîì, â òî÷êå ìèíèìóìà ýíåðãèè ñèñòåìû âåëè÷èíà Ì(b–a) áóäåò ìàêñèìàëüíîé èç âñåõ âîçìîæíûõ è ãåíåðàöèÿ à(1Äg) â ïðîöåññå ïåðåõîäà
3
X ∑ g−  → a (1 ∆ g ) áóäåò îáëåã÷åíà.


Ñëåäîâàòåëüíî, íàðÿäó ñ ìåõàíèçìîì Ìèíàåâà âîçìîæåí ìåõàíèçì èçìåíåíèÿ ñïèíîâîãî ñîñòîÿíèÿ òðèïëåòíîãî êèñëîðîäà (÷àñòè÷íîå ñíÿòèå ñïèíîâîãî çàïðåòà), â êîòîðîì Ì(b–
3
a) è X ∑ g−  → a (1 ∆ g ) èãðàþò èñêëþ÷èòåëüíóþ
ðîëü. Î íåçíà÷èòåëüíîé âåëè÷èíå îáìåííî-êîððåëÿöèîííîãî ïîòåíöèàëà íà ôðàãìåíòàõ ìîæíî ñóäèòü ïî èíäóöèðîâàíèþ ñïèíîâîé ïëîòíîñòè íà àòîìàõ, êîòîðàÿ ñóììàðíî áóäåò êîìïåíñèðîâàòüñÿ. Ñ äðóãîé ñòîðîíû, îáìåííîêîððåëÿöèîííûé ïîòåíöèàë âñåé ñóïåðñèñòåìû
ìîæíî ðàññ÷èòàòü.  ïðîöåññå ìåæìîëåêóëÿðíîãî ñáëèæåíèÿ ôðàãìåíòîâ óæå íà çíà÷èòåëüíûõ ðàññòîÿíèÿõ áóäåò ïðîèñõîäèòü èíäóöèðîâàíèå âçàèìîêîìïåíñèðóåìîé ñïèíîâîé ïëîòíîñòè íà àòîìàõ ìîëåêóë ôðàãìåíòîâ, ïåðåðàñïðåäåëåíèå ñïèíîâîé ïëîòíîñòè íà àòîìàõ êèñëîðîäà ìîëåêóëû Î2 è, âîçìîæíî, åå ïðîñà÷èâàíèå íà àòîìû ñîñåäíèõ ìîëåêóë. Ýòîò ðåçóëüòàò áóäåò ñâèäåòåëüñòâîâàòü îá ýôôåêòå àêòèâàöèè ìîëåêóëÿðíîãî êèñëîðîäà è èíäóöèðîâàíèè ëîêàëüíûõ ìàãíèòíûõ îáëàñòåé ôåððîìàãíèòíîãî ïîðÿäêà íà ïàðòíåðàõ. Ðîëü ýëåêòðîííîãî ñïèíà â áèîõèìè÷åñêèõ ðåàêöèÿõ èçâåñòíà ñ 1937 ãîäà, êîãäà Ïîëèíã îáíàðóæèë,
÷òî óâåëè÷åíèå ðÍ ðàñòâîðà óìåíüøàåò ìàãíèò-
Êîáçåâ Ã.È.
Ñïèíîâûå ýôôåêòû â ôåðìåíòàòèâíûõ ðåàêöèÿõ îêèñëåíèÿ ñóáñòðàòîâ êèñëîðîäîì
íûé ìîìåíò ãåìîïðîòåèíîâ. Ýôôåêò áûë îáúÿñíåí ïåðåâîðîòîì ñïèíà èîíà æåëåçà çà ñ÷åò íåáîëüøèõ èçìåíåíèé â êîîðäèíàöèè ëèãàíäîâ.
Âàæíî îòìåòèòü, ÷òî ïðè÷èíîé èçìåíåíèÿ ñïèíîâîé ïëîòíîñòè íà ëîêàëüíûõ ÷àñòÿõ ñóïåðñèñòåìû ÿâëÿåòñÿ èçìåíåíèå îáìåííûõ âçàèìîäåéñòâèé âíóòðè ñèñòåì ïîä âëèÿíèåì ïàðòíåðîâ (â ÷àñòíîñòè, êèñëîðîäà) ïðè ðàçëè÷íîì
ðàñïîëîæåíèè ôðàãìåíòîâ îòíîñèòåëüíî äðóã
äðóãà. Òåîðèÿ ðàñïàðèâàíèÿ ñïèíà â ìîëåêóëàõ
â ïðîöåññå ðàäèêàëüíûõ õèìè÷åñêèõ ðåàêöèé
îñâåùàåòñÿ â ðàáîòàõ Áó÷à÷åíêî À.Ë. [24, 25].
Î ïåðåðàñïðåäåëåíèè ñïèíîâîé ïëîòíîñòè â
ñèíãëåòíûõ êèñëîðîäíûõ êîìïëåêñàõ ãîâîðèòñÿ â ðàáîòàõ Øåêà [25].
Äëÿ ïîäòâåðæäåíèÿ âûäâèíóòûõ ïðåäïîëîæåíèé ìåòîäàìè êâàíòîâîé õèìèè ïðîâåäåíû ïîëóýìïèðè÷åñêèå è íåýìïèðè÷åñêèå ðàñ÷åòû ýëåêòðîííûõ, ýíåðãåòè÷åñêèõ è ìàãíèòíûõ õàðàêòåðèñòèê îêèñëåííîé è âîññòàíîâëåííîé ôîðìû ëþìèôëàâèíà, âûñòóïàþùåãî
â êà÷åñòâå ìîäåëè FAD êàê àêòèâíîãî öåíòðà
ãëþêîçîîêñèäàçû (ÃÎ), ïðîòîíèðîâàííîãî ãèñòèäèíà His516+ è èññëåäîâàíû ìåõàíèçìû àêòèâàöèè êèñëîðîäà â áèìîëåêóëÿðíûõ êîìïëåêñàõ 3[His+ – 3Î2]+ è 3[Ëþìèôëàâèí – Î2]. Ðàñ÷åòû ýëåêòðîííûõ, ñïèíîâûõ õàðàêòåðèñòèê
äëÿ âûáðàííûõ ìåæìîëåêóëÿðíûõ ðàññòîÿíèé
R 1 è R 2 ïðîâåäåíû â ïðèáëèæåíèè CNDO,
INDO, ÐÌ3, à òàêæå ìåòîäîì ôóíêöèîíàëà
ïëîòíîñòè DFT è Ab initio ñ èñïîëüçîâàíèåì
áàçèñà STO – 3G.
