Гемоглобин

Работа с базами генетических
данных и построение
филогенетических деревьев
Выполнили:
Сутормин Олег
Лоншакова
Виктория
Студенты
ФФ06-24С
Цель
 Освоение некоторых методов работы с
базами генетических данных и
построение филогенетических деревьев
Задачи
 Ознакомиться с базой данных uniprot.org
 Построить филогенетические деревья на
основе анализа аминокислотных
последовательностей гемоглобин
субъединица β
 Ознакомиться с возможностями
программы ProtParam (на сайте
http://www.expasy.ch/tools/#primary)
Ход работы
1. Скачать с сайта uniprot.org
аминокислотную последовательность
гемоглобина.
2. Построить филогенетические деревья на
основе анализа аминокислотных
последовательностей гемоглобин
субъединица β
3. Проанализировать гемоглобин в
ProtParam
Исследуемый белок
 Гемоглобин — сложный
железосодержащий белок животных и
человека, способный обратимо
связываться с кислородом, обеспечивая
его перенос в ткани.Гемоглобин человека
является тетрамером, то есть состоит из
четырёх субъединиц. У взрослого
человека они представлены
полипептидными цепями α1, α2, β1 и β2.
Молекула гемоглобина
4 субъединицы глобина окрашены в разные цвета
Получение аминокислотных
последовательностей
Работа в программе Clustal
Целостное филогенетическое дерево
Филогенетическое дерево
Анализ гемоглобина в ProtParam
Молекулярная масса гемоглобина человека
равна 68 800 Да.
Средняя длина последовательности 360 а.о.
Самая коротка у GWA SEPOF: 2 а.о. Самая
длинная у TITIN MOUSE: 35213 а.о.
Молекула гемоглобина содержит 4 гема.
Изоэлектрическая точка гемоглобина лежит
в области рН = 6,9—7,0.
Выводы
 По анализу полученных аминокислотных
последовательностей были построены
филогенетические деревья, которые
показывают что человек и шимпанзе
имели одного общего предка и наиболее
близки по данному белку. Полученные
данные подтверждают тот факт что
человек либо произошел от шимпанзе,
либо мы с ним имели общего предка.