МИНИСТЕРСТВО ОБРАЗОВАНИЯ И НАУКИ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования «Иркутский государственный университет» (ФГБОУ ВПО «ИГУ») «УТВЕРЖДАЮ» _____________________ Декан биолого-почвенного факультета «____»_____________20____г. Биолого-почвенный факультет факультет (институт) Кафедра физиологии растений, клеточной биологии и генетики кафедра ПРОГРАММА М4.П НАУЧНО-ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКОЙ ПРАКТИКИ Направление подготовки 020400 «Биология» Профиль подготовки «Биохимия и молекулярная биология» Степень (квалификация) выпускника - магистр Одобрена на заседании УМК биолого-почвенного факультета генетики «__ _» ______2012г. Протокол №__ __ Протокол №________ Председатель УМК___________ ______________ Рассмотрена на заседании кафедры физиологии растений, клеточной биологии и «__ _» _ 20 г. Зав. кафедрой: д.б.н., чл.-корр. РАН, проф. Саляев Р.К. 1 г. Иркутск 2 1. Цели научно-исследовательской практики Целями практики являются получение конкретных практических навыков, необходимых в последующей профессиональной деятельности магистров-биологов, а также сбор необходимого материала для выполнения выпускной квалификационной работы. 2. Задачи научно-исследовательской практики Задачами научно-исследовательской практики являются: 1. совершенствование навыков и методов проведения научных исследований по конкретной теме; 2. совершенствование навыков работы в научно-исследовательском коллективе, развитие чувства ответственности за качество выполняемых работ; 3. самостоятельное выполнение полевых, лабораторных, вычислительных исследований при решении научно-исследовательских и производственных задач с использованием современной аппаратуры и вычислительных средств; 4. накопление фактического материала и подбор научной литературы по выполняемой теме выпускной квалификационной работы; 5. обработка и анализ полученных данных, сопоставление результатов собственных исследований с имеющими в литературе данными. 3. Место научно-исследовательской практики в структуре основной образовательной программы (ООП) магистратуры Научно-исследовательская практика базируется на знании студентами (магистрами) биохимии, молекулярной биологии, физиологии растений, биофизики и цитологии, которые создают необходимую теоретическую базу и практические навыки для понимания и осмысления положений, излагаемых в данном курсе. Научно-исследовательская практика для будущих магистров, является неотъемлемой частью учебного процесса и направлена на углубление знаний по дисциплинам профиля «Биохимия и молекулярная биология», на освоение традиционных, классических и современных методов исследований, необходимых для наработки экспериментального материала для выполнения выпускной квалификационной работы. 4. Формы проведения научно-исследовательской практики Практика начинается с ознакомления студентов (магистров) с работой научно-исследовательских лабораторий института, задачами, формой проведения, распорядком рабочего дня, правилами ведения дневников и рабочих журналов. За студентами (магистрами) закрепляются рабочие места, выдается необходимая посуда и материалы, проводится инструктаж по технике безопасности при работе с химическими соединениями, пожарной безопасности, правилам работы в лабораториях. Научный руководитель практики осуществляет контроль соблюдением всех вышеперечисленных требований. Научно-исследовательская практика предполагает самостоятельную работу студента (магистра) и заключается в выполнении ими индивидуального задания, сбора фактического материала. Индивидуальным планом предусматривается работа студента (магистра) над конкретной темой. Индивидуальный план прохождения практики составляется научным руководителем. Студент (магистр) заранее знакомится с темой предстоящей работы и планом ее выполнения. В зависимости от поставленной задачи, студент (магистр) работает под руководством научного руководителя либо самостоятельно (при консультации руководителя практики), занимаясь отдельным узким вопросом исследования. Полученные в ходе выполнения данные являются в дальнейшем основой для подготовки выпускной квалификационной работы. 5. Место и время проведения научно-исследовательской практики 3 Основными базами (местами) прохождения практики по профилю «Биохимия и молекулярная биология» являются лаборатории следующих учреждений: Кафедра физиологии растений, клеточной биологии и генетики ФГБОУ ВПО «ИГУ». Кафедра физико-химической биологии ФГБОУ ВПО «ИГУ». НИИ биологии ФГБОУ ВПО «ИГУ». Сибирский институт физиологии и биохимии растений СО РАН. Лимнологический институт СО РАН. НИИ эпидемиологии и микробиологии ВСНЦ СО РАМН. Научный центр реконструктивной и восстановительной хирургии ВСНЦ СО РАМН. Иркутский научно-исследовательский противочумный институт Сибири и Дальнего Востока. Время проведения практики составляет 14 недель. 