methodrec - Российский онкологический научный центр им. Н

РОССИЙСКАЯ АКАДЕМИЯ МЕДИЦИНСКИХ НАУК
ФГБУ
«РОССИЙСКИЙ ОНКОЛОГИЧЕСКИЙ НАУЧНЫЙ
ЦЕНТР ИМЕНИ Н.Н. БЛОХИНА»
НИИ ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНОЙ ДИАГНОСТИКИ И ТЕРАПИИ ОПУХОЛЕЙ
ЛАБОРАТОРИЯ ХИМИЧЕСКОГО СИНТЕЗА
Апрышко Г.Н.
кандидат биологических наук, ведущий научный сотрудник
МЕТОДИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ
ПО ПОДГОТОВКЕ И ВВОДУ ИНФОРМАЦИИ
В КОМПЬЮТЕРНУЮ БАЗУ ДАННЫХ ПО
ПРОТИВООПУХОЛЕВЫМ ВЕЩЕСТВАМ
МОСКВА
2014
Компьютерная База данных по противоопухолевым веществам
разработана в отделе экспериментальной химиотерапии НИИ ЭДиТО РОНЦ
им. Н.Н. Блохина РАМН для накопления и обобщения результатов
исследований
по
синтезу
и
изучению
биологической
активности
противоопухолевых веществ. База данных создана с помощью программного
комплекса ISISBase и имеет формат .db. В настоящее время База данных
поддерживается в лаборатории химического синтеза, постоянно пополняется
и
совершенствуется
в
соответствии
с
тенденциями
развития
как
экспериментальной химиотерапии рака, так и информационных технологий.
База
данных
электронном
по
виде
противоопухолевым
формализованные
веществам
данные
по
содержит
в
номенклатурным
характеристикам, химическому составу и строению, физико-химическим
свойствам и результатам биологического изучения синтетических и
природных веществ.
Используется
информационного
База данных
обеспечения
«Экспериментальная
подразделениях
аналитических
в качестве одного из источников
исследований
химиотерапия
НИИ
ЭДиТО,
исследованиях
опухолей»,
и
связи
как
в
предметной
проводимых
информационный
структура-активность.
области
во
всех
ресурс
в
Ключевым
моментом использования Базы данных по всем направлениям является
информационный поиск по структурным формулам, текстовым и числовым
полям.
Основой
полноценного
информационного
поиска
является
правильное представление стандартизованных данных.
Заполняется База данных поэтапно по мере создания информации и
поступления ее к сотрудникам, обеспечивающим ввод данных.
1. Первичная регистрация вещества в Базе данных.
Все вещества, передаваемые на изучение биологической активности в
подразделения НИИ ЭДиТО РОНЦ им. Н.Н. Блохина, регистрируются в Базе
данных по противоопухолевым веществам. Первичная регистрация нового
вещества заключается в присвоении ему уникального идентификационного
2
номера (IDcomp), который в дальнейшем используется при занесении в
компьютерную Базу данных паспортных сведений, позволяющих однозначно
идентифицировать вещество и необходимых для проведения корректных
биологических экспериментов, и при составлении всех видов документов по
веществу. При первичной регистрации в Базу данных вводятся следующие
паспортные данные:
 названия и шифры, позволяющие однозначно идентифицировать
вещество
 сведения по химическому составу и строению вещества, в том числе
структурные формулы
 физико-химические свойства, которые необходимы биологам для
планирования экспериментов по изучению биологической активности
вещества.
Паспортные данные извлекаются из паспорта, представляемого
авторами синтеза вещества или его получения из природного источника.
Химики, передающие вещества на изучение, в зависимости от
возможностей
использования
информационных
технологий,
могут
подготовить паспорт несколькими способами.
Наиболее продвинутый способ – заполнение «Электронного
паспорта». «Электронный паспорт» представляет собой Базу данных формата
.db, заполняется с помощью программного комплекса ISISBase и ISISDraw,
описанного на сайте http://www.symyx.com/products-/software/decisionsupport/isisbase/in-dex.jsp. «Электронный паспорт» доступен для импорта в виде
файла Pasport.db со страницы http://www.ronc.ru/main/struktura/niiedito/07-0700-00-laboratoriya-khimiches-kogo-sinteza.
Этот
вариант
позволяет
импортировать данные из «Электронного паспорта» в Базу данных по
противоопухолевым веществам, что облегчает ввод данных по сравнению с
ручным способом и снижает количество ошибок при вводе, а также
позволяет химику формировать собственную Базу данных по веществам,
переданным на биологические испытания.
3
Поля
«Электронного
паспорта»
являются
подмножеством
регистрационного (номенклатурно-химического) модуля Базы данных по
противоопухолевым веществам.
