ÐÎÑÑÈÉÑÊÀß ÔÅÄÅÐÀÖÈß (19) RU (11) 2 302 460 (13) C1 (51) ÌÏÊ C12N 15/09 C12N 15/24 (2006.01) (2006.01) ÔÅÄÅÐÀËÜÍÀß ÑËÓÆÁÀ ÏÎ ÈÍÒÅËËÅÊÒÓÀËÜÍÎÉ ÑÎÁÑÒÂÅÍÍÎÑÒÈ, ÏÀÒÅÍÒÀÌ È ÒÎÂÀÐÍÛÌ ÇÍÀÊÀÌ (12) ÎÏÈÑÀÍÈÅ ÈÇÎÁÐÅÒÅÍÈß Ê ÏÀÒÅÍÒÓ (21), (22) Çà âêà: 2005133963/13, 02.11.2005 (24) Äàòà íà÷àëà îòñ÷åòà ñðîêà äåéñòâè ïàòåíòà: 02.11.2005 (45) Îïóáëèêîâàíî: 10.07.2007 Áþë. ¹ 19 Àäðåñ äë ïåðåïèñêè: 630090, ã.Íîâîñèáèðñê, ïð-êò àêàä. Ëàâðåíòüåâà, 10, ÈÖèà ÑÎ ÐÀÍ, ïàòåíòíûé îòäåë (73) Ïàòåíòîîáëàäàòåëü(è): Èíñòèòóò öèòîëîãèè è ãåíåòèêè Ñèáèðñêîãî îòäåëåíè Ðîññèéñêîé àêàäåìèè íàóê (ÑÎ ÐÀÍ) (RU), Èíñòèòóò õèìè÷åñêîé áèîëîãèè è ôóíäàìåíòàëüíîé ìåäèöèíû Ñèáèðñêîãî îòäåëåíè Ðîññèéñêîé àêàäåìèè íàóê (ÑÎ ÐÀÍ) (RU) (54) ÐÅÊÎÌÁÈÍÀÍÒÍÀß ÏËÀÇÌÈÄÍÀß ÄÍÊ pBi101-IL18, ÊÎÄÈÐÓÞÙÀß ÑÈÍÒÅÇ 2 3 0 2 4 6 0 ôåðìåíòîì òðîìáèíîì, - 5'UTR îáëàñòè èç ãåíîìà âèðóñà ãðàâèðîâêè òàáàêà; - äâîéíîé 35S CaMV ïðîìîòîðà èç ãåíîìà âèðóñà ìîçàèêè öâåòíîé êàïóñòû; - 3'UTR îáëàñòü èç ãåíîìà âèðóñà ìîçàèêè öâåòíîé êàïóñòû. Èçîáðåòåíèå îáåñïå÷èâàåò ïåðåíîñ íóêëåîòèäíîé ïîñëåäîâàòåëüíîñòè ÈË-18 ÷åëîâåêà â ãåíîìíóþ ÄÍÊ ðàñòåíèé è ïðîäóêöèþ çðåëîé ôîðìû èíòåðëåéêèíà 18 ÷åëîâåêà, îáëàäàþùåé áèîëîãè÷åñêîé àêòèâíîñòüþ. 2 èë., 1 òàáë. R U (57) Ðåôåðàò: Èçîáðåòåíèå îòíîñèòñ ê áèîòåõíîëîãèè, â ÷àñòíîñòè ê ãåíåòè÷åñêîé èíæåíåðèè âûñøèõ ðàñòåíèé. Êîíñòðóèðóþò ðåêîìáèíàíòíóþ ïëàçìèäíóþ ÄÍÊ pBi101-IL18, ðàçìåðîì 15 ò.ï.í., ñîäåðæàùóþ ôðàãìåíò ÄÍÊ âåêòîðíîé ïëàçìèäû pBi101, ðàçìåðîì 13,9 ò.ï.í; - NdeI-BamHI/BglII ôðàãìåíòà ÄÍÊ, âë þùåãîñ ó÷àñòêîì êÄÍÊ ãåíà ÈË-18 ÷åëîâåêà; - NcoI-NdeI ôðàãìåíòà ïëàçìèäû ðÅÒ15b; êîäèðóþùèé N-êîíöåâîé ïîëèïåïòèä èç øåñòè àìèíîêèñëîò ãèñòèäèíà è ñàéò ãèäðîëèçà Ñòðàíèöà: 1 RU C 1 C 1 ÈÍÒÅÐËÅÉÊÈÍÀ-18 ×ÅËÎÂÅÊÀ  ÒÐÀÍÑÃÅÍÍÛÕ ÐÀÑÒÅÍÈßÕ 2 3 0 2 4 6 0 (56) Ñïèñîê äîêóìåíòîâ, öèòèðîâàííûõ â îò÷åòå î ïîèñêå: ZHANG Â, et al «Expression and production of bioactive human interleukin-18 in transgenic tobacco plants», Biotechnol Lett. 2003, 25(19): 1629-1635. ÑÀ 1340978, 02.05.2000. RU 1703693 A1, 07.01.1992. R U (72) Àâòîð(û): Òóð÷èíîâè÷ Àíäðåé Àëåêñååâè÷ (RU), Äåéíåêî Åëåíà Âèêòîðîâíà (RU), Ôèëèïåíêî Ìàêñèì Ëåîíèäîâè÷ (RU), Øóìíûé Âëàäèìèð Êîíñòàíòèíîâè÷ (RU), Õðàïîâ Åâãåíèé Àëåêñàíäðîâè÷ (RU), Ñåííèêîâ Ñåðãåé Âèòàëüåâè÷ (RU) RUSSIAN FEDERATION RU (19) (11) 2 302 460 (13) C1 (51) Int. Cl. C12N 15/09 C12N 15/24 (2006.01) (2006.01) FEDERAL SERVICE FOR INTELLECTUAL PROPERTY, PATENTS AND TRADEMARKS (12) ABSTRACT OF INVENTION (21), (22) Application: 2005133963/13, 02.11.2005 (24) Effective date for property rights: 02.11.2005 (45) Date of publication: 10.07.2007 Bull. 19 Mail address: 630090, g.Novosibirsk, pr-kt akad. Lavrent'eva, 10, ITsiG SO RAN, patentnyj otdel (54) RECOMBINANT PLASMID DNA pBi101-IL18 ENCODING HUMAN INTERLEUKIN-18 SYNTHESIS 2 3 0 2 4 6 0 R U hydrolysis, -5'URT region from genome of tobacco etch virus; double 35S CaMV promoter from genome of cauliflower mosaic virus; -3'URT region from genome of cauliflower mosaic virus. Method of present invention makes it possible to transfer nucleotide sequence of human IL-18 in plant genomic DNA. EFFECT: method for production of mature human IL-18 having biological activity. 2 dwg, 1 tbl, 3 ex Ñòðàíèöà: 2 EN C 1 C 1 IN TRANSGENIC PLANTS (57) Abstract: FIELD: biotechnology, in particular plant gene engineering. SUBSTANCE: recombinant plasmid DNA pBi101IL18 is constructed having length of 15000 n.p. and containing DNA fragment of pBi101-IL18 vector plasmide having length of 13900 n.p.; -NdeIBamHI/BgIII DNA fragment being cDNA site of human IL-18 gene; -Nol-NdeI fragment of pET15b plasmide; encoding N-terminal polypeptide from six hystidine amino acids and site of thrombin enzyme 2 3 0 2 4 6 0 (73) Proprietor(s): Institut tsitologii i genetiki Sibirskogo otdelenija Rossijskoj akademii nauk (SO RAN) (RU), Institut khimicheskoj biologii i fundamental'noj meditsiny Sibirskogo otdelenija Rossijskoj akademii nauk (SO RAN) (RU) R U (72) Inventor(s): Turchinovich Andrej Alekseevich (RU), Dejneko Elena Viktorovna (RU), Filipenko Maksim Leonidovich (RU), Shumnyj Vladimir Konstantinovich (RU), Khrapov Evgenij Aleksandrovich (RU), Sennikov Sergej Vital'evich (RU) RU 2 302 460 C1 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 Èçîáðåòåíèå îòíîñèòñ ê îáëàñòè áèîòåõíîëîãèè, â ÷àñòíîñòè ê ãåíåòè÷åñêîé èíæåíåðèè âûñøèõ ðàñòåíèé, è ìîæåò áûòü èñïîëüçîâàíî äë ñîçäàíè ðàñòèòåëüíûõ ïðîäóöåíòîâ èíòåðëåéêèíà-18 (ÈË-18) ÷åëîâåêà. Òðàíñãåííûå ðàñòåíè -ïðîäóöåíòû ÈË-18 ÷åëîâåêà ìîãóò áûòü èñïîëüçîâàíû äë ïåðîðàëüíîé äîñòàâêè ÈË-18 ê ñëèçèñòûì òîíêîãî êèøå÷íèêà, à òàêæå äë âûäåëåíè ÈË-18 â ÷èñòîì âèäå äë ôàðìàêîëîãèè. Èçâåñòíî, ÷òî ÈË-18 âë åòñ ïåðñïåêòèâíûì ïðîòèâîîïóõîëåâûì ïðåïàðàòîì, òàê êàê îáëàäàåò íåïîñðåäñòâåííûì öèòîòîêñè÷åñêèì ýôôåêòîì ïî îòíîøåíèþ ê ðàêîâûì êëåòêàì, çà ñ÷åò èíäóêöèè àïîïòîçà, ñòèìóëèðóåò ïðîäóêöèþ äðóãèõ öèòîêèíîâ, èãðàþùèõ êëþ÷åâóþ ðîëü ïðè óíè÷òîæåíèè îïóõîëè, à òàêæå ïîâûøàåò öèòîòîêñè÷íîñòü Ò-êèëëåðîâ è NK-êëåòîê ïî îòíîøåíèþ ê ðàêîâûì êëåòêàì (Dinarello Ñ. // METHODS. 1999, V.19, Ð.121-122). ÈË-18 ïîâûøàåò àíòèãåíïðåäñòàâë þùèå ñïîñîáíîñòè ìàêðîôàãîâ è ìîæåò èñïîëüçîâàòüñ êàê àäúþâàíò ïðè èììóíèçàöèè âàêöèíàìè. Îñîáûé èíòåðåñ ïðåäñòàâë åò èñïîëüçîâàíèå ÈË18 â êà÷åñòâå ìóêîçíîãî àäúþâàíòà ïðè èììóíèçàöèè æèâîòíîãî îðãàíèçìà «ñúåäîáíûìè âàêöèíàìè». Èçâåñòíà ðåêîìáèíàíòíà ïëàçìèäíà ÄÍÊ, êîäèðóþùà ñèíòåç çðåëîé ôîðìû ÈË-18 ÷åëîâåêà â êëåòêàõ E.coli, ñêîíñòðóèðîâàííà íà îñíîâå áàêòåðèàëüíîãî ýêñïðåññèðóþùåãî âåêòîðà ðÊÊ223-3 (Ushio S., Namba M., Okura Ò. et al. // The J. Immunol. 