Приложение

Приложение
к инструкции по применению набора реагентов для детекции
генетических полиморфизмов методом пиросеквенирования
с применением системы генетического анализа серии
PyroMark
«АмплиСенс Пироскрин»
«ПЛАЗМО-скрин»
Профиль генетического исследования
«Плазменные факторы системы свертывания крови»
Форма 6: REF PMQ-001-50-F / VER 25.08.11 / стр. 1 из 10
Комплект реагентов «ПЛАЗМО-скрин» – комплект реагентов для амплификации и
пиросеквенирования – включает:
Реактив
ПЦР-смесь-1 ПФ-1
ПЦР-смесь-1 ПФ-2
ПЦР-смесь-1 ПФ-3
ПЦР-смесь-1 ПФ-4
ПЦР-смесь-1 ПФ-5
Полимераза (TaqF)
2,5х ПЦР-буфер blue
Минеральное масло
для ПЦР
Праймер для
секвенирования ПФ-1-S
Праймер для
секвенирования ПФ-2-S
Праймер для
секвенирования ПФ-3-S
Праймер для
секвенирования ПФ-4-S
Праймер для
секвенирования ПФ-5-S
Описание
Прозрачная
бесцветная жидкость
Прозрачная
бесцветная жидкость
Прозрачная
бесцветная жидкость
Прозрачная
бесцветная жидкость
Прозрачная
бесцветная жидкость
Прозрачная
бесцветная жидкость
Прозрачная жидкость
синего цвета
Бесцветная вязкая
жидкость
Прозрачная
бесцветная жидкость
Прозрачная
бесцветная жидкость
Прозрачная
бесцветная жидкость
Прозрачная
бесцветная жидкость
Прозрачная
бесцветная жидкость
Локус
(полиморфизм)
F2
(20210 G>A)
F5
(R534Q G>A)
F7
(R353Q G>A)
FGB
(455 G>A)
SERPINE1
(–675 5G>4G)
Объем,
мл
Кол-во
0,275
1 пробирка
0,275
1 пробирка
0,275
1 пробирка
0,275
1 пробирка
0,275
1 пробирка
–
0,03
5 пробирок
–
0,6
5 пробирок
–
4,0
2 флакона
0,33
5 пробирок
0,33
5 пробирок
0,33
5 пробирок
0,33
5 пробирок
0,33
5 пробирок
F2
(20210 G>A)
F5
(R534Q G>A)
F7
(R353Q G>A)
FGB
(455 G>A)
SERPINE1
(–675 5G>4G)
Комплект реагентов рассчитан на проведение 55 реакций пиросеквенирования для
каждого исследуемого генетического локуса.
К комплекту реагентов прилагается следующий реагент:
Реактив
ОКО
Описание
Прозрачная бесцветная
жидкость
Объем, мл
Кол-во
1,2
1 пробирка
Форма 6: REF PMQ-001-50-F / VER 25.08.11 / стр. 2 из 10
Анализируемые полиморфизмы
Локус
Продукт
Полиморфизм
rs
Последовательность
для анализа
Анализ
F2
Протромбин
20210 G>A
rs1799963
CTC/TGCTGAGA
обратный
F5
Фактор Лейдена
R534Q G>A
rs6025
C/TGCCTGTCCA
обратный
F7
Коагуляционный
фактор VII
R353Q G>A
rs6046
CG/AGGGCACGTGG
прямой
455 G>A
rs1800790
C/TATTAAAATCAATAG
обратный
–675 5G>4G
rs1799768
GAGTCAGC
прямой
FGB
SERPINE1
Фибриноген
Ингибитор
активатора
плазминогена
Варианты
генотипа
GG
GA
AA
GG
GA
AA
GG
GA
AA
GG
GA
AA
5G/5G
5G/4G
4G/4G
Форма 6: REF PMQ-001-50-F / VER 25.08.11 / стр. 3 из 10
СХЕМЫ ОЖИДАЕМЫХ РЕЗУЛЬТАТОВ
Локус: F2, полиморфизм 20210 G>A
Генотип: GG
Генотип: GA
Генотип: AA
Форма 6: REF PMQ-001-50-F / VER 25.08.11 / стр. 4 из 10
Локус: F5, полиморфизм R534Q G>A
Генотип: GG
Генотип: GA
Генотип: AA
Форма 6: REF PMQ-001-50-F / VER 25.08.11 / стр. 5 из 10
Локус: F7, полиморфизм R353Q G>A
Генотип: GG
AG
1
E
S
T
C
A
G
G
C
A
C
G
G
G
C
A
C
G
Генотип: GA
AA
1
E
S
T
C
A
Генотип: AA