Структура Электронного паспорта
№№
п\п
1
Имя поля
2
Содержание поля
3
Порядковый номер записи – автоматически создается
СУБД ISISBase
Идентификационный номер – формируется при
регистрации по правилу ХХХХУУУ – ХХХХ – год
регистрации, УУУ – порядковый номер вещества при
регистрации в текущем году
конфиденциальность
Организация, в которой вещество синтезировано или
выделено из природного сырья
Ф.И.О. химиков, синтезировавших или выделивших
вещество из природного сырья
1
ID
2
IDcomp
3
confidential
4
organization
5
authors
6
obtaining_technique
Способ получения
7
shifr_chem
8
names_chem_rus
9
names_chem_engl
10
other_names_rus
11
other_names_engl
12
biotype
13
family_rus
14
family_lat
15
kind_rus
16
kind_lat
17
kind_engl
18
19
20
harvesting_place
harvesting_time
raw_materials_supplier
21
raw_materials_description
22
23
24
preparation_description
structure
*fmla_structure
Шифр, присвоенный веществу авторами
Химические названия вещества по различным
химическим номенклатурам на русском языке
Химические названия вещества по различным
химическим номенклатурам на английском языке
Тривиальное название и синонимы на русском языке
Тривиальное название и синонимы на английском
языке
Тип организма, из которого выделено природное
вещество (экстракт)
Семейство организма, из которого выделено природное
вещество (экстракт), на русском языке
Семейство организма, из которого выделено природное
вещество (экстракт), на латинском языке
Вид организма, из которого выделено природное
вещество (экстракт), на русском языке
Вид организма, из которого выделено природное
вещество (экстракт), на латинском языке
Вид организма, из которого выделено природное
вещество (экстракт), на английском языке
Место сбора природного сырья
Время сбора природного сырья
Поставщик природного сырья
Описание частей организма, послуживших сырьем для
выделения природное вещества (экстракта)
Описание природного экстракта
Структурная химическая формула
Брутто-формула
4
1
25
26
2
*mol.weight_structure
saltdata
27
composition_empiric
28
29
CHEM_CLASSES
chem_class_name
30
stereo_isomer
31
optic_isomer
32
phys_chem_data
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
state_of_aggregation
outward_appearance
density
melting_point
boiling_point
hygroscopicity
stability
keeping_conditions
SOLUBILITY:
solvent
level_of_solubility
44
logP
45
46
47
48
49
51
52
N_O
H_Donors
H_Accept
Rot_Bond
PSA
additional_comments_che
m
references_chem
certificate_is_formulated
53
handed_to_biologists
50
3
Молекулярная масса
Сольватная часть молекулы
Элементный состав, определенный эмпирическим
путем
ХИМИЧЕСКИЕ КЛАССЫ
Название химического класса
Стерео изомер (если вещество обладает
пространственной изомерией)
Оптический изомер (если вещество обладает
оптической изомерией)
Перечень имеющихся для вещества результатов
физико-химического анализа
Агрегатное состояние
Описание внешнего вида
Плотность
Температура плавления
Температура кипения
гигроскопичность
Устойчивость во внешней среде
Условия хранения
РАСТВОРИМОСТЬ
Растворитель
Степень растворимости
Логарифм коэффициента распределения в системе
октанол/вода
Суммарное число атомов N и O в молекуле
Число доноров водородных связей в молекуле
Число акцепторов водородных связей в молекуле
Число вращаемых связей в молекуле
Площадь полярной поверхности молекулы
Дополнительные сведения
Ссылки на публикации (если они есть)
ФИО лица, составившего паспорт
ФИО биологов, которым вещество передавалось для
изучения
База данных pasport.db имеет 3 интерфейса (экранные формы для ввода
данных), которые можно загружать в зависимости от особенностей вводимых
конкретных данных. При составлении паспорта на синтетическое вещество
рекомендуется использовать экранную форму «pasport_synt.frm”, паспорта
на вещество (экстракт) природного происхождения - экранную форму
«pasport_nature.frm)”. Эти формы содержат ячейки для заполнения полей с
данными для веществ только синтетического или только природного
происхождения. Экранная форма «passport_tot.frm” содержит ячейки,
5
соответствующие всем полям БД pasport.db, и может использоваться при
заполнении паспортов на вещества обоих типов. Ее недостатком по
сравнению с двумя первыми является меньший размер ячеек (из-за
одновременного размещения на экране большего количества полей), что
несколько затрудняет работу.
Исследователи, не имеющие возможности работать с системой
ISISBase, могут подготовить паспорт в виде таблицы формата Word, строки
которой соответствуют полям «Электронного паспорта».
Текстовая таблица «Паспорт вещества (природного экстракта),
передаваемого на биологическое изучение»
№№
п\п
1
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
Содержание поля
2
Идентификационный номер –
присваивается при регистрации
конфиденциальность
Организация, в которой вещество
синтезировано или выделено из
природного сырья
Ф.И.О. химиков, синтезировавших
или выделивших вещество из
природного сырья
Ячейки для ввода текстовых данных
3
Способ получения
Шифр, присвоенный веществу
авторами
Химические названия вещества по
различным химическим
номенклатурам на русском языке
Химические названия вещества по
различным химическим
номенклатурам на английском языке
Тривиальное название и синонимы
на русском языке
Тривиальное название и синонимы
на английском языке
Тип организма, из которого выделено
природное вещество (экстракт)
Семейство организма, из которого
выделено природное вещество
(экстракт), на русском языке
6
1
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
27.1
27.2
27.N
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
2
Семейство организма, из которого
выделено природное вещество
(экстракт), на латинском языке
Вид организма, из которого
выделено природное вещество
(экстракт), на русском языке
Вид организма, из которого
выделено природное вещество
(экстракт), на латинском языке
Вид организма, из которого
выделено природное вещество
(экстракт), на английском языке
Место сбора природного сырья
Время сбора природного сырья
Поставщик природного сырья
Описание частей организма,
послуживших сырьем для выделения
природное вещества (экстракта)
Описание природного экстракта
Структурная химическая формула
Брутто-формула
Молекулярная масса
Сольватная часть молекулы
Элементный состав, определенный
эмпирическим путем
ХИМИЧЕСКИЕ КЛАССЫ
Название химического класса 1
Название химического класса 2
--------------------------------------Название химического класса N
Стерео изомер (если вещество
обладает пространственной
изомерией)
Оптический изомер (если вещество
обладает оптической изомерией)
Перечень имеющихся для вещества
результатов физико-химического
анализа
Агрегатное состояние
Описание внешнего вида
Плотность
Температура плавления
Температура кипения
гигроскопичность
Устойчивость во внешней среде
Условия хранения
РАСТВОРИМОСТЬ
Растворитель 1
Степень растворимости 1
Растворитель 2
3
7
1
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
2
Степень растворимости 2
--------------------------------------------------------------------------Растворитель N
Степень растворимости N
Логарифм коэффициента
распределения в системе
октанол/вода
Суммарное число атомов N и O в
молекуле
Число доноров водородных связей в
молекуле
Число акцепторов водородных связей
в молекуле
Число вращаемых связей в молекуле
Площадь полярной поверхности
молекулы
Дополнительные сведениёя
Ссылки на публикации (если они
есть)
ФИО лица, составившего паспорт
ФИО биологов, которым вещество
передавалось для изучения
3
К таблице должна быть приложена структурная формула вещества,
подготовленная в любом варианте, рукописном или с помощью доступных
химику компьютерных средств.
