Идентификация нового пандемического вируса гриппа A/H1N1(sw2009) методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) АНАЛИТИЧЕСКИЕ ХАРАКТЕРИСТИКИ Эффективность работы наборов «АмплиСенс® Influenza virus A/BFL» и «АмплиСенс® Influenza virus A/Н1-swine» показана на штамме А/California/04/2009. ОБЩАЯ ИНФОРМАЦИЯ В соответствии с Методическими указаниями Роспотребнадзора и рекомендациями ВОЗ в отношении лабораторной диагностики нового пандемического гриппа А/H1N1 (sw2009) молекулярная диагностика является предпочтительным методом выявления вирусов, подобных штамму A/California/4/2009. РЕКОМЕНДУЕМЫЙ АЛГОРИТМ ИССЛЕДОВАНИЙ Проведение исследований при подозрении на пандемический грипп А/H1N1(sw2009) с использованием наборов реагентов производства ФГУН «ЦНИИЭ Роспотребнадзора» рекомендуется проводить в два этапа. Этап №1: Исследование биологического материала на присутствие вирусов гриппа А и В с помощью набора реагентов «АмплиСенс® Influenza virus A/B-FL». При получении положительного результата по обнаружению вируса гриппа А на первом этапе, образцы кДНК, в которых была обнаружена РНК Influenza virus A, исследуются далее. Этап №2: Для лабораторного подтверждения случая заболевания пандемическим гриппом нового варианта А/H1N1(sw2009), (подобных штамму A/California/4/2009) следует использовать набор реагентов «АмплиСенс® Influenza virus А/H1-swine-FL», предназначенный для идентификации вируса гриппа свиней А/H1-swine методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) с гибридизационно-флуоресцентной детекцией. 10 x титровка кДНК штамма А/California/04/2009 Набор реагентов «АмплиСенс® Influenza virus A/Н1-swine» обнаруживает НА тип 1 свиного происхождения и не дает перекрестных реакций со штаммами и изолятами A/H1N1, вызывающими сезонный грипп. Набор реагентов рекомендуется использовать для анализа образцов кДНК, в которых была обнаружена РНК Influenza virus A в процессе исследования клинического материала или культур вирусов с набором реагентов «АмплиСенс® Influenza virus A/BFL» или «АмплиСенс® Influenza virus A/H5N1-FL». С целью сокращения времени анализа допустима одновременная постановка тестов «АмплиСенс® Influenza virus A/B-FL» и «АмплиСенс® Influenza virus А/H1-swine-FL». При получении отрицательных результатов после второго этапа исследования, для проведения дальнейшего типирования следует использовать набор реагентов «АмплиСенс® Influenza virus A-тип-FL» предназначенный для идентификации вирусов гриппа А, вызывающих сезонный грипп человека H1N1 и H3N2. Если образец не типируется по одной из мишеней (HA или NA), то материал считается подозрительным на содержание нового антигенного варианта вируса гриппа А, и должен направляться в референс-лабораторию для дальнейшего исследования. При диагностике гриппа во время ежегодного эпидемического подъема (при отсутствии подозрений на A/H1N1(sw2009) или птиц) после обнаружения гриппа А с набором реагентов «АмплиСенс® Influenza virus A/B-FL» целесообразно использовать набор реагентов «АмплиСенс® Influenza virus A-тип-FL». Если образец не типируется по одной из мишеней (HA или NA), то материал считается подозрительным на содержание нового антигенного варианта вируса гриппа А и требует дальнейшего исследования в референс-лаборатории. Возможности диагностики гриппа с помощью наборов реагентов производства ФГУН «ЦНИИЭ Роспотребнадзора» Тестирование штаммов сезонного гриппа