Семейства белков-регуляторов транскрипции у эукариот.

Семейства белковрегуляторов транскрипции у
эукариот.
Типы транскрипционных факторов
 Базальные – обязательно необходимые, для
связывания РНК-полимеразы с промотором.
 Активаторы- белки, связывающиеся с промотором
и усиливающие транскрипцию
 Репрессоры - белки, связывающиеся с промотором
и угнетающие транскрипцию
 В эукариотах последовательность на
промоторе,узнаваемая активаторами называется
response element
 Коактиваторы- факторы не связывающиеся с ДНК, но
необходимые для связывания факторов с ДНК.
Response element




Heat shock response element (HRE)
Glucocorticoid response element (CRE)
Estrogen response element (ERE)
Serum response element (SRE)
Способы активации ТФ
Классификация
транскрипционных факторов
 Факторы, ДНК-связывающий домен которых
обогащен положительно заряженными
аминокислотными остатками
-Факторы с доменами спираль-петля-спираль
(bHLH)
 Факторы, у которых ДНК-связывающий домен
формируется с участием координированных
ионов цинка
- zinc-coordinated DNA-binding
domain
 Факторы, имеющие ДНК-связывающий мотив
типа спираль-поворот-спираль ( helix-turn-helix
DNA binding motif, 369 факторов ).
-Гомеодомены
Zn-finger (Цинковый
палец).”Классический” C2H2
 Cys-X2-4-Cys-X3-Phe-X5-Leu-X2-His-X3-His
 His и Cys остатки связываются с Zn благодаря
чему весь мотив сворачивается
в компактный домен
 В одном белке может
Содержаться от 2 до 30
Цинковых пальцев
Zn-finger C2H2
 С- концевая часть
каждого пальца
формирует
альфа-спираль.
 N-концевая часть
Каждого пальца
формирует бета-лист.
 Каждая альфаспираль формирует 2
специфичных
контакта с ДНК
Взаимодействие с ДНК
Ядерные рецепторы гормонов как
активаторы
 Лиганд-зависимые
активаторы.
 Имеют отдельные
ДНК - и лиганд
– связывающие
домены.
Способы активации ТФ
Стероидные рецепторы имеют
Zn-finger типа C4
 ДНК –связывающие домены
стероидных рецепторов –
разновидность Zn-finger,
имеющих Cys ,но не His остатки.
 Cys-X2-Cys-X13-Cys-X2-Cys
 Стероидные рецепторы связываются с
ДНК как димеры (палиндромный сайт
посадки на ДНК)
Глюкокортикоидные и
эстрагеновые рецепторы
 2 цинковых пальца
 1ый участвует
ДНК-связывании.
 2ой отвечает
за димеризацию.

Образуют гомодимеры
Тиреоидные и ретиноидные
рецепторы.
 Образуют гетеродимеры.
 Сайт посадки – прямые ДНК повторы.
 Разным гетеродимерам
соответствуют
последовательности
на ДНК с разной
длиной между
прямыми повторами.
Zn-finger(Zn2C6) в структуре фактора
GAL4
К вопросу о димерах и мономерах..
Белки с гомеодоменами
 Гомеодомен – ДНК-связывающий
домен ок. 60 а.о.,образующих 3 альфаспирали.
 17 а.о третьей альфа-спирали на Сконце взаимодействуют с большой
бороздкой ДНК
 Белки с гомеодоменами могут быть как
активаторами,так и репрессорами
транскрипции
Белки с гомеодоменами
НТН-мотив встречающийся в
гомеодоменах также встречается у
прокариот.
HTH
мотив
Спецефические
Взаимодействия
Не специфические
Взаимодействия 
Нelix-loop-heliх
 helix-loop-helix (HLH) =спираль-петля-спираль –
мотив,ответственный за димеризацию класса
транскрипционных факторов (HLH белков)
 bHLH белки имеют ДНК-связывающий
участок,прилегающий к HLH мотиву.
 HLH белки длиной 40-50 а.о.,содержат 2 амфипатический
альфа-спирали,разделенные 15-16 а.о
 HLH белки связываясь с bHLH белками образуют
гетеродимер не способный связываться с ДНК.
Нelix-loop-heliх
Пример регуляции при помощи HLH
белков
Leucine zippers – Лейциновая
молния
 Лейциновая молния – тип димеризующего мотива.
 Димеризация происходит
за счет амфипатической
cпирали, в которой каждым
седьмым аминокислотным
остатком является Leu
 Все боковые остатки Leu
выступают с одной стороны
альфа-спирали и при
воздействии двух
полипептидных цепей
переплетаются друг с другом,
как в застежке-молнии
Signaling