1996, V.156, P.4274-4279). Âåêòîð îáåñïå÷èâàåò âûñîêèé óðîâåíü ïðîäóêöèè ÈË18 â áàêòåðè õ. Îäíàêî â ïðîêàðèîòè÷åñêèõ êëåòêàõ íå ïðîèñõîäèò ïðàâèëüíîé óêëàäêè ïîëèïåïòèäíîé öåïè ÈË-18, âñëåäñòâèå ÷åãî áåëîê íàêàïëèâàåòñ â âèäå íåðàñòâîðèìûõ âíóòðèêëåòî÷íûõ àãðåãàòîâ. Äë äàëüíåéøåãî ïðåâðàùåíè ðåêîìáèíàíòíîãî áåëêà â ðàñòâîðèìóþ è áèîëîãè÷åñêè àêòèâíóþ ôîðìó òðåáóþòñ äîðîãîñòî ùèå è äëèòåëüíûå ïðîöåäóðû ðåôîëäèíãà. Äðóãèì íåäîñòàòêîì ïðîêàðèîòè÷åñêèõ ñèñòåì ýêñïðåññèè âë åòñ âîçìîæíà êîíòàìèíàöè öåëåâîãî áåëêà áàêòåðèàëüíûìè òîêñèíàìè. Íàèáîëåå áëèçêîé ê çà âë åìîé ïëàçìèäå - ïðîòîòèïîì, âë åòñ ðåêîìáèíàíòíà ïëàçìèäíà ÄÍÊ pBin/hIL-18, â êîòîðîé íóêëåîòèäíà ïîñëåäîâàòåëüíîñòü ïðî-ÈË-18 âñòðîåíà â ýêñïðåññèîííûé âåêòîð pBin438, ïîä êîíòðîëü äâîéíîãî ïðîìîòîðà 35S âèðóñà ìîçàèêè öâåòíîé êàïóñòû (Zhang Â., Yang Y.H., Lin Y.M. et al. // Biotechnol Lett., 2003, V.25, P.1629-1635). Èçâåñòíà ïëàçìèäà pBin/hIL-18 ðàçìåðîì 14 ò.ï.í. ñîäåðæèò: - BamHI-SalI ôðàãìåíò ÄÍÊ ïëàçìèäû pCI-18, ðàçìåðîì 0,58 ò.ï.í., êîäèðóþùèé ïðîÈË18 ÷åëîâåêà, à òàêæå ñàéòû ðåñòðèêöèè, ðåãóë òîðíûå ó÷àñòêè, ãåíåòè÷åñêèå ìàðêåðû. - ÄÍÊ âåêòîðíîé ïëàçìèäû pBin438 ðàçìåðîì 13,5 ò.ï.í Îñíîâíîé íåäîñòàòîê äàííîé ïëàçìèäíîé ÄÍÊ çàêëþ÷àþòñ â òîì, ÷òî â êà÷åñòâå ïåðåíîñèìîãî ãåíà â íåé ñîäåðæèòñ ïîñëåäîâàòåëüíîñòü ÄÍÊ, êîäèðóþùà áèîëîãè÷åñêè íåàêòèâíûé ïðåäøåñòâåííèê ÈË-18 ÷åëîâåêà (ïðîÈË-18) ñ ìîëåêóë ðíûì âåñîì 24 êÄà. Êðîìå òîãî, â èçâåñòíîé ïëàçìèäíîé ÄÍÊ çàêîäèðîâàí áåëîê, íå ñîäåðæàùèé êàêîãî-ëèáî ó÷àñòêà, îáëàäàþùåãî âûñîêèì ñðîäñòâîì ê èçâåñòíûì õðîìàòîãðàôè÷åñêèì ñîðáåíòàì, ÷òî çàòðóäí åò âîçìîæíîñòü âûäåëåíè òàêîãî áåëêà ìåòîäàìè àôôèííîé õðîìàòîãðàôèè. Òåõíè÷åñêîé çàäà÷åé èçîáðåòåíè âë åòñ ñîçäàíèå ðåêîìáèíàíòíîé ïëàçìèäíîé ÄÍÊ, îáåñïå÷èâàþùåé ïðîäóêöèþ çðåëîé áèîëîãè÷åñêè àêòèâíîé ôîðìû ÈË-18 ÷åëîâåêà â òðàíñãåííûõ ðàñòåíè õ. Ïîñòàâëåííà çàäà÷à äîñòèãàåòñ íîâîé ñêîíñòðóèðîâàííîé ïëàçìèäíîé ÄÍÊ pBi101IL18 ðàçìåðîì 15 ò.ï.í., îáåñïå÷èâàþùåé ïåðåíîñ öåëåâîé ïîñëåäîâàòåëüíîñòè ÄÍÊ â ãåíîì ðàñòåíèé è ýêñïðåññèþ ãåíà ÈË-18 ÷åëîâåêà. Ñïîñîá êîíñòðóèðîâàíè çàêëþ÷àåòñ â êëîíèðîâàíèè ó÷àñòêà êÄÍÊ ãåíà ÈË-18 ÷åëîâåêà â ïëàçìèäå ðÅÒ15b+ ñîâìåñòíî ñ íóêëåîòèäíîé ïîñëåäîâàòåëüíîñòüþ øåñòè àìèíîêèñëîò ãèñòèäèíà è ñàéòà ãèäðîëèçà ôåðìåíòîì òðîìáèíîì. Íà ñëåäóþùåì ýòàïå ôðàãìåíò ÄÍÊ, ñîñòî ùèé èç íóêëåîòèäíîé ïîñëåäîâàòåëüíîñòè ïîëèãèñòèäèíà, òðîìáèíîâîãî ñàéòà è ÈË-18 ÷åëîâåêà ïåðåíîñ ò â ïëàçìèäó pAVA321 ïî ñàéòàì ðåñòðèêöèè NcoI/BglII. Ïëàçìèäà pAVA321 ñîäåðæèò ôóíêöèîíàëüíûå ýëåìåíòû, íåîáõîäèìûå äë ýêñïðåññèè öåëåâîãî ãåíà â ðàñòåíèè. Íà çàêëþ÷èòåëüíîì ýòàïå êëîíèðîâàíè Sail-BamHI ôðàãìåíò ïëàçìèäíîé ÄÍÊ pAVA321, ñîäåðæàùèé ãåí ÈË-18 ÷åëîâåêà ïîä óïðàâëåíèåì ðàñòèòåëüíûõ ýëåìåíòîâ ýêñïðåññèè, ñóáêëîíèðóþò â ïîëèëèíêåð Ò-ÄÍÊ îáëàñòè áèíàðíîé âåêòîðíîé ïëàçìèäû pBi101.  