Аннотация по дисциплине «Микробиология, вирусология» 1. Трудоёмкость дисциплины № Тип занятия 1 2 3 4 Часы Лекции Практические занятия Контроль (экзаменационные/зачетные часы) (0 *) Самостоятельная работа Общая трудоёмкость (в часах) 36,00 108,00 36,00 72,00 252,00 2. Цели и задачи дисциплины Цель Целью является изучение основных биоогических свойств микроорганизмов, принципов и методов лабораторнй диагностики, специфической профилактики и терапии инфекционных заболеваний. Знание предмета необходимо для практической деятельности врача любой специальности. Задачи 1 2 3 4 5 При изучении общей части предмета студент должен занть биологические сойства основных групп микроорганизмов, влияние факторов внешней среды на микроорганизмы. Знать взаимоотношения, которые складываются между микроорганизмом и организмом человека (инфекция) и ответную реакцию организма человека. Свойства антигенов и антител. Реакции иммунитета, их механизмы и практическое использование. Принципы приготовления и практического использования всех групп специфических препаратов для диагностики, профилактики и лечения инфекционных заболеваний. При изучении частной микробиологии должен знать этиологию, эпидемиологию патогенез основных инфекционных заболеваний. Механизмы иммунитета. Принципы и методы лабораторной диагностики и специфической профилактики и лечения инфекционных заболеваний. 6 Получение сведений по вопросам истории предмета, с особым вделением приоритета отечественных учёных, навыкам самостоятельной работы с учебной, справочной, научной литературой. 3. Требования к результатам освоения дисциплины № Индекс Компетенция Уровень сформированнности Дескриптор Описания Формы контроля 1 ОК-1 способностью и готовностью анализировать социально-значимые проблемы и процессы, использовать на практике методы гуманитарных, естественнонаучных, медикобиологических и клинических наук в различных видах профессиональной и социальной деятельности Базовый Знать Уметь Владеть историю микробиологии, вирусологии, основные этапы формирования данных наук (1 модуль); классификацию, морфологию и физиологию микробов и вирусов, их биологические и патогенные свойства, влияние на здоровье населения (1,3,4,7 модули); особенности формирования процессов симбиоза организма человека с микробами, роль резидентной микрофлоры организма в развитии оппортунистических болезней (2,3,4 модули); интерпретировать результаты наиболее распространённых методов лабораторной диагностики микробиологических, молекулярнобиологических и иммунологических (1,5,6,7 модули) обосновывать выбор методов микробиологической и серологической диагностики инфекционных и оппортунистических заболеваний (4,5,6,7 модули) основными навыками работы с современными приборами, применяемыми для диагностики инфекционных заболеваний (1,2 модули) Решение проблемно-ситуационных задач; Тестирование Решение проблемно-ситуационных задач; Тестирование Решение проблемно-ситуационных задач; Тестирование Выполнение письменной контрольной работы; Решение задач; Решение проблемно-ситуационных задач Выполнение письменной контрольной работы; Решение задач; Решение проблемно-ситуационных задач Решение проблемно-ситуационных задач 40 ПК-32 способностью и готовностью к участию в освоении современных теоретических и экспериментальных методов исследования с целью создания новых перспективных средств, в организации работ по практическому использованию и внедрению результатов исследований Базовый Знать Уметь Владеть особенности генетического контроля Решение проблемно-ситуационных п а т о г е н н о с т и и задач; антибиотикорезистентности микробов, Тестирование механизмы выработки резистентности и способы её определения (2,3 модули); м е т о д ы м и к р о б и о л о г и ч е с к о й Решение проблемно-ситуационных диагностики, применение основных задач; антибактериальных, противовирусных Тестирование и биологических препаратов, принципы их получения и применения (3,6 модули) использовать полученные знания для Выполнение письменной контрольной определения т а к т и к и работы; антибактериальной, противовирусной и Решение задач; иммунотропной терапии; применить Решение проблемно-ситуационных принципы экстренной профилактики и задач антитоксической терапии пациентов (3,6,7 модули) анализировать действие лекарственных Выполнение письменной контрольной с р е д с т в - а н т и б и о т и к о в и работы; иммунобиологических препаратов - по Решение задач; с о в о к у п н о с т и и