Аспартатные протеазы обще-основной катализ Аспартатные протеазы • Обще-основной (нековалентный) катализ. Нуклеофил — H2O • В активном центре — два остатка аспарагиновой кислоты (Asp) • Необратимо ингибируются эпоксисоединениями Аспартатные протеазы (структурные особенности) • «Высшие» (пепсиноподобные) и «низшие» (вирусные протеазы) • Двухдоменная структура (высшие) или димер (вирусные) • Боковые группы остатков Asp находятся почти в одной плоскости • Большой субстрат-связывающий участок (6-8 остатков субстрата) • Субстрат-связывающий участок прикрыт подвижной петлей (flap) Двухдоменная структура или димер Большой субстрат-связывающий участок Остатки Asp в активном центре Механизм аспартатных протеаз («классический»)