инновации програмных продуктов и тест

ИННОВАЦИИ ПРОГРАМНЫХ ПРОДУКТОВ И ТЕСТ-СИСТЕМ В
РАМКАХ «АВТОМАТИЗИРОВАННОГО РАБОЧЕГО МЕСТА
МИКРОБИОЛОГА,ЭПИДЕМИОЛОГА И ХИМИОТЕРАПЕВТА».
НЕХОРОШЕВА А.Г. СКАЛА Л.З., ЛУКИН И.Н.
ГКБ № 15 им. О.М. Филатова, г. Москва
www.medproject-3.com
«Автоматизированное рабочее место микробиолога, эпидемиолога и
химиотерапевта», состоящее из двух программ: «Микроб-Автомат» и сетевая
версия программы «Микроб-2» постоянно модернизируется, как в плане
совершенствования программных продуктов, так и включении новых тестсистем для идентификации микроорганизмов различных групп. В плане
программных продуктов: обновлена экспертная система, увеличилось
количество микроорганизмов и антибактериальных препаратов, расширились
возможности печати выходных данных (отчеты и бланки анализов), создана
возможность предварительного просмотра выходных форм и сохранение их в
формате PDF, CSV, RTF (табличный вариант). Появилась возможность
сортировать по алфавиту и по группам антибактериальных препаратов списки
антибиотиков в бланках анализов. Идентификация микроорганизмов различных
групп
предполагает
использование
тест-систем
«Микро-Ла-Тестов»
производства ПЛИВА-Лахема. Все тест-системы представляют собой
стриппированные плоскодонные 96 луночные планшеты с внесенными
биохимическими тестами в количестве от 8 до 24 тестов в зависимости от вида
идентифицируемых микроорганизмов.
Обработка результатов биохимических и других тестов на заключительном
этапе идентификации представляет собой сложный процесс, занимающий
много времени. Поэтому для идентификации микроорганизмов различных
групп разработаны компьютерные программы, позволяющие регистрировать
результаты как визуального считывания результатов биохимических реакций
(программа «Микроб-2») так и автоматизированного (программа «МикробАвтомат»). Преимуществом использования программ является возможность
расширения числа идентифицируемых видов микроорганизмов, спектра
изучаемых признаков (тестов) и получения стандартных, воспроизводимых и
сопоставимых результатов. Идентификация микроорганизмов в программах
основана на обработке результатов выполненных тестов. В данной версии
программ
предоставлена
возможность
идентификации
более
500
микроорганизмов различных групп. Для этого на каждую группу
микроорганизмов составляется «банк» данных, представляющий собой
обобщенные сведения о частоте встречаемости того или иного теста у
микроорганизмов различных видов. При проведении идентификации визуально
или автоматизировано учитывают результаты выполненных тестов, отмечая их
«+» при положительной реакции и «-» при отрицательной. Если результат
реакции нечеткий, для этого теста вводится знак «?». Разработанные банки
данных представляют собой «открытые» системы, так как кроме тестов,
2
включенных в тест-систему, позволяют пользователю вносить дополнительную
информацию, полученную при первичном посеве (гемолиз, рост на
дифференциально-элективных средах, наличие пигмента, каталаза, оксидаза и
др.), а также результаты традиционных тестов, поставленных одновременно с
тест-системой (подвижность, O/F) или рекомендуемых программой для
разделения возможных вариантов культур.
В том случае, когда в результате обработки тестов на экран выводится две
и более культур, выдается перечень атипичных тестов для каждой культуры и
предлагаются разделительные тесты, после внесения которых программа
заново рассчитывает результат идентификации и выдает готовый бланк
анализа.
После внесения результата дополнительного теста СGL «+», программа
рассчитывает результат идентификации и выдает готовый бланк анализа.
Номер анализа:
ФИО:
Отделение:
Материал:
Выделена культура:
910
Сидоров И.И.
Проктология
отделяемое из раны
Staphylococcus aureus spp. ssp aureus
Результат идентификации включает:
3
1. Наименование наиболее вероятного или вероятных микроорганизмов из
имеющихся в банке данных.
2. Подобие (вероятность), %ид - показатель, показывающий насколько
полученный профиль соответствует идентифицированному микробу в
сравнении с другими таксонами, включенными в данный банк данных. Этот
показатель может варьироваться от 0 до 100%.
3. Т-индекс (Тин) - показывает насколько идентифицированный микроб по
своему профилю соответствует данному таксону. Этот показатель колеблется
от 0 до 1 и обратно пропорционален количеству атипичных тестов.
4. Качественная оценка идентификации - определяется соотношением %ид
и Тин:
Оценка
%ид
Тин
Отлично
≥ 99.9
≥ 0.75
Очень хорошо
≥ 99.0
≥ 0.50
Хорошо
≥ 90.0
≥ 0.25
Приемлемо
≥ 85
≥ 0.10
5. Данные о несовпадающих (атипичных) тестах в полученном профиле
для каждого из вероятных таксонов с % положительных реакций, заложенных в
банке.
6. Перечень дополнительных разделительных тестов в случае получения
двух и более вероятных культур с указанием % положительных реакций для
каждого теста и таксона.
7. Идентификация до рода или группы микроорганизмов одного рода - в
случае неудовлетворительной идентификации для каждого из выбранных
таксонов, но дающих в сумме для двух и более таксонов одного родового
наименования удовлетворительные показатели.
К настоящему времени, к имеющимся уже тест-системам, фирма
разработала два новых: набора СТАФИтест 24 и КАНДИДАтест 21. Эти тестсистемы принципиально отличаются от ранее выпускаемых тем, что они не
нуждаются в дополнительных реактивах после инкубации и возможностью их
хранения при комнатной температуре.
