Акимов Михаил Геннадьевич Год и место рождения: г. Москва, 29 сентября 1982 года Отец: Акимов Геннадий Григорьевич, полковник ФСБ РФ в отставке Мать: Акимова Елена Михайловна, профессор, канд. ист. наук Образование - - школа с углубленным изучением немецкого языка, серебряная медаль, дипломы победителя олимпиад по географии (районный тур), информатике (районный тур), биологии (районный тур), математике (городской тур), 1989-2000 биологический факультет МГУ им. М.В. Ломоносова, очное отделение, специальность биохимия, специализация биоорганическая химия, диплом с отличием, 2000-2005 аспирантура ИБХ РАН, специальность биохимия, (тема диссертации «Биосинтез и метаболизм N-ацилдофаминов в тканях и клетках животных»), 2005-2008 кандидат химических наук, специальность биохимия, 2009 школа по конфокальной и электронной микроскопии Leica, Пущино, 2006 Электронные курсы - R Programming, Data Manipulation, Data Visualization, Statistical Modelling, Importing and Cleaning Data - DataCamp Machine Learning - Stanford University (Coursera) Введение в машинное обучение - ВШЭ (Coursera) Machine Learning: Regression - University of Washington (Coursera) Initiating and Planning Projects - University of California, Irvine (Coursera) Using Databases with Python - University of Michigan (Coursera) Python Data Structures - University of Michigan (Coursera) Programming for Everybody (Getting Started with Python) - University of Michigan (Coursera) The Data Scientist’s Toolbox - Johns Hopkins University (Coursera) Practical Machine Learning - Johns Hopkins University (Coursera) Exploratory Data Analysis - Johns Hopkins University (Coursera) Reproducible Research - Johns Hopkins University (Coursera) Python for Genomic Data Science - Johns Hopkins University (Coursera) Python (CodeAcademy) Introduction to SQL (CodeAcademy) Principles of Biochemistry – HarvardX (edX) Learning Python for Data Analysis and Visualization (Udemy) Научные интересы Изучение физиологической роли липидов в работе нервной системы животных, изучение путей превращения и их физиологической значимости для биоэффекторных липидов, изучение роли сигнальных липидов в процессах регенерации, разработка новых лекарственных препаратов на основе биоэффекторных липидов. Научные достижения 1. Охарактеризованы пути биосинтеза и катаболизма N-ацилдофаминов в печени, головном и спинном мозге крысы и в гомогенате пресноводной гидры. 1 2. В организме пресноводных гидр Hydra attenuata и Hydra magnipapillata идентифицирован Nдокозагексаеноилдофамин. 3. Разработана тест-система для оценки гидролитической стабильности пептидов и других соединений при пероральном введении на основе фрагментов желудочно-кишечного тракта крысы. Работа Лаборатория оксилипинов ИБХ РАН, инженер-исследователь, 2005-2008 ООО Пептос-Фарма, инженер-исследователь, 2008-2009 Лаборатория химии липидов ИБХ РАН, научный сотрудник (на временной ставке на время по уходу за ребенком), 2009-2011 Лаборатория оксилипинов, научный сотрудник, 2011-наст. вр. Статьи (15) 2011-2016: 1 А.М. Ашба, М.Г. Акимов, Н.М. Грецкая, В.В. Безуглов N-ацилдофамины вызывают гибель клеток феохромоцитомы РС12 за счет индукции генерации оксида азота и окислительного стресса. Докл. Акад. Наук, 1016, 467, 1, 101-104. 2 Akimov MG Gretskaya NM Zinchenko GN, Bezuglov VV: Cytotoxicity of endogenous lipids N-acyl dopamines and their possible metabolic derivatives for human cancer cell lines of different histological origin Anticancer Res 35: 2657-2661, 2015. 