1. Ðàñ÷åòû ýëåêòðîííûõ è ñïèíîâûõ
õàðàêòåðèñòèê îêèñëåííîãî
è âîññòàíîâëåííîãî ëþìèôëàâèíà
Ãåîìåòðè÷åñêèå è ýëåêòðîííûå õàðàêòåðèñòèêè â âîññòàíîâëåííîì è îêèñëåííîì ëþìèôëàâèíå èçîáðàæåíû íà ðèñóíêàõ 2-5.
Ñðàâíèòåëüíûå õàðàêòåðèñòèêè ýëåêòðîííîé
ýíåðãèè ïðèâåäåíû â òàáëèöå 1. Âåëè÷èíû ïîëíîé ýëåêòðîííîé ýíåðãèè, ïîëó÷åííûå ïîëóýìïèðè÷åñêèìè ìåòîäàìè CNDO, INDO PM3 è Ab initio
â áàçèñå STO-3G, à òàêæå ìåòîäîì ôóíêöèîíàëà
ïëîòíîñòè (DFT) ñ îáìåííî-êîððåëÿöèîííûì ïîòåíöèàëîì B3-LYP, çíà÷èòåëüíî ðàçëè÷àþòñÿ.
Ó÷åò êîððåëÿöèîííîé ýíåðãèè â íåýìïèðè÷åñêèõ ðàñ÷åòàõ ïî Moller-Plesseta (ÌÐ2) ïðèâîäèò ê åùå áîëüøèì ðàçëè÷èÿì. Îäíàêî ñèíãëåò–òðèïëåòíîå (S-T) ðàñùåïëåíèå â ðàñ÷åòàõ àb
initio è DFT ñ ó÷åòîì ÌÐ2 ïðàêòè÷åñêè ñîâïàäàþò è ðàâíû -26.82 êêàë/ìîëü è -25.58 êêàë/
ìîëü ñîîòâåòñòâåííî (òàáë. 1).
Ðèñóíîê 2. Äëèíû ñâÿçåé â èçîàëëîêñàçèíîâîì ÿäðå
âîññòàíîâëåííîãî ëþìèôëàâèíà, ðàññ÷èòàííûå
ìåòîäîì ÐÌ3 â ðàìêàõ íåîãðàíè÷åííîãî ìåòîäà
Õàðòðè-Ôîêà (ÍÕÔ)
Ðèñóíîê 3. Çàðÿäû íà àòîìàõ âîññòàíîâëåííîãî
ëþìèôëàâèíà, ðàññ÷èòàííûå ìåòîäîì ÐÌ3
â ðàìêàõ ÍÕÔ
Ðèñóíîê 4. Äëèíû ñâÿçåé â èçîàëëîêñàçèíîâîì ÿäðå
îêèñëåííîãî ëþìèôëàâèíà, ðàññ÷èòàííûå ìåòîäîì
ÐÌ3 â ðàìêàõ ÍÕÔ
Ðèñóíîê 5. Çàðÿäû íà àòîìå, åäèíèöà çàðÿäà ýëåêòðîíà
â îêèñëåííîì ëþìèôëàâèíå, ðàññ÷èòàííûå ìåòîäîì
ÐÌ3 â ðàìêàõ ÍÕÔ
ÂÅÑÒÍÈÊ ÎÃÓ 9`2005
145
Åñòåñòâåííûå íàóêè
Ðàñ÷åòû ÐÌ3, INDO, DFT áåç ó÷åòà ÌÐ2
äàþò áëèçêèå çíà÷åíèÿ S-T ðàñùåïëåíèÿ, ðàâíûå
-57.71; -56.26; -53.49 êêàë/ìîëü ñîîòâåòñòâåííî.
Ñîãëàñíî ðàñ÷åòàì ÐÌ3 è àb initio ñïèíîâàÿ ïëîòíîñòü íà àòîìàõ îêèñëåííîãî ëþìèôëàâèíà â òðèïëåòíîì ñîñòîÿíèè äåëîêàëèçîâàíà íà àòîìàõ óãëåðîäà èçîàëëîêñàçèíîâîãî êîëüöà, ïðè ýòîì íà àòîìàõ àçîòà N1 è N5
íàáëþäàåòñÿ áîëüøàÿ ïî ìîäóëþ ñïèíîâàÿ
ïëîòíîñòü. Ìåòîäîì àb initio ïîëó÷åíû ñëåäóþùèå çíà÷åíèÿ ñïèíîâîé ïëîòíîñòè: ñ(N5)
= 1,17; ñ(N1) = 1,073. Íà îñòàëüíûõ àòîìàõ
ñïèíîâàÿ ïëîòíîñòü âçàèìíî êîìïåíñèðóåòñÿ âñëåäñòâèå âîçíèêíîâåíèÿ èíäóêòèâíîãî
ñïèíîâîãî ýôôåêòà â àðîìàòè÷åñêîì êîëüöå
ëþìèôëàâèíà.
Ñïèíîâàÿ ïëîòíîñòü íà àòîìàõ êèñëîðîäà
11
Î , Î12 èçîàëëîêñàçèíîâîãî êîëüöà îñòàåòñÿ
ïîëîæèòåëüíà è ïðèìåðíî ðàâíà 0.6 çà ñ÷åò
ñïèí–ïîëÿðèçàöèè ñ ñîñåäíèìè àòîìàìè óãëåðîäà Ñ2 è Ñ4 ñîîòâåòñòâåííî.
Çàðÿäû íà ýòèõ àòîìàõ êèñëîðîäà, ðàññ÷èòàííûå ìåòîäàìè DFT è àb initio, ñîâïàäàþò
q(Î11) = q (Î12)= – 0.2e.
Ðàñ÷åòû, ïðîâåäåííûå íàìè, ïîäòâåðæäàþò
ðàíåå ïðåäëîæåííûé Ãàìèëüòîíîì ìåõàíèçì
ãèäðèðîâàíèÿ FAD [26], îñíîâàííûé íà ïðèñîåäèíåíèè ãèäðèäèîíà Í â ïîëîæåíèå N5. Ïðè
ýòîì ïðîòîí äîëæåí ïðèñîåäèíÿòüñÿ â ïîëîæåíèå N1. Çàðÿäû íà àòîìàõ N5 è N1 â ìîëåêóëå
FAD ðàâíû: â îêèñëåííîé ôîðìå q(N5) = 0.12,
q(N1) = – 0.24; â âîññòàíîâëåííîé ôîðìå q(N5)
=0.174, q(N1) =0.114, ÷òî ñîâïàäàåò ñ ðàñ÷åòíûìè çíà÷åíèÿìè, ïðèâåäåííûìè â ðàáîòå [7].