Набор реагентов «АмплиСенс® Influenza virus A-тип-FL» обнаруживает РНК вируса гриппа А и идентифицирует субтип H1N1 вирусов гриппа по гемагглютинину и нейраминидазе в суспензии с инфекционной активностью 0,03 lgTCID50/мл, идентифицирует субтип H3N2 в суспензии с инфекционной активностью 0,02 lgTCID50/мл. Тест H1N1 в наборе «АмплиСенс® Influenza virus A-тип-FL» не дает перекрестной реакции по гену NA тип 1 с изолятами подобными A/California/04/2009. АмплиСенс® Influenza virus А/H1-swine-FL НАБОРЫ РЕАГЕНТОВ Зарегистрированы на территории РФ РУ № ФСР 2009/05143 Наборы реагентов для амплификации и идентификации кДНК вируса гриппа свиней А/Н1 методом полимеразной цепной реакции certified Преимущества наборов реагентов АмплиСенс® Influenza virus А/H1-swine-FL Обнаруживает ген НА тип 1 свиного происхождения и не дает перекрестных реакций со штаммами и изолятами гриппа А/Н1N1, вызывающего сезонный грипп. Внутренний контроль позволяет контролировать все этапы анализа, включая этап выделения РНК, обратной транскрипции и ПЦР. Материал для исследования Рекомендуемые наборы для экстракции и обратной транскрипции Вид исследуемого материала РЕКОМЕНДУЕМОЕ ОБОРУДОВАНИЕ Клинический материал: мазки из носоглотки и ротоглотки, смывы из носоглотки и ротоглотки, мокрота (аспираты из трахеи) Муколизин для разжижения слизи, РИБО-сорб или РИБО-преп, Реверта-L Секционный материал: фрагменты легких и трахеи РИБО-сорб, Реверта-L Варианты наборов реагентов Формат Прибор для проведения полимеразной цепной реакции Rotor-Gene 6000, производства Corbett Research, Австралия Кат. номер Название R-V55 (RG) АмплиСенс® Influenza virus А/H1swine-FL R-V55 (iQ) АмплиСенс® Influenza virus А/H1swine-FL R-V5550-R0,5FEP АмплиСенс® Influenza virus А/H1swine-FL R-V5550-R0,2FEP АмплиСенс® Influenza virus А/H1swine-FL Комплектация Флуоресцентная метка Специальное оборудование 55 Green/ FAM Yellow/ JOE Rotor-Gene 3000/6000 (Corbett Research) 55 FAM/JOE iQ iCycler, iQ5 (Bio-Rad) 55 FAM/HEX ПЦР-детектор AЛА-1/4 (BioSan), Джин (ДНК-технология) 55 FAM/HEX ПЦР-детектор AЛА-1/4 (BioSan) Кол-во тестов Тип — анализ в режиме реального времени (Real-time PCR) — FRT Fluorescence Real-Time detection — анализ по «конечной точке» — FEP Fluorescence detection with End Point analysis — набор реагентов для амплификации — готовые ПЦР-пробирки с нижней реакционной смесью под слоем воска Аналитические характеристики Чувствительность 1х103 копий/мл тестируемого образца Россия, 119021, Москва Олсуфьевский пер., д. 8, стр. 1 Тел.: +7 (495) 664 2884 Факс: +7 (495) 664 2884 www.interlabservice.ru Специфичность Специфичность оценивалась при тестировании панели образцов, содержащих штаммы гриппа А различных субтипов, гриппа В, респираторно-синцитиального вируса, аденовируса, вируса парагриппа (1-4 тип), клинического материала от пациентов с острыми респираторными заболеваниями различной этиологии, от группы пациентов без признаков респираторной патологии, образцов аутопсийного материала, а также субпродуктов и мяса домашних птиц. В рамках предложенной панели специфичность составила 100%. Все случаи заболевания, вызванные высокопатогенным вирусом гриппа типа А/H1N1, выявленные на территории РФ, были подтверждены с использованием наборов «АмплиСенс® Influenza virus А/H1-swine-FL». 520420 Анализатор автоматический люминесцентный мультиканальный АЛА 1/4, производства «SIA BioSan», Республика Латвия