3 Akimov MG Ashba AM Gretskaya NM, Bezuglov VV: Some aspects of the Mechanism of Cell Death Induction by the Lipids of N-Acyl Dopamines Family in PC12 and C6 Cancer Cell Lines Anticancer Res 34: 5797-5800, 2014. 4 Акимов МГ Фомина-Агеева ЕВ, Безуглов ВВ: Оптимизация процедуры количественного анализа оксида азота для его определения в среде культивирования клеток млекопитающих Биоорг Хим 41: 74-81, 2015. 5 Акимов МГ Грецкая НМ Синицына ИА Ефремова АС Андреева ЛА Шрам СИ Безуглов ВВ, Мясоедов НФ: Синтез нового флуоресцентного аналога проглипрола и исследование механизмов его транспорта в культивируемые клетки феохромоцитомц крысы Докл Акад Наук 460: 224-227, 2015. 6 Грецкая НМ Акимов МГ, Безуглов ВВ: Новый флуоресцентный аналог для исследования транспорта анандамида в клеточных культурах Биоорг Хим 40: 1-5, 2014. 7 Akimov MG Gretskaya NM Karnoukhova VA Serkov IV Proshin AN Shtratnikova VYy, Bezuglov VV: The Effect of Docosahexaenoic Acid Moiety on the Cytotoxic Activity of 1,2,4-Thiadiazole Derivatives Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry 8: 43-46, 2014. 8 Акимов МГ, Безуглов ВВ: Биоактивные липиды семейства ацилдофаминов как компонент системы противораковой защиты организма Современная Медицина: Актуальные Вопросы 20-27, 2013. До 2011 9 Акимов МГ Назимов ИВ Грецкая НМ Дейгин ВИ, Безуглов ВВ: Исследование стабильности 2 10 11 12 13 14 15 16 пептидов в условиях гидролиза фрагментами органов желудочно-кишечного тракта крысы Биоорг Хим 36: 753-759, 2010. Остроумова ТВ Маркова ЛН Акимов МГ Грецкая НМ, Безуглов ВВ: Докозагексаеноил дофамин в пресноводной гидре: влияние на регенерацию и метаболические превращения Онтогенез 41: 199-203, 2010. Безуглов ВВ Грецкая НМ Бобров МЮ Акимов МГ Фомина-Агеева ЕВ Зинченко ГН Баирамишвили ДИ, Мирошников АИ: Модификация рекомбинантных белков методом ковалентного полисиалирования на примере инсулина человека Биоорг Хим 35: 274-278, 2009. Безуглов ВВ Грецкая НМ Клинов ДВ Бобров МЮ Шибанова ЕД Акимов МГ Фомина-Агеева ЕВ Зинченко ГН Баирамашвили ДИ, Мирошников АИ: Нанокомплексы рекомбинантных белков с полисиаловой кислотой. Получение и биологическая активность Биоорг Хим 35: 350-356, 2009. Акимов МГ Назимов ИВ Грецкая НМ Зинченко ГН, Безуглов ВВ: Сульфатирование Nацилдофаминов в тканях крысы Биохимия 74: 836-841, 2009. Маркова ЛН Остроумова ТВ Акимов МГ, Безуглов ВВ: N-арахидоноилдофамин - возможный регулятор скорости закладки щупалец у пресноводной гидры при регенерации Онтогенез 39: 66-71, 2008. Акимов МГ Грецкая НМ Шевченко КВ Шевченко ВП Мясоедов НФ Бобров МЮ, Безуглов ВВ: Новые аспекты биосинтеза и метаболизма N-ацилдофаминов в тканях крысы Биоорг Хим 33: 648--652, 2007. Безуглов ВВ Грецкая НМ Блаженова АВ Андрианова ЕЛ Акимов МГ Бобров МЮ Назимов ИВ Кисель МА Шарко ОЛ Новиков АВ Краснов НВ Шевченко ВП Шевченко КВ Вьюнова ТВ, Мясоедов НФ: Арахидоноиламинокислоты и арахидоноилпептиды: синтез и свойства Биоорг Хим 32: 258-267, 2006. Главы в монографиях (7) 2011-2016: 1. Bobrov MYu Akimov MG Gretskaya NM Serkov IV Barskov IV Khaspekov LG, Bezuglov VV: Endocannabinoids, Endovanilloids, Related Neurolipins as Multifunctional Protective Lipids . In: Endocannabinoids: Chemical structure, role in physiological processes, therapeutic effects (Garza T (ed.).NY, Nova Science Publishers, 2015. 2. Bezuglov VV Akimov MG Gretskaya NM Surin AM Pinelis VG Shram SI Vyunova TV Shevchenko KV,reeva LA, Myasoedov NF: The Study of the Neurotropic Peptides Role in Cell Responses Regulation . In: Horizons in neuroscience research (Costa A, Villalba E (eds.). NY, Nova Science Publishers, pp 151-170, 2015. 