Prosite. 1) Паттерн по множественному выравниванию. ENO_PSEPK: MIELDGTENKAKLGANAILAVSLAAAKAAA ENO1_PSESM:MIALDATENKASLGANAILAVSLAAAKAAA ENO_ACIAD: MIELDGTENKEKLGANATLAVSLAAARAAA ENO_BACCZ: MIELDGTPNKGKLGANAILGVSMAVAHAAA ENO_CORDI: MIALDGTENKSRLGANAILGVSIAVAKAAA ENO_RALSO: LIDLDGTENKGRLGANATLAVSMAVAKAAA ENO_BUCAI: MIDLDGTINKSKLGANAILSVSLAVAKAAA ENO_BUCAP: MINLDGTENKSNLGSNSILSVSLATAKAAA ENO_WIGBR: MINLDGTKNKSNLGANAILAVSLANAKAAS ENO_BUCBP: MINLDGTKNKSKIGANSILSVSIATAKAAA Вид паттерна: [ML]-I-X-L-D-[GA]-T-X-N-K-X(2)-[LI]-G-[AS]-N-[AS]-[IT]-L-X-V-S[LMI]-A-X-A-[KRH]-A-A-[AS]. 2) Поиск по паттерну в банке данных SWISS-Prot. Результаты: o Мотив, удовлетворяющий паттерну, найден в 76 последовательностях. o Найдены ВСЕ(!) последовательности из данного выравнивания. o Ни у одной из последовательностей название не «выбивается» из общего ряда, у всех в названии есть ENO. 3) Все известные паттерны в белке ENO_ECOLI. Известные сайты и мотивы в белке ENO_ECOLI. Идентификатор документа PROSITE (AC) Идентификато р документа с описанием мотива Название мотива PS00008 PDOC00008 Сайт Nмиристоилирования PS00001 PDOC00001 PS00005 PDOC00006 PS00006 PDOC00006 PS00007 PDOC00007 PS00009 PDOC00009 Паттерн (регулярное выражение) Насколько подпись специфична ? Сколько мотивов нашлось в белке? паттерн G-[GASVMLIQ]x(2)-[GAST][MSLVDIQG] неспецифич на 11 паттерн N-K-S-K неспецифич на 1 паттерн [TS]-x-[KR] неспецифич на 3 паттерн [TS]-x(2)-[ED] неспецифич на 8 паттерн KmakDag.Y специфична 1 паттерн n-G-R-K неспецифич на 1 Тип подписи (паттерн, профиль) Например, Сайт Nгликозилирования Сайт фосфорилирования протеинкиназой С Сайт фосфорилирования казеинкиназой II Сайт фосфорилирования тирозинкиназой Сайт амидирования