Ðàñ÷åò ýíåðãèè ñèíãëåò-òðèïëåòíîãî ðàñùåïëåíèÿ âîññòàíîâëåííîãî ëþìèôëàâèíà ïîêàçûâàåò, ÷òî çíà÷åíèÿ, ïîëó÷åííûå ðàçëè÷íûìè ìåòîäàìè, êîëåáëþòñÿ îò 30 äî 127 êêàë/ìîëü
(òàáë. 1). Ïðè ýòîì çíà÷åíèÿ, ïîëó÷åííûå ìåòîäàìè DFT (-88.36 êêàë/ìîëü) è ÌÐ2 (-89.23 êêàë/
ìîëü) ïðàêòè÷åñêè ñîâïàäàþò ñî çíà÷åíèÿìè,
ïîëó÷åííûìè ìåòîäîì INDO, à çíà÷åíèÿ ýíåðãèè S–T ïåðåõîäà, ïîëó÷åííûå áåç ó÷åòà ÌÐ2,
áëèçêè ê çíà÷åíèÿì ýëåêòðîííûõ ýíåðãèé S – T,
ðàññ÷èòàííûì ìåòîäîì àb initio áåç ó÷åòà ÌÐ2.
Äëÿ âñåõ ìåòîäîâ ýíåðãèè ñèíãëåò-òðèïëåòíûõ ïåðåõîäîâ âîññòàíîâëåííîãî ëþìèôëàâèíà áîëüøå âåëè÷èíû ÄÅ(S – T) îêèñëåííîãî
ëþìèôëàâèíà.  âîññòàíîâëåííîì ëþìèôëàâèíå, òàê æå, êàê è â îêèñëåííîì, èíäóöèðîâàííûé èíäóêòèâíûé ñïèíîâûé ýôôåêò â àðîìàòè÷åñêîì êîëüöå ñîõðàíÿåòñÿ, âñëåäñòâèå ÷åãî
ñïèíîâàÿ ïëîòíîñòü íà àòîìàõ âçàèìíî êîìïåíñèðóåòñÿ, ÷òî ôèêñèðóåòñÿ ìåòîäàìè ÐÌ3 è
INDO.
Ìîæíî îòìåòèòü, ÷òî ýíåðãèÿ êîððåëÿöèè,
âûÿâëåííàÿ ìåòîäîì ÌÐ2 â àb initio ðàñ÷åòàõ
äëÿ îêèñëåííîãî ëþìèôëàâèíà â ñèíãëåòíîì è
òðèïëåòíîì ñîñòîÿíèè, ðàçëè÷àåòñÿ, ïðè ýòîì
â ñèíãëåòíîì ñîñòîÿíèè âåëè÷èíà ýíåðãèè ÌÐ2
áîëüøå, ÷åì â òðèïëåòíîì ñîñòîÿíèè (ÄE êîð.(ST) = -129.85 êêàë/ìîëü (5.63 ýÂ)), ÷òî ñîñòàâëÿåò áîëüøóþ ÷àñòü ýíåðãèè (S-T) îêèñëåííîãî
ëþìèôëàâèíà (-157.11 êêàë/ìîëü) (òàáë. 1).
Èçâåñòíî, ÷òî ÄE (S-T) = 2I, ãäå I – îáìåííûé èíòåãðàë. Òàêèì îáðàçîì, âåëè÷èíà îáìåííîãî èíòåãðàëà, ñîãëàñíî ðàñ÷åòàì, â îêèñëåííîì ëþìèôëàâèíå ñîñòàâëÿåò 65 êêàë/ìîëü. Äëÿ
Òàáëèöà 1. Ñðàâíèòåëüíûå õàðàêòåðèñòèêè ýëåêòðîííûõ ýíåðãèé S0 è T1 îêèñëåííîãî (C13Í12Î2N4) è
âîññòàíîâëåííîãî (C13Í14Î2N4) ëþìèôëàâèíà, âûñòóïàþùåãî â êà÷åñòâå ìîäåëè FAD, ðàññ÷èòàííûå â ðàìêàõ
íåîãðàíè÷åííîãî ìåòîäà Õàðòðè-Ôîêà ðàçíûìè ìåòîäàìè
Ìåòîäû
Eïîëí.
PM3
INDO
CNDO
Ab initio
C13Í14Î2N4
-69030,52
1
C13Í14Î2N4
-69000,62
3
-31,37
26,34
-57,78
-27,88
Eïîëí.
-111787,82
-111731,56
-112837,23
-112748,0
ÄH 0f
-6652,27
-6596,02
-6795,86
-6706,63
Eïîëí.
-116162,18
-116079,65
-117213,97
-117113,34
ÄH 0f
-7145,35
-7062,81
-7291,32
-7190,68
Eïîëí.
MP2
-537081,01
-674,41
-537054,18
-544,56
-537821,40
-654,51
-537753,43
-595,36
-537755,85
-537598,74
-538475,91
-538348,78
-539931,69
-1122,59
-539878,19
-1150,51
-540683,5
-1084,00
-540617,63
-1060,50
-541054,28
-541028,71
-541767,48
-541678,12
E
Eïîëí.
MP2
E
ïîëíàÿ
Ó MP
2
146
C13Í12Î2N4
-68239,24
3
ÄH 0f ,
ïîëíàÿ
Ó MP
2
DFT
C13Í12Î2N4
-68296,95
1
ÂÅÑÒÍÈÊ ÎÃÓ 9`2005
Êîáçåâ Ã.È.
Ñïèíîâûå ýôôåêòû â ôåðìåíòàòèâíûõ ðåàêöèÿõ îêèñëåíèÿ ñóáñòðàòîâ êèñëîðîäîì
âîññòàíîâëåííîé ôîðìû (Red) ëþìèôëàâèíà
ÌÐ 2
ÄE êîð
(S-T) = 59.15 êêàë/ìîëü, ÷òî çíà÷èòåëüíî
ìåíüøå, ÷åì äëÿ îêèñëåííîãî ëþìèôëàâèíà. Èç
ýòîãî ñëåäóåò, ÷òî îáìåííûå âçàèìîäåéñòâèÿ â
îêèñëåííîé ôîðìå áîëåå ñóùåñòâåííû, ÷åì â
âîññòàíîâëåííîé ôîðìå ëþìèôëàâèíà.