3. Бобров МЮ Грецкая НМ Акимов МГ, Безуглов ВВ: Нейролипины – эндогенные нейропротекторы при ишемии мозга и основа для создания новых гибридных мультифункциональных препаратов. In: Нейродегенеративные заболевания: От генома до целостного организм (Угрюмов МВ (ed.).Москва, Научный мир, pp 726-763, 2015. 4. Bezuglov VV Akimov MG, Serkov IV: Hybrid Multifunctional Ibuprofen Drugs: New Generation, Novel Possibilities . In: Ibuprofen: Clinical pharmacology, medical uses, adverse effects (Carter WC, Brown BR (eds.). New York, Nova Science Publishers, Inc., pp 275-310, 2013. 5. Akimov MG, Bezuglov VV: N-Acylated Dopamines: A New Life for the Old Dopamine. In: Dopamine: Functions, regulation, health effects (Kudo E, Fujii Y (eds.). NY, Nova Science Publishers, pp 49-80, 2012. 6. Akimov MG, Bezuglov VV: Methods of Protein Digestive Stability Assay - State of the Art. In: New advances in the basic, clinical gastroenterology (Brzozowski T (ed.).InTech, pp 211-234, 2012. 3 До 2011: 7. Акимов МГ: Мембраны и рак. In: Липиды и рак. Очерки липидологии онкологического процесса (Безуглов ВВ, Коновалов СК (eds.). СПб, Прайм-ЕВРОЗНАК, pp 47-79, 2009. Тезисы докладов (37) 2011-2016: 1. Proglyprol conjugates with docosahexaenoic acid and dopamine induce neuromorphogenesis in C6 glioma and PC12 pheochromocytoma cell lines; 40th FEBS congress . Berlin: 2015. Стендовый 2. Bioactive lipids of N-Acyl dopamine family induce cancer cell apoptosis via oxidative stress and nitric oxide; 2015 cis-rorea conference on science and technology. Moscow: Publishing house of MIS&S; 2015. Приглашенный 3. Morphogenetic effects of n-docosahexaenoyl dopamine on PC12 and C6 cell lines ; Russian-German biotech-2015. Russian-German forum "bioeconomy and biomedicine". Pushchino: 2015. Устный 4. Эндоканнабиноиды и эндованилоиды: Как липиды защищают нас от рака; XXVII зимняя молодежная научная школа «Перспективные направления физико- химической биологии и биотехнологии». Москва: 2015. Устный 5. Возможный механизм цитотоксического действия ацилдофаминов на клетки феохромоцитомы PC12; XXVII зимняя молодежная научная школа «Перспективные направления физико- химической биологии и биотехнологии». Москва: 2015. Устный 6. A possible mechanism of cancer cell toxicity of the N-Acyl dopamines; International bioforum 2014, Russian-German session, programme & abstracts collection. Pushchino, Russia: 2014. Устный 7. Synthesis of BODIPY labeled nootropic peptides PGP, HFPGP and MEHFPGP and their transport to pheochromocytoma cell line PC12; International conference on bioorganic chemistry, biotechnology and bionanotechnology, dedicated to the 55th anniversary of the M.M. Shemyakin and Yu.A.Ovchinnikov institute of bioorganic chemistry, Russian academy of sciences and the 80th anniversary of professor Yuri Ovchinnikov. Moscow, Russia: 2014. Стендовый 8. Acyl-dopamine-resistant glioma C6 cell line; International conference on bioorganic chemistry, biotechnology and bionanotechnology, dedicated to the 55th anniversary of the M.M. Shemyakin and Yu.A.Ovchinnikov institute of bioorganic chemistry, Russian academy of sciences and the 80th anniversary of professor Yuri Ovchinnikov. Moscow, Russia: 2014. Стендовый 9. Influence of acyl dophamines on inflammatory response in macrophages RAW264.7 culture; International conference on bioorganic chemistry, biotechnology and bionanotechnology, dedicated to the 55th anniversary of the M.M. Shemyakin and Yu.A.Ovchinnikov institute of bioorganic chemistry, Russian academy of sciences and the 80th anniversary of professor Yuri Ovchinnikov. Moscow, Russia: 2014. 