6. Компетенции обучающегося, формируемые в результате прохождения научно-исследовательской практики В результате прохождения научно-исследовательской практики обучающийся должен приобрести следующие общекультурные и профессиональные компетенции: Общекультурные компетенции: 1. Способен к творчеству (ОК-1). 2. Способен к инновационной деятельности (ОК-2). 3. Способен к адаптации и повышению своего научного и культурного уровня (ОК-3). 4. Понимает пути развития и перспективы сохранения цивилизации, связь геополитических и биосферных процессов, проявляет активную жизненную позицию, используя профессиональные знания (ОК-4). Профессиональные компетенции: 1. Понимает современные проблемы биологии и использует фундаментальные биологические представления в сфере профессиональной деятельности для постановки и решения новых задач (ПК-1). 2. Знает и использует основные теории, концепции и принципы в избранной области деятельности, способен к системному мышлению (ПК-2). 3. Самостоятельно анализирует имеющуюся информацию, выявляет фундаментальные проблемы, ставит задачу и выполняет полевые, лабораторные биологические исследования при решении конкретных задач по специализации с использованием современной аппаратуры и вычислительных средств, демонстрирует (ПК-3). 4. демонстрирует знание истории и методологии биологических наук, расширяющее общепрофессиональную, фундаментальную подготовку (ПК-4). 5. Демонстрирует знание основ учения о биосфере, понимание современных биосферных процессов, способность к их системной оценке, способность прогнозировать последствия реализации социально значимых проектов (ПК-5). 6. Творчески применяет современные компьютерные технологии при сборе, хранении, обработке, анализе и передаче биологической информации (ПК-6). 7. Понимает и глубоко осмысливает философские концепции естествознания, место естественных наук в выработке научного мировоззрения (ПК-7). 8. Использует навыки организации и руководства работой профессиональных коллективов, способен к междисциплинарному общению и к свободному деловому общению на русском и иностранных языках, работе в международных коллективах (ПК-8). 4 9. Профессионально оформляет, представляет и докладывает результаты научно-исследовательских и производственно-технологических работ по утвержденным формам (ПК-9). 10. Глубоко понимает и творчески использует в научной и производственно-технологической деятельности знания фундаментальных и прикладных разделов специальных дисциплин магистерской программы (ПК-10). 11. Умеет планировать и реализовывать профессиональные мероприятия (ПК-11). 12. Применяет методические основы проектирования и выполнения полевых и лабораторных биологических и экологических исследований с использованием современной аппаратуры и вычислительных комплексов (ПК12). 13. Самостоятельно использует современные компьютерные технологии для решения научно-исследовательских и производственно-технологических задач профессиональной деятельности, для сбора и анализа биологической информации (ПК-13). 14. Планирует и проводит мероприятия по оценке состояния и охране природной среды в соответствии со специализацией (ПК-14). 15. Использует знание нормативных документов, регламентирующих организацию и методику проведения научно-исследовательских и производственно-технологических биологических работ (ПК-15). 16. Имеет навыки формирования учебного материала, чтения лекций, готов к преподаванию в высшей школе и руководству научно-исследовательскими работами (ПК-16). 7. Содержание научно-исследовательской практики Общая трудоемкость научно-исследовательской практики составляет 28,5 единиц. № п/п Содержание практики 1 Общее знакомство с местом практики зачетных (научно-исследовательскими лабораториями института). 2 Составление и утверждение графика прохождения практики. 3 Прохождение инструктажа и сдача минимума по технике безопасности и охране труда. 4 Работа с научной литературой. 5 Освоение правил пользования и техники безопасности при работе на специальном научном оборудовании. 6 Освоение методов исследования. 7 Проведение самостоятельных экспериментальных исследований по индивидуальному плану. 8 Статистическая обработка данных, полученных в результате экспериментальных исследований. 