Микробиологический мониторинг хронической инфекции легких

Микробиологический мониторинг
хронической инфекции легких у больных
муковисцидозом как модель изучения
микроэволюции внутрибольничных
штаммов P.aeruginosa, S.aureus,
B.cepacia
Шагинян И.А., главный научный сотрудник,
руководитель лаборатории молекулярной
эпидемиологии госпитальных инфекций
ФГБУ ФНИЦ Эпидемиологии и Микробиологии
им.Н.Ф.Гамалеи Минздрава России
Выводы из опыта работы по
мониторингу в НИИ трансплантологии
1. Методы классической микробиологии , а именно идентификация
микроорганизмов, определение спектра устойчивости к антибиотикам
неэффективны при оперативном мониторинге инфекций, связанных с оказанием
медицинской помощи.
2.При использовании молекулярно-генетических методов можно выявлять
«эпидемически» значимые штаммы и определять ареолы их распространения;
3. Установлено, что в стационарах циркулируют одновременно несколько различных
генотипов определенного вида возбудителей, но только «эпидемически» значимые
варианты циркулируют в течение длительного времени, а остальные генотипы чаще
всего являются транзиторными;
4. Нами показано, что в стационарах циркулируют потенциально эпидемически
значимые штаммы, имеющие гены, способные акцептировать мобильные
генетические элементы - транспозоны, интегроны, плазмиды, в составе которых
могут быть гены вирулентности и гены антибиотикоустойчивости.
5. Методами полногеномного секвенирования штаммов, выделенных с интервалом в
3 года доказывается наличие микроэволюции возбудителей, циркулирующих в
отделении реанимации.
Хроническая инфекция нижних дыхательных путей у больных муковисцидозом является ведущим фактором, определяющим тяжесть клинического течения и прогноз заболевания. При изучении микрофлоры нижних дыхательных путей различных возрастных групп больных муковисцидозом, установлено, что основными возбудителями инфекции легких у больных муковисцидозом, являются Рseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus и B.cepacia complex и Achromobacter xylosoxidans. Основной причиной летальных исходов у 90­95% больных муковисцидозом являются инфекционные процессы в легких, часто с генерализацией инфекции, то есть с развитием сепсиса.
В первые годы жизни у больных муковисцидозом доминирует золотистый стафилококк, а затем основным возбудителем становится синегнойная палочка. В 65% случаев хроническая инфекция легких представляет собой смешанную инфекцию.
Наиболее частые комбинации
смешанной инфекции
•
Pseudomonas aeruginosa+Staphylococcus aureus
•
Pseudomonas aeruginosa (мукоидный и немукоидный)
+Staphylococcus aureus
•
Pseudomonas aeruginosa+Burkholderia cepacia
•
Pseudomonas aeruginosa+Burkholderia cepacia+ Stаhylococcus
aureus
•
Pseudomonas aeruginosa +Stаhylococcus aureus
•
+ неферментирующие грам(-) микроорганизмы
(Stenotrophomonas maltophilia, Acinetobacter spp.,
Achromobacter хylosoxidans)
Достоинства модели
хронической инфекции легких
1. Возможность долговременного мониторинга и
постоянство микрофлоры очага воспаления;
2. Периодическое использование для лечения
антимикробных препаратов и возможность
оценки эффективности их использования;
3. Возможность анализа подвижного
генетического пула возбудителей инфекции и
оценки его перемещения между разными
видами возбудителей.
Пациент
Дата 12.05.12
Результат
106
Дата 22.05.12
Результат
117
Дата 16.09.13
Результат
44В
Х
P.aeruginosa (гем+) 103
(мукоидный фенотип)
B.cenocepacia 104
Streptococcus spp. -103(ά)
S.aureus 1 КОЕ
S.epidermidis 1 КОЕ
B.cenocepacia 103
Streptococcus spp.
-103(ά )
N. Subflava 102
P.aeruginosa (гем+)3х 102
B.cenocepacia 104
Streptococcus spp. -103(ά гем)
Плесневые грибы 4 КОЕ
Candida spp. 2x101
A.xylosoxidans 102
S.aureus 2х101
S.epidermidis 2х101
7305
(2008г)
B.cenocepacia
Пациент
Дата 27.02.12
Результат
С
B.cenoc
epacia
8041
(2009 г)
8176
(2009 г)
P.aeruginosa — 4
P.aeruginosa — 104
(мукоидный фенотип) КОЕ
B.cenocepacia - 104
B.cenocepacia - 104
Candida spp. -102
S.epidermidis — 3х101
Streptococcus spp.
-103(ά гем)
P.аerugi
nosa
2009 г
Дата 07.03.12
Результат
Дата 06.07.12 и 23.07.13
Результат 164 и 177
Дата 31.07.13
Результат 33В
P.aeruginosa — 104
(гем+)немук
B.cenocepacia - 104
Candida spp. - 102
P.aeruginosa — 103
(мук фенотип)
P.aeruginosa — 103
(немук.)
B.cenocepacia - 104
Candida spp. -4 КОЕ
S.epidermidis — 2
КОЕ
5 посев
Масс-спектр
+ 1731,6
+ 4803,0
+ 6538,2
+ 7381,4
+ 8414,9
-
2141,9
-
3445,5
-
5539,4
-
6422,9
-
6816,7
-
6888,4
Мониторинг антибиотикочувствительности штаммов выделенных
от одного больного в течение ряда лет
Группа
К-во
больных
Спектр
устойчивости
Интервал
наблюдения
9 (26,5%)
От 1 года до 3
лет 7 месяцев
14 (41,2%)
От 14 дней до 5
лет 7 месяцев
не изменен
Спектр
устойчивости
увеличился
У 4 больных -приобретение устойчивости к цефтазидиму;
у 2 больных - к цефепиму;
у 3 больных — к хлорамфениколу;
у 2 больных — к бисептолу
Потеря
устойчивости
9 (26,4%)
От 3,5 месяцев
до 5 лет 7
месяцев
3 больных -появление чувствительности к меропинему;
3 больных — появление чувствительности к
хлорамфениколу;
2 больных -появление чувствительности к цефепиму;
1 больной — появление чувствительности к цефтазидиму
Потеря и
приобретение
устойчивости
2 (5.8%)
1 больной — потеря резистентности к меропинему и
цефепиму и приобретение устойчивости к хлорамфениколу
и цефтазидиму;
1 больной — потеря резистентности к бисептолу и
хлорамфениколу и приобретение устойчивости к
цефтазидиму
Всего
34 больных
Заключение
1. Мониторинг хронической инфекции легких у больных муковисцидозом показывает, что инфекция обусловлена длительной персистенцией мультирезистентных неферментирующих микрорганизмов – Р.aeruginosa, B.cepacia, A.xylosoxydans и S.аureus. 2. Инфекция характеризуется трудностью элиминации возбудителей и способностью изменять свои фенотипические и генотипические характеристики, то есть подвергаться микроэволюции