Простейший вариант составления паспорта – заполнение бумажных
бланков паспортов. Имеются 3 формы бланков паспортов, представляющих
собой копии интерфейсов пользователя при заполнении «Электронного
паспорта»:
 Общий паспорт для синтетических веществ и природных экстрактов
(файл паспорт общий.doc)
 Для синтетических веществ
(файл паспорт синтетического
вещества.doc)
 Для природных экстрактов (файл паспорт экстракта.doc)
Далее представлены бланки паспортов, которые соответствуют трем
вариантам
интерфейсов
заполнения
«Электронного
паспорта»
и
рекомендуются для использования при рукописном составлении паспорта на
вещество.
8
РОНЦ им. Н.Н. Блохина РАМН
ПАСПОРТ СИНТЕТИЧЕСКОГО ВЕЩЕСТВА
ID
конфиденциальность
организация
Структурная формула
авторы
способ получения
logP
авторский
шифр
паспорт заполнил
передается
биологам
IDcomp
другие названия
N_O
Химические классы
H_Donors
H_Accept
Rot_Bond
стерео изомер
оптический изомер
имеющиеся данные ФХА
агрегатное состояние
плотность
т-ра плавления
внешний вид
т-ра кипения
гигроскопичность
PSA
стабильность
брутто-формула
мол. масса
условия хранения
сольватная часть
Растворимость
растворитель
уровень растворимости
элементный состав
химические названия по IUPAC и др. номенклатурам
дополнительная информация
лит. ссылки (если есть)
9
РОНЦ им. Н.Н. Блохина РАМН
ПАСПОРТ ПРИРОДНОГО ВЕЩЕСТВА (ЭКСТРАКТА)
ID
конфиденциальность
организация
авторы
способ получения
Таксономия источника выделения вещества (эк страк та)
тип
семейство (русск.)
авторский
шифр
паспорт
заполнил
передается
биологам
IDcomp
названия
семейство (лат.)
Химические к лассы
вид (русск.)
вид (лат.)
вид (англ.)
имеющиеся данные ФХА
плотность
агрегатное состояние
т-ра плавления
т-ра кипения
внешний вид
гигроскопичность
Харак теристики сырья
место сбора
время сбора
стабильность
поставщик
условия хранения
Растворимость
растворитель
уровень растворимости
описание сырья
описание природного вещества (экстракта)
дополнительная информация
лит. ссылки (если есть)
10
РОНЦ им. Н.Н. Блохина
ПАСПОРТ ВЕЩЕСТВА, ПЕРЕДАВАЕМОГО НА БИОЛОГИЧЕСКОЕ ИЗУЧЕНИЕ
ID
конфиденциальность
организация
Структурная формула
авторы
способ получения
авторский шифр
logP
N_O
H_Donors
H_Accept
Rot_Bond
PSA
стерео изомер
плотность
оптич. изомер
данные ФХА
т-ра плавления
т-ра кипения
агрегатное состояние
внешний вид
гигроскопичность
стабильность
паспорт заполнил
мол. масса
тип
семейство (русск.)
семейство (лат.)
вид (лат.)
вид (русск.)
вид (англ.)
сольватная часть
Харак теристик и сырья
Растворимость
растворитель
IDcomp
Таксономия источника выделения природного
вещества
условия хранения
брутто формула
передается
биологам
место сбора
время сбора
поставщик
описание сырья
степень растворимости
элементный состав
химич. названия по IUPAC и др. номенклатурам
описание природного вещества (экстракта)
Химическ ие к лассы
дополнительная информация лит. ссылки (если есть)
другие названия
11
При подготовке паспорта в любом виде (Базы данных «Электронный
паспорт», электронной текстовой таблицы формата Word и бумажных форм)
необходимо использовать Единые правила заполнения паспортов и Словари
унифицированных терминов, позволяющие уменьшить количество
разночтений и ошибок, что имеет существенное значение при последующем
поиске информации в Базе данных.
Паспорта,
подготовленные
авторами-химиками
в
любом
из
3
вышеописанных вариантов подвергаются проверке и вводятся в электронную
Базу данных. При этом программные средства ISISBase по введенной в Базу
данных структурной формуле вещества рассчитывают молекулярную массу и
формируют брутто-формулу и химическое название. Это позволяет провести
дополнительный
контроль
правильности
соответствующих
данных
в
представленном автором паспорте и исправить возможные ошибки.
