А.М. Шимкевич, Н.В. Луханина, О.Г. Давыденко
advertisement
НАЦИОНАЛЬНАЯ АКАДЕМИЯ НАУК БЕЛАРУСИ ИНСТИТУТ ГЕНЕТИКИ И ЦИТОЛОГИИ ИДЕНТИФИКАЦИЯ КУЛЬТИВИРУЕМЫХ В БЕЛАРУСИ СОРТОВ ЯЧМЕНЯ С ПРИМЕНЕНИЕМ SSR АНАЛИЗА А.М. Шимкевич, Н.В. Луханина, О.Г. Давыденко Требования к методу молекулярного маркирования: -повторяемость и воспроизводимость данных, в том числе, в различных лабораториях - высокая разрешающая способность - возможность создания баз данных - доступность методики Достоинства и недостатки основных молекулярных маркеров (по Collard et al., 2005; Powell et al., 1995) Маркер Достоинства Недостатки RFLP Ясность, надежность, воспроизводимость Уровень выявляемого полиморфизма ограничен RAPD Простота, относительная дешевизна, возможность анализировать несколько локусов, небольшое количество ДНК Результаты плохо воспроизводимы SSR Простота, небольшое количество ДНК, высокая воспроизводимость Обычно необходимо проведение электрофореза в полиакриламидном геле AFLP Множество локусов, высокий уровень полиморфизма Требует большого количества ДНК, сложная методика Микросателлитные маркеры, используемые в работе (по Ramsay et al., 2000) № Праймер Последовательность (5'->3') Хромосома 1 Bmac 0093 F- CGTTTGGGACGTATCAAT R-GGGAGTCTTGAGCCTACTG 2H 2 Bmac 0163 F- TTTCCAACAGAGGGTATTTACG R-GCAAAGCCCATGATACATACA 5H 3 Bmag 0007 F- TGAAGGAAGAATAAACAACCAACA R- TCCCCTATTATAGTGACGGTGTG 7H 4 Bmac 0156 F- AACCGAATGTATTCCTCTGTA R- GCCAAACAACTATCGTGTAC 7H 5 HVM 68 F- AGGACCGGATGTTCATAACG R- CAAATCTTCCAGCGAGGCT 4H 6 Bmag 0507 F- CAACTAGCATACCCAAGCTATA R-ACCCCTATTTCAATAATGGA 7H 7 Bmag 0603 F- ATACCATGATACATCACATCG R-GGGGGTATGTACGACTAACTA 3H 8 EBmac 0701 F- ATGATGAGAACTCTTCACCC R- TGGCACTAAAGCAAAAGAC 4H 9 HVC MA F- GCCTCGGTTTGGACATATAAAG R- GTAAAGCAAATGTTGAGCAACG 7H 10 HVM 74 F- CAGGAAGTCATTGCGTGAG R- TGATCAAGAATGATAACATGG 6H 11 Bmag 0223 F- TTAGTCACCCTCAACGGT R- CCCCTAACTGCTGTGATG 5H 12 Bmag 0606 F- TATTTGTAATGTATGTATGTCCC R- TCATTGGTCCAGATAATACAA 3H 13 Bmac 0316 F- ATGGTAGAGGTCCCAACTG R-ATCACTGCTGTGCCTAGC 6H Результаты детектируются на приборе Applied Biosystems Genetic Analyzer 3500 Условные обозначения используемых маркеров Название маркера Условное обозначение Bmac 0163 A Bmac 0156 B EBmac 0701 C Bmag 0507 D Bmag 0603 E Bmag 0606 F HVM 68 G Bmac 0316 H HVM 74 I Bmac 0093 J Bmag 0007 K HVC MA L Bmag 0223 M Результаты SSR-анализа сортов ячменя Название сорта Формула генотипа Талер A147B170C146D148,150E118F150G196H171,190I195J163 Сталы A145B170C148D146,148E135F150G196H165I195J163 Антьяго A145B170C148D150,154E118F150G196H131I197J163 Тюрингия A147B140C146D115E118F125G209H13I197J163 Сябра A145B170C148D148E118F150G216H131I197J163 Гонар A145B140C138,150D148,150E118F150G199H163I197J161 Атаман A145B170C138D148E118F150G216H131I197J149,157 Дзiвосны A145B170C146D148E118F150G223H165I195J167 Стратус A145,147B140C146D148E135F123G216H163I197J163 Якуб A145B170C148D148E118F150G209H163I197J157 Гастинец A147B170C150D148E118F123G196H131I205J159 Бурштын A145B170C146,148D148E118F125G209H193I197J157 Зазерский A145B140C146D148,154E135F150G216H131I195J159 Бацька A154B155C153D153E123F125H127I191J160 Фэст A152B171C120,151D151E123F149H160I201J160 СПАСИБО ЗА ВНИМАНИЕ!
