МИНИСТЕРСТВО ЗДРАВООХРАНЕНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ ОБРАЗОВАТЕЛЬНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ

МИНИСТЕРСТВО ЗДРАВООХРАНЕНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ ОБРАЗОВАТЕЛЬНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ
ВЫСШЕГО ПРОФЕССИОНАЛЬНОГО ОБРАЗОВАНИЯ
«ДАГЕСТАНСКАЯ ГОСУДАРСТВЕННАЯ МЕДИЦИНСКАЯ АКАДЕМИЯ»
ПРИНЯТО
решением Ученого совета
ГБОУ ВПО «ДГМА МЗ РФ»
протокол №
от ___ _______________ 2015 г.
УТВЕРЖДАЮ
И.о.ректора, профессор
Д.Р.Ахмедов
___ _______________ 2015 г.
ПРОГРАММА КАНДИДАТСКОГО ЭКЗАМЕНА
послевузовского профессионального образования (аспирантура)
по специальности 03.02.03 – «МИКРОБИОЛОГИЯ»
(медицинские науки)
(2 части: основная программа-минимум и дополнительная программа)
Махачкала – 2015
Рабочая программа послевузовского профессионального образования по
специальности 03.02.03 «Микробиология»
основной образовательной
программы послевузовского профессионального образования (аспирантура)
по специальности 03.02.03 «Микробиология»
Разработала - доцент кафедры микробиологии, вирусологии и иммунологии
ДГМА к.м.н. А.И.Алиева
Зав. кафедрой микробиологии,
вирусологии, иммунологии
к.м.н., доцент
М.С.Саидов
Рабочая программа утверждена на заседании Ученого совета ГБОУ ВПО
«ДГМА» от «___»____________________20__г.
Рабочая программа согласована:
1. Директор НМБ ДГМА _________________________Н.В.Бекеева
2. УМО _________________________________М.Н.Гаджимурадов
3. Начальник Управления АОИ________________А.М.Магомедова
Председатель Ученого совета
«___»__________20____г.
_____________
(подпись)
_____________
(Ф.И.О.)
Составители:
Зав.кафедрой _____________________________________________________
Зав.учебной частью
кафедры _________________________________________________________
Рецензент: _______________________________________________________
2
1. Общие положения.
2. Содержание программы.
3. Процедура проведения кандидатского экзамена по специальности
03.02.03 – «МИКРОБИОЛОГИЯ».
4. Перечень вопросов для подготовки к кандидатскому экзамену.
5. Образец билета для сдачи кандидатского экзамена.
3
1. ОБЩИЕ ПОЛОЖЕНИЯ
Дисциплина «Микробиология» является обязательной дисциплиной
образовательной составляющей программы подготовки аспирантов по
научной специальности 03.02.03- «микробиология» (медицинские
науки).
Специальность 03.02.03 - «микробиология» направлена на
подготовку научных и научно-педагогических кадров, а также
высококвалифицированных специалистов практиков, занимающихся
исследованием актуальных проблем микробиологии.
Областью исследования специальности 03.02.03 - «микробиология»
являются: глубокое изучение структуры и важнейших биологических
свойств патогенных микробов, взаимоотношения их с организмом
человека в определенных условиях природной и социальной среды,
совершенствование методов микробиологической диагностики,
разработка новых, более эффективных лечебных и профилактических
препаратов, решение такой важной проблемы, как ликвидация и
предупреждение инфекционных болезней.
Цель экзамена – установить глубину профессиональных знаний
соискателя
ученой
степени,
уровень
подготовленности
к
самостоятельной
научно-исследовательской
работе.
Сдача
кандидатских экзаменов обязательна для присуждения ученой степени
кандидата медицинских наук.
Кандидатский экзамен по специальной дисциплине можно сдавать
лишь в тех ВУЗах, где есть аспирантура по данной специальности.
Данная программа кандидатского экзамена по специальной
дисциплине разработана на основе типовой программы-минимум по
специальности, предложенной ведущими в соответствующей отрасли
высшими учебными заведениями и научными учреждениями,
организациями и утвержденной Минобрнауки Российской Федерации.
4
ПРОГРАММА-МИНИМУМ
кандидатского экзамена по специальности
03.02.03 «Микробиология»
по медицинским наукам
Введение
В основу настоящей программы положены следующие разделы: история, предмет и
задачи микробиологии; морфология и структурно-функциональная организация клеток
микроорганизмов; систематика микроорганизмов; рост и развитие микроорганизмов; типы
питания микроорганизмов, физиологические группы; биохимические основы
жизнедеятельности микроорганизмов; регуляция метаболизма у микроорганизмов;
генетика микроорганизмов; экология микроорганизмов; микробная биотехнология.
Программа разработана экспертным советом Высшей аттестационной комиссии по
медицине (медико-гигиеническим специальностям) при участии Московской
медицинской академии им. И.М. Сеченова.
1. История, предмет и задачи микробиологии
Этапы развития микробиологии (эвристический, морфологический,
физиологический, иммунологический, молекулярно-генетический). Связь микробиологии
с иммунологией и другими дисциплинами. Основополагающая роль А. Левенгука, Л.
Пастера, Р. Коха, П. Эрлиха, Д.И. Ивановского, И.И. Мечникова и других ученых в
развитии микробиологии и смежных дисциплин: открытие А. Левенгуком
микроорганизмов; роль работ Л. Пастера в развитии общей, медицинской, технической,
сельскохозяйственной микробиологии и иммунологии; роль работ Р. Коха в медицинской
микробиологии (выделение чистых культур, методы микроскопии, триада Генле-Коха и
др); открытие вирусов Д.И. Ивановским; введение принципа элективных культур,
открытие автотрофии (С.Н. Виноградский), развитие экологии микроорганизмов;
обнаружение ферментативной активности в бесклеточных препаратах дрожжей (Бюхнер)
и развитие биохимии дрожжей; развитие генно-инженерных исследований; открытие
витаминов, сульфамидных препаратов, антибиотиков и других биологически активных
препаратов, а также создание биотехнологических производств; вклад отечественных
ученых в развитие микробиологии - исследования В.Л. Омелянского, Г.Н., Габричевского,
Н.Ф. Гамалеи, А.Н. Лебедева, С.П. Костычева, Г.А. Надсона, В.Г. Будкевича, Д.К.
Заболотного, Н.Г. Холодного, Б.А. Исаченко, В.Н. Шапошникова, Н.Д. Иерусалимского,
Н.А. Красильникова, П.Ф. Здродовского, В.Д. Тимакова, З.В. Ермольевой и др.
Соотношение и взаимосвязь бактериологии, вирусологии, микологии,
протозоологии иммунологии и аллергологии. Значение методов молекулярной биологии,
цитологии, физиологии, биохимии и генетики в изучении микробов. Характеристика
общей, медицинской, фармацевтической, санитарной, технической,
сельскохозяйственной, ветеринарной, водной, почвенной, геологической и космической
микробиологии; связи между разделами микробиологии. Палеомикробиология.
Современные представления об эволюции микроорганизмов.
2. Морфология и структурно-функциональная организация клеток
микроорганизмов
Основные типы клеток; клетки прокариот и эукариот. Структурнофункциональные особенности эубактерий, архебактерий и различных представителей
эукариот.
Основные структурные компоненты клеток и методы их изучения
Цитологические методы: методы окраски микроорганизмов и методы микроскопии
(люминесцентная, темнопольная, фазово-контрастная, электронная и др.).
Цитохимические методы. Приготовление препаратов для электронной микроскопии:
5
тотальные препараты, ультратонкие срезы, реплики (криофрактография),
контрастирование препаратов.
Строение клеток прокариотных микроорганизмов (эубактерий и архебактерий).
Особенности морфологических типов клеток.
Клеточная стенка бактерий. Строение, химический состав и функции. Строение,
функции липополисахарида и пептидогликана. Стенки эубактерий и архебактерий. Синтез
и сборка компонентов клеточных стенок. Образование S-, R-, L-форм бактерий,
протопластов и сферопластов, некультивируемых форм бактерий.
Капсулы и фимбрии (пили). Химический состав, структура и функции.
Жгутики, подвижность бактерий. Строение и химический состав жгутиков.
Периплазматические жгутики спирохет; строение и функции. Скользящая подвижность
некоторых бактерий и ее механизм. Хемо-, фото-, и магнитотаксисы.
Периплазматическое пространство у грамотрицательных бактерий. Состав,
структура и функции.
Мембраны бактерий, структура и функции: цитоплазматическая мембрана;
внутрицитоплазматические мембранные структуры бактерий - производные
цитоплазматической мембраны; фотосинтезирующий мембранный аппарат; тинакоиды,
хлоросомы, родопсиновые мембранные структуры галобактерий; мембранные структуры
метилотрофных, нитрифицирующих и других бактерий; мезосомы бактерий; наружная
мембрана грамотрицательных бактерий.