Далее с помощью программных средств ACDLABS и CHED по
структурной формуле рассчитываются физико-химические показатели,
имеющие значение для биодоступности и “лекарствоподобия“ вещества, а
именно LogP (коэффициент распределения в системе октанол/вода), площадь
полярной поверхности молекулы PSA, число донорных и акцепторных
водородных связей, число вращающихся связей. Полученные данные
вносятся в соответствующие поля Базы данных.
Распечатанный экземпляр паспорта с указанным на нем IDcomp и
образец вещества передаются для проведения биологических испытаний в
соответствующее экспериментальное подразделение.
12
Правила заполнения паспорта на вещество (природный экстракт), передаваемое на биологическое изучение в
НИИ ЭДиТО РОНЦ РАМН
№
№
п\
п
1
Имя поля в БД
pasport.db
Содержание поля
2
3
ID
Порядковый номер записи – автоматически
создается СУБД ISISBase
2
IDcomp
Идентификационный номер – формируется при
регистрации по правилу ХХХХУУУ – ХХХХ – год
регистрации, УУУ – порядковый номер вещества
при регистрации в текущем году
3
confidential
конфиденциальность
4
organization
5
authors
6
obtaining_technique
Способ получения
7
shifr_chem
Шифр, присвоенный веществу авторами
8
names_chem_rus
Химические названия вещества по различным
химическим номенклатурам на русском языке
9
names_chem_engl
10
other_names_rus
1
Организация, в которой вещество синтезировано
или выделено из природного сырья
Ф.И.О. химиков, синтезировавших или
выделивших вещество из природного сырья
Химические названия вещества по различным
химическим номенклатурам на английском языке
Тривиальное название и синонимы на русском
языке
Особенности заполнения поля
4
В «Электронном паспорте» ISISBase создается
автоматически, в текстовом формате и бумажном
варианте не заполняется
Это поле авторы не заполняют, присваивается при
первичной регистрации в БД
Уровень конфиденциальности определяется авторами,
при заполнении используется только один из терминов
словаря «КОНФИДЕНЦИАЛЬНОСТЬ»
Приводится полное название организации с указанием
формы собственности и ведомственной принадлежности
Перечисляются Ф.И.О. всех авторов через запятую
Используется только один из терминов словаря
«СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ»
Для правильного поиска в БД по этому полю важно
соблюдать регистр шрифта (русский или латинский)
Каждое название вводится с новой строки без
разделения знаками препинания (они могут быть внутри
химического названия)
Заполнение этого поля желательно, но необязательно
Каждое название вводится с новой строки без
разделения любыми знаками препинания
13
1
2
11
other_names_engl
12
biotype
13
family_rus
14
family_lat
15
kind_rus
16
kind_lat
17
kind_engl
18
19
harvesting_place
harvesting_time
raw_materials_suppli
er
raw_materials_descri
ption
20
21
3
4
Каждое название вводится с новой строки без
Тривиальное название и синонимы на английском
разделения любыми знаками препинания
языке
Заполнение этого поля желательно, но необязательно
Деление живых организмов, из которых выделено
регистрируемое вещество (экстракт) природного
Тип организма, из которого выделено природное
происхождения, на типы в БД не совпадает с таковым в
вещество (экстракт)
современной биологической систематике. При
заполнении поля необходимо использовать только
термины из словаря «ТИП»
Семейство организма, из которого выделено
Для правильного поиска в БД по этому полю важно
природное вещество (экстракт), на русском языке
соблюдать регистр шрифта (русский или латинский)
Семейство организма, из которого выделено
Для правильного поиска в БД по этому полю важно
природное вещество (экстракт), на латинском языке соблюдать регистр шрифта (русский или латинский)
Если вид точно не определен, в этом поле можно
Вид организма, из которого выделено природное
привести название рода
вещество (экстракт), на русском языке
Для правильного поиска в БД по этому полю важно
соблюдать регистр шрифта (русский или латинский)
Если вид точно не определен, в этом поле можно
Вид организма, из которого выделено природное
привести название рода
вещество (экстракт), на латинском языке
Для правильного поиска в БД по этому полю важно
соблюдать регистр шрифта (русский или латинский)
Если вид точно не определен, в этом поле можно
Вид организма, из которого выделено природное
привести название рода
вещество (экстракт), на английском языке
Для правильного поиска в БД по этому полю важно
соблюдать регистр шрифта (русский или латинский)
Место сбора природного сырья
Заполняется в произвольной форме
Время сбора природного сырья
Заполняется в произвольной форме
Поставщик природного сырья
Может быть указана организация или частное лицо
