Амплификация неклеиновых кислот Система AmpliGrid Анализ в 1 мкл Амплификация нуклеиновых кислот – самая высокая чувствительность уже всего с ОДНОЙ клеткой 2 НОВЫЕ СТАНДАРТЫ В ПЦР Искусство уменьшения объемов биологических реакций До сих пор исследователи, работающие в области молекулярной биологии одиночных клеток, при проведении амплификационных анализов полагаются на микропланшеты или пробирки. Вследствие этого, большие «мертвые» объемы, абсорбция матрицы и отсутствие оптического контроля качества приводят к значительному ухудшению достоверности и низкой воспроизводимости результатов. Кроме того, средняя чувствительность систем на основе микропланшетов обычно намного ниже ожиданий пользователей. Инновационная система AmpliGrid компании Advalytix позволяет достичь надежного постоянного уровня чувствительности, эффективности и воспроизводимости результатов в использовании методик амплификации с одиночными клетками и ультрамалыми объемами. В результате обеспечивается быстрое и удобное выполнение поставленных задач. Компания Advalytix представляет платформу для амплификации высшего качества, в основе которой лежит химически структурированный слайд для микроскопии. Система AmpliGrid является ключевым элементом, позволяющим получить безупречные результаты, в особенности при работе с одиночными клетками, а также практически с любым другим изучаемым материалом, например при окрашивании очищенных нуклеиновых кислот для судебно-медицинских исследований. Двумерная конструкция AmpliGrid облегчает нанесение одиночных клеток на поверхность слайда, например при помощи активированной флуоресценцией сортировки клеток (FACS), микроманипулятора или микродиссекции, что делает возможными разнообразные варианты работы с одиночными клетками, а также дает полноценный доступ к «одноклеточному геному». При использовании комбинации системы AmpliGrid с термоциклером AmpliSpeed снижение времени реакции амплификации достигает 50 % по сравнению с альтернативными методиками с использованием микропланшетов. В дополнение к ручной обработке образцов, платформа AmpliGrid совместима с любыми типами автоматизированных систем работы с жидкими материалами, что делает данную платформу наиболее предпочтительным вариантом для применения при высокопроизводительном скрининге (HTS, «high throughput screening»). Своей системой AmpliGrid/AmpliSpeed компания Advalytix создает новый стандарт для исследований малых объемов и одиночных клеток. Если мы говорим одиночная клетка, мы имеем в виду всего лишь ОДНУ единственную клетку. 3 НЕ СОДЕРЖАЩИЙ ДНК МИКРОЛИТРОВЫЙ СЛАЙД ДЛЯ ПРОВЕДЕНИЯ РЕАКЦИИ Вы устали от переноса крохотных объемов пипеткой на микропланшеты? Новый слайд AmpliGrid может выполнить точные манипуляции за вас! Перенос малых объемов пипеткой в микропланшеты часто приводит к появлению капель на слайдах или на краях лунок. Компания Advalytix использует усовершенствованную систему полупроводниковой литографии для структурирования поверхности слайдов AmpliGrid с целью обеспечения четкого позиционирования ровно одного микролитра (1 мкл) в каждую из 48 дискретных точек реакции. Благодаря гидрофильному характеру точек реакции все водные реагенты самостоятельно центрируются в идеальном положении, даже если они не очень аккуратно нанесены пипеткой, что делает обработку образцов простой и точной. AmpliGrid AG480F Теперь объемы реакции 1 мкл могут стать для вас «стандартными»; снижение потребления реагента и ферментов может достигать 25 раз. Кроме того, снижение объема реакции также повышает чувствительность и эффективность реакции в 10 раз, одновременно снижая время, требуемое для проведения реакции. Ошибки работы с пипеткой уйдут в прошлое, поскольку плоская поверхность обеспечивает точный оптический контроль нанесения образца. Благодаря высококачественной двумерной поверхности в сочетании с системой AmpliGrid можно использовать любой вид оптического контроля. Слайды AmpliGrid удобны как для проведения большого количества исследований, так и для небольшого количества образцов при ручной обработке, поскольку эту технологию легко приспособить для применения в сочетании сAmpliGrid большинством стандартных автоматических Specifications систем работы с жидкими материалами, предназначенных для применения при высокопроизводительном скрининге (HTS). Для того, чтобы использовать весь потенциал системы AmpliGrid, компания Advalytix предлагает оптимизированные наборы для амплификации и обратной транскрипции. Эти ориентированные на удобство пользователя наборы специально разработаны для усовершенствованной геометрии реакций в малых объемах на слайде AmpliGrid. AMPLISPEED ASC100D/200D/400D4 Передовая технология управлениятемпературой на предметных стеклах Amplispeed- ультракомпактный прибор специально разработанный для достижения высокоскоростных, воспроизводимых циклических