Цитоплазма бактерий. Химический состав, физико-химические показатели,
структура. Включения: полифосфаты (волютин), гликоген, гранулеза, гранулы поли-бетагидрооксимасляной кислоты, белковые кристаллы, элементарная сера, карбоксисомы,
магнитосомы, фикоциановые гранулы цианобактерий. Рибосомы бактерий. Состав,
строение и функции. Различия рибосом эубактерий, архебактерий и эукариот. Различия в
аппарате трансляции у грамположительных и грамотрицательных эубактерий и
архебактерий. Газовые вакуоли - уникальные структуры прокариотной клетки.
Ядерный аппарат бактерий - нуклеоид. Состав и структура. Бактериальная
хромосома. Репликация ДНК и сегрегация нуклеоидов при делении клеток. Связь
нуклеоида с мембранными структурами клетки. Особенности ядерного аппарата
архебактерий.
Особенности физиологии бактерий
Структурно-функциональные перестройки клеток бактерий в цикле развития и под
влиянием факторов окружающей среды. Клеточный цикл и клеточная дифференциация в
процессе онтогенетического развития бактерий. способы размножения бактерий:
бинарное деление, почкование и др. Покоящиеся, некультивируемые формы бактерий.
Эндоспоры, экзоспоры, цисты, миксоспоры, акинеты и гетероцисты бактерий,
особенности их строения, образования, прорастания, рекультивации.
Строение клеток эукариотных микроорганизмов
Жизненный и клеточный цикл. Размножение. Клеточная дифференциация.
Спорообразование у дрожжей и мицелиальных грибов. Инцистирование простейших.
Клеточная стенка и цитоплазматическая мембрана. Строение, химический состав,
функции, синтез компонентов.
Эндоплазматический ретикулум. Структура и происхождение. Функция гладкого и
шероховатого ретикулума. Связь мембран ретикулума с мембранами аппарата Гольджи,
цитоплазматической и ядерной мембранами. Микросомы.
Аппарат Гольджи. Строение, функции и роль в синтезе мембран, лизосом и
клеточной стенки. Лизосомы; вакуоли, фагосомы, сегрегационные и пищеварительные
вакуоли. Пероксисомы. Структура, состав и функции.
Митохондрии. Строение, химический состав и функции; наружная и внутренняя
мембраны, кристы, ДНК, белоксинтезирующий аппарат, гипотезы о происхождении
6
митохондрий. Хлоропласты. Строение, химический состав и функция; наружная и
внутренняя мембраны, тилакоиды, ДНК, белоксинтезирующий аппарат.
Цитоплазма. Состав и строение компонентов цитоплазмы. Гиалоплазиа. Запасные
вещества: полифосфаты, углеводы, липидные гранулы, белковые кристаллы. Амебоидное
движение. Рибосомы (строение, состав, функции). Микротрубочки и тонофиламенты цитоскелет клетки. Жгутики и реснички.
Ядро. Ядерные структуры (строение и функции): мембрана, хромосомы, ядрышко,
ядерный сок. Митоз, эндомитоз. Макро- и микронуклеусы простейших.
3. Систематика микроорганизмов
Мир микробов: доклеточные формы (вирусы - царство Vira) и клеточные формы
(бактерии, архебактерии, грибы и простейшие). Домены «Bacteria», «Archaea», «Eucarya».
Домен «Bacteria» - прокариоты (истинные бактерии, или эубактерии). Домен
«Archaea» - прокариоты (архебактерии) Домен «Eucarya» - эукариоты: царство Fungi
(грибы); царство Stramenopila, царство растений Plantae; царство животных Animalia с
подцарством Protozoa (простейшие).
Систематика, классификация, таксономия номенклатура, диагностика,
идентификация. Таксономические категории, современные критерии вида и подвидовых
категорий.
Использование фенотипических, генотипических и филогенетических показателей
для идентификации и типирования бактерий:
ФЕНОТИПИЧЕСКИЕ - окраска по Граму, морфологические и культуральные
свойства, биохимические реакции, хромогенные ферментативные реакции, использование
источников углевода, антибиотикограмма, бактериоцинотипирование, фаготипирование,
антигенные свойства, химический состав клеточной стенки (пептидогликан, миколовая
кислота и др.), а также белков и липидов клетки;
ГЕНОТИПИЧЕСКИЕ - соотношение G+C, гибридизация ДНК, молекулярное
зондирование, плазмидный анализ, полиморфизм длины фрагментов рестрикции ДНК,
риботипирование;
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ - анализ рРНК-последовательности, РНК-РНК
гибридизация, амплификация полиморфной ДНК с использованием производных
праймеров, секвенирование 16S и 23S рРНК.
Группы бактерий, сформированные по фенотипическим признакам (Определитель
бактерий Берджи, 1994; перевод с англ. 1997, 9 издание).
Спирохеты;
Аэробные/микроаэрофильные, подвижные, спиралевидные/вибриоидные,
грамотрицательные бактерии;
Неподвижные или, редко, подвижные, грамотрицательные, изогнутые бактерии;
Грамотрицательные, аэробные/микроаэрофильные палочки и кокки;
Факультативно анаэробные, грамотрицательные палочки;
Грамотрицательные, анаэробные, прямые, изогнутые и спиральные палочки;
Бактерии, осуществляющие диссимиляционное восстановление сульфата или серы;
Анаэробные грамотрицательные кокки;
Риккетсии и хламидии;
Аноксигенные фототрофные бактерии (содержат бактериохлорофилл);
Оксигенные фототрофные бактерии (содержат хлорофилл);
Аэробные хемолитотрофные бактерии и близкие организмы;
Почкующиеся и /или образующие выросты бактерии;
Бактерии, имеющие чехлы;
Нефотосинтезирующие скользящие бактерии, не образующие плодовые тела;
Скользящие бактерии, образующие плодовые тела;
Грамположительные кокки;
7
Образующие эндоспоры грамположительные палочки и кокки;
Грамположительные палочки правильной формы;
Грамположительные палочки неправильной формы;
Микобактерии;
22-29. Актиномицеты;
30. Микоплазмы (роды Mycoplasma, Ureaplasma, Acholeplasma и др.)
31-35. Архебактерии (метаногены, сульфатредуцирующие археи, галобактерии,
архебактерии без клеточной стенки, термофилы и гипертермофилы, метаболизирующие
S0.
Классификация бактерий по генотипическим и фенотипическим признакам.
(Bergey's Manual of Systematic Bacteriology 2nd. Edition 2001).
Характеристика грамотрицательных бактерий, большинство которых по свойствам
рРНК объединены в тип протеобактериий («Proteobacteria»). Характеристика
грамположительных бактерий с двумя большими подотделами - с высоким и низким
соотношением G+C (генетическое сходство).
Характеристика домена «Bacteria», среди 22 типов которого имеют медицинское
значение следующие:
Тип Proteobacteria
Класс Alphaproteobacteria. Роды: Rickettsia, Orientia, Ehrlichia, Bartonella, Brucella
Класс Betaproteobacteria. Роды: Burkholderia, Alcaligenes, Bordetella, Neisseria,
Kingella, Spirillum
Класс Gammaproteobacteria. Роды: Francisella, Legionella, Coxiella, Pseudomonas,
Moraxella, Acinetobacter, Vibrio, Enterobacter, Callimatobacterium, Citrobacter, Edwardsiella,
Erwinia, Escherichia, Hafnia, Klebsiella, Morganella, Proteus, Providencia, Salmonella, Serratia,
Shigella, Yersinia, Pasteurella
Класс Deltaproteobacteria. Род: Bilophila
Класс Epsilonproteobacteria. Роды: Campylobacter, Helicobacter, Wolinella
Тип Firmicutes (главным образом грамположительные)
Класс Clostridia. Роды: Clostridium, Sarcina, Peptostreptococcus, Eubactеrium,
Peptococcus, Veillonella (грамотрицательные)
Класс Mollicutes. Роды: Mycoplasma, Ureaplasma
Класс Bacilli. Роды: Bacillus, Sporosarcina, Listeria, Staphylococcus, Gemella,
Lactobacillus, Pediococcus, Aerococcus, Leuconostoc, Streptococcus, Lactococcus
Тип Actinobacteria
Класс Actinobacteria. Роды: Actinomyces, Arcanodacterium, Mobiluncus, Micrococcus,
Rothia, Stomatococcus, Corynebacterium, Mycobacterium, Nocardia, Propionibacterium,
Bifidobacterium, Gardnerella
Тип Clamydiae
Класс Chlamydiae. Роды: Chlamydia, Chlamydophila
Тип Spirochaetes
Класс Spirochaetes. Роды:Spirochaeta, Borrelia, Treponema, Leptospira
Тип Bacteroidetes
Класс Bacteroidetes. Роды: Bacteroides, Porphyromonas,Prevotella
Класс Flavobacteria. Род: Flavobacterium
Систематика грибов.
Принципы построения современных систем грибов. Основные таксономические
критерии: наличие подвижны стадий, телеоморфы и типы полового процесса, анаморфы и
типы бесполого размножения, особенности морфологии, химический состав клеточных
структур, экологические ниши и биотопы, факторы вирулентности и др.
