Document 4664317

Доклиническая диагностика онкозаболеваний.
Биомаркеры рака
Шаповал Андрей Иванович, к.б.н.
Директор РАПРЦ, профессор кафедры физико-химической
биологии и биотехнологии АлтГУ, научный сотрудник
университета штата Аризона
Размер опухоли
Биомаркеры онкологических
заболеваний
Терапия
Прогрессия
Порог первичной диагностики
Стабилизация
Рецидив
Ответ
Будет ли у меня рак?
Есть ли у меня рак?
Порог диагностики рецидива
Вернется ли рак?
Насколько агрессивен рак?
Какой это рак?
Биомаркеры
риска Биомаркеры
скрининга Биомаркеры
Работает ли лечение?
Какое лечение выбрать?
Биомаркеры
Биомаркеры рецидива
Биомаркеры ответа
диагностики
терапии
Биомаркеры
прогноза HER2, EGFR, KСемейная
история,
BRCA1, BRCA2
HPV 16/18, AFP
PSA, CA 125
PML-RARA, BCRABL1, CBFBMHLY11, RUNX1
WNT, MYC, p53
RAS, c-Met,
PIR3CA, CDK4,
FGFR
Универсальный тест
Определение иммуносигнатур
S100
СА 15.3, СА2729, САЕ,
тиреоглобулин
Идеология универсального теста для
биомаркеров - оценка репертуара антител
Репертуар циркулирующих антител в сыворотке,
ИММУНОСИГНАТУРА, это запись наших
взаимодействий с чужеродными антигенами и
отражение реакции иммунной системы на эти
взаимодействия.
Аллергия
Опухоль
Инфекция
Биомаркеры и антитела
Онкомаркер
ОЗ
Антитела
Простата специфический
антиген
Простата
+
Раково-эмбриональный
антиген
ЖКТ
+
CA 125
Гинекологические
+
СА 15-3
МЖ
СА 19-9
ПЖ
Альфа-фетопротеин
Печень
Бета-2-микроглобулин
Почки
CА 72-4
ЖКТ
Cyfra-21-1
Легкого
+
+
Нейро-специфическая энолаза Нейроэндокринны
е
Белок S100
Меланома
HER2
МЖ
+
p53
Различные
+
Иммуносигнатура - immunosignature
В отличие от анализа взаимодействий циркулирующих антител с ограниченным
числом известных антигенов, иммуносигнатура опирается на мультиплексную
систему, в которой тестируются все антитела, находящиеся в крови на данный
момент времени.
Единичные маркеры
(ИФА, ПЦР)
Мультиплексные системы
(микрочипы)
Принципы определения иммуносигнатур
Антитела против
иммуноглобулинов
Сыворотка
330 000 точек
Каждая точка уникальный пептид
Микроэррей (х24)
Микрочип
Универсальный тест (иммуносигнатура)
Диагностика по капле крови
Образцы крови
Сканирование
Сыворотка
Разведение (1:500)
Обработка
микрочипов
Биоинформатика
анализ иммуносигнатур
Визуализация результатов
иммуносигнатуры
Анализ имиджей
Оцифрованние результатов
Иммуносигнатура
Выбор пептидов
Нормализация и
контроль качества
Replicate 2
Сканирование
Replicate 1
Первый тест РАПРЦ
Здоровый донор
Рак молочной железы
140 пептидов способны показать
различая между сыворотками
полеченными от разных доноров.
Рак молочной железы
Здоровый донор
Рак МЖ
Здоровый
донор
Иммуносигнатуры различных заболеваний
Саркома (20)
Рак МЖ IV (42)
Астроцитома (166)
Глиобластома (27)
Олиго/Астро (97)
Олигодендроглиома (48)
Рак МЖ II, III (141)
Доноры без
признаков ОЗ (249)
Панкреатит (82)
Миелома (112)
Рак матки (86)
Рак легкого (107)
Рак поджелудочной
железы (136)
Рак МЖ
Вторичный (61)
Долинная лихорадка (142)
Stafford P. Immunosignature system for diagnosis of cancer. PNAS
2014;111(30):E3072-80
Инфраструктура РАПРЦ
Анкета
• Анамнез
• Генотип
• Фенотип
• Биохимия
База Данных
Профилактика
Геномика
Мол.
диагностика
Алтайский филиал
РОНЦ
Другие
вкладчики
Биобанк
Архивирование
образцов
Другие
проекты
Протеомик
а
Immunosignature
Лаб-намикрочипе
Lab-On-a-Chip
Проекты АКОД и РАПРЦ
Биоинформатика
Спасибо за внимание!
Acknowledgment
АлтГУ
Землюков СВ
Тишкин АА
Требухов АВ
Подлесных СВ
Щербаков ДН
Курчанова ЕА
«Вектор»
Ильичев АА
АКОД
Лазарев АФ
Петрова ВД
Лазарев СА
Пупкова ЕЭ
Беленинова ИА
Синькина ТВ
ИХБФМ СО РАН
Власов ВВ
Филипенко МЛ
Синяков АН
АГМУ
Шойхет ЯН
ИКИ СО РАН
Козлов ВА
ASU
Johnston SA
Stafford P
Legutki JB