х с в о й с т в и Решение проблемно-ситуационных возможность их использования для задач терапевтического лечения пациентов различного возраста (2,3 модули) навыками п о с т а н о в к и Решение проблемно-ситуационных п р е д в а р и т е л ь н о г о д и а г н о з а н а задач основании результатов лабораторного обследования взрослого населения и подростков (4,5,6,7 модули) 15 ПК-7 способностью и готовностью применять методы асептики и антисептики, использовать медицинский инструментарий, проводить санитарную обработку лечебных и диагностических помещений медицинских организаций, владеть техникой ухода за больными Базовый Знать Уметь методикой интерпретации результатов Решение проблемно-ситуационных микробиологического исследования, задач определения антимикробной активности антибиотических препаратов и микробиологически обоснованными правилами их применения для лечения больных (3,4,5,6,7 модули) методами подбора противомикробных Решение проблемно-ситуационных и иммунобиологических препаратов задач для адекватной профилактики и лечения инфекционных и неинфекционных заболеваний (3,5,6,7 модули) правила техники безопасности и Решение проблемно-ситуационных р а б о т ы в м и к р о б и о л о г и ч е с к и х задач; л а б о р а т о р и я х , с р е а к т и в а м и и Тестирование приборами, лабораторными животными (1,4 модули); п о л ь з о в а т ь с я м е д и ц и н с к и м Выполнение письменной контрольной оборудованием; соблюдать технику работы; б е з о п а с н о с т и , р а б о т а т ь с Решение задач; у в е л и ч и т е л ь н о й т е х н и к о й Решение проблемно-ситуационных (микроскопами, стерео-, и простыми задач лупами), интерпретировать данные микроскопии (1,5,6 модули); соблюдать технику безопасности и правила работы с материалом, представляющим биологическую опасность (1 модуль) соблюдать технику безопасности и Выполнение письменной контрольной п р а в и л а р а б о т ы с м а т е р и а л о м , работы; представляющим биологическую Решение задач; опасность (1 модуль) Решение проблемно-ситуационных задач Владеть основными методами стерилизации, дезинфекции и антисептической обработки инструментов и оборудования во избежании инфицирования врача и пациента (2,3 модули); основными навыками работы с современными приборами, применяемыми для диагностики инфекционных заболеваний (1,2 модули) основными навыками работы с материалом, содержащим патогенные и условно-патогенные микроорганизмы (2,3 модули) Решение проблемно-ситуационных задач Решение проблемно-ситуационных задач 4. Содержание дисциплины (модуля), структурированное по темам (разделам) с указанием отведенного на них количества академических часов и видов учебных занятий № п/п Наименование модуля дисциплины 1 Морфология микроорганизмов Трудоемкость модуля з.е. часы 0,47 17,00 Содержание модуля 1 Систематика микроорганизмов. Предмет и задачи медицинской микробиологии. Открытия А. Левенгука, Л. Пастера, Р. Коха. Связь микробиологии с другими дисциплинами. Значение микробиологии в подготовке врача. Систематика микроорганиз-мов. Принципы систематики. Понятия вид, штамм, культура, клон, популяция. Современные приёмы систематики – рестрикционный анализ, типирование ДНК и 16Sрибосомальной. 2 Методы изучения микроорганизмов. Характеристика микроскопического метода исследования. Различные способы и приёмы микроскопического исследования бактерий. Способы приготовления нативных и фиксированных препаратов. Простые и сложные способы окраски мазков. Окраска бактерий по Граму, механизм и практическое значение. Окраска бактерий по ЦилюНильсену, механизм и практическое значение. Выявление спор и капсулы у бактерий. Значение микроскопического метода в диаг-ностике заболеваний. 2 Физиология и генетика микроорганизмов 0,78 28,00 3 Морфология микроорганизмов. Основные признаки прокариотической клетки. Ультраструктура и химический состав бактерий. Строение оболочки бактерий. Различия в строении грамположительных и грамотрицательных бактерий. Химический состав, строение и роль капсулы и споры. Протопласты, сферопласты, L-формы бактерий и микоплазмы. 1 Физиология микроорганизмов. Представления о бактериальной клетке, как живой системе. Питание и дыхание прокариотов. Конститутивные и индуцибельные ферменты бактерий. Механизмы поступления питательных веществ в прокариотиче-скую клетку. Механизм перемещения субстратов через цитоплаз-матическую мембрану. Катаболизм, амфиболизм и анаболизм у аэробных и анаэробных бактерий. Типы фосфорилирования. Характеристика процессов роста и размножения у бактерий. Фазы развития бактериальной популяции. Биотехнология. Пищевая и промышленная микробиология. 