Характеристика грибов: хитридиомицеты (тип Chytridiomycota), зигомицеты (тип
Zygomycota), аскомицеты (тип Ascomycota), базидиомицеты (тип Basidiomycota),
8
формальный тип/группа - дейтеромицеты (Deiteromycоta), или так наз. митоспоровые
грибы. Особенности гифальных и дрожжевых грибов. Диморфизм грибов.
Царство Stramenopila, тип Oomycota; отличия их от грибов.
Систематика простейших.
Характеристика простейших, в том числе имеющих медицинское значение (типы
Sarcomastigophora, Apicomplexa, Ciliophora, Microspora).
Систематика вирусов.
Характеристика оболочечных и безоболочечных вирусов; вирусы, имеющие
двунитевую ДНК, однонитевую ДНК, плюс однонитевую РНК, минус однонитевую РНК,
двунитевую РНК, идентичные плюс нитевые РНК (ретровирусы). Вирусы животных,
грибов, растений, бактерий. Вирулентные и умеренные бактериофаги. Лизогения.
4. Рост и развитие микроорганизмов
Питательные среды: элективные, дифференциально-диагностические, специальные,
обогатительные, органические, неорганические, синтетические и др. Принципы и методы
стерилизации посуды, сред, оборудования. Методы определения числа бактерий и их
биомассы. Накопительные культуры. Чистые и смешанные культуры.
Особенности культивирования аэробов, анаэробов, психрофилов, мезофилов,
термофилов, гемофилов, галофилов и других групп микроорганизмов.
Рост микроорганизмов. Периодические культуры и периодическое
культивирование; фазы роста, методы культивирования. Параметры роста: скорость,
время генерации и др. Проточное культивирование. Принципы работы хемостата,
турбодостата. Синхронизированные культуры. Понятие сбалансированного роста.
Лимитирующие факторы. Торможение роста.
5. Типы питания микроорганизмов, физиологические группы
Фото- и хемо-, ауто- и гетеро-, лито- и органотрофы. Метилотрофы. Аэробные
литотрофные бактерии: водородные бактерии, нитрифицирующие бактерии, серные
бактерии, железобактерии и др. Аэробы, микроаэрофилы, капнофилы, факультативные
анаэробы, облигатные анаэробы. Аммонифицирующие, денитрофицирующие,
сульфатредуцирующие, метанообразующие и др. бактерии. Микроорганизмы деструкторы. Прототрофы, ауксотрофы, паразиты, патогенные и условно-патогенные
микроорганизмы, сапрофиты.
6. Биохимические основы жизнедеятельности микроорганизмов
Методы разрушения микроорганизмов и получения фракций. Получение
очищенных ферментов. Ферментные препараты.
Поступление источников питания в клетку: механизмы пассивной и облегченной
диффузии; активный транспорт, транслокация радикалов.
Принципы использования органических соединений микроорганизмами. Основные
пути утилизации углеводов - гексоз и пентоз (пути Эмбдена-Мейергофа, ЭнтнераДудорова, пентозофосфатный путь). Основные пути использования ароматических
соединений и углеводородов.
Центральный метаболизм; основные циклы (цикл трикарбоновых кислот,
пентозофосфатный цикл, глиоксолатный шунт).
Энергетическая основа клеточного метаболизма. Субстратное фосфорилирование.
Брожение, типы и механизм. Фосфорилирование, механизм и разновидности.
Окислительное фосфорилирование, механизмы. Анаэробное дыхание, механизмы. АТФ и
трансмембранный потенциал как энергетический резерв клетки. Разобщение окисления и
фосфорилирования.
Биосинтетические реакции у микроорганизмов. Ассимиляция углерода
углекислоты микроорганизмами. Биосинтез аминокислот, пуриновых и пиримидиновых
9
оснований, витаминов. Биосинтез белка, жирных кислот и липидов, углеводов и
полисахаридов. Биосинтез РНК и ДНК. Биосинтез пигментов, антибиотиков и др.
вторичных метаболитов. Биохимия ассимиляции азотсодержащих соединений.
Ферментный аппарат микроорганизмов. Эндо- и экзоферменты. Конститутивные и
индуцибильные ферменты. Регуляция синтеза и активности. Практическое использование
ферментов.
7. Регуляция метаболизма у микроорганизмов
Регуляция ферментативных реакций; константы, влияние различных факторов.
Роль аллостерических белков.
Генетическая регуляция синтеза ферментов; механизмы. Опероны и регулоны.
Катаболитная репрессия и катаболитное торможение. Роль циклического АМФ,
субклеточных структур и полиферментных комплексов в регуляции метаболизма. Роль
изоферментов. Регуляция синтеза ДНК и РНК, полисахаридов, полифосфатов, липидов.
8. Генетика микроорганизмом
Геномы микроорганизмов. Генетический код и синтез белка. Типы мутаций у
микроорганизмов. Молекулярные механизмы генных мутаций. Системы генетической
коррекции и репарации. Виды изменчивости. Модификационная и генотипическая
изменчивость.
Генетические рекомбинации у прокариот. Конъюгация, трансформация,
трансдукция. Методы локализации генов. Транспозоны, IS-элементы. Свойства плазмид.
Рестрикция и модификация чужеродной ДНК. Методы генной инженерии.
Генетическая рекомбинация у эукариотических микроорганизмов. Методы
селекции микроорганизмов. Применение молекулярно-генетических методов для
индикации микробов и диагностики инфекций (ПЦР, методы гибридицации нуклеиновых
кислот, зонды и др.). Достижения и перспективы генной инженерии.
9. Экология микроорганизмов
Геохимическая деятельность микроорганизмов. Роль микроорганизмов в
круговороте веществ в природе. Микробиоценозы. Симбиоз, комменсализм, нейтрализм,
конкуренция, паразитизм, хищничество. Эндо- и эктосимбионты растений и животных.
Лишайники. Микориза. Микрофлора организма человека, животных, почвы, воды,
воздуха. Функции микрофлоры. Колонизационная резистентность микрофлоры человека.
Дисбиоз, дисбактериоз. Понятия о пробиотиках, пребиотиках и симбиотиках.
Микробиологические показатели качества воды и других сред. Роль свободноживущих
микроорганизмов в формировании и развитии биосферы Земли. Участие микробов в
биогеохимических циклах химических элементов, синтезе и трансформации веществ,
поддержании планетарного радиационного баланса. Микробиологические аспекты охраны
окружающей среды.
Болезни человека, животных, растений, вызываемые микроорганизмами. Факторы
патогенности микроорганизмов, токсины. Взаимоотношения микроорганизмов с
неспецифическими факторами защиты и факторами приобретенного иммунитета.
10. Микробная биотехнология
Биотехнология как междисциплинарная область научно-технического прогресса.
Техническая микробиология и ее значение в развитии современной биотехнологии.
Роль микроорганизмов: в виноделии, при хлебопечении; в производстве молочных
продуктов, этанола, глицерина, ацетона, бутанола, органических кислот, полисахаридов,
аминокислот, гормонов, вакцин, антибиотиков, инсулина, иммуномодуляторов,
энтомопатогенных препаратов и др. Методы получения и контроля штаммов-продуцентов
10
биологически активных веществ. Методы очистки продуктов. Иммобилизованные
биокатализаторы. Промышленные и лабораторные биореакторы. Основные виды сырья.
Биогеотехнология. Роль бактерий в получении металлов, в повышении
нефтеотдачи пластов, в разрушении нефти и рекультивации нефтезагрязненных почв,
водоемов, а также в снижении метаноопасности угольных пластов.
11
ПРОГРАММА
кандидатского экзамена по специальности
03.02.03 «Микробиология»
(часть 2 – дополнительная)
Основы общей микробной экологии.
Экология микроорганизмов – одно из направлений современной микробиологии и
экологии. Определение микробной экологии. Современные взгляды на определение
предмета и задач экологии микроорганизмов. Методы современной микробной экологии.
Молекулярные методы экологии микроорганизмов.
Корни экологии микроорганизмов: общая экология, микробиология. Общая
экология во второй половине ХIХ века. Введение понятий «биоценоз» /К. Мебиус/ и
«сообщество». Успехи общей экологии в ХХ в. Введение понятия «экосистема»
/А.Тенсли/ и «биогеоценоз» /В.Н.Сукачев/. Учение о биосфере В.И.Вернадского.
Выделение экологической микробиологии в самостоятельный раздел (С.Н. Виноградский,
1945). Значение микробов в формировании, существовании и развитии биосферы Земли.
Понятие об экологических факторах. Классификация экологических факторов по
разным признакам. Биотические и абиотические факторы. Естественные и антропогенные
факторы. Условия обитания и ресурсы.
Понятие об абиотических факторах и экологической физиологии. Зоны оптимума,
лимитирования, ингибирования. Ксенобиотики.
Понятие экологической ниши. Современная концепция экологической ниши как
комплексной аутэкологической характеристики влияния на организм экологических
факторов. Экологическая ниша как область в пространстве экологических факторов.