ÌÐ 2
Ðàñ÷åòû âåëè÷èíû ÄE êîð
(S-T) ìåòîäîì
DFT è àb initio îòëè÷àþòñÿ, ïîñêîëüêó îáìåííî-êîððåëÿöèîííûé ïîòåíöèàë Â3-LYP óæå ó÷èòûâàåò îáìåííî-êîððåëÿöèîííóþ ýíåðãèþ.
2. Ðàñ÷åòû ýëåêòðîííûõ è ñïèíîâûõ
õàðàêòåðèñòèê ïðîòîíèðîâàííîãî His516+
Ýëåêòðîííûå ýíåðãèè S0 è T1 ïðîòîíèðîâàííîãî His516+, ïîëó÷åííûå ðàçíûìè ìåòîäàìè,
ïðåäñòàâëåíû â òàáëèöå 2. Çíà÷åíèÿ ÄE (S-T)
èìåþò çíà÷èòåëüíûé ðàçáðîñ.  òðèïëåòíîì
ñîñòîÿíèè ãèñòèäèíà ñïèíîâàÿ ïëîòíîñòü äâóõ
íåñïàðåííûõ ýëåêòðîíîâ äåëîêàëèçîâàíà ïî
àòîìàì óãëåðîäà.
Íàèáîëüøàÿ ñïèíîâàÿ ïëîòíîñòü ñîñðåäîòî÷åíà íà àòîìàõ Ñ16, Ñ17; Ñ19 ãèñòèäèíà è ñîîòâåòñòâåííî ðàâíà 0,545; 0,595; 0,681, ÷òî â ñóììå
ñîñòàâëÿåò 1.83. Îñòàëüíàÿ ñïèíîâàÿ ïëîòíîñòü
ëîêàëèçîâàíà ñ ìàëûìè âåëè÷èíàìè íà îñòàëüíûõ àòîìàõ. Ðàñ÷åò ÐÌ3 ñèíãëåòíîãî ñîñòîÿíèÿ
ïîêàçàë, ÷òî íà àòîìàõ ïÿòè÷ëåííîãî öèêëà íàáëþäàåòñÿ èíäóêòèâíûé çàðÿäîâûé ýôôåêò. Ïðè
ýòîì íà àòîìàõ àçîòà ïðîñëåæèâàåòñÿ íåäîñòàòîê çàðÿäà (0,46å), à íà àòîìå êèñëîðîäà èçáûòîê ýëåêòðîííîé ïëîòíîñòè (-0,33å). Â òðèïëåòíîì ñîñòîÿíèè ðàñïðåäåëåíèå çàðÿäîâ íà àòîìàõ
ñîõðàíÿåòñÿ ïî çíàêó, íî èìååò ìåíüøèå ïî ìîäóëþ çíà÷åíèÿ. Ðàñ÷åòû ìåòîäàìè INDO è àb
initio ïîêàçûâàþò, ÷òî ñïèíîâàÿ ïëîòíîñòü â
òðèïëåòíîì ñîñòîÿíèè (ñ = 2) ìîæåò áûòü äåëî-
êàëèçîâàíà ëèáî íà àòîìàõ óãëåðîäà è àçîòà
ïÿòè÷ëåííîãî öèêëà (àb initio), ëèáî ëîêàëèçîâàíà ïî îäíîìó ñïèíó íà ðàçëè÷íûõ ôðàãìåíòàõ, ðàñïîëîæåííûõ íà çíà÷èòåëüíîì ðàññòîÿíèè äðóã îò äðóãà (INDO). Íàïðèìåð, îäèí èç
ñïèíîâ ëîêàëèçîâàí íà àòîìå àçîòà (ñ(N) = 1), à
âòîðîé ñïèí äåëîêàëèçîâàí ïî àòîìàì óãëåðîäà
ïÿòè÷ëåííîãî öèêëà ñî çíà÷èòåëüíîé ñïèí ïîëÿðèçàöèåé. Ðàñ÷åòû ìåòîäîì CNDO äàþò íåñîãëàñîâàííóþ êàðòèíó: îäèí èç ñïèíîâ ëîêàëèçîâàí íà àòîìå êèñëîðîäà êàðáîíèëüíîé ãðóïïû
(ñ(Î) = 0,89), à âòîðîé ñïèí äåëîêàëèçîâàí ïî
àòîìàì àçîòà è óãëåðîäà ïÿòè÷ëåííîãî öèêëà,
ïðè ýòîì ñïèí-ïîëÿðèçàöèÿ íå íàáëþäàåòñÿ (ðàçäåëåíèå ñïèíîâîé ïëîòíîñòè íà ïîëîæèòåëüíûå
è îòðèöàòåëüíûå çíà÷åíèÿ íà ðàçíûõ öåíòðàõ).
Òàáëèöà 2. Ñðàâíèòåëüíûå õàðàêòåðèñòèêè
ýëåêòðîííûõ ýíåðãèé ïðîòîíèðîâàííîãî ãèñòèäèíà His
516+, ðàññ÷èòàííûå ðàçíûìè ìåòîäàìè â ðàìêàõ ÍÕÔ â
ñèíãëåòíîì è òðèïëåòíîì ñîñòîÿíèè
Ìåòîä
ðàñ÷åòà
PM3
INDO
Ab initio
DFT
Ýíåðãèÿ
Èññëåäóåìûé îáúåêò
1
His 516+
3
His 516+
Eïîëí.
-44576,86
-44490,54
ÄH 0f
82,07
168,39
Eïîëí.
-73521,47
-73387,69
ÄH 0f
-3368,43
-3234,66
Eïîëí.
-338217,16
-338090,34
MP2
-377,79
-317,55
E Total
Ó MP
2
-338594,95
-338407,88
Eïîëí.
-339845,38
-339939,04
MP2
-600,42
-623,66
-340445,81
-340562,69
E Total
Ó MP
2
Òàáëèöà 3. Çàâèñèìîñòü ýëåêòðîííîé ýíåðãèè òðèïëåòíîãî êèñëîðîäíîãî êîìïëåêñà 3[Ëþìèôëàâèí…Î2]0
âîññòàíîâëåííîãî ëþìèôëàâèíà îò ìåæìîëåêóëÿðíîãî ðàññòîÿíèÿ R1 ìåæäó êèñëîðîäîì è ëþìèôëàâèíîì
R1=2,6 Å
R1=2,7 Å
R1=2,80 Å
R1=2,83 Å
R1=3 Å
R1=4 Å
R1=5 Å
–
–
-82499,04
-82498,93
-82498,93
-82498,89
0
ÄH f
–
–
-82499,07
-62,18
-62,15
-62,04
-62,05
-62,01
Eïîëí.