10. Влияние присоединения этаноламидов жирных кислот на противовоспалительную активность ибупрофена, индометацина и диклофенака; XXVI зимняя молодежная научная школа «перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии». Москва: 2014. Устный 11. Синтез эфиров этаноламидов жирных кислот и нестероидных противовоспалительных средств; XXVI зимняя молодежная научная школа «перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии». Москва: 2014. Стендовый 12. Докозагексаеноилдофамин индуцирует дифференцировку в клетках крысиной глиомы линии С6; Липидология – наука XXI века: II всероссийская научная интернет - конференция с международным участием : Материалы конф. (Казань, 11 ноября 2014 г.). Казань: 2014. Устный 13. Новые экспериментальные системы для изучения протеолиза терапевтически значимых белков и пептидов; Протеолитические ферменты: Структура, функции, эволюция. VII всероссийская конференция. Петрозаводск: Карельский научный центр РАН; 2014. Стендовый 14. The biochemistry and signaling of bioactive lipids of N-acyl dopamines group; 38th FEBS congress 2013. St. Petersburg, Russia: 2013. Устный 4 15. Нейролипины – основа эндогенной липидной нейрозащитной системы; XXII съезд физиологического общества им. И.П. Павлова. Волгоград: ВолгГМУ; 2013. Стендовый 16. Дининтроглицериновый эфир простагландина Е как донор оксида азота; Липидология – наука XXI века: I международная научно - практическая интернет - конференция: Материалы конф. (Казань, 26 ноября 2013 г.). Казань: ИП Синяев Д. Н.; 2013. Стендовый 17. Взаимодействие метилированных и окисленных метаболитов N-ацилдофаминов с ванилоидным (TRPV1) и каннабиноидными (СВ1, СВ2) рецепторами; Липидология – наука XXI века: I международная научно - практическая интернет - конференция: Материалы конф. Казань: ИП Синяев Д. Н.; 2013. Устный 18. N-Ацилдофамины: Вчера, сегодня, завтра; Материалы XXV международной зимней молодёжной научной школы "перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии". Москва: ИБХ РАН; 2013. Устный 19. Биоактивные липиды семейства ацилдофаминов как компонент системы противораковой защиты организма; «Современная медицина: Актуальные вопросыя»: Материалы международной заочной научно-практической конференции. Новосибирск: СибАК; 2013. Стендовый 20. The metabolism and cannabinoid receptor binding of N-acyl dopamines in rat tissues; 8th FENS forum of neuroscience. Barcelona, Spain: 2012. Стендовый 21. Acylated neurotransmitters as potential therapeutic agents for neurodegenerative disorders; RussianGerman symposium "molecular neurobiology today and tomorrow". Moscow: 2012. Устный 22. Василов РГ, editor. Нейролипины – основа создания нового поколения лекарственных препаратов для борьбы с нейродегенеративными заболеваниями; Биология – наука XXI века: Материалы международной конференции. Москва: МАКС Пресс; 2012. Стендовый 23. Ацилнейротрансмиттеры и простамиды – новые метаболически связанные семейства биоактивных липидов; Биология – наука ХХI века: 16-я международная пущинская школаконференция молодых ученых. Пущино: 2012. Устный 24. N-ацилдофамины – ключевой компонент липидной системы противораковой защиты; Материалы 2-й всероссийской научной конференции молодых ученых "проблемы биомедицинской науки третьего тысячелетия". Санкт-Петербург: 2012. Стендовый 25. Разработка инновационного лекарственного средства на основе пептолипинов для борьбы с нейродегенеративными процессами; Фундаментальные науки - медицине. Тезисы докладов на конференциях и семинарах, проведенных в рамках научных подпрограмм в 2012 году. Москва: Слово; 2012. Стендовый 