Описание частей организма, послуживших сырьем
для выделения природное вещества (экстракта)
Заполняется в произвольной форме
(например, высушенная трава, корни)
14
1
2
preparation_descripti
on
Описание природного экстракта
23
structure
Структурная химическая формула
24
*fmla_structure
Брутто-формула
25
*mol.weight_structur
e
Молекулярная масса
26
saltdata
Сольватная часть молекулы
27
composition_empiric
Элементный состав, определенный эмпирическим
путем
28
CHEM_CLASSES
ХИМИЧЕСКИЕ КЛАССЫ
22
29
30
31
chem_class_name
stereo_isomer
optic_isomer
3
Название химического класса
Стерео изомер (если вещество обладает
пространственной изомерией)
Оптический изомер (если вещество обладает
оптической изомерией)
4
В произвольной форме м.б. указаны способ экстракции и
его особенности
Вводится в компьютерную БД «Электронный паспорт» с
помощью структурного редактора ISISDraw, при
заполнении бумажной формы паспорта рисуется от руки
в соответствующей графе бланка, если паспорт
заполняется на компьютере в текстовом формате
структурную формулу необходимо приложить на бумаге
В «Электронном паспорте» генерируется
автоматически, в остальных случаях вводится вручную
В «Электронном паспорте» генерируется
автоматически, в остальных случаях вводится вручную
В виде брутто-формулы с указанием числа молекул
сольватной части (например, J–, 2Н2О), могут
использоваться термины из словаря «СОЛЬВАТНАЯ
ЧАСТЬ»
Перечисляются найденные эмпирическим путем
процентные значения содержания в молекуле всех
атомов
Общий заголовок таблицы списка названий химических
классов, к которым можно отнести вещество
В табличном поле вводятся отдельные записи для
каждого из классов, к которым можно отнести вещество,
классы называются во множественном числе
Используются только термины из словаря «СТЕРЕО
ИЗОМЕР»
Используются только термины из словаря
«ОПТИЧЕСКИЙ ИЗОМЕР»
15
1
2
3
32
phys_chem_data
Перечень имеющихся для вещества результатов
физико-химического анализа
33
state_of_aggregation
Агрегатное состояние
34
outward_appearance
Описание внешнего вида
35
density
Плотность
36
melting_point
Температура плавления
37
boiling_point
Температура кипения
38
hygroscopicity
гигроскопичность
39
stability
Устойчивость во внешней среде
40
keeping_conditions
Условия хранения
41
SOLUBILITY:
РАСТВОРИМОСТЬ
42
43
solvent
level_of_solubility
44
logP
45
N_O
Растворитель
Степень растворимости
Логарифм коэффициента распределения в системе
октанол/вода
Суммарное число атомов N и O в молекуле
4
Перечисляются через запятую сокращения методов
физико-химического анализа, результаты изучения
вещества которыми есть у авторов (например, ИК
спектры, РСА)
Используются только термины из словаря
«АГРЕГАТНОЕ СОСТОЯНИЕ»
Заполняется в произвольной форме
В виде десятичной дроби, м.б. указаны условия
определения
М.б. введены как точные, так и интервальные значения,
а также условия определения
М.б. введены как точные, так и интервальные значения,
а также условия определения
Рекомендуется использовать термины из словаря
«ГИГРОСКОПИЧНОСТЬ», допускается использование
иных терминов
Рекомендуется использовать термины из словаря
«СТАБИЛЬНОСТЬ», допускается использование иных
терминов
Заполняется в произвольной форме
общее название таблицы из 2 столбцов, содержащей
данные по растворимости вещества в различных
растворителях
Рекомендуется использовать термины из словаря
«РАСТВОРИТЕЛЬ», допускается использование иных
терминов
Используются только термины из словаря «СТЕПЕНЬ
РАСТВОРИМОСТИ»
М.б. рассчитан с помощью компьютерных программ, не
обязательно для заполнения
В виде целого числа
16
1
2
3
46
H_Donors
Число доноров водородных связей в молекуле
47
H_Accept
Число акцепторов водородных связей в молекуле
48
Rot_Bond
Число вращаемых связей в молекуле
49
PSA
Площадь полярной поверхности молекулы
50
51
52
53
additional_comments
Дополнительные сведения
_chem
references_chem
Ссылки на публикации (если они есть)
certificate_is_formula
ФИО лица, составившего паспорт
ted
ФИО биологов, которым вещество передавалось
handed_to_biologists
для изучения
4
М.б. рассчитано с помощью компьютерных программ, не
обязательно для заполнения
М.б. рассчитано с помощью компьютерных программ, не
обязательно для заполнения
М.б. рассчитано с помощью компьютерных программ, не
обязательно для заполнения
М.б. рассчитано с помощью компьютерных программ, не
обязательно для заполнения
Существенная для характеристики вещества
информация, не учтенная в других полях
Представляются в произвольной форме
В бумажном варианте ставится также подпись лица,
составившего паспорт
Заполняется при регистрации в БД
Поля, для заполнения которых авторы не имеют данных, оставляются пустыми.