Ñòðàíèöà: 3 DE RU 2 302 460 C1 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 ðåçóëüòàòå ïîëó÷àþò ðåêîìáèòíàíòíóþ ïëàçìèäíóþ ÄÍÊ pBi101-IL18 ðàçìåðîì 15 ò.ï.í., îáåñïå÷èâàþùóþ ïåðåíîñ öåëåâîé ïîñëåäîâàòåëüíîñòè ÄÍÊ â ãåíîì ðàñòåíèé è ýêñïðåññèþ ãåíà ÈË-18 ÷åëîâåêà. Ïëàçìèäà ñîñòîèò èç ñëåäóþùèõ ýëåìåíòîâ: - ÄÍÊ âåêòîðíîé ïëàçìèäû pBi101 ðàçìåðîì 13,9 ò.ï.í; - NdeI-BamHI/BglII ôðàãìåíòà ÄÍÊ, âë þùåãîñ ó÷àñòêîì êÄÍÊ ãåíà ÈË-18 ÷åëîâåêà; - NcoI-NdeI ôðàãìåíòà ïëàçìèäû ðÅÒ15b; - 5'UTR îáëàñòè èç ãåíîìà âèðóñà ãðàâèðîâêè òàáàêà; - Äâîéíîãî 35S CaMV ïðîìîòîðà èç ãåíîìà âèðóñà ìîçàèêè öâåòíîé êàïóñòû; - 3'UTR îáëàñòè èç ãåíîìà âèðóñà ìîçàèêè öâåòíîé êàïóñòû. Ôèçè÷åñêà êàðòà ïëàçìèäû pBi101-IL18 ñ óêàçàíèåì ãåíåòè÷åñêèõ ìàðêåðîâ ïðèâåäåíà íà ôèã.1, ãäå 6xHis - ïîñëåäîâàòåëüíîñòü ÄÍÊ, êîäèðóþùà øåñòü àìèíîêèñëîòíûõ îñòàòêîâ ãèñòèäèíà; Trs - ïîñëåäîâàòåëüíîñòü ÄÍÊ, êîäèðóþùà ñàéò óçíàâàíè ôåðìåíòîì òðîìáèíîì; IL-18 - íóêëåîòèäíà ïîñëåäîâàòåëüíîñòü çðåëîé ôîðìû ÈË-18 ÷åëîâåêà; 35SCaMV - äâîéíîé ïðîìîòîð ãåíà 35S ÐÍÊ âèðóñà ìîçàèêè öâåòíîé êàïóñòû; TL - ëèäåðíà ïîñëåäîâàòåëüíîñòü òðàíñë öèè èç ãåíîìà âèðóñà ãðàâèðîâêè òàáàêà; TcaMV - òåðìèíàòîð ãåíà 35S ÐÍÊ âèðóñà ìîçàèêè öâåòíîé êàïóñòû; LB, RB - ëåâà è ïðàâà ãðàíèöû Ò-ÄÍÊ îáëàñòè; PNOS - ïðîìîòîð ãåíà íîïàëèíñèíòåòàçû èç Ti-ïëàçìèäû Agrobacterium tumefaciens; NPTII-ãåí íåîìèöèíôîñôîòðàíñôåðàçûII; TNOS - òåðìèíàòîð ãåíà íîïàëèíñèíòåòàçû; Â-Glue - íóêëåîòèäíà ïîñëåäîâàòåëüíîñòü β -ãëþêóðîíèäàçû E.coli. Îòëè÷èå ïîëó÷åííîé ðåêîìáèíàíòíîé ïëàçìèäíîé ÄÍÊ îò ïðîòîòèïà ñîñòîèò â èñïîëüçîâàíèè íóêëåîòèäíîé ïîñëåäîâàòåëüíîñòè õèìåðíîãî áåëêà, ñîñòî ùåãî èç áåçëèäåðíîé (çðåëîé) ôîðìû ÈË-18 ÷åëîâåêà, N-êîíöåâîãî ïåïòèäà èç øåñòè àìèíîêèñëîò ãèñòèäèíà è ñàéòà ãèäðîëèçà ôåðìåíòîì òðîìáèíîì ìåæäó íèìè. Èñïîëüçîâàíèå òàêîé ïîñëåäîâàòåëüíîñòè ÄÍÊ â êà÷åñòâå öåëåâîãî ãåíà ïîçâîëèò ïîëó÷àòü ðàñòåíè ïðîäóöåíòû áèîëîãè÷åñêè àêòèâíîãî ÈË-18 ÷åëîâåêà, à òàêæå ñäåëàåò âîçìîæíûì âûäåëåíèå ðåêîìáèíàíòíîãî ÈË-18 â ÷èñòîì âèäå èç ðàñòåíèé ìåòîäàìè ìåòàëë-õåëàòíîé àôôèííîé õðîìàòîãðàôèè. Ñóùíîñòü èçîáðåòåíè ïî ñí åòñ ñëåäóþùèìè ïðèìåðàìè. Ïðèìåð 1. Êîíñòðóèðîâàíèå ïëàçìèäû pBi101-IL18. 10 ìêã ÄÍÊ ïëàçìèäû pBluescriptSK-IL18, ñîäåðæàùåé ôðàãìåíò êÄÍÊ ÈË-18 ÷åëîâåêà, îáðàáàòûâàëè ðåñòðèêòàçàìè FauNDI (100 å.à.) è BamHI (100 å.