Определение популяции в экологии, микробной экологии и генетике. Понятие
особи как элемента микробной популяции. Границы микробной популяции и объективные
трудности их установления.
Рост микробной популяции. Экспоненциальная модель роста микроорганизмов.
Основные составляющие скорости роста микробной популяции: рождаемость, смертность.
Проблема динамики численности микробной популяции и различные подходы к ее
решению. Факторы, регулирующие динамику популяций.
Концепция саморегуляции популяции. Поведенческие, физиологические и
генетические механизмы регуляции численности. Управление динамикой численности
популяции.
Взаимодействие микробных популяций. Основные типы межпопуляционных
взаимодействий и их разновидности.
Понятие термина «сообщество». Характеристики, отличающие сообщество от
популяции и организма: видовой состав, видовое разнообразие. Сообщество как
совокупность взаимодействия и их характеристики. Межвидовая конкуренция: ее
определение, типы и различные подходы к изучению.
Микробное сообщество. Трофическая структура микробного сообщества.
Функциональное разнообразие микробного сообщества.
Понятие об экосистемах (биогеоценозах).
Круговорот воды, азота и минеральных элементов в экосистемах. Анализ обменных
процессов в экосистемах методами теории матриц и графов. Интегральные
характеристики круговорота элементов в экосистемах. Минеральные удобрения и
проблема эвтрофикации. Проблемы радиоэкологии.
Учение об экологических сукцессиях. Смены экосистем во времени: внезапные
(катастрофические) и последовательные (сукцессионные). Сукцессии первичные и
вторичные, эндогенные и экзогенные.
12
Понятие о биосфере. Представления В.И.Вернадского о живом веществе и его
биогеохимической роли. Биологическая продуктивность биосферы и пищевые ресурсы
человечества.
Определение экологической стратегии. Теория основных типов экологических
стратегий. Особенности экологической стратегии во взаимоотношениях с
микроорганизмами, животными и растениями. Биотические связи с участием
микроорганизмов.
Эволюционная
роль
симбиотических
отношений
между
микроорганизмами. Экологические связи микробов (симбиоз, комменсализм, нейтрализм,
конкуренция, паразитизм, хищничество).
Медицинские аспекты микробной экология Медицинская микроэкология).
Микробиота (нормальная микрофлора тела) человека. Заносные свободноживущие
микробы. Нормальная (резидентная) микрофлора. Аутохтонная и аллохтонная,
пристеночная и просветная микрофлора. Формирование и развитие нормальной
микробиоты. Видовой и количественный состав нормальной микрофлоры
(эумикробиоценоза) отдельных биотопов тела человека. Функции нормальной
микрофлоры:
противоинфекционная,
метаболическая,
иммунобиологическая,
антитоксическая. Факторы, оказывающие влияние на состав микробиоты. Методы
изучения микробиоты человека и животных. Гнотобиология. Патогенная роль части
микробиоты, условия проявления.
Дисбиоз (дисбактериоз), причины возникновения, классификация, принципы
коррекции. Препараты и другие средства для восстановления микробиоты (пробиотики,
пребиотики, синбиотики, пробиотические продукты функционального питания).
Механизм их лечебно-профилактического действия. Роль аутометаболитов в регуляции
численности популяций и реализации полезных для макроорганизма функций
пробиотических микробов. Биотехнологические аспекты производства пробиотических
препаратов и других средств коррекции микробиоты.
Литература
1. Определитель бактерий Берджи. Перевод с англ. М.: Мир, 1997 г., т. 1, 432 с.; т. 2,
368 с.
2. Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology 2nd. Edition, 2001 г.
3. Глин В., Пастернак Дж. Молекулярная биотехнология. Перевод с англ. М.: Мир,
2001 г.
4. Медицинская микробиология, иммунология и аллергология. Компьютерный атласруководство под ред. академика РАМН, проф. А.А. Воробьева и проф. А.С.
Быкова. М.: Диаморф, 2002 г.
5. Определитель нетривиальных патогенных грамотрицательных бактерий Перевод с
англ. М.: Мир, 1999 г., 791 с.
6. Микробиология и иммунология под ред. академика РАМН, проф. А.А. Воробьева.
М.: Медицина, 1999 г., 464 с.
7. Поздеев О.К. Медицинская микробиология под ред. академика РАМН, проф. В.И.
Покровского. М.: ГЭОТАР-МЕД, 2001 г., 768 с.
8. Атлас по зоопаразитологии. Н.В. Чебышев, М.В. Далин, В.К. Гусев и др. М.: АОЗТ
«ИНТЕРХИМ», 1998 г., 173 с.
9. Саттон Д., Фотергилл А., Ринальди М. Определитель патогенных и условнопатогенных грибов. Перевод с англ. М.: Мир, 2001 г., 486 с.
10. Микробиология./ Под ред.А.А.Воробьева. - М.: Медицина, 1998 и др.годы издания.
13
11. Микробиология и иммунология./ Под ред.А.А.Воробьева. - М.: Медицина, 1999 и
др.годы издания.
12. Руководство к практическим занятиям по медицинской микробиологии,
вирусологии и иммунологии. Под ред. В.В.Теца. – М.: «Медицина», 2002.
13. Руководство к практическим занятиям по медицинской микробиологии. Томск,2003 и др. издания для практических занятий (Под ред. Теца, Борисова и
др.).
14. Учебник: Медицинская микробиология./ Под ред. В.И.Покровского, О.К.Поздеева.
- М.: ГЭОТАР Медицина,1999 и др. годы издания.
15. Акатов А. К., Зуева. B.C. Стафилококки- М.: Медицина, 1983.
16. Актуальные проблемы клинической микробиологии (сборник научных трудов)
НИИЭМ им.Н.Ф.Гамалеи. - М., 1989.
17. Антонов В.Б., Яробкова Н.Д-, Чайка Н.А. Аспергиллез и СПИД. - СПб., 1992.
18. Белозеров Е.С. Бруцеллез. - М.: Медицина, 1985.
19. Букринская А.Г. Вирусология. - М., 1986.
20. Вершигора А.Е. Общая иммунология. - Киев, 1990,.
21. Вирусология (3 тома)./ Под ред. Б.Филсца и Д.Найпа. - М„ 1989.
22. Внутрибольничные инфекции. / Под ред. В.П.Венцела. - М., 1990.
23. Воробьев А.А. Основы медицинской биотехнологии. - М., 1990.
24. Дифтерия./ Под ред. Л.А.Фаворовой, Н.В.Астафьевой, М.Н.Коржаковой. - М.:
медицина, 1988.
25. Елинов Н.П. Химическая микробиология. - М.: «Высшая школа», 1989.
26. Ермольева 3.В. Антибиотики, интерферон. Бактериальные полисахариды. 2-е изда.
- М.: Медицина, 1968.
27. Знаменский В.А. Кишечныеиерсиниозы. - М.: ЦОЛИУВ, 1982.
28. Иммунологическая диагностика вирусных инфекций. / Под ред. Т.В.Перадзе,
П.Халонена. - М., 1985.
29. Иммунология (3 тома)./ Под ред. У.Пола. - М., 1987.
30. Иммунология инфекционного процесса. Руководство для врачей Под ред.
В.И.Покровского, С.П.Гордиенко, В.И.Литвинова. - М., 1994.
31. Исхакова Х.Н., Влодовец В.В., Колкер И.И. Микробиологические аспекты
внутрибольничных инфекций в хирургических стационарах. - Ташкент: Медицина,
1987.
32. Кетлинский С.Л., Симбирцев А.С., Воробьев А.А. Эндогенные иммуномодуляторы,
- С. -Петербург, 1992.
33. Клиническая иммунология и аллергология (3 тома)./ Под ред. Л.Иегера. - М.,1990.
34. Кочемасова З.Н.. Ефремова С.А., Рыбакова А.М. Санитарная микробиология
ивирусология, - М, 1987.
35. Кубась В.Г., Данилова О.П., Чаша Н.А. Кандидоз. - СПб., 1997.
36. Лабораторные тесты. Микробиологическая и вирусологическая диагностика (1-Ш
части). - М.: Каина, 1995.
37. Лебедев К.А., Понякина И.Д. Иммунограмма в клинической практике. - М., 1985.
38. Лещенко В.М. Лабораторная диагностика грибковых заболеваний. - М., 1982.
39. Львов Д.К., Клименко СМ., Гайдамович С.Я. Арбовирусы и арбовирусные
инфекции. - М, 1989.
40. Маянский А.Н., Маянский Д.Н. Очерки о нейтрофиле и макрофаге. - Новосибирск.
«Наука», 1989.
41. Медицинская микробиология./ Под ред. Покровского В.И.. - М., ГЭОТАР, 1998.
42. Микробиология./ Под ред. А.А.Воробьева. - М., 1994.
43. Микробиология с вирусологией и иммунологией./ Под ред. Л.Б.Борисова,
А.М.Смирновой. - М.,1994.
44. Михайлов В.В. Ботулизм- Л.: Медицина, 1980.
