Идентификация и скрининг микроорганизмов в продуктах

Идентификация и скрининг микроорганизмов
в продуктах питания
Система идентификации микроорганизмов (MICROSEQ MICROBIAL IDENTIFICATION SYSTEM)
разработана компанией Applied Biosystems (США).
С помощью системы MicroSeq возможно определять более тысячи видов микроорганизмов
(бактерии, дрожжи и грибы). Процесс идентификации занимает всего 8 часов, начиная с
выделения ДНК и до обработки результата при помощи специального программного обеспечения.
При использовании системы MicroSeq, вам не понадобится предварительная информация о
микроорганизме, не нужна окраска по Грамму, не нужны предварительные биохимические
исследования, не нужен опыт работы.
По сравнению с другими методами определения микроорганизмов, MicroSeq на сегодняшний
день единственная коммерческая система, которая на специальных испытаниях показала 100%
точность и 100% воспроизводимость результатов при определении 18 линий из коллекции
American Type Culture Collection (ATCC) микроорганизмов, которые наиболее часто встречаются в
местах производства фармацевтической продукции.
База данных MicroSeq включает более 1700 видов, как грамм отрицательных, так и грамм
положительных бактерий. С 2003 года в базу данных добавлена информация об особо опасных
патогенах - Bacillus anthracis, Francisella tularensis, Yersinia pestis, Brucella melitensis. Библиотека
для грибов содержит информацию о более чем 1000 видов. Обе библиотеки непрерывно
обновляются и пополняются новыми видами. Библиотеки содержат информацию о
полиморфизмах и включают бактериальные агенты категории А. Также, вы можете создавать
собственные библиотеки для интересующих вас видов и добавлять информацию о генетических
последовательностях новых или известных видов.
Система MicroSeq определяет бактерии с помощью автоматического сиквенирования
универсального гена 16S рибосомальной РНК (rRNA) - основной показатель бактериальной
таксономической классификации в Bergey's Manual. Грибы идентифицируются с помощью
сиквенирования D2 участка гена 26S rRNA. После сиквенирования гена rRNA система
автоматически сравнивает результаты с данными микробных библиотек MicroSeq и выдает список
соответствующих результатов. Данные результаты распределяются в соответствии с генетической
дистанцией от образца и отображаются на мониторе в виде филогенетического дерева.
Программное обеспечение автоматически определяет процент сходства неизвестного образца с
наиболее схожими образцами из библиотеки MicroSeq, основанной на подобии информации о
нуклеотидной последовательности и филогенетического дерева.
Наборы, реагенты и программное обеспечение:





PrepMan® Ultra Reagent – специально разработанный реактив для выделения ДНК из
колоний или культур микроорганизмов;
MicroSeq 500 16S Bacterial Identification Kit - набор, который состоит из реагентов для
идентификации бактерий, основанный на сиквенировании 500 пн 16S РНК гена;
MicroSeq Full Gene 16S Bacterial Identification Kit - включает реактивы для определения
бактерий по полной последовательности 16S РНК гена;
MicroSeq D2LSU Fungal Identification Kit - набор для идентификации грибов по ядерной
рибосомальной ДНК;
MicroSeq ID Analysis Software - программное обеспечение, которое включает все
необходимое для идентификации микроорганизмов.
Система MicroSeq объединяет в себе инструментальную поддержку, наборы реактивов,
библиотеки последовательностей ДНК и программное обеспечение, необходимые для
автоматизированного сиквенирования ДНК микроорганизмов. Каждый компонент системы
подобран для качественной и точной совместимой работы, что делает вашу работу удобной и
позволяет получать достоверные, точные и воспроизводимые результаты.
Данная система может использоваться:






В лабораториях по контролю продуктов питания и напитков – мониторинг, контроль
процесса приготовления, выявление при вспышках заболеваний;
В сельском хозяйстве - идентификация патогенных грибов в c/х продукции и при ее
хранении;
В медицине - идентификация микроорганизмов;
На фармацевтическом производстве - контроль качества субстанций и готовой продукции;
В сфере экологии - оценка биологического разнообразия в естественных условиях;
В коллекциях культур микроорганизмов – подтверждение.