Курсовая работа студента 445 группы А. В. Алеева Научный руководитель: ассистент кафедры информатики Н. И. Вяххи 2011 За последние годы биология начала превращаться в науку, «богатую данными». Существует множество приложений, обеспечивающих доступ к геномной информации и работе с ней, но зачастую они недостаточно удобны, либо предоставляют недостаточно широкую функциональность. Одной из основных областей биоинформатики является аннотация геномов. Примеры задач: ◦ Исследователя может интересовать, какие гены находятся в хромосоме или ее части. ◦ Потеря части данных о нуклеотидной цепочке при установке кариотипа пациента. Обзор существующих решений задачи о получении информации о последовательности нуклеотидов по ее местоположению в геноме человека Добавлении данной функциональности в рамках проекта Genome Query Преимущества: ◦ Наглядное представление результатов работы сервиса. Недостатки: ◦ Отсутствие информации об экзонах и интронах. Преимущества: ◦ Огромное количество геномной информации. ◦ Текстовый вид результатов работы позволяет легче использовать их для дальнейших исследований, есть возможность записи в файл. Недостатки: ◦ Создание запроса является трудоемким. ◦ Результат работы сложно разобрать без дополнительной обработки. Преимущества: ◦ Возможность масштабирования картинки Недостатки: ◦ Отсутствие информации об экзонах и интронах Все сервисы имеют свои преимущества, но и недостатки. Отсутствие возможности автоматизировать создание запросов сужает круг решаемых задач, либо затрудняет их. Принято решение добавить в проект Genome Query возможность получения информации о последовательности нуклеотидов по ее местоположению в геноме человека. o o Требуется обеспечить по заданной позиции быстрый доступ к геномной информации, относящейся к этой позиции. Создание структуры: Сделан обзор существующих решений описанной задачи. Реализовано собственное решение. В дальнейшем планируется добавление визуализации результатов для более наглядного представления, тщательное тестирование.