Геномы вирусов
advertisement
ГЕНОМЫ ВИРУСОВ РНК-овый геном. •Быстро изменяется, так как РНК-полимераза делает много ошибок. Каждая новая молекула РНК имеет 1 ошибку •Репликация РНК может сопровождаться делециями, дупликациями и рекомбинациями ( как с вирусными РНК, так и клеточными) •Цис- и транссплайсинг и обратный сплайсинг. Такая изменчивость чревата образованием вирулентных штаммов из невирулентных вакцинных Геномы вирусов • Самые простые • Очень компактны – содержат только гены, тесно прилегающие друг к другу, иногда перекрывающиеся 1978 - первый полностью секвенированный геном: бактериофаг φХ 174 5 374 н.п. 9 генов Геномы вирусов ДНК или РНК 1-цепочечная или 2-цепочечная линейная или кольцевая одна молекула или несколько • Число генов – от 3 – 30 у простых вирусов до 200 у самых сложных. Вирус гриппа Гемагглютинин РНК – 8 молекул, (-) цепи Геном – 13 000 н. 10 генов в 8 молекулах РНК Реплицируется в ядре, РНК → РНК Высокомутабильный Частота мутаций у вирусов • Наиболее мутабильны вирусы с РНКгеномами – поскольку синтез РНК у всех организмов менее точен, чем синтез ДНК. • У большинства РНК-вирусов (гриппа, атипичной пневомнии) частота мутаций составляет 10–5 нуклеотидов в день. • У вируса ВИЧ (РНК ретровирус) она в три раза выше. Практические приложения вирусной геномики • Консервативные сайты позволяют определить жизненно важные гены → выработать лекарства, специфичные к данному вирусу. • Высокомутабильные сайты → прогнозировать способность вирусов находить нового хозяина. Ретровирусы • 1-цепочечные РНК-вирусы, цикл размножения которых обязательно включает ДНК. • • • • 1911 – вирус Саркомы рауса у птиц 1930е – 1970е РНК-вирусы рака у птиц и мышей 1962 – Темин, гипотеза «стадии провируса» 1969 – Huebner, Todaro – гипотеза онкогена в составе вируса • 1970 – Темин, Балтимор – открыли обратную транскриптазу • 1978 – Bishop, Varmus – онкогены вирусов происходят от генов хозяина • 1981 Gallo – ретровирус человека (HTLV-Human T Cell Leukemia Virus) Гены и белки вируса ВИЧ Структурные белки трансмембранные белки липидной оболочки матрикс капсид нуклеокапсид Ферменты Ревертаза Интеграза Протеаза 3 гена – gag, pol и env Жизненный цикл ретровируса Все ретровирусы имеют в жизненном цикле стадию провируса – встраивания в хозяйский геном Интеграция ретровируса в хромосому хозяина