14
45. Навашин С.М., Фомина И.П. Справочник по антибиотикам. - М.: Медицина, 1984.
46. Петров Р.В. Иммунология. - М., 1987.
47. Плейфер Дж. Наглядная иммунология. - М., ГЭОТАР, 1998.
48. Реброва Р.Н. Грибы рода Candida при бактериальных инфекциях. 2-е изд. - М.:
Медицина, 1991.
49. Репродуктивное здоровье./ Под ред. Л.Г.Кента, Г.С.Бергера, Д.А.Эбельмана. - М.:
Медицина, 1988, т.1-2.
50. Роит А. Основы иммунологии. - М., 1991.
51. Руководство к лабораторным занятиям по микробиологии./ Под ред. Л.Б.Борисова.
- М., 1984.
52. Руководство по иммунологическим и аллергологическим методам в гигиенических
исследованиях - Федосеева В.Н., Порпаин Г.В., Ковальчук Л.В., Чередеев А.Н„
Кочан В.Ю., Помедэк. - 1993.
53. Руководство по контролю качества питьевой воды. Гигиенические критерии и
другая релевантная информация. - Женева: ВОЗ, 1987, т. 27.
54. Руководство по лабораторной диагностике дифтерийной инфекции. - М.:
Информационно-издательский центр Госкомсанэпиднадзора России, 1995.
55. Руководство по эпидемиологии инфекционных болезней (2 тома). - М., 1993./ Под
ред. академика РАМН В.И.Покровского.
56. Современные представления о биологии возбудителей и методах лабораторной
диагностики бактериальной дизентерии./ Под ред. В.И.Покровского. - М.:
ВНИИМИ, 1981.
57. Столярова Л.Г., Соловьева В.Е. Лабораторная диагностика коклюша и
коклюшеподобных заболеваний. - М.: ЦОЛИУВ, 1992.
58. Столярова Л.Г., Соловьева В.Е. Дифтерия. - М.: ЦОЛИУВ, 1993.
59. Учебно-методическое пособие. Микробиология полости рта. М.Г.Чеснокова,
Н.В.Рудаков, В.П.Клишевич. Омск, 2002.
60. Хаитов P.M., Игнатьева Г.А. СПИД. - М„ 1992.
61. Шлегель Г. Общая микробиология. - М.: «Мир», 1987.
62. Шендеров Б.А. Медицинская микробная экология и функциональное питание- М.,
1998.
63. Энтеробактерии: Руководство. / Под ред. В.И.Покровского. - М.: Медицина, 1985.
64. Банникова Л.А., Королёва Н.С., Семенихина В.Ф. Микробиологические основы
молочного производства: Справочник. - М.: Агропромиздат, 1987. -400 с.
65. Микробиология продуктов животного происхождения / Г.Д. Мюнх, Х. Заупе, М.
Шрайтер. Пер. с нем. - М.: Агропромиздат. 1985. – 592 с.
66. Королёва Н.С., Семенихина В.Ф. Санитарная микробиология молока и молочных
продуктов. - М.: «Пищевая промышленность», 1980. – 255 с.
67. Степаненко П.П. Микробиология молока и молочных продуктов, - Сергиев Посад:
ООО «Всё для Вас – Подмосковье «, 1999. – 415 с.
Дополнительная литература
Бактерийные, сывороточные и вирусные лечебно-профилактические препараты.
Аллергены. Дезинфекционно-стерилизационные режимы помещений.: справочник
практического врача /Под ред. Н.А. Озерецковского, Г.И.Останина.- СПб.: Фолиант,
1998.- 512 с.
Бондаренко В.М., Мацулевич Т.В. Дисбактериоз кишечника как клинико-лабораторный
синдром (современное состояние проблемы). – М.:ГЭОТАР-Медиа, 2006. – 304 с.
Громов Б. В., Павленко Г. В. Экология бактерий: Учеб. пособие. – Л.: Изд-во Ленингр. унта, 1989. – 248 с.
15
Елинов Н. П. Основы биотехнологии / Для студентов институтов, аспирантов и
практических работников. – СПб: Изд. Фирма «Наука», 1995. – 600 с.
Иммунобиологические препараты и перспективы их применения в инфектологии
/Под
ред. Г.Г.Онищенко, В.А.Алёшкина, С.С.Афанасьева, В.В.Поспеловой. – М.: ГОУ ВУНМЦ
МЗ РФ, 2002. – 608 с.
Коротяев А.И., Бабичев С.А. Медицинская микробиология, иммунология и вирусология.
Учебник. - СПб: «Специальная Литература», 1998. - 592 с.
Нетрусов А.И. Экология микроорганизмов. М. Академия.2004. 270 с.
Организация вакцинопрофилактики: пособие для врачей. /Под ред.акад. РАМН Г.Г.
Онищенко. / М., Фед.центр гигиены и эпидемиологии Роспотребнадзора, 2007.- 672 с.
Петровская В. Г., Марко О. П. Микрофлора человека в норме и патологии. – М.:
Медицина, 1976. – 231 с.
Таточенко В.К., Озерецковский Н.А., Федоров А.М., Соколова А.Ф., Алексина С.Г.
Иммунопрофилактика – 2003.- М., Изд-во Серебряные нити, 2003. – 176 с.
Учайкин В.Ф., Нисевич Н.И., Шамшева О.В. Инфекционные болезни и
вакцинопрофилактика у детей: учебник. – М.: ГЭОТАР–Медиа, 2007. – 688 с.
Шендеров Б. А. Медицинская микробная экология и функциональное питание. Т. I, II, III –
М.: Грант, 1998-2001.
Evaldson G., Heimdahl A., Kager L., Nord C. E. The normal human anaerobic microflora //
Scand. J. Infect. Dis. Suppl. – 1982. – 35. – C. 9 – 15.
Gibson G. , Rastall R. Prebiotics: development & application../ - John Wiley & Sons. 2006 256 p.
Goktepe I., Juneja V., Ahmedna M. Probiotics in food safety and human health. - CRC
Press/Taylor & Francis Group. 2005 - 494 p.
Lee Y., Salminen S. Handbook of probiotics and prebiotics. - John Wiley & Sons. 2009 - 596 p.
Rašic J. Lj, Kurmann J. A. Bifidobacteria and their role: microbiological, nutritional –
physiological, medical and technological aspects and bibliography. – Basel – Boston – Stuttgart:
Birkhäuser Verlag, 1983. – 295 p.
Tannock G. Probiotics and prebiotics: where are we going?.. - Horizon Scientific Press, 2002. 333 p.
16
ПРОЦЕДУРА ПРОВЕДЕНИЯ КАНДИДАТСКОГО ЭКЗАМЕНА по
НАУЧНОЙ СПЕЦИАЛЬНОСТИ 03.02.03 – «микробиология»
(медицинские науки)
На экзамене кандидатского минимума по специальности аспирант
(соискатель степени кандидата наук) должен продемонстрировать знание
современных биологических технологий, включая теоретические и
практические положения всех разделов дисциплины специализации. Особое
значение отводится умению использовать методы и приемы биотехнологии
для решения фундаментальных и прикладных задач в избранной области
предметной специализации.
Комиссия по приему кандидатского экзамена организуется под
председательством ректора (проректора) ГБОУ ВПО «ДГМА». Члены
комиссии назначаются из числа высококвалифицированных научнопедагогических и научных кадров, включая научных руководителей
аспирантов, по представлению заведующих кафедрами.
Комиссия правомочна принимать кандидатский экзамен, если в ее
заседании участвуют не менее двух специалистов по профилю принимаемого
экзамена, в том числе один доктор наук.
При приеме документов могут присутствовать члены соответствующего
диссертационного совета организации, где принимается экзамен, ректор,
проректор, декан, представители министерства или ведомства, которому
подчинена организация.
Кандидатский экзамен проводится по усмотрению экзаменационной
комиссии по билетам или без билетов. Для подготовки ответа соискатель
ученой степени использует экзаменационные листы, которые сохраняются
после приема экзамена в течение года.
На каждого соискателя ученой степени заполняется протокол приема
кандидатского экзамена, в который вносятся вопросы билетов и вопросы,
заданные соискателю членами комиссии.
Уровень знаний соискателя ученой степени оценивается на «отлично»,
«хорошо», «удовлетворительно», «неудовлетворительно».
Протокол приема кандидатского экзамена подписывается членами
комиссии с указанием их ученой степени, ученого звания, занимаемой
должности и специальности согласно номенклатуре специальностей научных
работников.
17
Протоколы заседаний экзаменационных комиссий после утверждения
ректором высшего учебного заведения или руководителем научного
учреждения, организации хранятся по месту сдачи кандидатского экзамена.
О сдаче кандидатского экзамена выдается удостоверение установленной
формы.
18
ПЕРЕЧЕНЬ ВОПРОСОВ ДЛЯ ПОДГОТОВКИ
К КАНДИДАТСКОМУ ЭКЗАМЕНУ
по научной специальности
03.02.03 – «микробиология» (медицинские науки)
1. Медицинская бактериология: предмет изучения, цели и задачи.