2 Характеристика бактериологического метода исследования. Питательные среды. Чистые культуры и их получение. Этапы бактериологического метода исследования. Способы идентификации выделенной культуры, определения её чувствительности к антибиотикам. Способы культивированяя аэробных и ана-эробных бактерий. Особенности метаболизма и принципы культивирования микоплазм, хламидий, риккетсий, спирохет, грибов. 3 Генетика микроорганизмов. Строение бактериального генома. Особенности взаимосвязи генотипа и фенотипа у прокариот. Современные представления о механизмах репликации хро-мосомной ДНК у бактерий. Роль плазмид и других мобильных генетических элементов в жизнедеятельности бактерий. Характе-ристика основных форм изменчивости. Механизмы наследуемой и ненаследуемой изменчивости. Фенотипическая и генотипическая изменчивость. Модификации и мутации. Виды рекомбинативной изменчивости у бактерий. Характеристика процессов трансформации, конъюгации, трансдукции и лизогенной конверсии. Роль различных видов изменчивости в эволюции бактерий. Механизмы возникновения и распространения лекарственной устойчивости на уровне клетки и популяции. R-плазмиды и их роль в устойчивости. История изучения видов изменчивости у бактерий. Понятия прототроф, ауксотроф, значение при изучении изменчивости. 3 Экология микроорганизмов 0,50 18,00 4 Бактериофаги. Понятие о вирулентных и умеренных фагах. Классификация, механизмы взаимодействия бактериофага с клеткой. Лизогения и лизогенная конверсия. Трансдукция. Понятия профаг, дефектный фаг. Практическое значение фагов в биологии и медицине. Генная инженерия и биотехнология. Гене-тическая основа молекулярно-биологических методов диагности-ки (плазмидный профиль, рестрикционный анализ, риботипиро-вание, использование микрочипов, разновидности ПЦР: в реаль-ном времени, branch-PCR) 1 Распространение микроорганизмов в окружающей среде. Микрофлора организма человека и ее функции. Симбиоз и антибиоз. Микроэкология организма человека. Понятия экологическая ниша, биотоп. Микробиоценоз. Факторы регуляции микробиоценозов. Межмикробные взаимодействия. Симбиоз и его роль в инфекции. Положительная и отрицательная роль нормальной (резидентной) микрофлоры организма. Пробиотики (эубиотики). Учение о биоплёнках. Биоплёнки и механизмы их образования. Адгезия и коаггрегация бактерий. Понятие о кворум-сенсинг факторах. Роль микробов в круговороте веществ в природе. Микрофлора почвы, воды, воздуха, бытовых и медицинских объектов, организма животных и человека. Санитарная микробиология. 2 Уничтожение микробов в окружающей среде. Де-зинфектология. Принцип деконтаминации. Понятия дезинфекции и стерилизации. Физические основы и закономерности деконтаминации в отношении грамположительных и грамотрицательных бактерий, кислотоустойчивых бактерий и спор, грибов, вирусов и прионов. Асептика и антисептика. Физические и химические факторы деконтаминации. Способы стерилизации и дезинфекции в медицине. Дезинфекция высокого и низкого уровня. Классификация медицинских изделий и инструментов по степени эффективности деконтаминации - критические, полукритические и некритические изделия и инструменты. Аппаратура. Методы контроля эффективности стерилизации и дезинфекции. 3 Антибиотики. Классификация. Антибактериальная химиотерапия. Мишени для антибиотиков в прокариотической клетке. Бактериоцины. 4 Инфекция и иммунитет 0,86 31,00 1 Роль микроорганизма в развитии инфекционного процесса. Инфекция и инфекционный процесс. Движущие силы. Формы взаимодействия микро- и макроорганизма. Понятия патогенности и вирулентности. Характеристика факторов вирулентности микроорганизмов. Сравнительная характеристика экзо- и эн-дотоксинов бактерий. Генетический контроль факторов патогенности у микроорганизмов. Роль плазмид. Патогенные свойства риккетсий, хламидий, микоплазм, грибов, простейших, вирусов. Антигены. Характеристика бактериальных антигенов. Определе-ние понятий антиген, гаптен, эпитоп, антигенная детерминанта. Иммунопрофилактика, иммунотерапия и иммунокоррекция. Им-мунотропные препараты. Вакцины и их виды. Анатоксины. Адъ-юванты. Календарь прививок. 