Набор СТАФИтест 24 предназначен для идентификации микроорганизмов
рода Staphylococcus и родственных им других грамположительных каталазо
положительных кокков, встречающихся и имеющих значение в клинической
практике. Набор позволяет провести идентификацию 55 наименований
микроорганизмов, включающих следующих роды: Staphylococcus - 40.видов
Aerococcus - 1, Dermacoccus - 1, Kocuria - 3, Kytococcus - 1, Macrococcus - 6,
4
Micrococcus - 2, Rothia - 1. Набор включает 24 планшетных тестов. Регистрация
результатов работы биохимических тестов производится как визуально , так и
при фотометрическом считывании. В банки данных включены кроме того
обязательные тесты: определение коагулазы и резистентности к новобиоцину и
дополнительные ускоренные тесты ВПтест, ПИРАтест, ОКСИтест и другие при
рекомендации их компьютерными идентификационными программами.
Апробация тест-системы СТАФИтест 24 проведена на 16 музейных
культурах в том числе на 6 референтных штаммах, рекомендованных
инструкцией и 63 штаммах, выделенных из клинического материала.
Отработаны фотометрические параметры для автоматизированного считывания
биохимических реакций для 24 планшетных тестов. Составлен компьютерный
банк, включающий кроме планшетных 16 дополнительных тестов. При оценке
качества тест-системы с использованием музейных штаммов установлено
соответствие биохимического профиля паспортным данным для испытуемых
референтных культур. При работе с клиническими штаммами без
использования дополнительных тестов 86.2% изученных культур прошли с
оценкой отлично, очень хорошо и хорошо, 9.8% культур с оценкой приемлемо,
не идентифицировано 2 штамма (3,9%). Спектр идентифицированных культур
включал: Staphylococcus aureus spp. aureus (32 штамма), Staphylococcus
haemolyticus (12), Staphylococcus chromogenes (2), Staphylococcus simulans(1),
Staphylococcus auricularis (1), Staphylococcus xylosus (1), Staphylococcus cohnii
spp. Cohnii (1), Staphylococcus cohnii spp. Ureolyticus (1), Staphylococcus
epidermidis (8), Micrococcus luteus (1), Staphylococcus hominis (1), не
идентифицировано 2 культуры стафилококков.
Набор КАНДИДАтест 21 предназначен для рутинной биохимической
идентификации наиболее клинически значимых патогенных грибов при
использовании 21 планшетного теста в течении 24-х часов. Набор предназначен
для идентификации 49 видов грибов с использованием 21 биохимического
теста (используются хромогенные субстраты, реакции декарбоксилирования и
ассимиляции) и трех тестов негативных контролей каждой группы реакций для
упрощения регистрации результатов биохимических тестов. Набор содержит 5
стриппированных пластмассовых пластинок (4 трехрядных стрипа по 24
ячейки) с высушенными питательными средами и субстратами для 21 тестов.
При окончательной идентификации необходимо внести данные микроскопии:
трубки роста, псевдогифы и наличие артроспор. Спектр идентифицируемых
грибов с помощью тест-системы КАНДИДАтест 21 включает: род Candida - 34
вида, Cryptococcus - 7, Rhodotorula - 2, Saccharomyces - 1, Trichosporon - 3,
Geotrichum - 2.
Апробация тест-системы КАНДИДАтест 21 проведена на 6 музейных
культурах (5 видов) и 28 клинических штаммов. На основании проведенных
исследований
определены
фотометрические
параметры
считывания
биохимических реакций и разработана компьютерная идентификационная
программа. Перечень грибов, выделенных из клинического материала состоит
из: Candida albicans 1 (14 штаммов), Candida dubliniensis (1), Candida glabrata
5
(2), Candida kefyr (2), Candida krusei (2), Candida lusitaniae (2), Candida
parapsilosis (1), Trichosporon sp. RAF-/MEL- (1), Trichosporon beigelii (1).
При работе с клиническими штаммами грибов 20 изученных культур
прошли с оценкой отлично, очень хорошо и хорошо, 5 культур с оценкой
приемлемо, не идентифицировано 2 штамма.
Кроме описанных наборов фирма ПЛИВА-Лахема разработала β-лактам
тест в двух вариантах:
1. В виде диагностической полоски для быстрого выявления активности
бактериальной β-лактамазы ацидиметрическим методом. Гидролиз на полоске
выявляется смещением pH и изменением цвета ацидиметрического индикатора
в полоске. Ацидиметрическая методика эффективна для определения βлактамаз у стафилококков, нейсерий и гемофилов.
2. В виде диагностических дисков Нитроцефина. Данный препарат
пигментообразующий цефалоспорин, эффективный для выявления всех известных бета-лактамазных ферментов, которые гидролизуют связанные амиды в
бета-лактамном кольце Нитроцефина, в результате чего происходит изменение
желтого цвета на красный. Диски предназначены для быстрого выявления беталактамаз у Neisseria gonorrhoeae, Moraxella catarrhalis, Staphylococcus spp.,
Haemophilus influenzae и анаэробных бактерий.
Таким образом новые тест-системы СТАФИтест 24 и КАНДИДАтест 21
позволяют идентифицировать широкий спектр микроорганизмов в течение 24
часов как при визуальном считывании, так и при автоматизированном.
Проведенные исследования показали их высокую эффективность при
идентификации испытуемых групп микроорганизмов. Особо следует отметить
два достоинства этих тест-систем: хранение при комнатной температуре и
отсутствие необходимости добавления реактивов после инкубации.