-140305,03
-140304,95
-140304,89
-140304,88
-140304,81
-140304,55
-140304,61
-7569,79
-7569,72
-7569,66
-7569,65
-7569,58
-7569,31
-7569,37
-593836,31
-551,56
-469125,35
-104,58
-469232,48
-106,62
-469259,46
-107,14
-453496,44
-206,30
-449296,97
-218,56
-630459,41
-708,25
Total
Ó MP
2
-594387,87
-469229,93
-469339,10
-469366,59
-453702,75
-449515,54
-631167,66
-V/T
Eïîëí.
MP2
1,914
-602952,39
-593,56
-603545,95
1,712
-602963,53
-579,99
1,713
-602973,51
-577,25
1,713
-602975,93
-576,78
1,698
-476345,26
-328,60
1,691
-478123,49
-325,93
2,01
-445537,39
-275,38
-60354352
-603550,76
-603552,71
-476673,86
-478449,42
-445812,77
1,93
1,93
1,93
1,93
1,7350
1,7357
1,6828
Eïîëí,
PM3
CNDO
Ab initio
DFT
ÄH
0
f
Eïîëí.
MP2
E
E
Total
Ó MP
2
-V/T
ÂÅÑÒÍÈÊ ÎÃÓ 9`2005
147
Åñòåñòâåííûå íàóêè
3. Ðàñ÷åòû ýëåêòðîííûõ è ñïèíîâûõ
õàðàêòåðèñòèê â áèìîëåêóëÿðíîì
êîìïëåêñå 3[Ëþìèôëàâèí …Î2]
Çíà÷åíèÿ ïîëíîé ýëåêòðîííîé ýíåðãèè è
ýíåðãèè êîððåëÿöèè â çàâèñèìîñòè îò ìåæìîëåêóëÿðíîãî ðàññòîÿíèÿ R1 ìåæäó Î2 è ëþìèôëàâèíîì ïðèâåäåíû òàáëèöå 3. Ïîëó÷åííûå çíà÷åíèÿ âèðèàëà (-Y/T) äëÿ êàæäîé ñòàöèîíàðíîé
òî÷êè ñóùåñòâåííî îòëè÷àþòñÿ ïî âåëè÷èíå.
Ìîæíî ëèøü íà êà÷åñòâåííîì óðîâíå ñóäèòü îá
èçìåíåíèè âåëè÷èíû ýíåðãèè äëÿ áëèçêèõ çíà÷åíèé âèðèàëà. Èç òàáëèöû 3 âèäíî, ÷òî ñîãëàñíî CNDO ðàñ÷åòàì ýíåðãèÿ òðèïëåòíîãî êîìïëåêñà 3[Ëþìèôëàâèí – 3Î2] ïðàêòè÷åñêè íå èçìåíÿåòñÿ â èíòåðâàëå 2.6-5 Å (èçìåíåíèÿ ñîñòàâëÿþò 1 êêàë/ìîëü).
Ðåçóëüòàòû CNDO ðàñ÷åòîâ âïîëíå îáúÿñíèìû, ïîñêîëüêó ìåòîä íå ïàðàìåòðèçîâàí äëÿ
îïèñàíèÿ ìåæìîëåêóëÿðíîãî âçàèìîäåéñòâèÿ.
Ñîãëàñíî àb initio ðàñ÷åòàì áåç ó÷åòà ýíåðãèè
êîððåëÿöèè ìåòîäîì ÌÐ2, â òî÷êå ñ R1 = 2.83 Å
íàáëþäàåòñÿ ìèíèìóì ýëåêòðîííîé ýíåðãèè. Òàêèì îáðàçîì, èç êà÷åñòâåííûõ ñîîáðàæåíèé ìîæíî ñäåëàòü âûâîäû, ÷òî âîññòàíîâëåííûé ëþìèôëàâèí ìîæåò îáðàçîâûâàòü äîñòàòî÷íî óñòîé÷èâûé êîìïëåêñ ñ òðèïëåòíûì êèñëîðîäîì (ýíåðãèè ñðàâíèâàëèñü ïðè áëèçêèõ çíà÷åíèÿõ âèðèàëà). Ýíåðãèÿ êîððåëÿöèè ÌÐ2 èçìåíÿåòñÿ ïðè
ñáëèæåíèè ôðàãìåíòîâ. DFT ðàñ÷åòû ïîäòâåðæäàþò ýòó òåíäåíöèþ (òàáë. 3). Îáìåííî-êîððåëÿöèîííàÿ ýíåðãèÿ ìîæåò áûòü ðàññ÷èòàíà êàê ðàçíîñòü ýíåðãèé DFT è CNDO â ñòàöèîíàðíûõ òî÷êàõ.  ýòîì ñëó÷àå òî÷êà ìèíèìóìà ïîëíîé ýíåðãèè ñîâïàäàåò ñ ìèíèìóìîì êðèâîé îáìåííî-êîððåëÿöèîííîé ýíåðãèè, ÷òî ñâèäåòåëüñòâóåò î çíà÷èòåëüíîì îáìåííîì âçàèìîäåéñòâèè íà êèñëîðîäå è èíäóöèðîâàííîì íåçíà÷èòåëüíîì îáìåííîì âçàèìîäåéñòâèè íà ëþìèôëàâèíå.
4. Ðàñ÷åòû ýëåêòðîííûõ è ñïèíîâûõ
õàðàêòåðèñòèê â áèìîëåêóëÿðíîì
êîìïëåêñå 3[His++ 3Î2]+
Õàðàêòåðèñòèêè êîìïëåêñà ðàññ÷èòàíû íåýìïèðè÷åñêèì ìåòîäîì â áàçèñå STO-3G, à òàêæå ïîëóýìïèðè÷åñêèìè ìåòîäàìè CNDO, ÐÌ3
â ðàìêàõ íåîãðàíè÷åííîãî Õàðòðè-Ôîêà ñ çàðÿäîì êîìïëåêñà êàòèîíà ïëþñ îäèí.
Âçàèìíîå ðàñïîëîæåíèå àòîìîâ êèñëîðîäà
è ãèñòèäèíà ïîñëå îïòèìèçàöèè â êîìïëåêñå
ïðèâåäåíî íà ðèñóíêå 6. Çà êîîðäèíàòó ðåàêöèè ïðèíÿòî ðàññòîÿíèå ìåæäó îäíèì èç àòîìîâ âîäîðîäà ñâÿçè N-H ïÿòè÷ëåííîãî öèêëà è
àòîìîì êèñëîðîäà â ìîëåêóëå Î2.