2 Роль макроорганизма в развитии инфекционного процесса. Восприимчивость и инфекционная чувствительность. Неспецифические факторы защиты организма человека. Понятие о врождённом иммунитете. Гетерогенность человеческой популя-ции с точки зрения восприимчивости к инфекции. Иммунная сис-тема организма человека и основные ее функции. Понятия имму-нитет, иммунологическая реактивность, иммунный ответ. Имммуноглобулины и антитела. Иммунобиологические препараты, содержащие антитела. 3 Понятие о патогенезе инфекционной болезни. Формы инфекций. Влияние физиологической гипореактивности организ-ма у детей на инфекционный процесс. Склонность к генерализа-ции процессов. Пути распространения микроорганизмов и токси-нов в организме. Роль внешней среды в инфекционном процессе. Пути передачи инфекционных заболеваний. Микробная перси-стенция – базовый феномен инфектологии. Варианты выживания микроорганизмов в организме хозяина. Классификация механизмов персистенции. Практическое использование персистентных характеристик микроорганизмов для создания новых диагности-ческих, прогностических и терапевтических технологий. 4 Серологические реакции. Механизм реакций агглютинации, преципитации, лизиса, связывания комплемента. Получение иммунных сывороток. Серологический метод диагностики инфекционных болезней, его цели. Современные приёмы серодиагностики и сероидентификации. Иммунофлюоресцентный, иммуноферментный и радиоиммунный анализ. 5 Частная бактериология 1,33 48,00 6 Клиническая микробиология. Микология и паразитарная микробиология. 0,83 30,00 1 Патогенные кокки. Грамположительные и грамотрицательные кокки (стафило-, стрепто-, энтеро-, пептострептококки, нейссерии, моракселлы, вейллонеллы) 2 Грамотрицательные палочки. Грамотрицательные факультативно-анаэробные и аэробные палочки (энтеробактерии, гемофилы, эйкенеллы, псевдомонады, бруцеллы, бартонеллы, франциселлы, коксиеллы, легионелы, бордетеллы, вибрионы, иерсинии). Грамотрицательные облигатно-анаэробные палочки (бактероиды, превотеллы, порфиромонады, фузобактерии) 3 Грамположительные палочки. Грамположительные спорообразующие палочки (клостридии раневой инфекции, столбняка, ботулизма и псевдомембранозного колита, бациллы). Грамположительные правильной формы палочки (лактобактерии, листерии). Грамположительные неправильной формы палочки и ветвящиеся (нитевидные) бактерии (коринебактерии, микобакте-рии, актиномицеты, пропионибактерии, бифидобактерии, эубактерии) 4 Бактерии других морфологических форм. Спирохеты и другие спиральные, изогнутые бактерии (трепонемы, боррелии, лептоспиры, кампилобактерии, хеликобактерии, спириллы, воли-неллы). Риккетсии. Хламидии. Эрлихии. Анаплазмы. Микоплазмы. 1 Основные биотопы организма человека и особенности состава микрофлоры. Нормальная или резидентная микрофлора организма человека. Синергизм и антагонизм. Симбиоз микробных ассоциаций слизистых оболочек и макроорганизма. Стабилизирующая и агрессивная микрофлора организма. 2 Внутрибольничные и оппортунистические инфекции. Моно- и смешанная инфекция. Этиология, патогенез и особенности клинической картины оппортунистических болезней. Диагностика оппортунистических болезней и дисбиозов. Выявление возбудителей при смешанных инфекциях. Особенности профилактики и лечения оппортунистических болезней. 3 Патогенные грибы. Мицелиальные и дрожжеподобные грибы. Возбудители системных, подкожных и поверхностных микозов. Возбудители оппортунистических микозов. Возбудители микотоксикозов. 4 Патогенные простейшие (Амебы, лямблии, трихомонады, лейшмании, трипаносомы, плазмодии малярии, токсоплазма). 7 Вирусология 1,22 44,00 1 Общая вирусология. Понятие о вирусе и вирионе. Современные принципы классификации и номенклатуры вирусов. Особенности структурной организации вирусов. Этапы взаимодействия вируса с клеткой. Понятие вирогении. Способы проникновения вируса в клетку. Особенности репродукции ДНК - и РНК-содержащих вирусов. Особенности взаимодействия ретровирусов с клеткой. Способы культивирования вирусов. Общая характеристика механизмов изменчивости вирусов. Вирусы и прионы – возбудители медленных инфекций. Вироиды и прионы, их роль в патологии. 2 ДНК-геномные вирусы (оспы, герпеса, адено-, папиллома-, парво-, гепатитов ТТV и В). Онкогенные вирусы (роль герпес-, папиллома-, вирусов гепатита В, С в канцерогенезе). Прочие ДНК-вирусы - возбудители вирусных инфекций. 3 РНК-геномные вирусы (гриппа, везикулярного стоматита, ящура, бешенства, рота-, корона-, тога-, энтеровирусы, ВИЧ). Возбудители арбовирусных инфекций, гепатита С, кори, краснухи, эпидемического паротита. Прочие РНК-вирусы – возбудители вирусных инфекций.