Семинар 1. Строение простых биоорганических молекул Цель: 1. Научиться определять по наличию функциональных групп в молекуле класс биоорганического соединения. 2. Познакомиться с важнейшими биоорганическими молекулами организма и их ролью. Краткие теоретические сведения Основой для построения биоорганических молекул является атом углерода (С). В образовании биомолекул участвуют также атомы кислорода (О), водорода (Н), азота (N), фосфора (Р) и серы (S). Только атом С способен образовывать различные по длине и строению структуры молекул, соединяясь друг с другом химическими связями. Обычно для изображения строения молекул применяют упрощенные структурные формулы, в которых связи с атомами водорода не показывают валентными черточками. В сложных циклических структурах иногда не обозначают атом углерода, оставляя только валентные черточки (связи) идущие к соседним атомам. Примеры структур, образованные атомом углерода • Линейные структуры • Циклические и разветвленные: и • Гетероциклические (цикл образован не только атомами С) В молекулах углерод всегда имеет 4 связи. Атом Н имеет только 1 связь (Н−) в молекулах, атом О образует 2 связи Бывает 2 вида связей: насыщенные (одинарные) связи (С − С ненасыщенные (двойные, тройные) (С = С, С=О, С ≡ N).. Свойства биоорганических молекул определяются: - числом и расположением атомов в углеродном скелете молекулы, - природой функциональных групп, находящихся в молекуле, - видом связей между атомами С в молекуле. Функциональная группа – это группировка атомов в молекуле, придающая ей характерные биохимические свойства. Класс органических молекул определяется по наличию в ней определенной функциональной группы. Основные функциональные группы и классы органических молекул представлены на следующем слайде. Часто имеется несколько функциональных групп в одной биомолекуле и отнести к одному классу ее нельзя, тогда говорят кетокислота или альдегидоспирт Функциональная группа Структурная формула Класс соединения Примеры Биохимическая роль −СО− (карбонильная) R1 − C − R2 II O Кетоны Ацетон СН3СОСН3 Продукт усиленного расщепления жиров − СНО− (альдегидная) R1 − C − H II O Альдегиды Ацетальдегид СН3СНО Образуется при распаде этилового спирта в печени − СООН − (карбоксильная) R1 − C − OH II O Кислоты Уксусная СН3СООН Ключевое соединение обмена веществ − СОО − (сложноэфирная) R1 − C − ОR2 II O Сложные эфиры Моноглицерид СН2 − СН − СН2 I I I ОН ОН ОСОR Продукт распада жира − ОН − (гидроксильная) R1 − H2C − OH Спирты (оксисоединения) Глицерин СН2 − СН − СН2 I I I ОН ОН ОН Основа нейтрального жира в организме − NH2 − (аминогруппа) R1 − H2C − NH2 Амины Этаноламин ОНСН2СН2NH2 Образуется из серина, участвует в образовании мембран клеток − SH − R1 − SH Тиосоединения Цистеин SHCH2CH − COOH I NH2 Аминокислота, необходима для синтеза белков Характеристика органического соединения 1. Указать число атомов С в молекуле. 2. Определить строение каркаса из атомов С: линейная, циклическая, гетероциклическая. Линейная или разветвленная – цепь из атомов С не замкнута, Циклическая – цепь замкнута, Гетероциклическая – в образовании цикла участвуют другие атомы, кроме углерода (N,O,S). 3. Определить тип связей между атомами С: насыщенные, ненасыщенные. Насыщенные – все связи между атомами углерода одинарные (С−С) Ненасыщенные – есть двойные связи между атомам углерода (С=С), 4. Определить функциональные группы в молекуле: какие и сколько. 5. Назвать класс биоорганической молекулы. 6. Указать название и функции в организме. Пример 1: Дана молекула формулы СН3−СН2-ОН Характеристика и роль в обмене веществ 1. 2 атома углерода 2. Линейная 3. Насыщенные связи 4. Гидроксильная группа – 1 5. Класс – спирт 6. Этиловый спирт – промежуточный продукт обмена, при распаде которого в печени образуется ядовитое вещество ацетальдегид, нарушающее работу нервных клеток. Пример 2: Дана молекула СН3−СО−СООН 1. 3 атома С 2. Линейная 3. Насыщенные связи 4. Кетогруппа – 1, карбоксильная – 1 5. Класс – кетокислота 6. Пировиноградная кислота – образуется при распаде глюкозы, из нее в мышцах образуется молочная кислота при скоростной кратковременной работе без кислорода. Задание по теме Найдите по названию биомолекулы ее строение и дайте характеристику по примеру 1,2. • Молочная кислота • Аланин • Глицерин • Глюкоза • Цитозин • Гистамин • Мочевина • Карнитин • Креатинфосфат • Триптофан