Исторические этапы и основные направления развития медицинской
микробиологии.
2. Медицинская вирусология: предмет изучения, цели и задачи.
Исторические этапы и основные направления развития медицинской
вирусологии.
3. Иммунология: предмет изучения, цели и задачи. Исторические этапы и
основные направления развития иммунологии.
4. Принципы классификации, систематика и номенклатура бактерий.
Определение понятий: вид, штамм, биовар.
5. Строение бактериальной клетки: основные структурные компоненты и их
функции.
6.Оболочка бактериальной клетки: ультраструктура, химический состав и
функции.
7. Клеточная стенки грамположительных бактерий: ультраструктура,
химический состав, функции и морфогенез.
8. Клеточная стенки грамотрицательных бактерий: ультраструктура,
химический состав, функции и морфогенез.
9. Клеточная стенки кислотоустойчивых бактерий: ультраструктура,
химический состав, функции и морфогенез.
10. Цитоплазматическая мембрана бактерий: ультраструктура, химический
состав и функции.
11. Капсула и капсулоподобные оболочки бактерий: ультраструктура,
химический состав, функции и морфогенез.
12. Жгутики и реснички бактерий: ультраструктура, химический состав,
функции и морфогенез.
13. Споры бактерий: ультраструктура, химический состав, функции и
морфогенез.
14. Морфология микробных сообществ: структурная организация и
основные компоненты микробных колоний и биопленок.
15. Бактерии, имеющие извитую форму (спирохеты, спириллы, вибрионы):
ультраструктура, морфология, физиология, методы изучения.
16. Бактерии - облигатные внутриклеточные паразиты (представители
порядков Rickettsiales и Chlamydiales): ультраструктура, морфология и
физиология, методы изучения.
17. Бактерии, лишенные клеточной стенки (представители класса
Mollicutes): ультраструктура, морфология, физиология, методы изучения. Lформы бактерий.
19
18. Бактерии – представители порядка Actinomycetales: ультраструктура,
морфология, физиология, методы изучения.
19. Грибы: морфология и ультраструктура, методы изучения. Принципы
классификации грибов.
20. Грибы: строение клетки, основные структурные компоненты и их
функции.
21. Клеточная стенка и плазматическая мембрана грибов: ультраструктура,
химический состав, функции.
22. Грибы: физиология, методы культивирования и идентификации.
23. Механизмы и типы питания бактерий. Определение понятий: автотроф,
гетеротроф, ауксотроф, прототроф.
24. Простейшие: морфология и ультраструктура, методы изучения. Роль
простейших в экологии патогенных бактерий.
25. Энергетический метаболизм бактерий: способы получения и запасания
энергии. Определение понятий: фототроф, хемотроф, органотроф, литотроф.
26. Роль кислорода в метаболизме бактерий. Особенности метаболизма
аэробных, анаэробных и факультативных бактерий.
27. Транспорт веществ между бактериальной клеткой и окружающей средой.
Механизмы секреции макромолекул (белков и нуклеиновых кислот) у
патогенных бактерий.
28. Конститутивные и индуцибельные процессы в микробной клетке.
Адаптация бактерий. Стрессовые системы бактерий.
29. Роль температуры в жизнедеятельности бактерий. Температура как
регулятор функций микробной клетки (морфогенеза, вирулентности). 30.
Движение бактерий. Таксис. Способы перемещения патогенных бактерий в
организме хозяина.
31. Внутриклеточный паразитизм. Облигатные и факультативные
внутриклеточные паразиты.
32. Культивирование бактерий. Методы выделения чистых культур бактерий
и их идентификации.
33. Стерилизация и дезинфекция: определение понятий, методы,
применение, значение для медицины. Асептика и антисептика.
34. Физиология микробных сообществ. Формирование и расселение
сообществ микроорганизмов, кооперация микробов в составе сообществ.
35. Вирусы: отличительные особенности морфологии и физиологии,
принципы классификации вирусов.
36. Вирусы: химический состав и структура. Функции основных
компонентов вириона.
37. Репродукция вирусов.
38. Продуктивная вирусная инфекция: определение понятия, основные
стадии взаимодействия вируса с клеткой хозяина, способы проникновения
вирусов в клетки эукариот и бактерий.
20
39. Продуктивная вирусная инфекция: определение понятия, основные
стадии взаимодействия вируса с клеткой хозяина, способы морфогенеза и
выхода вирусов из клетки.
40. Продуктивная вирусная инфекция: определение понятия, основные
стадии взаимодействия вируса с клеткой хозяина, синтез белка и
нуклеиновых кислот у плюс-РНК-содержащих, минус-РНК-содержащих и
ДНК-содержащих вирусов.
41. Интегративная вирусная инфекция: определение понятия, основные
стадии взаимодействия вируса с клеткой хозяина.
42. Вирусы: способы персистенции в клетке хозяина. Абортивная вирусная
инфекция.
43. Дефектные вирусы: происхождение, свойства, биологическая роль.
44. Бактериальные вирусы (фаги): строение, репродукция. Вирулентные и
умеренные фаги. Применение фагов в медицине.
45. Вирусы: методы культивирования, индикации и идентификации.
46. Организация генома бактерий. Роль хромосомы и мобильных
генетических модулей в хранении и передаче генетической информации у
бактерий.
47. Спонтанные и индуцированные мутации: причины, классификация.
Системы репарации повреждений ДНК у бактерий. Мутационная
изменчивость микроорганизмов и ее значение в эволюции.
48. Рекомбинация ДНК у бактерий: определение понятия, механизмы,
значение в эволюции.
49. Горизонтальный перенос генов: определение понятия, механизмы
(трансформация, конъюгация), значение в эволюции.
50. Горизонтальный перенос генов: определение понятия, механизмы
(трансдукция, GTA-транспорт), значение в эволюции.
51. Плазмиды, транспозоны, Is-элементы бактерий: свойства и функции.
52. Прионы: происхождение, свойства и способы распространения.
53. Генетика бактериальных популяций. Сохранение, накопление,
распространение и утрата генетической информации в микробной
популяции.
54. Механизмы регуляции основных биологических процессов (репликации,
транскрипции, трансляции, морфогенеза) у бактерий.
55. Экология микроорганизмов. Экологическая роль аутохтонной
микрофлоры почвы и воды.
56. Воздух как фактор распространения патогенных микроорганизмов.
Показатели микробной загрязненности воздуха и микробиологические
методы оценки санитарно-бактериологического состояния воздуха закрытых
помещений.
57. Почва как среда обитания патогенных микроорганизмов. Показатели
бактериальной загрязненности почвы. Патогенные виды, длительно
сохраняющиеся в почве.
21
58. Вода как среда обитания патогенных микроорганизмов. Методы и
показатели для оценки бактериальной загрязненности воды. Патогенные
виды, длительно сохраняющиеся в воде.
59. Микрофлора организма человека: состав, свойства. Дисбактериоз.
60. Микрофлора организма человека: основные функции.
61. Антимикробные препараты – антибиотики, антисептики, дезинфектанты:
определения
понятий,
отличия,
область
применения.
Основы
избирательности действия антибиотиков.
62. Лекарственная устойчивость микроорганизмов: основные механизмы,
причины и способы возникновения, пути распространения.
63. Методы определения чувствительности микроорганизмов к
антибиотикам. Способы преодоления лекарственной устойчивости.
64. Бета-лактамные антибиотики: свойства препаратов, классификация,
механизмы микробной устойчивости. Бета-лактамазы.
65. Пенициллины: свойства препаратов, механизмы микробной
устойчивости. Метициллин-устойчивые бактерии.
66. Цефалоспорины: свойства препаратов, механизмы микробной
устойчивости.
67. Бета-лактамы группы резерва (монобактамы, карбапенемы и др.):
свойства препаратов, механизмы микробной устойчивости.
68. Гликопептиды, циклосерин, фосфомицин, бацитрацин: свойства
препаратов, механизмы микробной устойчивости.
69. Полимиксины, грамицидины, тироцидины: свойства препаратов,
механизмы микробной устойчивости
70. Аминогликозиды: свойства препаратов, механизмы микробной
устойчивости.
71. Тетрациклины, хлорамфеникол: свойства препаратов, механизмы
микробной устойчивости.
72. Макролиды, азалиды, линкозамины: свойства препаратов, механизмы
микробной устойчивости.
73. Cтрептограмины, сульфазолидиноны: свойства препаратов.
74.. Роль колонизации в процессе взаимодействия паразит-хозяин.
75.Прямые механизмы повреждения организма хозяина при бактериальных
инфекциях.
76. Агрессины бактерий: определение понятия, роль во взаимодействии
паразит-хозяин, примеры.
77. Пенетрация и инвазия бактерий: определение понятий, механизмы, роль
во взаимодействии паразит-хозяин, примеры.
78. Экзотоксины бактерий: локализация генов, способы секреции и доставки
в клетки-мишени, классификация.