9 Составление и оформление отчетов. 5 8. Учебно-методическое обеспечение самостоятельной работы студентов (магистров) на научно-исследовательской практике Углубление знаний по курсу осуществляется за счет организации самостоятельной работы студентов (магистров) по разделам, установленным программой дисциплины. 1. Техника безопасности и правила приборных исследований (рН-метрия, центрифугирование, полярография, спектрофотометрия, электрофорез). 2. Формирование понятия об эксперименте и понимание его значения. Актуальность исследования, его практическая и теоретическая значимость. 3. Техника безопасности и правила работы в биохимической лаборатории. 4. Подготовка посуды и расходных материалов для проведения эксперимента. 5. Приготовление буферных растворов. 6. Выращивание растительного материала и подготовка его для исследования. 7. Методы выделения и очистки различных субклеточных структур (дифференциальное центрифугирование). 8. Полярографический анализ энергетической активности изолированных органелл клетки и методы расчета параметров окислительной и фосфорилирующей активности митохондрий. 9. Спектрофотометрический метод определения набухания изолированных органелл клетки. 10. Методы выделения и очистки биологических макромолекул (белков). 11. Методы разделения белков с помощью электрофореза в полиакриламидном геле в нативных и денатурирующих условиях и расчета молекулярных масс белков. 12. Методы иммуноблоттинга. 13. Методы количественного определения белков. 14. Методы определения активности ферментов. 15. Методы статической обработки полученных данных. 9. Формы промежуточной аттестации (по итогам научно-исследовательской практики) Во время практики студенты (магистры) обязаны вести дневник и рабочий журнал, где ежедневно записываются содержание и результаты работы. По окончании практики студенты (магистры) представляют на кафедру дневник, отчет по практике и отзыв-характеристику, подписанные руководителем практики от предприятия и заверенные печатью предприятия. Дневник практики заполняется лично студентом (магистром). Записи в дневнике о выполненной работе производятся ежедневно и заверяются подписью научного руководителя практики. Письменный отчет студента (магистра) о результатах прохождения практики должен содержать следующие разделы: 1. Актуальность исследования, его практическая и теоретическая значимость. 2. Постановка цели и решаемых задач. 3. Описание объектов и методов исследования. 4. Анализ результатов экспериментов с соответствующим иллюстративным материалом и обсуждение этих результатов. 5. Заключение, выводы. 6. Список использованной литературы. Отчет обязательно подписывается руководителем практики с указанием оценки. Результаты прохождения практики докладываются студентом (магистром) на заседании кафедры в виде устного сообщения с демонстрацией презентации. По результатам доклада студентов (магистров) и с учетом характеристики руководителя, студенту (магистру) выставляется соответствующая оценка. 6 По результатам докладов студентов (магистров) и с учетом отзыва руководителя, в котором он отражает значимость полученных результатов, степень выполнения задания, качество, объем, оформление, использование современных методов исследований и вычислительной техники, а так же степень самостоятельности при выполнении работы, инициативу, исполнительскую дисциплину, соблюдение графика выполнения работ, выставляется соответствующая оценка. Время проведения аттестации назначается руководителем практики. 10. Учебно-методическое и информационное обеспечение научно-исследовательской практики Интернет-источники 1. http://elibrary.ru/defaultx.asp - научная электронная библиотека, крупнейший российский информационный портал в области науки, технологии, медицины и образования; 2. http://humbio.ru/humbio/Biochem/000b6185.htm - электронный ресурс - краткий учебник по основным вопросам биохимии; 3. http://www.molbiol.ru – электронный ресурс - молекулярно-биологический справочник, описание молекулярно-биологических методик, журналы, книги и обзоры имеющие отношение к биологии, форумы; 4. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed – текстовая база данных медицинских и биологических публикаций на английском языке, на основе раздела «биотехнология» Национальной медицинской библиотеки США; 5. http://www.pereplet.ru - сайт Соросовского образовательного журнала; 6. http://www.plantphysiol.org – сайт журнала Plant Physiology, свободный доступ к полнотекстовым статьям; 7. http://www.pnas.org - ведущий американский журнал для публикации оригинальных научных исследований в различных областях, главным образом в биологии и медицине, а также по физике и социальным наукам; 8. http://www.protein.bio.msu.ru/biokhimiya/index.htm интернет версия международного журнала по биохимии и биохимическим аспектам молекулярной биологии, биоорганической химии, микробиологии, иммунологии, физиологии и биомедицинских исследований; 9. http://www.ru.wikipedia.org/wiki - свободная универсальная энциклопедия; 10. http://www.xumuk.ru – химическая энциклопедия представляет собой научно-справочный документ по химии и химической технологии; 11. http://www.yanko.lib.ru/books/biolog/nagl_biochemindex.htm - Кольман Я., Рем К.-Г., Вирт Ю. Наглядная биохимия. ЛИТЕРАТУРА Основная 1. Коничев А.С. Молекулярная биология / А. С. Коничев, Г. А. Севостьянова. - М. : Академия, 2005. - 400 с. 2. Эллиот В. Биохимия и молекулярная биология. Пер. с англ. / В. Эллиот, Д. Эллиот; под ред. А. И. Арчакова, М. П. Кирпичникова, А. Е. Медведева, В. П. Скулачева. М. : изд-во НИИ Биомедицинской химии РАМН, 2000. – 366 с. Дополнительная 1. Биссвангер Х. Практическая энзимология / Х. Биссвангер; пер. с англ. – М. : БИНОМ. Лаборатория знаний, 2012. – 328 с. 2. Войников В. К. К вопросу о выделении интактных растительных митохондрий / В. К. Войников // Известия Сибирского Отделения Академии наук СССР. Серия биологических наук. - 1980. - Вып. 2. - С. 121 –126. 7 3. Зеленский М. И. Полярографическое определение кислорода в исследованиях по фотосинтезу и дыханию / М. И. Зеленский. - Л. : Наука, 1986. - 140 с. 4. Корнберг А. Синтез белка / А. Корнберг; под ред. Г. П. Георгиева. - М. : Мир, 1977. - 360 с. 5. Молекулярно-генетические и биохимические методы в современной биологии растений / под ред. Вл. В. Кузнецова, В. В. Кузнецова, Г. А. Романова. – М. : БИНОМ. Лаборатория знаний, 2012. – 487 с. 6. Остерман Л. А. Методы исследования белков и нуклеиновых кислот: Электрофорез и ультрацентрифугирование (практическое пособие) / Л. А. Остерман. - М.: Наука, 1981. - 288 с. 7. Остерман Л. А. Хроматография белков и нуклеиновых кислот / Л. А. Остерман. - М.: Наука, 1985. - 536 с. 8. Побежимова Т.П. Методы изучения митохондрий растений. Полярография и электрофорез / Т. П. Побежимова, А. В. Колесниченко, О. И. Грабельных; отв. ред. Р.К. Саляев. – Москва: ООО «НПК «Промэкобезопасность», 2004. - 98 с. 9. Практикум по биохимии / Под ред. С.Е. Северина, Г.А. Соловьевой. – М.: МГУ, 1989. – 509 с. 10. Руководство по изучению биологического окисления полярографическим методом. - М. : Наука, 1973. - 222 с. 11. Семихатова О. А. Физиология дыхания растений: Учеб. пособие. / О. А. Семихатова, Т. В. Чиркова - СПб. : Изд-во С.-Петерб. ун-та, 2001. – 224 с. 12. Сердюк И. Н. Методы в молекулярной биофизике: структура, функция, динамика: учебное пособие. В 2 тт. / И. Сердюк, Н. Заккаи, Дж. Заккаи ; науч. ред. И. Сердюк. – М. : КДУ, 2010. 13. Скоупс Р. Методы очистки белков / Р. Скоупс; пер. с англ. - М. : Мир, 1985. 358 с. 14. Справочник биохимика. Пер. с англ. / Р. Досон, Д. Эллиот, У. Эллиот, К. Джонс. – М. : Мир, 1991. – 544 с. 15. Хелдт Г.-В. Биохимия растений. Пер. с англ. / Г.-В. Хелдт; Под ред. А. М. Носова, В. В. Чуба. – М. : БИНОМ. Лаборатория знаний, 2011. – 471 с. Кроме этого, студентам (магистрам) рекомендуется изучение периодических научных изданий: «Физиология растений», «Физиология и биохимия культурных растений», «Биохимия», «Биологические мембраны», «Доклады Академии наук», «Биофизика», «Известия РАН. Серия биологическая», «Молекулярная биология», «Прикладная биохимия и микробиология». Студенты (магистры) в период практики по согласованию с администрацией предприятия (научно- исследовательского института) имеют право пользоваться научными периодическими изданиями России и зарубежных стран, научно-справочными материалами, сетевым источникам информации, фондам научных библиотек, аудио- и видеоматериалам по профилю подготовки, имеющимися на предприятии, которые должны в обязательном порядке вернуть по окончании практики. Разработчик программы: Грабельных О. И., к.б.н., доцент кафедры физиологии растений, клеточной биологии и генетики биолого-почвенного факультета ИГУ __________ (подпись) 8 Программа рассмотрена на заседании кафедры физиологии растений, клеточной биологии и генетики «___» ______201__г. (дата) Протокол № ____ клеточной биологии и генетики Зав.кафедрой кафедрой физиологии растений, чл. корр. РАН Р. К. Саляев _____________ (подпись) 9