Форма 6: REF PMQ-001-50-F / VER 25.08.11 / стр. 6 из 10
Локус: FGB, полиморфизм 455 G>A
Генотип: GG
Генотип: GA
Генотип: AA
Форма 6: REF PMQ-001-50-F / VER 25.08.11 / стр. 7 из 10
Локус: SERPINE1, полиморфизм –675 5G>4G
Генотип: 5G/5G
Генотип: 5G/4G
Генотип: 4G/4G
Форма 6: REF PMQ-001-50-F / VER 25.08.11 / стр. 8 из 10
ПРИМЕРЫ РЕЗУЛЬТАТОВ
Локус: F2, полиморфизм 20210 G>A
C2: CTC/ TGCTGAGAGTCA
C : 100%
T: 0%
250
200
150
100
50
0
E
S
G
C
T
C
G
C
T
G
5
Генотип: GG
Локус: F5, полиморфизм R534Q G>A
A2: C/ TGCCTGTCCA
C : 98%
T: 2%
150
125
100
75
50
25
0
E
S
G
C
T
G
C
T
G
T
5
Генотип: GG
Локус: F7, полиморфизм R353Q G>A
C4: CG/ AGGGCACGTGG
A: 51%
G: 49%
400
300
200
100
0
E
S
T
C
A
G
G
C
A
C
G
5
Генотип: GA
Локус: FGB, полиморфизм 455 G>A
B6: C/ TATTAAAATCAATAG
C : 99%
T: 1%
500
400
300
200
100
0
E
S
G
C
T
A
T
A
A
T
C
A
5
Генотип: GG
10
Локус: SERPINE1, полиморфизм –675 5G>4G
B7: GAGTCAGCCG
200
150
100
50
0
E
S
Генотип: 5G/4G
C
G
A
G
T
C
5
Форма 6: REF PMQ-001-50-F / VER 25.08.11 / стр. 9 из 10
Лист вносимых изменений
Редакция
Место внесения
изменений
Суть вносимых изменений
Название «АмплиСенс® ПироМарк-SNP» исправлено на
«Пироскрин»
Название столбца «Локус» исправлено на «Локус
(полиморфизм)»
В название ПЦР-смесей-1 добавлено обозначение R
Внесена информация о том, что ПЦР-смесь-1-R
Таблица состава
раскапана под воск
Добавлен информация об объеме пробирок (0,2 или
0,5 мл)
Добавлена информация о прилагаемом реагенте – ОКО
Каталожный номер PMQ-001 исправлен на PMQ-001Нижний колонтитул
R0,5 и PMQ-001-R0,2
Добавлено краткое название приложения – «ПЛАЗМОТитульный лист
скрин»
Название комплекта реагентов «ПЦР-комплект»
исправлено на «ПЛАЗМО-скрин»
Объем и количество реагентов ПЦР-смесь-1 изменено
с 0,005 мл – 55 пробирок на 0,275 мл – 1 пробирка
Из названия ПЦР-смеси-1 удалено R
Информация о том, что ПЦР-смесь-1 раскапана под
воск удалена
Состав
Реагент ПЦР-смесь-2-blue заменен на 2,5х ПЦРбуфер blue
Добавлен реагент полимераза (TaqF) (0,03 мл –
5 пробирок)
Добавлен столбец «Описание»
В столбец «Локус (полиморфизм)» добавлены
полиморфизмы
Нижний
Изменен кат. номер: PMQ-001-50-F вместо PMQ-001колонтитул
R0,5 и PMQ-001-R0,2
Таблица
Для локуса F7 изменена последовательность для
«Анализируемые анализа с TACCG/AGGGCACGTG на
полиморфизмы»
CG/AGGGCACGTGG
Схемы ожидаемых Для локуса F7, полиморфизм R353Q G>A, заменены
результатов
схемы ожидаемых результатов
Примеры
Для локуса F7, полиморфизм R353Q G>A, генотип GG
результатов
заменен на генотип: GA (изменен пример результатов)
Название набора Название набора «Пироскрин» изменено на
реагентов
«АмплиСенс® Пироскрин»
Титульная
Добавлен символ, обозначающий «изделие для in vitro
страница
диагностики»
Нижний
«Кат. №» и «дата изменения» заменены на
колонтитул
соответствующие символы
Название
12.10.10
10.05.11
LA
27.06.11
VV
02.08.11
VV
25.08.11
VV
Форма 6: REF PMQ-001-50-F / VER 25.08.11 / стр. 10 из 10