à.) â òå÷åíèå 1 ÷àñà ïðè 37°Ñ â 50 ìêë áóôåðà, ñîäåðæàùåãî 10 mM Tris-HCl ðÍ 7.6; 10 mM MgCl2; 50 mM NaCl; 1 mM DTT. Ãèäðîëèçàò ðàçäåë ëè ýëåêòðîôîðåçîì â 1,5% àãàðîçíîì ãåëå, ãåëü îêðàøèâàëè ðàñòâîðîì áðîìèñòîãî ýòèäè â âîäå (1 ìêã/ìë) è ôðàãìåíò ÄÍÊ ðàçìåðîì 460 ï.í. âûäåë ëè èç ãåë ìåòîäîì ñîðáöèè ÄÍÊ íà ñèëèêàãåëå. 10 ìêã ÄÍÊ ïëàçìèäû ðÅÒ15b ãèäðîëèçîâàëè ðåñòðèêòàçàìè FauNDI (100 å.à.) è BamHI (100 å.à.) 1 ÷àñ ïðè 37°Ñ â 50 ìêë áóôåðà, ñîäåðæàùåãî 10 mM Tris-HCl ðÍ 7.6; 10 mM MgCl2; 50 mM NaCl; 1 mM DTT. Ðåàêöèîííóþ ñìåñü ðàçäåë ëè ýëåêòðîôîðåçîì â 1,5% àãàðîçíîì ãåëå, ãåëü îêðàøèâàëè ðàñòâîðîì áðîìèñòîãî ýòèäè â âîäå (1 ìêã/ìë) è ôðàãìåíò ÄÍÊ ðàçìåðîì 5700 ï.í. âûäåë ëè èç ãåë ìåòîäîì ñîðáöèè ÄÍÊ íà ñèëèêàãåëå. Ñìåøèâàëè 0.03 ìêã FauNDI - BamHI ôðàãìåíòà ïëàçìèäû ðÅÒ15b è 3 ìêã FauNDI-BamHI ôðàãìåíòà ïëàçìèäû pBluescriptSK-IL18, ñîäåðæàùåãî íóêëåîòèäíóþ ïîñëåäîâàòåëüíîñòü ÈË-18 ÷åëîâåêà, â 10 ìêë áóôåðà, ñîäåðæàùåãî 50 mM Tris-HCl ðÍ 7.8; 10 mM MgCl2; 10 mM DTT; 1 mM ÀÒÐ; 25 mkg/ml BSA. Ê ñìåñè äîáàâë ëè 100 å.à ÄÍÊ-ëèãàçû ôàãà Ò4 è èíêóáèðîâàëè 10 ÷àñîâ ïðè 4°Ñ. 5 ìêë ëèãàçíîé ñìåñè èñïîëüçîâàëè äë òðàíñôîðìàöèè êîìïåòåíòíûõ êëåòîê E.coli øòàììà XLBlue. Òðàíñôîðìàíòû âûñåâàëè íà ÷àøêó ñ LBàãàðîì, ñîäåðæàùåì 100 ìêã/ìë àìïèöèëëèíà. Êëîíû, íåñóùèå ðåêîìáèíàíòíûå ïëàçìèäû ñî âñòðîåííûì ãåíîì, îòáèðàëè ìåòîäîì ÏÖÐ àíàëèçà ÄÍÊ îòäåëüíûõ êîëîíèé E.coli ñ ïðàéìåðàìè íà íóêëåîòèäíóþ ïîñëåäîâàòåëüíîñòü ÈË-18 ÷åëîâåêà. Ïëàçìèäíûå ÄÍÊ äâóõ êëîíîâ èç äåñ òè îòîáðàííûõ äë àíàëèçà, äàâøèõ ñèãíàë ÏÖÐ, ñîîòâåòñòâóþùèé ïî äëèíå íóêëåîòèäíîé ïîñëåäîâàòåëüíîñòè ÈË-18 ÷åëîâåêà, äîïîëíèòåëüíî àíàëèçèðîâàëè ñ ïîìîùüþ ãèäðîëèçà ðåñòðèêòàçàìè FauNDI è BamHI è ïîñëåäóþùèì ðàçäåëåíèåì Ñòðàíèöà: 4 RU 2 302 460 C1 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 ïðîäóêòîâ ãèäðîëèçà ãåëü-ýëåêòðîôîðåçîì â 1,5% àãàðîçå.  ðåçóëüòàòå ðåñòðèêöèîííîãî àíàëèçà ïîäòâåðæäåíà âñòðîéêà ÈË-18 â îáîèõ îòîáðàííûõ ïëàçìèäàõ. Bsp19I - BamHI ôðàãìåíò îäíîé èç òàêèõ ïëàçìèä (pET15b-IL18) èñïîëüçîâàëñ äë êîíñòðóèðîâàíè ïëàçìèäû pAVA321-IL18. Ñ ýòîé öåëüþ 2 ìêã ÄÍÊ ïëàçìèäû pAVA321 îáðàáàòûâàëè ðåñòðèêòàçàìè Bsp19I (100 å.à.) è BglII (100 å.à.) 1 ÷àñ ïðè 37°Ñ â 50 ìêë áóôåðà, ñîäåðæàùåãî 50 mM Tris-HCl ðÍ 7.6; 10 mM MgCl2; 100 mM NaCl; 1 mM DTT. 10 ìêã ïëàçìèäû pET15b-IL18 ãèäðîëèçîâàëè ðåñòðèêòàçàìè Bsp19I (100 å.à.) è BamHI (100 å.à.) â áóôåðå òîãî æå ñîñòàâà. Ïðîäóêòû ãèäðîëèçà ðàçäåë ëè â 1,5% àãàðîçíîì ãåëå. Âûäåë ëè ôðàãìåíòû ÄÍÊ ðàçìåðîì 4 ò.ï.í. è 540 ï.