изменений температуры на стеклянных слайдах. Оптимальные температурные параметры в ячейках слайдов гарантируются превосходной теплопередачей, основанной на использовании высоко-планарной кремний - органической подложки. Это уникальная система воспроизводит чрезвычайно гомогенные температуры на стекле и эффективное 0 нагревание и охлаждение в лунке до 3 С в секунду. Это может быть классифицировано как ВЫСОКОСКОРОСТНАЯ технология. AMPLISPEED 5 Термальный цикл – следующая ступень в амплификации Новаторский и интуитивный контактный графический пользовательский дисплей доступен для программирования непосредственно с дисплея или с использованием компьютера. Система может быть интегрирована с Вашим ежедневным технологическим процессом путем использования Ethernet: вы можете параллельно работать с компьютером или наслаждаться чашечкой кофе, система пошлет Вам сообщение, что цикл амплификации на приборе закончен. Индивидуальные программы могут быть сохранены или перенесены с помощью стандартного SD носителя, обеспечивая удобство в пользовании и хранении пользовательских рабочих программ. AmpliSpeed slide Передовая технология обеспечивает простоту и эффективность пользования С системой Amplispeed/AmpliGrid фирма Advalytix определила новый стандарт для молекулярногенетических исследований на одной клетке и ПЦР диагностике в различных областях медицины. В приборе доступны 1,2,3 и 4 модуля для слайдов, с независимым температурным контролем. Integration in liquid handling При использовании роботизированной системы пробоподготовки к прибору могут быть легко добавлены дополнительные термоблоки до 20 штук. Еще одной особенностью прибора является его бесшумность из-за отсутствия охлаждающих вентиляторов для элементов Пельтъе. Для достижения максимальной точности во время амплификационного процесса возможно применение устройства для температурной калибровки в лунке слайда, которое может быть интегрировано с Amplispeed. Graphical user A A Применение B Генетическое типирование единичных клеток Генетическое типирование человеческих ДНК является развивающийся областью молекулярной биологии. Использование наборов для основывающихся на определении коротких тандемных повторах ( STR) может быть использовано в онкологии, для идентификации циркулирующих опухолевых клеток и для идентификации личности. Использую технологию амплификации на одной клетке возможно значительно увеличить чувствительность и специфичность определения изучаемых последовательностей ДНК. C Определение мутаций и секвенирование Использование технологии ПЦР на одной клетке можно значительно расширить область применения ее в таких областях как научные исследования в области фундаментальной молекулярной биологии клетки, так и в практических областях таких как иммунология, популяционная генетика, предимплантационная диагностика, пренатальная диагностика, онкологическая диагностика, типирование стволовых клеток. С Amplispeed амплификация и анализ гена ( секвенирование, единичные SNP) могут быть интегрированы в одном технологическом процессе. Реакция амплификации проходит точно в месте осаждения клетки. Все шаги в процессе подготовки и амплификации исключают риск контаминации и получения артефактов. D Анализ вариации числа хромосом Анализ числа хромосом, их отсутствия или наличия дополнительных хромосом, также и их фрагментов, играет огромную роль в медицинской диагностике особенно в предимплантационной и пренатальной диагностике. Применение Amplispeed в данном случае значительно облегчает диагностику и делает ее незаменимой из-за одно- временного анализа всего хромосомного набора на одной клетке. Advalytix разработал протоколы позволяющие значительно уменьшить сложность полногеномной амплификации ДНК. Применение этой технологии позволяет на единичных клетках проводить детекцию числа хромосом и хроматид очень аккуратно и точно. Генетическое типирование еденичных клеток. B Определение мутаций и секвенеирование. C Анализ вариации числа хромосом . D Комбинированный иммунофенотипирующий и экспрессионный анализ на еденичных клетках . Комбинированный иммунофенотипирующий и экспрессионный анализ на еденичных клетках Анализ экспрессии генов по определению уровня РНК с помощью RT-PCR одна из последних продвинутых методик для анализа функции генов. С функциональной точки зрения использование проточной цитометрии и сортинга для анализа экспрессии генов является очень интересным. Действительно фенотипический отбор клеток по флуоресцентному маркеру с последующим анализом экспрессии генов отражающих функцию клеток несущих этот маркер имеет ключевое значение для понимания функции клеток. Анализ на одной клетке – крупное достижение для новой области науки-« Cellomics». Advalytix единственная платформа позволяющая делать подобные исследования и может интегрирована с любим сортировщиком клеток.