Pseudomonas stutzeri

Протеогеномный анализ
Pseudomonas stutzeri KOS6
Аспирант
Лайков А.В.
Таблица 1. Химические параметры промышленных углеводородных шламов и почвы
Объект
КОС
НКНХ
УНПЗ
почва
Органический углерод (Сорг), г/кг
211
218
182
56
Общий азот, гN/кг
4,0
4,8
2,7
4,5
Валовый фосфор, гР/кг
2,1
3,5
2,3
2,0
100:1,9:1,0
100:2,2:1,6
100:1,5:1,3
100:8,0:3,6
рН (Н2О)
8,2
7,6
7,3
6,8
Плотность г/см3
1,3
1,0
1,2
0,9
Параметр
Соотношение С:N:P
2
Pseudomonas stutzeri KOS6
Филогенетическое
положение доминирующих
изолятов
Наложение геномов P. stutzeri
Система
Азотфикса
секрецииVI
ция
типа
Штамм
P. stutzeri
Источник
выделения
KOS6
нефтешлам
+
A1501
ризосфера
+
ATCC14405
морская вода
ATCC17588
клинические
образцы
CCUG29243
загрязненные
морские осадки
DSM10701
почва
DSM4166
ризосфера
SDM-LAC -
-
T13
активный ил
TS44
почва загрязненная
арсенидами
XLDN-R
почва
Деструкция
нафталина
+
+
+
+
+
+
Количество идентифицированных пептидов после
протеолиза в растворе
Образец
Количество трип.
Количество нетрип.
Количество белков
-N + нафталин I
3738
273
697
-N + нафталин II
3934
309
728
-N + сахароза I
7282
621
1171
-N + сахароза II
6291
468
1053
+N + нафталин I
5616
381
976
+N + нафталин II
5096
364
891
+N + сахароза I
5948
284
990
+N + сахароза II
5419
223
938
Количество идентифицированных белков
Диаграмма Венна по встречаемости белков
Уникальные белки для питательной среды с
нафталином
Уникальные белки
для питательной среды
с сахарозой