í. èç ïëàçìèä pAVA321 è pET15b-IL18 ñîîòâåòñòâåííî, êàê îïèñàíî âûøå. 0,1 ìêã ôðàãìåíòà ïëàçìèäíîé ÄÍÊ pAVA321 è 0,5 ìêã ôðàãìåíòà èç âåêòîðà pET15b-IL18 ñìåøèâàëè â 10 ìêë ëèãàçíîãî áóôåðà è îáðàáàòûâàëè ÄÍÊ-ëèãàçîé, êàê îïèñàíî âûøå. Ëèãàçíîé ñìåñüþ òðàíñôîðìèðîâàëè êîìïåòåíòíûå êëåòêè E.coli øòàììà XLBlue, òðàíñôîðìàíòû âûñåâàëè íà ÷àøêè ñ LB-àãàðîì, ñîäåðæàùèå 100 ìêã/ìë àìïèöèëèíà. Êëîíû, íåñóùèå ðåêîìáèíàíòíûå ïëàçìèäû ñî âñòðîåíûì ãåíîì ÈË-18 ÷åëîâåêà îòáèðàëè ÏÖÐ-àíàëèçîì. Ïëàçìèäíóþ ÄÍÊ îäíîãî êëîíà, äàâøåãî ïîëîæèòåëüíûé ÏÖÐ-ñèãíàë, àíàëèçèðîâàëè ñ ïîìîùüþ ãèäðîëèçà ðåñòðèêòàçàìè Bsp19I è BamHI è ïîñëåäóþùèì ðàçäåëåíèåì ïðîäóêòîâ ãèäðîëèçà ãåëü-ýëåêòðîôîðåçîì â 1,5% àãàðîçå. Ïî àíàëîãè÷íîé ñõåìå êëîíèðîâàíè SalI - BamHI ôðàãìåíò ÄÍÊ èç ïëàçìèäû pAVA321IL18 áûë ïåðåíåñåí â ïîëèëèíêåðíóþ îáëàñòü ïëàçìèäû pBi 101. Ïðèìåð 2. Ïîëó÷åíèå ìîíîèíñåðöèîííûõ òðàíñãåííûõ ðàñòåíèé. Ïîëó÷åííîé ïëàçìèäíîé ÄÍÊ pBi101-IL18 òðàíñôîðìèðîâàëè êëåòêè Agrobacterium tumefaciens (øòàìì LBA4404). Òðàíñôîðìàöèþ ðàñòåíèé òàáàêà Nicotiana tabacum (ëèíèè SRI) ïðîâîäèëè ìåòîäîì êîêóëüòèâàöèè ëèñòîâûõ äèñêîâ ñ ñóñïåíçèåé êëåòîê àãðîáàêòåðèé, êàê îïèñàíî â (Horsch R., Fry J., Hoffman N. et al. // Plant Molecular Biology Manual. Dordrecht. Kluwer Academic Publishers. 1988, P. A5/1-A5/9). Ïîëó÷åííûå ðåãåíåðàíòû âûðàùèâàëè íà ñðåäå Ìóðàøèãå è Ñêóãà (ÌÑ) (Murasige Ò., Skoog F. // Physiol. Plant. 1962, V.15, Ð.473-497), ñîäåðæàùåé 250 ìã/ë êëàôîðàíà è 50 ìã/ë êàíàìèöèíà. Ïîñëå ñàìîîïûëåíè ðàñòåíèé-ðåãåíåðàíòîâ Ò0 àíàëèçèðîâàëè ñîîòíîøåíèå óñòîé÷èâûõ è íåóñòîé÷èâûõ ê àíòèáèîòèêó ðàñòåíèé T1 ïîêîëåíè íà ñðåäå ñ êàíàìèöèíîì. Äë ýòîãî ñåìåíà T1 ïîêîëåíè ñòåðèëèçîâàëè 10%-íûì ðàñòâîðîì ãèïîõëîðèòà íàòðè è 96° ýòàíîëîì ïî ñòàíäàðòíîé ìåòîäèêå è âûñåâàëè íà ÷àøêè ñî ñðåäîé ÌÑ ñ äîáàâëåíèåì 100 ìã/ë êàíàìèöèíà. ×àøêè èíêóáèðîâàëè äâå íåäåëè ïðè 25°Ñ ñî ñòàíäàðòíûì ñâåòîâûì ðåæèìîì (16 ÷àñîâ ñâåò, 8 ÷àñîâ òåìíîòà) è ïîäñ÷èòûâàëè ñîîòíîøåíèå áåëûõ è çåëåíûõ ïðîðîñòêîâ. Ïîêàçàíî, ÷òî ýòî ñîîòíîøåíèå áëèçêî ê 3:1 ó 6 èç 30 ïðîàíàëèçèðîâàííûõ ëèíèé. Äë äàëüíåéøèõ èññëåäîâàíèé áûëè îòîáðàíû òîëüêî T1 ðàñòåíè , ñðåäè êîòîðûõ íàáëþäàëîñü äîñòîâåðíîå ðàñùåïëåíèå 3:1 ïî ïðèçíàêó êàíàìèöèíóñòîé÷èâîñòè. Íàëè÷èå íóêëåîòèäíîé ïîñëåäîâàòåëüíîñòè ÈË-18 ÷åëîâåêà â ãåíîìàõ îòîáðàííûõ ðàñòåíèé ïîäòâåðæäàëè ìåòîäîì ÏÖÐ ñ ïðàéìåðàìè íà íóêëåîòèäíóþ ïîñëåäîâàòåëüíîñòü ÈË-18. Ìîíîèíñåðöèîííîñòü ðàñòåíèé äîïîëíèòåëüíî àíàëèçèðîâàëè áëîò-ãèáðèäèçàöèåé HindIII - ãèäðîëèçàòîâ ãåíîìíûõ ÄÍÊ ðàñòåíèé ñ 32Ð ìå÷åíûì ôðàãìåíòîì êÄÍÊ ÈË-18 ÷åëîâåêà íà íèòðîöåëëþëîçíîé ìåìáðàíå. Àíàëèç óðîâí ýêñïðåññèè ÈË-18 ÷åëîâåêà ó òðàíñãåííûõ ðàñòåíèé ïðîâîäèëè ìåòîäîì Âåñòåðí-áëîòòèíãà ñ ïðèìåíåíèåì ïîëèêëîíàëüíûõ àíòèòåë êðîëèêà, ñïåöèôè÷íûõ ê ÈË-18 ÷åëîâåêà.  