17
СЛОВАРИ (СПИСКИ ТЕРМИНОВ)
для использования при составлении паспортов на вещества, передаваемые на
изучение биологической активности в НИИ ЭДиТО РОНЦ
КОНФИДЕНЦИАЛЬНОСТЬ*
открыто
конфиденциально
СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ*
синтетический
природный
полусинтетический
ТИП*
растение
водоросль морская
водоросль пресноводная
гриб
животное
животное морское
лишайник
микроорганизм
растение морское
СОЛЬВАТНАЯ ЧАСТЬ**
Br2 BrC2H5OH
CH3COOH
CH3I
CH3OH
Cl2 ClH2O
H2SO4
HBr
HCl
INO3SO4 2Адипинат
Бензоат
Метилат
Оксалат
Салицилат
Тартрат
Цитрат
18
СТЕРЕО ИЗОМЕР*
цис
транс
ОПТИЧЕСКИЙ ИЗОМЕР*
L
D
рацемат
АГРЕГАТНОЕ СОСТОЯНИЕ*
твердое
жидкое
газообразное
ГИГРОСКОПИЧНОСТЬ**
негигроскопично
гигроскопично
мало гигроскопично
умеренно гигроскопично
очень гигроскопично
чрезвычайно гигроскопично
СТАБИЛЬНОСТЬ**
устойчиво
неустойчиво
РАСТВОРИТЕЛЬ**
вода
этанол
ацетон
бензол
буферный раствор
гексан
диоксан
дихлорэтан
ДМСО
ДМФА
масло
масло камфорное
масло косточковое
масло минеральное
масло оливковое
масло персиковое
масло растительное
масло сезамовое
метанол
органические растворители
пиридин
19
раствор бикарбоната натрия
раствор глюкозы
соляная кислота
спирты
тетрагидрофуран
толуол
уксусная кислота
физиологический раствор
фосфатный буфер
хлороформ
четыреххлористый углерод
щелочной раствор
этанол водный
этанол водный 10%
этилацетат
эфир
эфир петролейный
СТЕПЕНЬ РАСТВОРИМОСТИ*
растворим
практически нерастворим
легко растворим
мало растворим
очень легко растворим
очень мало растворим
растворим при нагревании
умеренно растворим
(При составлении этого словаря использованы термины,
рекомендованные в Государственной Фармакопее СССР, XI издание)
ХИМИЧЕСКИЙ КЛАСС**
адамантаны
азаиндолы
азаурацилы
азепаны
азепины
азетидины
азиды
азиридины
азосоединения
азулены
акридины
акриловые кислоты
алкалоиды
алкалоиды гелиотриданового ряда
алкалоиды индолового ряда
20
алкалоиды трополонового ряда
алканы
алкены
алкиламины
алкины
альдегиды
алюминия органические соединения
амидоимиды
аминокислот амиды
аминокислот эфиры
аминокислоты
аминополисахариды
аммониевые соединения
андростаны
анилины
антраизоксазолы
антрахиноны
антрацены
аскорбиновой кислоты производные
аценафтены
ацетаты
барбитуровой кислоты производные
бензальдегиды
бензамиды
бензимидазолы
бензоаты
бензойные кислоты
бензотиазолы
бензотриазолы
бензофеноны
бензохинолины
бензохиноны
бипиридины
борадамантаны
борорганические соединения
броморганические соединения
бромэтиламины
ванадия органические соединения
винные кислоты
витанолиды
вольфрама органические соединения
галлия органические соединения
галогенорганические соединения
гексозы
германия органические соединения
21
герматраны
гетероциклические соединения
гидразиды
гидразиды карбоновых кислот
гидразины
гидразоны
гидроксамовые кислоты
гликозиды
гликозиды ротеноидного ряда
гликозиды спиростанолового ряда
гликозиды стероидного ряда
гликозиды тритерпенового ряда
гликозиды фуростанолового ряда
гликоли
гликопротеиды
глутаминовые кислоты
глюканы
глюкоманнаны
диазосоединения
диазофосфинины
дикарбоновые кислоты
диоксаны
дипептиды
дисахариды
дисульфиды
дитерпеноиды ряда абиетана
дитерпены
дифениловые эфиры
железа органические соединения
золота органические соединения
изатины
изобензофураны
изоксазолы
изотиомочевины
имидазолидины
имидазолы
имины
индазолы
индолины
индолокарбазолы
индолхиноксалины
индолы
иодорганические соединения
иразолины
иридия органические соединения
22
калия органические соединения
карбазолы
карбаминовые кислоты
карболины
карбоновые кислоты
карбоновых кислот амиды
карбоновых кислот эфиры
кобальта органические соединения
коричной кислоты производные
краунэфиры
кремния органические соединения
кумарины
лактоны
лактоны сесквитерпеновые
лантаноидов соединения
липиды
липополисахариды
малеиновые кислоты
малоновые кислоты
маннаны
марганца органические соединения
меди комплексные соединения
меди соединения
меланоидины
металлов комплексные соединения
металлов органические соединения
металлов соединения
молибдена органические соединения
морфолины
мочевины
мышьяка органические соединения
натрия органические соединения
нафталины
нафтиридины
нафтохиноны
никотиновые кислоты
нитрилы
нитробензойной кислоты производные
нитробензола производные
нитрозомочевины производные
нитрозосоединения
нитросоединения
нуклеозиды
нуклеозиды пиримидинового ряда
нуклеозиды пуринового ряда
23
нуклеотиды
оксазины
оксазолы
оксалаты
оксимы
оксираны
палладия органические соединения
пенициллановые кислоты
пентозы
пептиды
пептиды циклические
пиколины
пипеколины
пиперазины
пиперидинопиримидины
пиперидины
пиразины
пиразолины
пиразолопиразины
пиразолопиридины
пиразолопиримидины
пиразолотриазины
пиразолы
пиранозы
пираны
пиридины
пиримидиновых нуклеозидов аналоги
пиримидины
пирролидины
пирролобензодиазепины
пирролоиндолизины
пирролопиридины
пирролопиримидины
пирролы
пицены
платины комплексные соединения
полимеры
полипептиды
полисахариды
полифенолы
полициклические ароматические соединения
проантоцианидины
протеины
птеридины
пурины
24
редкоземельных элементов соединения
родия органические соединения
ротеноиды
ртути органические соединения
рутения органические соединения
сапонины
сапонины стероидные
сарколизина производные
селена соединения
семикарбазиды
семикарбазоны
серебра соединения
соли
спиросоединения
спирты
спирты ароматические
спирты гетероциклические
спирты сесквитерпеновые
стероиды
стильбены
сульфиды
сульфокислоты
сульфолены
сульфонилфториды
таннины
терпеноиды
тетразолы
тетрацены
тиадиазолы
тиазины
тиазолидины
тиазолины
тиазолы
тиолактоны
тиолы
тиоморфолины
тиомочевины
тиосемикарбазиды
тиосемикарбазоны
тиоурацилы
тиофены
тиофосфаты
тиоцианаты
титана органические соединения
тозилаты
25
толуолы
триазены
триазепины
триазины
триазолы
триптамины
тритерпеноиды лупанового ряда
тритерпеноиды олеонанового ряда
тропилиевые соединения
урацилы
феназины
феналены
фенантролины
феноксазины
фенотиазины
фенотиазоны
флавоноиды
флавоны
флуореноны
формилы
фосфаты
фосфиновые кислоты
фосфиты
фосфорорганические соединения
фталимиды
фталоцианины
фталоцианины безметальные
фторорганические соединения
фторэтиламины
фумаровой кислоты производные
фуранозы
фураны
хиназолины
хиноксалины
хинолизидины
хинолины
хинуклидины
хлоралкиламины
хлорорганические соединения
хлорэтиламинофенилы
хлорэтиламины
хроманы
хромоны
цезия органические соединения
циклоалканы
26
циклоалкены
циклобутаны
циклогексаны
циклогексены
циклооктаны
циклопентадиены
циклопентаны
цинка комплексные соединения
цинка органические соединения
циркония органические соединения
этиленгликоли
* - словари фиксированного типа, изменения терминов не допускаются
** - словари свободного типа, допускается использование других терминов
При заполнении полей, имеющих словари фиксированного типа, нельзя
использовать термины, отличные от терминов, содержащихся в словаре. При
заполнении
полей,
имеющих
словари
открытого
типа,
разрешается
использование терминов, отличные от терминов, содержащихся в словаре.