148
ÂÅÑÒÍÈÊ ÎÃÓ 9`2005
Ðèñóíîê 6. Îïòèìèçèðîâàííàÿ ãåîìåòðèÿ êîìïëåêñà
3
[His+ … 3Î2]+ ñ óêàçàíèåì íîìåðîâ àòîìîâ
â ïÿòè÷ëåííîì öèêëå ãèñòèäèíà
Ýíåðãåòè÷åñêèå è ñïèíîâûå õàðàêòåðèñòèêè êîìïëåêñà äëÿ ðàçëè÷íûõ ìåæìîëåêóëÿðíûõ
ðàññòîÿíèé, ðàññ÷èòàííûå ðàçíûìè ìåòîäàìè,
ïðèâåäåíû â òàáëèöàõ 4-6.
Ab initio ðàñ÷åòû äàþò ìèíèìóì ïîëíîé ýëåêòðîííîé ýíåðãèè â îêðåñòíîñòè òî÷êè R2 = 4 Å,
ïðè ýòîì îáìåííî-êîððåëÿöèîííàÿ ýíåðãèÿ â
òî÷êå ìèíèìóìà ïîëíîé ýëåêòðîííîé ýíåðãèè
èìååò âíîâü íàèìåíüøåå çíà÷åíèå, à ñïèíîâàÿ
ïëîòíîñòü íà àòîìàõ Î2 îòëè÷íà îò åäèíèöû è
ñîñòàâëÿåò íà êàæäîì àòîìå ïî 0.5 (òàáë. 3).
Çàêëþ÷åíèå
Ðàñ÷åò ýëåêòðîííûõ è ñïèíîâûõ õàðàêòåðèñòèê ìåòîäàìè ab initio, DFT, CNDO, PM3 â ðàìêàõ ÍÕÔ â êîìïëåêñàõ 1,3[Ëþìèôëàâèí … Î2] è
1,3
[Î2 …His516+ ]+ äëÿ ðàçëè÷íûõ ðàññòîÿíèé R1
è R2 ïîêàçàë, ÷òî â ïðèñóòñòâèå êèñëîðîäà íà
àòîìàõ ëþìèôëàâèíà è àòîìàõ ïðîòîíèðîâàííîãî His516+ âîçíèêàþò èíäóöèðîâàííûå âçàèìîêîìïåíñèðóþùèåñÿ ñïèíîâûå ïëîòíîñòè ñ
ðàçëè÷íûìè ñõåìàìè ðàñïàðèâàíèÿ áåç èçìåíåíèÿ ïîëíîãî ñïèíà ñèñòåìû. Êàæäàÿ ñõåìà ðàñïàðèâàíèÿ õàðàêòåðèçóåòñÿ ñâîåé ýíåðãèåé.
Ðàñ÷åòû ïîäòâåðæäàþò ðàíåå ïðåäëîæåííûé ìåõàíèçì ãèäðèðîâàíèÿ FAD, îñíîâàííûé
íà ïðèñîåäèíåíèè ãèäðèä – èîíà Í? â ïîëîæåíèè N5. Ïðè ýòîì ïðîòîí ïðèñîåäèíÿåòñÿ â ïîëîæåíèå N1 [26]. Çàðÿäû íà àòîìàõ N5 è N1 â â
îêèñëåííîé ôîðìå ìîëåêóëû FAD ðàâíû: 0.12
è -0.24å ñîîòâåòñòâåííî, à â âîññòàíîâëåííîé
ôîðìå ýòè çíà÷åíèÿ ñîñòàâëÿþò 0.174 è 0.114å.
Íåýìïèðè÷åñêèìè è ïîëóýìïèðè÷åñêèìè
ðàñ÷åòàìè ïîêàçàíî, ÷òî â êîìïëåêñàõ 1,3[Ëþìèôëàâèí … Î2] è 1,3[Î2 …His516+ ]+ òî÷êà ìè-
Êîáçåâ Ã.È.
Ñïèíîâûå ýôôåêòû â ôåðìåíòàòèâíûõ ðåàêöèÿõ îêèñëåíèÿ ñóáñòðàòîâ êèñëîðîäîì
Òàáëèöà 4. Ïîëíàÿ, êîððåëÿöèîííàÿ ýíåðãèÿ è ðàñïðåäåëåíèå ñïèíîâîé ïëîòíîñòè íà àòîìàõ êîìïëåêñà 3[His++ 3Î2]+
ïðè ïåðåìåííîì çíà÷åíèè R2, ïîëó÷åííûå ìåòîäîì àb initio â ðàìêàõ íåîãðàíè÷åííîãî ìåòîäà Õàðòðè-Ôîêà
Ñèìâîë
è íîìåð àòîìà
O13
O14
N15
C16
C17
N18
C19
Eïîëí.
MP2
E
Total
Ó MP
2
R2=1,5; Å
0
-0,001
-0,088
0
0
0
-0,061
-340103,31
-5,01
R2=2; Å
0,666
0,331
0
0
0
0
0
-379536,28
-59,06
-340108,33
-379595,34
Ñïèíîâûå ïëîòíîñòè
R2=3; Å
0
0
0
0
-0,002
0
0
-351594,66
-17,520
-351612,18
R2=4; Å
0,497
0,503
0,007
0,003
0
0
0
-381413,53
-67,26
R2=5; Å
0,604
0,396
0,004
0,524
0,549
0,004
0
-325322,75
-22,93
-381480,79
-325543,68
Òàáëèöà 5. Ïîëíàÿ, êîððåëÿöèîííàÿ ýíåðãèÿ è ðàñïðåäåëåíèå ñïèíîâîé ëîòíîñòè íà àòîìàõ êîìïëåêñà 3[His++ 3Î2]+
ïðè ïåðåìåííîì çíà÷åíèè R2, ðàññ÷èòàííûå ìåòîäîì ÐÌ3 â ðàìêàõ íåîãðàíè÷åííîãî ìåòîäà Õàðòðè-Ôîêà
Ñèìâîë
è íîìåð àòîìà
O13
O14
N15
C16
C17
N18
C19
ñ His
Eïîëí,
0
ÄH f
R2=1,5; Å
1,076
0,909
0,008
0,015
-0,011
0,006
0,001
0,019
-58007,05
R2=2; Å
1,068
0,930
0,005
-0,005
0,005
-0,002
-0,001
0,002
-58033,86
116,03
89,23
Ñïèíîâûå ïëîòíîñòè
R2=3; Å
1,038
0,962
0
0
0
0,001
-0,001
0
-58042,73
80,35
R2=4; Å
1,023
0,977
0
0
0
0,001
-0,001
0
-58043,22
R2=5; Å
1,015
0,985
0,001
0
0
0
-0,001
0
-58043,0
79,86
79,82
Òàáëèöà 6. Ðàñïðåäåëåíèå ñïèíîâîé ïëîòíîñòè íà àòîìàõ êîìïëåêñà 3[His++ 3Î2]1 è ïîëíàÿ ýíåðãèÿ ïðè ïåðåìåííîì
Ñèìâîë
è íîìåð àòîìà
O13
O14
N15
C16
C17
N18
C19
ñ(His)
Eïîëí,
R2=1,5; Å
0,993
0,970
0,038
0,006
0,001
0,001
0,005
0,051
-99540,57
R2=2; Å
1,018
0,978
0,005
0
0
0
0
0,005
-99539,5
íèìóìà ïîëíîé ýëåêòðîííîé ýíåðãèè ñîîòâåòñòâóåò ìèíèìóìó êðèâîé îáìåííî-êîððåëÿöèîííîé ýíåðãèè, â êîòîðîé Ì(b–a) áóäåò ìàêñèìàëüíûì è, êàê ñëåäñòâèå, ãåíåðàöèÿ ñèíãëåòíîãî êèñëîðîäà áóäåò îáëåã÷åíà. Ðàñ÷åòû
ñî âñåé î÷åâèäíîñòüþ ñâèäåòåëüñòâóþò, ÷òî
êèñëîðîä ñòðåìèòñÿ çàíÿòü òàêîå ïîëîæåíèå â
êîìïëåêñå, â êîòîðîì îí áóäåò íàèáîëåå àêòèâèðîâàí.