êà÷åñòâå âòîðè÷íûõ àíòèòåë èñïîëüçîâàëè êîçüè àíòèòåëà ê IgG2 êðîëèêà, êîíüþãèðîâàííûå ñ ùåëî÷íîé ôîñôàòàçîé. Äë äåòåêöèè ôåðìåíòàòèâíîé àêòèâíîñòè ùåëî÷íîé ôîñôàòàçû èñïîëüçîâàëè íàáîð õåìèëþìèíåñöåíòíûõ ðåàêòèâîâ Immunstar (BioRad, ÑØÀ). Ïðè ïðèãîòîâëåíèè ìàòåðèàëà äë Âåñòåðí-áëîòòèíãà ñóììàðíûé áåëîê èç 0,3 ã ëèñòüåâ òàáàêà ýêñòðàãèðîâàëè â 1 ìë Áóôåðà 1 (50 ìÌ Tris-HCl pH 8.0, 500 ìÌ NaCl, 0.1% Tween-20, 5 ìÌ β -ÌÅ, 1 ìÌ PMSF). Êîíöåíòðàöèþ áåëêà â ýêñòðàêòàõ îïðåäåë ëè ìåòîäîì Áðåäôîðäà. Ýêñòðàêòû ïðîïóñêàëè ÷åðåç ìèêðîêîëîíêè ñ 20 ìêë NiNTA àãàðîçû.  êà÷åñòâå ïðîìûâî÷íîãî ðàñòâîðà èñïîëüçîâàëè áóôåð 1 ñ äîáàâëåíèåì Ñòðàíèöà: 5 RU 2 302 460 C1 5 10 15 20 25 30 35 40 èìèäàçîëà äî êîíöåíòðàöèè 20 ìÌ. Ïîñëå 3-êðàòíîé ïðîìûâêè áåëîê ñ êîëîíîê ýëþèðîâàëè â 150 ìêë áóôåðà 1 ñ äîáàâëåíèåì èìèäàçîëà äî êîíöåíòðàöèè 150 ìÌ. Äë àíàëèçà èñïîëüçîâàëè 75 ìêë ïðèãîòîâëåííîãî ýëþàòà (30 íã áåëêà). Íà ôèã.2 ïðåäñòàâëåíû ðåçóëüòàòû Âåñòåðí-áëîòòèíãà äâóõ íåçàâèñèìûõ ìîíîèíñåðöèîííûõ òðàíñãåííûõ ðàñòåíèé òàáàêà, ãäå 7 è 15 - ýëþàòû èç ýêñòðàêòîâ òðàíñãåííûõ ðàñòåíèé ¹7 è ¹15 ñîîòâåòñòâåííî; Í - ýëþàò èç ýêñòðàêòà íåòðàíñãåííîãî ðàñòåíè ; Ê+ - ýëþàò èç ýêñòðàêòà íåòðàíñãåííîãî ðàñòåíè ñ äîáàâëåííûì ðåêîìáèíàíòíûì ÈË-18 ÷åëîâåêà, ïîëó÷åííûì èç êëåòîê E.coli, äî êîíöåíòðàöèè 0,01% ñóììàðíîãî áåëêà (400 íã/ìë ýêñòðàêòà); Á - 700 íã ðåêîìáèíàíòíîãî ÈË-18 ÷åëîâåêà, ïîëó÷åííîãî èç êëåòîê E.coli. Ìîë ðíà ìàññà ÈË-18 ÷åëîâåêà, ñîäåðæàùåãî ïîëèãèñòèäèíîâóþ ïîñëåäîâàòåëüíîñòü è ñàéò ãèäðîëèçà ôåðìåíòîì òðîìáèíîì ñîñòàâë åò 20 êÄà, ÷òî õàðàêòåðíî èìåííî äë çðåëîé ôîðìû. Òàêèì îáðàçîì, ó îáîèõ ðàñòåíèé ïîêàçàíî ïðèñóòñòâèå áåëêà, ñîîòâåòñòâóþùåãî ïî ìîëåêóë ðíîé ìàññå è èììóíîëîãè÷åñêèì ñâîéñòâàì ÈË-18 ÷åëîâåêà, ïîëó÷åííîìó èç êëåòîê E.coli.  êà÷åñòâå ïîëîæèòåëüíîãî êîíòðîë èñïîëüçîâàëè ýëþàò, ïîëó÷åííûé èç ýêñòðàêòà íåòðàíñãåííîãî ðàñòåíè ñ äîáàâëåííûì áàêòåðèàëüíûì ÈË-18 ÷åëîâåêà äî êîíöåíòðàöèè 0,01% ñóììàðíîãî áåëêà. Ñðàâíèâ èíòåíñèâíîñòè ïîëîñ íà äîðîæêàõ 7, 15 è Ê, ìîæíî çàêëþ÷èòü, ÷òî ñîäåðæàíèå ðåêîìáèíàíòíîãî áåëêà ó ïðîàíàëèçèðîâàííûõ ðàñòåíèé ñîñòàâèëî áîëåå 0,01% ñóììàðíîãî áåëêà èëè â ïåðåñ÷åòå íà ñûðîé âåñ ðàñòåíè - 1,3 ìã/êã. Ïðèìåð 3. Èññëåäîâàíèå áèîëîãè÷åñêîé àêòèâíîñòè ðåêîìáèíàíòíîãî ðàñòèòåëüíîãî õèìåðíîãî ÈË-18 ÷åëîâåêà Ïðè ïðèãîòîâëåíèè ìàòåðèàëà äë àíàëèçà áèîëîãè÷åñêîé àêòèâíîñòè ñóììàðíûé áåëîê èç 0,3 ã ëèñòüåâ òàáàêà ýêñòðàãèðîâàëè â 1 ìë Áóôåðà 1 (50 ìÌ Tris-HCl pH 8.0, 500 ìÌ NaCl 0.1% Tween-20, 5 ìÌ β -ME, 1 ìÌ PMSF). Êîíöåíòðàöèþ áåëêà â ýêñòðàêòàõ îïðåäåë ëè ìåòîäîì Áðåäôîðäà. Ýêñòðàêòû ïðîïóñêàëè ÷åðåç ìèêðîêîëîíêè ñ 20 ìêë NiNTA àãàðîçû.  