26. Гидролитическая стабильность пептидов в желудочно-кишечном тракте крысы; V российский симпозиум белки и пептиды. Петрозаводск: 2011. Стендовый 27. От ацилдофаминов к простамидам: Липидная вселенная продолжает расширяться; Научная конференция по биоорганической химии и биотехнологии "Х чтения памяти академика юрия анатольевича овчинникова". Москва-Пущино: 2011. Устный До 2011: 28. Fatty acids acylated neurotransmitters (FANT) as neuroactive lipids; German-Russian symposium: “Molecular neurobiology today and tomorrow”. Berlin, Germany: 2010. Устный 29. N-acyldopamines as multifunctional lipid regulators; Международная научная конференция по биоорганической химии, биотехнологии и бионанотехнологии, посвящённой 75-летию со дня рождения акад. Ю.А. Овчинникова. Москва: 2009. Устный 30. Метаболизм N-ацилдофаминов в тканях и клетках животных; Международная научная конференция по биоорганической химии, биотехнологии и бионанотехнологии, посвящённой 75летию со дня рождения акад. Ю.А. Овчинникова. Москва: 2009. Устный 31. Возможное участие N-арахидоноилдофамина в регуляции морфогенеза пресноводной гидры при регенерации; VI сибирский физиологический съезд. Барнаул: 2008. Стендовый 32. Метаболизм n-дофаминамидов арахидоновой и докозагексаеновой кислот в гомогенате H. 1 5 Magnipapillata; Всероссийская конференция, посвященная 90-летию со дня рождения акад. Т. М. Турпаева "механизмы нервных и нейроэндокринных регуляций" . Москва: 2008. Стендовый 33. Метаболизм эндогенных дофаминамидов жирных кислот в тканях крысы; XIX зимняя молодёжная научная школа «перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии». Москва: 2007. Стендовый 34. Neurolipins – multivalent effectors of polyligand receptors; Симпозиум с международным участием «нейрорецепторы: Структура, механизм действия и роль в патологиях». Москва: 2007. Устный 35. Метаболизм N-арахидоноилдофамина в гомогенатах печени и головного мозга крысы; VIII чтения, посвященные памяти академика Ю.А. Овчинникова. Москва-Пущино: 2006. Стендовый 36. От ациламинокислот к N-ацилпептидам; II российский симпозиум по химии и биологии пептидов. СПб: 2005. Стендовый 37. Судьба рахидоноилдофамина в клетке ; XVII зимняя молодежная научная школа «перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии». Москва: 2005. Устный Патенты (2) 1 2 Безуглов ВВ, Грецкая НМ, Акимов МГ, Бобров МЮ Простамиды и их аналоги, обладающие нейрозащитным действием // Патент РФ 2474426.- Заявка 2011153003 от 26 декабря 2011 Безуглов ВВ, Грецкая НМ, Бобров МЮ, Акимов МГ, Баирамашвили ДИ, Шибанова ЕД, Клинов ДВ, Мирошников АИ Комплекс биологически активного рекомбинантного белка с полисиаловой кислотой // Патент РФ 2391354.- Заявка 2008140687 от 15 октября 2008 Руководство грантами (3) 1 2 3 МК-3842.2015.4 Новый подход к поиску механизмов цитотоксического действия ацилдофаминов 2015-2016 МинОбрНауки СП-1256.2012.4 Эндованилоиды – ключевой компонент эндогенной липидной системы противораковой защиты 2012-2014 МинОбрНауки МК-4679.2012.4 Биогенные производные N - ацилдофаминов как лиганды ключевых рецепторов каннабиноидно - ванилоидной системы 2012-2013 МинОбрНауки Участие в грантах в качестве исполнителя (14) 1 2 3 4 5 6 7 8 16-04-00729-a Ацилдофамины как фактор дифференцировки трансформированных клеток 2016-2018 РФФИ 09-04-00317-а Циклооксигеназные метаболиты нейроактивных липидов и их производные как потенциальные нейропротекторы 2009-2011 РФФИ 11-04-01469-а Трансмиттеры и их аналоги в регуляции различных процессов онтогенеза 2011-2013 РФФИ 12-04-00608-а Новые гибридные соединения на основе нейролипинов и простамидов с сочетанным нейрозащитным и противовоспалительным действием 2012-2014 РФФИ 13-04-40085-Н Модифицированные пептиды для изучения механизма действия и повышения эффективности пептидов семакса, селанка и проглипрола 2014-2015 РФФИ 14.740.11.0116 Структурно-функциональные исследования ряда потенциальных препаратов корректоров заболеваний системы кроветворения у человека и животных. 