Анализ протеома бактерии M

Анализ протеома бактерии M. synoviae, штамм 53.
А.А.Твардовский, студент 1 курса
Введение.
Русское название бактерии Mycoplasma synoviae – микоплазма синовиае.
Вид synoviae относят к роду Mycoplasma, семейству Mycoplasmataceae, порядку Mollicutes,
классу Firmicutes, царству Bacteria
Рис.№1Вид бактерии под микроскопом
Схема бактерии Тода Гросбека(Todd roesbeck),CBI
Вид бактерии под микроскопом см. в файле S_simplicita.jpg
(фото №1 взято с сайта google.ru при помощи поиска по картинкам Mycoplasma synoviae, фото
№2 взято с: http://www.ncbi.nlm.nih.gov)
Mycoplasma synoviae является паразитом кур и некоторых других птиц.
Вне хозяина бактерии довольно быстро гибнут.
Являются грамм отрицательными, оптимальная температура – 37 градусов по Цельсию.
Mycoplasma synoviae вызывает у кур и некоторых других птиц ряд заболеваний(чаще всего
респираторные). Без развития осложнений инфекции проявляется в поражении воздухоносных
мешков. Иногда можно наблюдать также осложнения – трахеиты, синуситы, конъюнктивиты и
т.д. Заражение птиц родительского стада в период кладки зачастую вызывает ухудшение
показателей по производству яиц, поражение воздухоносных мешков у эмбрионов и увеличение
случаев их гибели.
Геном бактерии M. synoviae секвенирован для того, чтобы способствовать разработке новых
более эффективных методов борьбы с ней.
Для отбора статей, посвященных среде обитания S.simplicita, написанных в 2006 году не на
японском языке, был составлен запрос (S.simplicita[title] AND Sancta[title]) OR (habitat OR
2006[edat]) NOT jpn[la]). В БД PubMed по запросу найдено 50555 статей. В статье [3]
анализируются особенности обитания бактерии в океане.
Интересной особенностью бактерии Mycoplasma synoviae (как и всех микоплазм) является
1)отсутствие клеточных стенок, что обуславливает их довольно быструю гибель вне птицносителей. Антибиотики, воздействующие на жесткие клеточные стенки, как,
например,пеницилинили цефалоспорин, не отличаются в данномслучае эффективностью.
Микоплазмы чувствительны к тетрациклину, тилозину итиамулину, кинолону (энрофлоксацин)
и тилмикозину.
2)Маленький размер бактерии
Геном и протеом M. synoviae
Статистические данные о геноме приведены в табл.1 Они взяты с сайта
http://www.ebi.ac.uk/genomes/bacteria.html
Табл.1 Статистические данные о геноме M. synoviae
Хромосома
Число пар
Число генов
Суммарная
или плазмида
нуклеотидов
длина генов
(% от длины
хромосомы
или плазмиды)
хр.1 кольцевая 799476
672
89%
Литература
1)http://www.ebi.ac.uk/integr8/OrganismStatsAction
2)http://www.ncbi.nlm.nih.gov
3) http://www.aviagen.com
Суммарная
длина
межгенных
промежутков
(%)
11%
GC
состав
(%)
28.5%