Ñïèíîâûå ïëîòíîñòè
R2=3; Å
1,022
0,978
0
0
0
0
0
0
-99534,18
R2=4; Å
1,013
0,987
0
0
0
0
0
0
-99534,02
R2=5; Å
1,009
0,991
0
0
0
0
0
0
-99533,99
Ìåõàíèçì ñíÿòèÿ ñïèíîâîãî çàïðåòà â õèìè÷åñêèõ ðåàêöèÿõ îêèñëåíèÿ êèñëîðîäîì ìîæåò áûòü îñíîâàí íà èíäóöèðîâàíèè ìàêñèìàëüíîé âåëè÷èíû ìîìåíòà ïåðåõîäà Ì(b–a) â
êèñëîðîäå, à òàêæå ñâÿçàí ñ èçìåíåíèåì ñïèíîâîé ïëîòíîñòè íà àòîìàõ òðèïëåòíîãî ìîëåêóëÿðíîãî êèñëîðîäà âñëåäñòâèå âîçíèêíîâåíèÿ
îáìåííî-êîððåëÿöèîííîãî ïîòåíöèàëà â êèñëîðîäíûõ êîìïëåêñàõ.
Ñïèñîê èñïîëüçîâàííîé ëèòåðàòóðû:
1. Óàéò À., Õåíäëåð Ô., Ñìèò Ý., Õèëë Ð., Ëåìàí È. Îñíîâû áèîõèìèè. Ò. 1. – Ì.: Ìèð, 1981. – 532 ñ.
2. Ìåöëåð. Áèîõèìèÿ. Ò 2, ñ. 134. Ì.: Ìèð, 1980. – 560 ñ.
ÂÅÑÒÍÈÊ ÎÃÓ 9`2005
149
Åñòåñòâåííûå íàóêè
3. Ìàëåð Ã., Êîðäåñ Þ. Îñíîâû áèîëîãè÷åñêîé õèìèè. Ì.: Ìèð, 1970. – 560 ñ.
4. Êðåòîâè÷ Â.Ë. Áèîõèìèÿ ðàñòåíèé: Ó÷åáíèê äëÿ áèîë. Ôàêóëüòåòîâ óí-òîâ. Ì.: Âûñøàÿ øêîëà,1980. – 445 ñ.
5. Ïëåøêîâ Á.Ï. Áèîõèìèÿ ñåëüñêîõîçÿéñòâåííûõ ðàñòåíèé. – 5-å èçä., äîï. è ïåðåðàá. – Ì.: Àãðîïðîìèçäàò, 1987. – 494 ñ.
6. Ìåðçëÿê Ì.Í., Àêòèâèðîâàííûé êèñëîðîä è æèçíåäåÿòåëüíîñòü ðàñòåíèé, // Ñîðîñîâñêèé îáðàçîâàòåëüíûé æóðíàë. – 1999,
¹9, ñ 15.
7. Ìèíàåâ Á.Ô., Ìèíàåâà Â. À., Ëåùåíêî Â. Í. // Æ. Áèîïîëèìåðû è êëåòêà (Óêðàèíà), 2004. Ò. 20, ¹3. Ñ. 224-232.
8. Ìèíàåâ Á. Ô. Ýëåêòðîííûå ìåõàíèçìû áèîàêòèâàöèè ìîëåêóëÿðíîãî êèñëîðîäà. // Óêðàèíñêèé áèîõèìè÷åñêèé æóðíàë. –
2002. – V. 74. – ¹3. – Ñ. 6-14.
9. Minaev B. Spin effects in reductive activation of O2 by oxidase enzymes. // RIKEN Rev. – 2002. – V. 44. – P. 147-149.
10. Prabhakar R., Siegbahn P., Minaev B.F., Ågren H. Activation of triplet dioxigen by glucose oxidase. // J. Phys. Chem. Â. – 2002. –
V. 106. – P. 3742-3750.
11. Klinman J. P. Life as aerobes: are there simple rules for activation of Cavelier G., Amzel L.M. Mechanism of NAD(P)H:Quinone
Reductase: Ab Initio Studies of Reduced Flavin. // PROTEINS: Structure, Function and Genetics. – 2001. – V. 43. – P. 420-432.
12. Meyer M. Density functional study of isoalloxazine and C4a-hydroperoxidihydroisoalloxazine. // J. Mol. Struct. – 1997. – V. 417. –
P. 163-168.
13. Êóòîâàÿ Î.Â., Êîáçåâ Ã.È.. Ïîëÿðèçàöèÿ ñïèíîâîé ïëîòíîñòè íà FAD è His516+ ïðè àêòèâàöèè êèñëîðîäàâ êàòàëèòè÷åñêîì
öèêëå. // Ìàòåð. Ìåæäóí. êîíô. ñòóä. è àñïèð. ïî ôóíä. íàóêàì «Ëîìîíîñîâ-2004». Ñåêöèÿ «Õèìèÿ», ò.2. Ì.,2004. ñ.128Ò.