2010-2012 МинОбрНауки 14.740.11.0181 Создание математической модели динамики активации системы комплемента, являющейся частью иммунной системы, c участием фактора XII и калликреина 2010-2012 МинОбрНауки 14.740.11.0422 Создание интерактивной базы биологических данных по видам-вселенцам Черного и Каспийского морей с учётом их происхождения и вектора заноса в водоем для анализа 6 9 10 11 12 13 14 15 их катастрофического воздействия на состояние данных экосистем. Разработка мер по предупреждению природных катастроф, вызванных появлением новых видов-вселенцев 2010-2012 МинОбрНауки 14.740.11.0810 Разработка принципов создания нейропротекторов нового поколения на основе гетероциклических сера- и селенсодержащих соединений с NO-генерирующим фрагментом 2010-2012 МинОбрНауки 02.740.11.0865 Лиганд-управляемые ионные каналы: выяснение механизмов действия и создание новых пептидных модуляторов 2010-2012 МинОбрНауки 02.512.11.2205 Создание новых потенциальных иммуно- и гемотропных терапевтических препаратов на основе низкомолекулярных производных пептидов и пептидомиметиков, обладающих повышенной устойчивостью к энзиматическому расщеплению в организме. 2008-2009 МинОбрНауки ГП/07/599/НТБ/к Разработка технологий диагностики и коррекции здоровья человека с использованием морфологического анализа биологических жидкостей при воздействии токсических факторов и создание на этой основе медицинских препаратов нового поколения пептидного происхождения, шифр "Пептид" 2007-2009 МинПромТорг 04-04-81028-Бел2004_а N-арахидоноиламинокислоты и их производные как модуляторы ферментов биосинтеза и превращений биоэффекторных липидов" 2004 -2006 РФФИ 05-04-48293-а Множественность онтогенетических функций биогенных моноаминов и ацетилхолина и возможность существования их эндогенных конъюгатов с жирными кислотами" 2005-2007 РФФИ 08-04-00144-а Функции биогенных моноаминов и их ацилированных производных в регуляторных процессах индивидуального развития" 2008-2010 РФФИ Руководство студентами (7) 1 2 3 4 5 6 7 Шабардина В.А. Диплом/Специалист МГУ им. М.В. Ломоносова Ашба А.М. Диплом/Бакалавр МГУ им. М.В. Ломоносова Ашба А.М. Диплом/Магистр МГУ им. М.В. Ломоносова Кусакина А.В. Диплом/Бакалавр РХТУ им. Д.И. Менделеева Волкова Ю.С. Диплом/Бакалавр РХТУ им. Д.И. Менделеева Шилков Н.Н. летняя практика МГУ им. М.В. Ломоносова Полианчик Д.А. летняя практика МФТИ Награды (2) 1 2 Диплом 1 степени МАИК «Наука» за лучшую публикацию, 2006 г. Диплом 3 степени на Конкурсе молодых ученых в рамках VIII чтений, посвященных памяти академика Ю.А. Овчинникова, ИБХ РАН, Москва, 25—27 октября 2006 г. Научные программные продукты (2) 1 База данных хроматограмм для программы Мультихром и программно-аппаратного комплекса Милихром-А02 2 База данных химических структур, сопряженная с базой данных хроматограмм и массспектров. Лекции (3) 1 2 3 Лекция в составе курса Биоэффекторные липиды Семинар в составе курса Компьютерная грамотность для аспирантов ИБХ РАН (до 2014 г.) Курс лекций Биохимия для аспирантов ИБХ РАН 7 Сведения о цитируемости общее/за 5 лет elibrary Web of Science Scopus h-индекс 4 2 3 число публикаций 27/13 14/8 24/14 16/13 23/21 число 51/36 цитирований 8