Биология - ЛБХФ (Петрусева)

Руководителю институтской практики
студентов ФЕН НГУ
ЗАЯВКА НА СТУДЕНТА
Заведующий ЛБХФ чл-корр. РАН д.х.н. О.И. Лаврик
непосредственный руководитель ст.н.сотр. ЛБХФ к.х.н. И.О. Петрусева
соруководитель аспирант Лукьянчикова Н.В. тел. 9-029, адрес irapetru@niboch.nsc.ru)
Тема дипломной работы:
«Анализ эффективности удаления повреждений белками системы эксцизионной репарации
нуклеотидов млекопитающих из модельных ДНК различной структуры».
Система эксцизионной репарации нуклеотидов удаляет из ДНК различные объемные аддукты.
Такие повреждения, в частности, во множестве возникают в ДНК под действием большинства
химиотерапевтических препаратов, используемых для лечения онкологических заболеваний и
при проведении комплексной терапии в целом. Широкая субстратная специфичность системы NER
может препятствовать сохранению повреждений в ДНК раковых клеток, а, следовательно,
служить одним из факторов, снижающих терапевтический эффект. Актуальным является вопрос о
взаимосвязи структуры повреждений, их взаимного расположения в ДНК и скорости их удаления
системой NER.
Задел для проведения выполнения такой работы имеется. Выполненные нами исследования
позволили выбрать синтетические объемные аддукты, которые эффективно распознаются и
удаляются системой NER млекопитающих. Предложенные нами в качестве модельных субстратов
ДНК-дуплексы, содержащие в одной из цепей ненуклеозидную вставку с антраценильным или
флуоресцеинильным фрагментом, позволили разработать чувствительный метод оценки
активности системы NER in vitro. С использованием этого метода можно не только детектировать
активность системы NER, но и отслеживать ее относительную эффективность в экстрактах
различных клеток и тканей, в том числе в экстрактах опухолевых клеток человека. В Лаборатории
есть все возможности для получения препаратов рекомбинантных белков, отработаны методики
получения NER-компетентных экстрактов эукариотических клеток и тканей. Работа потребует от
студента освоения методик работы с различными ферментами, в том числе и метода ПЦР,
методов экспрессии белков в различных системах и их очистки, аналитических техник,
основанных на использовании специфических антител, различных методов анализа белковонуклеиновых взаимодействий. Исследования, которые будут выполняться студентом в процессе
преддипломной и дипломной практики, находятся в русле основных направлений Лаборатории.
И.Петрусева.