14. Minaev B.F., Lunell S., Kobzev G.I.. The influence of intermolecular interaction On the forbidden near-IR transitions in molecular
Oxygen. // J. of Mol. Struct.(Theochem) 284. 1993 ñ. 1-9
15. Minaev B.F., Lunell S., Kobzev G.I.. Collision-induced intensity of the b ( 1Sg+)®a(1Dg) transition in molecular oxygen: Model
calculations for the collision complex O2+H2. // Int. J.Quant. Chem.V.50, 1994 ñ. 279-292.
16. Êîáçåâ Ã.È. Çàâèñèìîñòü ìîìåíòîâ ïåðåõîäîâ (a-X) è (b-a) â êèñëîðîäå îò ñòðóêòóðû è ÷èñëà ìîëåêóë â ñðåäå è èõ âçàèìíîé
îðèåíòàöèè. // Òðóäû VII Ìåíäåëååâñêîãî ñúåçäà ïî îáùåé è ïðèêëàäíîé õèìèè Êàçàíü 19-24 ñåíòÿáðÿ 2003 ã ò.1. ñ. 140.
17. Êîáçåâ Ã.È. Ìóëäàõìåòîâ Ç.Ì.,Ôåäóëîâà È.Â. Ïåðåíîñ ýíåðãèè îò ñåíñèáèëèçàòîðà è êèñëîðîäà íà ðàñòâîðèòåëü â òðèìîëåêóëÿðíîì êîìïëåêñå O2…CH3OH…C2H4. // Òðóäû ìåæäóíàðîäíîé íàó÷íîé è íàó÷íî-ìåòîäè÷åñêîé êîíôåðåíöèè «Íàóêà
è îáðàçîâàíèå 1997», ïîñâÿùåííîé 1500-ëåòèþ ã. Òóðêåñòàíà è 60-ëåòèþ èíñòèòóòà. – Øûìêåíò, 1997. – ñ.337-338.
18. Êîáçåâ Ã.È. Ìèíàåâ Á.Ô., Ìóëäàõìåòîâ Ç.Ì., Ìàðòûíîâ Ñ.È., Áåçíîñþê Ñ.À., Ìîçãîâàÿ Ò.À. Ìåõàíèçì âîçðàñòàíèÿ
èíòåíñèâíîñòè a(1 Dg) – b (1Sg+) ïåðåõîäà â ìîëåêóëå êèñëîðîäà ïîä âëèÿíèåì ìåæìîëåêóëÿðíîãî âçàèìîäåéñòâèÿ. // Îïòèêà
è ñïåêòðîñêîïèÿ 1997. – ò.83, ¹1, ñ. 64-68.
19. Ìèíàåâ Á.Â., Ìóëäàõìåòîâ Ç.Ì., Ôåäóëîâà Å.È., Èâàíîâà Í.Ì., Êîáçåâ Ã.È. Êîîïåðàòèâíîå âëèÿíèå ìîëåêóë Ñ2H4 è Í2 íà
ïåðåõîäû b-a è a-X â ìîëåêóëå Î 2 â òðîéíîì êîìïëåêñå. // Æóðí. «ïðèêëàäíîé ñïåêòðîñêîïèè.» (ÆÏÑ). 2000. – ¹4, ò.67,
ñ.453-456.
20. Êîáçåâ Ã.È., Ìèíàåâ Á.Ô., Ìóëäàõìåòâ Ç.Ì., Íóðòàêàíîâà Æ.Ó. Èññëåäîâàíèå a( 1 Dg) ® Õ(4åg-) è b(1Sg+)®(1 Dg) èçëó÷àòåëüíûõ ïåðåõîäîâ â òðîéíîì êîìïëåêñå ñòîëêíîâåíèé Î2…Ñ2H4…Í2Î. // Òðóäû ìåæäóíàðîäíîé íàó÷íîé êîíôåðåíöèè «Íàóêà
è îáðàçîâàíèå – âåäóùèé ôàêòîð ñòðàòåãèè «Êàçàõñòàí – 2030». – Êàðàãàíäà, 2000. – ñ.381 –384
21. Minaev B.F., Kobzev G.I. Response calculations of electronic and vibrational transitions in molecular oxygen induced by interaction
with noble gases // J. Spectrochimica Acta Part A 00 (2003) p.1-24.
22. Êîáçåâ Ã.È. Çàâèñèìîñòü ýëåêòðîäèïîëüíûõ ìîìåíòîâ ïåðåõîäîâ Ì(à-Õ) È Ì(b-a) â Î 2 îò âçàèìíîãî ðàñïîëîæåíèÿ ìîëåêóë Ñ2Í4 è N2 â òðîéíîì êîìïëåêñå ñòîëêíîâåíèé Ñ2Í4 – Î2 – N2. // Òðóäû ðåãèîíàëüíîé øêîëû-ñåìèíàðà êâàíòîâî-õèìè÷åñêèå ðàñ÷åòû: ñòðóêòóðà è ðåàêöèîííàÿ ñïîñîáíîñòü îðãàíè÷åñêèõ è íåîðãàíè÷åñêèõ ìîëåêóë. Èâàíîâî 12-15 àïðåëÿ 2003ã.ñ.812
23. Êîáçåâ Ã.È. Òåîðåòè÷åñêîå èññëåäîâàíèå îñíîâíîãî è ïåðâûõ âîçáóæäåííûõ ýëåêòðîííûõ ñîñòîÿíèé êèñëîðîäíûõ êîìïëåêñîâ ñòîëêíîâåíèé. // Àâòîðåô. äèñ… êàíäõèì. íàóê: Êàðàãàíäà, 1996. 24 ñ.
24. Áó÷à÷åíêî À.À., Ñàãäååâ Ð.Ç., Ñàëèõîâ Ê.Ì. Ìàãíèòíûå è ñïèíîâûå ýôôåêòû â õèìè÷åñêèõ ðåàêöèÿõ. – Íîâîñèáèðñê:
Íàóêà, 1978. –366 ñ. Áó÷à÷åíêî À.Ë., Áåðäèíñêèé Â.Ë.. // Êèíåòèêà è Êàòàëèç, 1996. 37, Ñ. 615.
25. Øåêà Å.Ô. Î ïðèðîäå õèìè÷åñêîé àêòèâíîñòè ôóëëåðåíà Ñ60 // â ïå÷àòè.
26. Òåðíåé À. Ñîâðåìåííàÿ îðãàíè÷åñêàÿ õèìèÿ. Ò2. – Ì.: Ìèð, 1981. – 651ñ.
150
ÂÅÑÒÍÈÊ ÎÃÓ 9`2005
Download