При заполнении паспорта в текстовом формате рекомендуется пользоваться
файлом со словарями, забирая нужный термин в «карман» и помещая его в
соответствующее поле. Это позволит ускорить заполнение паспорта и
снизить количество ошибок.
27
1. Подготовка и ввод данных по результатам изучения
биологической активности
1.1.
Для
Подготовка данных по результатам изучения цитотоксической
активности in vitro
формализованного
представления
результатов
изучения
цитотоксической активности разработана специальная таблица, которая
отражает структуру соответствующего модуля компьютерной Базы данных.
Строки таблицы соответствуют полям базы данных (стр. 30).
Таблица может быть заполнена в электронном или рукописном
варианте.
При этом рекомендуется придерживаться следующих правил.
1. Идентификационный номер БД – приводится 7-значный единый
идентификационный номер вещества, присвоенный ему при
регистрации в Банке данных
2. названия – желательно ввести все известные исследователю названия
вещества
3. шифр – приводится шифр, присвоенный веществу авторами синтеза
или выделения из природного сырья
4. организация – приводится название организации, из которой вещества
поступило на изучение в НИИ ЭДиТО РОНЦ
5. авторы – приводится фамилия и инициалы химиков, получивших
вещество путем синтеза или выделения из природного сырья
6. Линия клеток - приводится название линии клеток, на которых
получены
представленные
в
конкретной
записи
данные
по
цитотоксичности.
7. Концентрация вещества - приводится значение концентрации вещества в
среде
культивирования
клеток,
при
которой
зарегистрирован
приводимый в записи цитотоксический эффект по использованному в
данном случае параметру его оценки.
28
8. Размерность концентрации - приводится сокращенное название единицы
измерения концентрации вещества в среде культивирования.
9. Время экспозиции - приводится значение времени обработки клеток
испытуемым веществом.
10. Параметр оценки цитотоксической активности = приводится в
сокращенном виде обозначение параметра оценки цитотоксической
активности (ДНК/Т, МТТ или др.)
11. Торможение
параметра
–
приводится
количественное
значение
относительного торможения (в процентах) биологического процесса,
использованного в качестве параметра оценки цитотоксичности,
соответствующее указанным в данной записи концентрации вещества в
культуральной среде и времени инкубации клеток в его присутствии.
12. ЭК50 – приводится значение и размерность концентрации испытуемого
вещества, вызывающей 50% торможения биологического процесса,
использованного в качестве параметра оценки цитотоксичности.
13. дополнительные сведения - приводится не учтенная в вышеуказанных
полях, но имеющая с точки зрения исследователя существенное
значение информация о цитотоксической активности
14. исполнитель - приводится фамилия и инициалы исследователя,
получившего
представленные
в
данной
записи
показатели
цитотоксичности и несущего ответственность за их достоверность.
15. ссылка - приводится ссылка на первичный документ (номер
лабораторного журнала, протокола, публикация или другое), из
которого извлечены данные, помещенные в соответствующую запись
ЭБД.
Данные в полях 1-5 предназначены для однозначной идентификации
вещества и настоятельно рекомендуются к заполнению
29
РЕЗУЛЬТАТЫ ИЗУЧЕНИЯ ЦИТОТОКСИЧЕСКОЙ АКТИВНОСТИ
IN VITRO
Идентификационный
номер БД
названия
шифр
организация
авторы
Линия клеток
Концентрация
вещества
Размерность
концентрации
Время экспозиции
Параметр оценки
цитотоксической
активности
Торможение
параметра
ЭК50
дополнительные
сведения
исполнитель
ссылка
дата заполнения
30
2.2. Подготовка данных по результатам изучения противоопухолевой
активности
Для
формализованного
представления
результатов
изучения
противоопухолевой активности разработаны специальные таблицы, которые
отражают
структуру
компьютерной
базы
данных.
Строки
таблиц
соответствуют полям базы данных (стр. 36, 37).
Таблицы могут быть заполнены в электронном или рукописном
варианте.
При этом рекомендуется придерживаться следующих правил.
Правила заполнения таблицы
«РЕЗУЛЬТАТЫ ИЗУЧЕНИЯ ПРОТИВООПУХОЛЕВОЙ АКТИВНОСТИ
НА ПЕРЕВИВАЕМЫХ ОПУХОЛЯХ»
1.
