молекулярно-биологическая характеристика велогенных

МОЛЕКУЛЯРНО-БИОЛОГИЧЕСКАЯ
ХАРАКТЕРИСТИКА ВЕЛОГЕННЫХ ШТАММОВ
ВИРУСА БОЛЕЗНИ НЬЮКАСЛА,
ВЫДЕЛЕННЫХ НА ТЕРРИТОРИИ
КАЗАХСТАНА В 1998 ГОДУ
А.П.Богоявленский, С.В.Левандовская, И.С.Коротецкий,
А.Г.Прилипов, О.В.Ляпина, Е.В.Усачев, В.П.Толмачева,
Э.С.Омиртаева,
К.Д.Даулбаева,
И.Ш.Бутакова,
Т.С.Богомолова, В.Э.Березин
Институт микробиологии и вирусологии МОН РК,
Алматы, Казахстан; Институт вирусологии им.
Д.И.Ивановского РАМН, Москва, Россия
Структура генома вируса болезни Ньюкасла
Подбор праймеров на участке фрагмента гена F
Патогенные штаммы вируса болезни Ньюкасла,
выделенные на территории Казахстана в 1998 году
NN
Isolate identification
NDV strain
Year of isolation
1
APMV-1/chicken/Almaty/22/98
KAZ-22-98
1998
2
APMV-1/chicken/Almaty/26/98
KAZ-26-98
1998
3
APMV-1/chicken/Almaty/28/98
KAZ-28-98
1998
4
APMV-1/chicken/Almaty/30/98
KAZ-30-98
1998
5
APMV-1/chicken/Almaty/31/98
KAZ-31-98
1998
6
APMV-1/chicken/Almaty/34/98
KAZ-34-98
1998
7
APMV-1/chicken/Almaty/36/98
KAZ-36-98
1998
8
APMV-1/chicken/Almaty/38/98
KAZ-38-98
1998
9
APMV-1/chicken/Almaty/39/98
KAZ-39-98
1998
10
APMV-1/chicken/Almaty/43/98
KAZ-43-98
1998
Патогенные свойства исследованных штаммов ВБН
Штамм
Хозяин
ИЦИП
СВГ
Аминокислотная
последовательность сайта
расщепления
APMV-1/chicken/Almaty/22/98
fowl
1,64
54,2
112 RRQRR116
*
F117
APMV-1/chicken/Almaty/26/98
fowl
1,05
85,6
112 RRQRR116
*
F117
APMV-1/chicken/Almaty/28/98
fowl
1,68
51,4
112 RRQRR116
*
F117
APMV-1/chicken/Almaty/30/98
fowl
1,58
60,0
112 RRQRR116
*
F117
APMV-1/chicken/Almaty/31/98
fowl
1,61
54,9
112 RRQRR116
*
F117
APMV-1/chicken/Almaty/34/98
fowl
1,78
56
112 RRQRR116
*
F117
APMV-1/chicken/Almaty/36/98
fowl
1,58
59,2
112 RRQRR116
*
F117
APMV-1/chicken/Almaty/38/98
fowl
1,87
62,4
112 RRQRR116
*
F117
APMV-1/chicken/Almaty/39/98
fowl
1,42
70,4
112 RRQRR116
*
F117
APMV-1/chicken/Almaty/43/98
fowl
1,56
58,8
112 RRQRR116
*
F117
Филогенетическое дерево различных генотипов ВБН по фрагменту гена F
Филогенетическое дерево VII генотипа ВБН по фрагменту гена F (47-421)
Аминокислотная последовательность фрагмента гена F штаммов
ВБН, принадлежащих к различным субгенотипам VII генотипа
Genotypes,
acids
Majority
amino
5
9
10
13
19
23
28
63
93
101
104
107
109
112
113
114
115
121
S
I
P
L
I
L
L
V
T
R
G
S
S
R
R
Q
K
I
VIIa
P
T
-/R
V
VIIb
P
V
S
-/K
V
KAZ-22-98
P
F
S
R
V
KAZ-26-98
P
F
S
R
V
KAZ-28-98
P
F
S
R
V
KAZ-30-98
P
F
S
R
V
KAZ-31-98
P
F
S
R
V
KAZ-43-98
P
F
S
R
V
KAZ-34-98
P
F
S
R
V
KAZ-36-98
P
F
S
R
V
KAZ-38-98
P
F
S
R
V
KAZ-39-98
P
F
S
R
V
VIIc
P
K
V
VIId
P
VIIe
P
S
K
P
K
-/P
P
K
V
K
V
Спасибо за внимание!