79. Нейротоксины и энтеротоксины бактерий: механизмы действия,
примеры.
80. Токсины бактерий, нарушающие синтез белка и функции цитоскелета:
механизмы действия, роль во взаимодействии паразит-хозяин, примеры.
22
81. Мембранотоксины бактерий: механизмы действия, роль во
взаимодействии паразит-хозяин, примеры.
82. Бактериальные экзотоксины опосредованного действия: химическая
природа, механизмы действия, примеры.
83. Экзоферменты бактерий: способы секреции, механизмы действия, роль
во взаимодействии паразит-хозяин.
84. Опосредованные механизмы повреждения организма хозяина при
бактериальных инфекциях.
85. Эндотоксины бактерий: химическая природа, механизмы действия,
примеры.
86. Септический шок: причины, пусковые механизмы, роль микробов и
факторов иммунитета.
87. Токсический шок: причины, пусковые механизмы, роль микробов и
факторов иммунитета.
88. Роль микроорганизмов в патогенезе аутоиммунных заболеваний.
89. Модулины бактерий: определение понятия, роль в вирулентности,
примеры.
90. Иммунопротекторы бактерий: определение понятия, роль в
вирулентности. Способы преодоления неспецифической защиты организма.
Незавершенный фагоцитоз.
91. Иммунопротекторы бактерий: определение понятия, роль в
вирулентности. Способы преодоления специфической защиты организма.
92. Формы инфекции – острая и хроническая: определение понятий,
механизмы, примеры.
93. Формы инфекции – латентная и носительство: определение понятий,
механизмы, примеры.
94. Формы инфекции – локальная и генерализованная: определение понятий,
примеры, принципы диагностики.
95. Вторичная инфекция, смешанная инфекция: определение понятий,
механизмы, примеры.
96. Реинфекция, суперинфекция, рецидив: определение понятий, механизмы,
примеры.
97. Входные ворота и пути распространения возбудителей в организме.
Бактериемия, септицемия, токсинемия, вирусемия: определение понятий,
примеры.
98. Патогенность вирусов. Прямые и опосредованные механизмы
повреждения при вирусных инфекциях.
99. Механизмы иммунопротекции вирусов: способы преодоления раннего
(интерферон- независимого) противовирусного ответа и противодействия
факторам неспецифической защиты организма.
100. Механизмы иммунопротекции вирусов: способы преодоления
специфической защиты организма.
101. Факторы вирулентности грибов. Микотоксины.
23
102. Экология патогенных бактерий. Антропонозные, зоонозные и
сапронозные инфекции.
103. Источники заражения, механизмы и пути передачи возбудителей
болезней человека, экзогенная и эндогенная инфекция (примеры).
104. Иммунная система человека: основные функции, принципы
организации, центральные и периферические органы иммунной системы.
105. Виды иммунитета – видовой, неспецифический (врожденный),
специфический (приобретенный): определение понятий, основные свойства,
примеры.
106. Барьерный иммунитет: механизмы и защитная роль.
107. Специфический (приобретенный) иммунитет – активный, пассивный,
естественный, искусственный: определение понятий, механизмы, примеры.
Способы иммунизации.
108. Специфический (приобретенный) иммунитет – антимикробный и
антитоксический: определение понятий, механизмы, примеры. Способы
иммунизации.
109. Протективный иммунитет: определение понятия, механизмы, примеры.
Способы иммунизации.
100. Неспецифический (врожденный) иммунитет: распознавание паразитассоциированных молекулярных структур, пусковые механизмы и
медиаторы неспецифического воспалительного ответа, защитное и
повреждающее действие.
111. Гуморальные факторы неспецифического антибактериального и
антипротозойного иммунитета: клетки-продуценты, механизмы защитного и
повреждающего действия.
112. Система комплемента: компоненты, пути активации, механизмы
защитного и повреждающего действия.
113. Клеточные факторы неспецифического антибактериального и
антипротозойного иммунитета: происхождение, механизмы защитного и
повреждающего действия.
114. Фагоцитоз: фагоцитирующие клетки, стадии фагоцитоза, механизмы
защитного и повреждающего действия. Микробицидные механизмы
фагоцитов.
115. Ранний (интерферон-независимый) противовирусный ответ и клеточные
факторы неспецифического противовирусного иммунитета: активация,
механизмы защитного и повреждающего действия.
116. Интерфероны типа I: клетки-продуценты, механизмы противовирусного
и противоопухолевого действия.
117. Антигены: химическая природа, свойства, условия проявления
антигенности. Гаптены, Т-независимые и Т-зависимые антигены.
Суперантигены.
118.
Иммунохимическая
специфичность
антигенов,
антигенные
детерминанты (эпитопы). Гетероантигены, аллоантигены, изоантигены
(примеры).
24
119. Антигены микроорганизмов. Протективные антигены, антигенная
мимикрия (примеры).
120. Антигены организма человека: групповые, индивидуальные,
тканеспецифические, секвестрированные. Антигены эритроцитов. Антигены
гистосовместимости.
121. Иммунокомпетентные клетки: происхождение, созревание, принципы
селекции, функции.
122. Иммунологическая толерантность: определение понятия, механизмы.
Аутоиммунные заболевания.
123. Макрофаги: функции в иммунном ответе.
124. Цитокины: классификация, биологические функции, клеткипродуценты, клетки-мишени, роль в иммунитете. Провоспалительные
цитокины: защитное и повреждающее действие.
125. Хемокины: классификация, биологические функции, клеткипродуценты, клетки-мишени, роль в иммунитете. Роль эндотелия в
иммунном ответе.
126. Антиген-представляющие клетки: свойства, механизмы презентации
антигена, роль в иммунном ответе.
127. Т-лимфоциты: субпопуляции, распознавание антигена, функции в
иммунном ответе.
128. Натуральные киллеры и цитотоксические Т-лимфоциты: распознавание
мишени, активация, функции в иммунном ответе, защитное и повреждающее
действие.
129. Тучные клетки: активация, функции в иммунном ответе, защитное и
повреждающее действие.
130. В-лимфоциты: распознавание антигена, функции в иммунном ответе.
131. Цитокины, регулирующие активность лимфоцитов (IL-4, IFN- , IL-10,
TGF- : клетки-продуценты, свойства, функции.
132. Фазы иммунного ответа. Кооперация клеток в ходе иммунного ответа.
Первичный и вторичный иммунный ответ. Иммунологическая память.
133. Антитела: функциональная структура молекулы иммуноглобулина.
Генетические основы разнообразия антител.
134. Классы иммуноглобулинов: основные характеристики и функции в
иммунном ответе. Секреторные иммуноглобулины.
135. Реакция антиген-антитело: механизм, специфичность. Серологические
реакции и их использование в медицине (примеры).
136. Гуморальные реакции специфического иммунитета (опсонофагоцитарная реакция, иммунный бактериолиз): механизмы, защитное и
повреждающее действие (примеры).
137. Гуморальные реакции специфического иммунитета: нейтрализация
токсинов и вирусов, антителозависимая клеточная цитотоксичность:
механизмы, защитное и повреждающее действие (примеры).
138. Иммунное воспаление (гиперчувствительность замедленного типа):
механизм, защитное и повреждающее действие (примеры).
25
139. Клеточные реакции специфического антибактериального иммунитета:
механизмы, защитное и повреждающее действие (примеры).
140. Клеточные реакции специфического противовирусного иммунитета:
механизмы, защитное и повреждающее действие (примеры).
141. Механизмы специфического и неспецифического противоопухолевого
иммунитета.
142. Механизмы трансплантационного иммунитета.
143. Иммунодефициты: определение понятия, классификация, причины,
методы диагностики.
144. Аллергические реакции (гиперчувствительность): определение понятия,
классификация, причины, методы диагностики.
145. Гиперчувствительность немедленного типа I – анафилактические
(атопические) реакции: молекулярные механизмы, аллергены, принципы
диагностики и лечения.
146. Гиперчувствительность немедленного типа II – цитотоксические
реакции: молекулярные механизмы, аллергены, принципы диагностики и
лечения.
147. Гиперчувствительность немедленного типа III – иммунокомплексного:
молекулярные механизмы, аллергены, принципы диагностики и лечения.
Сывороточная болезнь.
148. Иммунные комплексы и их роль при заболеваниях микробной природы
(примеры).
149. Аутоиммунные заболевания: причины, молекулярные механизмы,
принципы диагностики и лечения.
150. Вакцинопрофилактика. Свойства, получение и применение живых и
убитых вакцин (примеры).
151. Вакцинопрофилактика. Свойства, получение и применение
анатоксинов, химических и генно-инженерных (рекомбинантных) вакцин
(примеры).
152. Пассивная иммунизация: цели, показания, получение и применение
препаратов для пассивной иммунизации.
153. Иммунологические методы в диагностике бактериальных инфекций
(примеры). Серодиагностика бактериальных инфекций.
154. Иммунологические методы в диагностике вирусных инфекций
(примеры). Серодиагностика вирусных инфекций.
155.