êà÷åñòâå ïðîìûâî÷íîãî ðàñòâîðà èñïîëüçîâàëè áóôåð 1 ñ äîáàâëåíèåì èìèäàçîëà äî êîíöåíòðàöèè 20 ìÌ. Ïîñëå 3-êðàòíîé ïðîìûâêè áåëîê ñ êîëîíîê ýëþèðîâàëè â 150 ìêë áóôåðà 1 ñ äîáàâëåíèåì èìèäàçîëà äî êîíöåíòðàöèè 150 ìÌ. Ýëþàò äèàëèçîâàëè ïðîòèâ 50 ìÌ íàòðèé-ôîñôàòíîãî áóôåðà (ðÍ 7.4) ñ 0.15 Ì ñîë íîé êèñëîòû. Äë àíàëèçà èñïîëüçîâàëè 10 ìêë ïðèãîòîâëåííîãî ýëþàòà. Äë èçó÷åíèè áèîëîãè÷åñêîé àêòèâíîñòè ðåêîìáèíàíòíîãî ðàñòèòåëüíîãî ÈË-18 ÷åëîâåêà èññëåäîâàëîñü åãî âëè íèå íà ñïîíòàííóþ è ñòèìóëèðîâàííóþ ïðîäóêöèþ TNFα è IFNγ. Ìîíîíóêëåàðíóþ ôðàêöèþ êëåòîê ïåðèôåðè÷åñêîé êðîâè ïîëó÷àëè ó çäîðîâûõ äîíîðîâ ìåòîäîì öåíòðèôóãèðîâàíè â ãðàäèåíòå ïëîòíîñòè ôèêîëëà. Êîëè÷åñòâåííîå îïðåäåëåíèå TNFα è IFNγ ïðîâîäèëè ìåòîäîì ýëåêòðîõåìèëþìèíèñöåíöèè. Äë ïîëó÷åíè êàëèáðîâî÷íûõ êðèâûõ èñïîëüçîâàëè ðåêîìáèíàíòíûå TNFα è IFNγ ÷åëîâåêà (R&D Systems, UK). Ïîëèêëîíàëüíûå è ìîíîêëîíàëüíûå àíòèòåëà ïîëó÷åíû èç Pepro Tech, Inc. (NJ, USA). Êóëüòèâèðîâàíèå ìîíîíóêëåàðíûõ êëåòîê ïåðèôåðè÷åñêîé êðîâè ÷åëîâåêà â ïðèñóòñòâèè ÊîíÀ (10 ìêã/ìë) èëè ïîëó÷åííîãî ýëþàòà (10 ìêë) ïðèâîäèò ê äîñòîâåðíîìó ïîâûøåíèþ óðîâí ïðîäóêöèè TNFα è IFNγ, ñîâìåñòíà ñòèìóë öè êëåòîê ÊîíÀ è ýëþàòà óñèëèâàåò ýòó ïðîäóêöèþ. Äàííûå ïî èíäóêöèè TNFα (24 ÷ èíêóáàöèè) è IFNγ (48 ÷ èíêóáàöèè) â ìîíîíóêëåàðíûõ êëåòêàõ ÷åëîâåêà ïðåäñòàâëåíû â òàáëèöå. Òàáëèöà 45 50 control Con A (10 mkg/ml) Ýëþàò Con A (10 mkg/ml) + Ýëþàò IFNγ, pg/ml 280±57 869±152 624±112 1986±268 TNFα, pg/ml 248±56 510±134 460 ±85 2238±427 Ïîëó÷åííûå ðåçóëüòàòû ñâèäåòåëüñòâóþò î òîì, ÷òî ýëþàò, îáîãàùåííûé â îòíîøåíèè ñîäåðæàíè ðåêîìáèíàíòíîãî áåëêà, íåñóùåãî ïîëèãèñòèäèíîâóþ ïîñëåäîâàòåëüíîñòü, ñïîñîáåí ñòèìóëèðîâàòü ñèíòåç TNFα è IFNγ â ìîíîíóêëåàðíîé ôðàêöèè ÷åëîâåêà ïðè êîñòèìóë öèè Con À, ÷òî õàðàêòåðíî äë áèîëîãè÷åñêîé àêòèâíîñòè çðåëîé ôîðìû èíòåðåëåéêèíà 18 ÷åëîâåêà. Ñòðàíèöà: 6 RU 2 302 460 C1 Òàêèì îáðàçîì, ïðèâåäåííûå äàííûå ñâèäåòåëüñòâóþò î òîì, ÷òî ñêîíñòðóèðîâàííà ïëàçìèäíà ÄÍÊ pBi101-IL18 îáåñïå÷èâàåò ïåðåíîñ íóêëåîòèäíîé ïîñëåäîâàòåëüíîñòè õèìåðíîãî ÈË-18 ÷åëîâåêà â ãåíîìíóþ ÄÍÊ ðàñòåíèé è ïðîäóêöèþ çðåëîé ôîðìû èíòåðëåéêèíà 18 ÷åëîâåêà, îáëàäàþùåé áèîëîãè÷åñêîé àêòèâíîñòüþ. 5 10 Ôîðìóëà èçîáðåòåíè Ðåêîìáèíàíòíà ïëàçìèäíà ÄÍÊ pBi101-IL18, êîäèðóþùà ñèíòåç èíòåðëåéêèíà-18 ÷åëîâåêà â òðàíñãåííûõ ðàñòåíè õ, èìåþùà ðàçìåð 15 ò.ï.í è ñîäåðæàùà ñëåäóþùèå êîíñòðóêòèâíûå ýëåìåíòû: ôðàãìåíò ÄÍÊ âåêòîðíîé ïëàçìèäû pBi101, ðàçìåðîì 13,9 ò.ï.í; NdeI-BamHI/BglII ôðàãìåíòà ÄÍÊ, âë þùèéñ ó÷àñòêîì êÄÍÊ ãåíà ÈË-18 ÷åëîâåêà; NcoINdeI ôðàãìåíò ïëàçìèäû ðÅÒ15b, êîäèðóþùèé N-êîíöåâîé ïîëèïåïòèä èç øåñòè àìèíîêèñëîò ãèñòèäèíà è ñàéò ãèäðîëèçà ôåðìåíòîì òðîìáèíîì; 5'UTR îáëàñòü èç ãåíîìà âèðóñà ãðàâèðîâêè òàáàêà; äâîéíîé 35S CaMV ïðîìîòîð èç ãåíîìà âèðóñà ìîçàèêè öâåòíîé êàïóñòû; 3'UTR îáëàñòü èç ãåíîìà âèðóñà ìîçàèêè öâåòíîé êàïóñòû. 15 20 25 30 35 40 45 50 Ñòðàíèöà: 7 CL RU 2 302 460 C1 Ñòðàíèöà: 8 DR