Молекулярно-биологические
и
биохимические
методы
в
микробиологической диагностике (примеры).
156. Методы оценки состояния иммунной системы организма.
157. Возбудители раневых и гнойных инфекций: Staphylococcusspp. Роль
Staphylococcusspp. при заболеваниях полости рта.
158. Возбудители раневых и гнойных инфекций: Streptococcusspp. Роль
Streptococcusspp. при заболеваниях полости рта.
159. Возбудители раневых и гнойных инфекций: Escherichiaspp., Proteusspp. и
другие энтеробактерии. Роль энтеробактерий при заболеваниях полости рта.
26
160. Возбудители раневых и гнойных инфекций: Pseudomonasspp.,
Stenotrophomonasspp., Burkholderiaspp.
161. Возбудители раневых и гнойных инфекций: Acinetobacterspp.,
Edwardsiellaspp., Vibriospp., Aeromonasspp.
162. Возбудители раневых и гнойных инфекций: Pasteurellaspp.,
Streptobacillusspp., Bergeyella (Weeksella) spp., Erysipelothrixspp.
163. Возбудители раневых и гнойных инфекций: Aerococcusspp., Gemellaspp.,
Pediococcusspp., Bacillusspp.
164. Возбудители раневых и гнойных инфекций: Corynebacteriumspp.,
Enterococcusspp., Lactobacillusspp. Роль при заболеваниях полости рта.
165. Возбудители раневых и гнойных инфекций: Bacteroidesspp.,
Prevotellaspp., Porphyromonasspp. Роль призаболеваний полости рта.
166. Возбудители раневых и гнойных инфекций: Fusobacteriumspp.,
Veillonellaspp. Роль призаболеваний полости рта.
167. Возбудители раневых и гнойных инфекций: Propionibacteriumspp.,
Peptostreptococcusspp. Роль при заболеваниях полости рта.
168. Возбудители газовой гангрены.
169. Возбудитель столбняка.
170. Возбудители листериоза.
171. Возбудители эшерихиозов.
172. Возбудители брюшного тифа, паратифов и сальмонеллезов.
173. Возбудители шигеллеза.
174. Возбудитель холеры.
175. Бактерии – возбудители пищевых интоксикаций.
176. Возбудитель ботулизма.
177. Возбудители актиномикоза и нокардиоза. Роль при заболеваниях
полости рта.
178. Возбудители пневмоний: Streptococcusspp.
179.
Возбудители
респираторных
инфекций:
Mycoplasmaspp.,
Chlamydophilaspp., Coxiellaspp.
180. Возбудители респираторных инфекций: Haemophilusspp., Moraxellaspp.,
Kingellaspp.
181. Возбудители респираторных инфекций: Corynebacteriumspp.
182. Возбудитель респираторных инфекций: Neisseriaspp.
183. Возбудители респираторных инфекций: Bordetellaspp.
184. Возбудители туберкулеза.
185. Возбудители микобактериозов. Возбудитель проказы.
186. Возбудитель сифилиса.
187. Возбудитель гонореи.
188. Возбудитель трихомониаза.
189. Возбудители негонококковых уретритов.
190. Возбудители анаэробноговагиноза.
191. Возбудители бартонеллеза и патогенные Wolbachiaspp.
27
192. Дрожжеподобные грибы – возбудители болезней человека. Роль
дрожжеподобных грибов при заболеваниях полости рта.
193. Возбудители подкожных и глубоких микозов.
194. Возбудители поверхностных микозов и дерматомикозов.
195. Грибы – возбудители микотоксикозов.
196. Бактерии – возбудители оппортунистических инфекций при
иммунодефицитах. Роль при заболеваниях полости рта.
197. Грибы – возбудители оппортунистических инфекций при
иммунодефицитах. Роль при заболеваниях полости рта.
198. Вирусы – возбудители оппортунистических инфекций при
иммунодефицитах. Роль при заболеваниях полости рта.
199. Возбудители респираторных инфекций: Rhinovirusspp., Coronavirusspp.,
Respirovirusspp., Pneumovirusspp.
200. Возбудители гриппа.
201. Возбудитель кори.
202. Возбудитель краснухи.
203. Возбудитель эпидемического паротита.
204. Возбудители болезней человека: Mastadenovirusspp.
205. Возбудитель полиомиелита и другие представители Enterovirusspp.
206. Возбудители кишечных инфекций: Rotavirusspp., Astrovirusspp.,
Caliciviridaespp.
207. Возбудитель бешенства.
208. Прионы – возбудители медленных инфекций ЦНС.
209. Вирус натуральной оспы и другие вирусы семейства Poxviridae.
210. Арбовирусы - возбудители трансмиссивных инфекций.
211. Возбудители простого герпеса и ветряной оспы/опоясывающего лишая.
Роль при заболеваниях полости рта.
212. Возбудители внезапной экзантемы (розеолы) и Cytomegalovirusspp. Роль
при заболеваниях полости рта.
213. Возбудитель инфекционного мононуклеоза. Роль при заболеваниях
полости рта.
214. Вирусы иммунодефицита человека.
215. Вирусы гепатита B, C, D.
216. Вирусы гепатита А и Е.
217. РНК-содержащие онкогенные вирусы.
218. ДНК-содержащие онкогенные вирусы. Papillomavirusspp.
219. Онкогенные герпесвирусы: Lymphocryptovirusspp., Rhadinovirusspp.
220. Роль микробов полости рта в возникновении бактериемии и сепсиса.
221. Роль микробов полости рта в возникновении соматических заболеваний.
222. Роль микроорганизмов в возникновении кариеса зубов. Антимикробные
препараты, применяемые при лечении кариеса.
223. Роль Streptococcusmutans и др. представителей группы viridans в
возникновении кариеса зубов.
224. Роль Actinomycesspp. в возникновении кариеса зубов.
28
225. Роль Lactobacillusspp. и Bifidobacteriumspp. в возникновении кариеса
зубов.
226. Роль микроорганизмов в возникновении заболеваний эндодонта.
Антимикробные препараты, применяемые при лечении эндодонта.
227. Роль микроорганизмов в возникновении заболеваний десен и пародонта.
Антимикробные препараты, применяемые при лечении заболеваний десен и
пародонта.
228. Роль микроорганизмов-возбудителей заболеваний десен и пародонта в
возникновении соматических заболеваний.
229.
Возбудители
заболеваний
полости
рта:
Actinobacillusspp.,
Capnocytophagaspp., Eikenellaspp. Роль при гнойных инфекциях.
230. Возбудители заболеваний полости рта: Bacteroidesspp., Prevotellaspp.,
Porphyromonasspp. Роль при гнойных инфекциях.
231. Возбудители заболеваний полости рта: Fusobacteriumspp., Veillonellaspp.
Роль при гнойных инфекциях.
232.
Возбудители
заболеваний
полости
рта:
Campylobacterspp.,
Helicobacterspp.
Роль
при
кишечных
инфекциях.
Возбудители
геликобактериоза.
233. Возбудители заболеваний полости рта: Treponemaspp.
234. Роль бактерий при заболеваниях слизистой оболочки полости рта.
Антимикробные препараты, применяемые при лечении заболеваний
слизистой оболочки полости рта.
235. Роль грибов при заболеваниях слизистой оболочки полости рта.
Антимикробные препараты, применяемые при лечении микозов полости рта.
236. Роль вирусов при заболеваниях слизистой оболочки полости рта.
Антимикробные препараты, применяемые при лечении вирусных
заболеваний слизистой оболочки полости рта.
29
ОБРАЗЕЦ БИЛЕТА ДЛЯ СДАЧИ КАНДИДАТСКОГО ЭКЗАМЕНА
МИНОБРНАУКИ РОССИИ
Государственное бюджетное образовательное учреждение высшего
профессионального образования
«Дагестанская государственная медицинская академия»
(ГБОУ ВПО ДГМА)
Специальность 03.02.03 - «микробиология» (медицинские науки)
ЭКЗАМЕНАЦИОННЫЙ БИЛЕТ № Х
УТВЕРЖДАЮ
Ректор, профессор
Ахмедов Д.Р.
«____» __________________2015 г
1. Капсула и капсулоподобные оболочки бактерий: ультраструктура,
химический состав, функции и морфогенез.
2. Бактерии – возбудители пищевых интоксикаций.
3. Вирусы: способы персистенции в клетке хозяина. Абортивная вирусная
инфекция.
30
Программу составила: доцент кафедры микробиологии, вирусологии и
иммунологии к.м.н. Алиева А.И.
Программа обсуждена на заседании кафедры микробиологии, вирусологии и
иммунологии (протокол №_____ от «______»___________2015 г.)
Зав. кафедрой микробиологии,
вирусологии и иммунологии
к.м.н. доцент
Саидов М.С.
Программа согласована и рекомендована к утверждению на заседании
Ученого совета ГБОУ ВПО «ДГМА» (протокол № ___ от «___»______2015г.
Председатель Ученого совета,
профессор ______________________________________
31
Д.Р.Ахмедов