Идентификационный номер БД – приводится 7-значный единый
идентификационный номер вещества, присвоенный ему при регистрации в
Банке данных
2.
названия – желательно ввести все известные исследователю названия
вещества
3.
шифр – приводится шифр, присвоенный веществу авторами синтеза
или выделения из природного сырья
4.
организация – приводится название организации, из которой вещества
поступило на изучение в НИИ ЭДиТО РОНЦ
5.
авторы – приводится фамилия и инициалы химиков, получивших
вещество путем синтеза или выделения из природного сырья
6.
опухоль - приводится название опухолевой модели, на которой
изучалась противоопухолевая активность in vivo
7.
место прививки, или локализация опухоли - вводятся данные о
локализации экспериментальной опухоли в организме животного
31
8.
животное-хозяин - приводится название вида животного с указанием
линии, на котором изучалась противоопухолевая активность вещества
9.
доза - приводится числовое значение и единица измерения дозы, при
которой получены представляемые значения противоопухолевого эффекта
10.
растворитель - приводится название растворителя, в котором вещество
вводили животному при изучении противоопухолевой активности
11.
режим лечения - приводится описание схемы введения вещества
животному при изучении противоопухолевой активности в формате
____________интервал между введениями Х число введений__________,
например, 24 ч х 5
12.
путь введения - приводится указание на путь введения вещества
животному с опухолью при изучении противоопухолевой активности
13.
УвПЖ - приводится среднее значение увеличения продолжительности
жизни животных с перевиваемой опухолью под действием вещества в
процентах
14.
Уменьшение ПЖ - приводится среднее значение уменьшения
продолжительности жизни животных с перевиваемой опухолью под
действием вещества в процентах.
15.
ТРО - приводится среднее значение торможения роста перевиваемой
опухоли под действием вещества в процентах
16.
Стимуляция Роста Опухоли приводится среднее значение стимуляции
роста перевиваемой опухоли под действием вещества в процентах
17.
излечение - вводятся в виде произвольного текста данные по
количеству излеченных под действием вещества животных с опухолями (в
процентах или абсолютное значение).
18.
дополнительные сведения приводится не учтенная в вышеуказанных
полях, но имеющая с точки зрения исследователя существенное значение
информация о противоопухолевой активности
32
19.
исполнитель - приводится фамилия и инициалы исследователя,
получившего представляемые данные по противоопухолевой активности и
несущего ответственность за их достоверность.
20.
ссылка - приводится ссылка на первичный документ (номер
лабораторного журнала, протокола, публикация или другое), из которого
извлечены приводимые данные по противоопухолевой активности.
Данные в полях 1-5 предназначены для однозначной идентификации
вещества и настоятельно рекомендуются к заполнению
1.
Правила заполнения таблицы
«РЕЗУЛЬТАТЫ ИЗУЧЕНИЯ ПРОТИВООПУХОЛЕВОЙ АКТИВНОСТИ
НА ИНДУЦИРОВАННЫХ ОПУХОЛЯХ».
1. Идентификационный номер БД – приводится 7-значный единый
идентификационный номер вещества, присвоенный ему при
регистрации в Банке данных
2. названия – желательно ввести все известные исследователю названия
вещества
3. шифр – приводится шифр, присвоенный веществу авторами синтеза
или выделения из природного сырья
4. организация – приводится название организации, из которой вещества
поступило на изучение в НИИ ЭДиТО РОНЦ
5. авторы – приводится фамилия и инициалы химиков, получивших
вещество путем синтеза или выделения из природного сырья
6. опухоль - приводится характеристика опухолевой модели, на которой
изучалась противоопухолевая активность
7. канцерогенное воздействие – приводится название химического
канцерогена и режим его введения или характеризуется физический
канцерогенный фактор
33
8. животное-хозяин - приводится название вида животного с указанием
линии, на котором изучалась противоопухолевая активность вещества
9. доза - приводится числовое значение и единица измерения дозы, при
которой получены представляемые значения противоопухолевого
эффекта
10.растворитель - приводится название растворителя, в котором вещество
вводили животному при изучении противоопухолевой активности
11.режим лечения - приводится описание схемы введения вещества
животному при изучении противоопухолевой активности в формате
____________интервал между введениями Х число
введений__________
12.путь введения - приводится указание на путь введения вещества
животному с опухолью при изучении противоопухолевой активности
13.полные ремиссии - приводится относительное (в процентах)
количество животных в опытной группе, у которых после курса
введения вещества наблюдается полная ремиссия (уменьшение
величины опухоли до 0-2 мм2, сохраняющееся на протяжении не менее
двух измерений)
14.частичные ремиссии - приводится относительное (в процентах)
количество животных в опытной группе, у которых после курса
введения агента наблюдается частичная ремиссия (уменьшение объема
опухоли более чем на 25%, сохраняющееся на протяжении не менее
двух измерений)
15.стабилизация – приводится относительное (в процентах) количество
животных в опытной группе, у которых после курса введения вещества
наблюдается стабилизация опухолевого роста (остановка роста
опухоли или уменьшение ее объема не более чем на 25%,
сохраняющееся на протяжении не менее двух измерений)
34
16.рост опухолей – приводится относительное (в процентах) количество
животных в опытной группе, у которых после курса введения агента
наблюдается увеличение объема опухолей
17.излечение - вводятся в виде произвольного текста данные по
количеству излеченных под действием вещества животных с
опухолями (в процентах или абсолютное значение)
18.дополнительные сведения приводится не учтенная в вышеуказанных
полях, но имеющая с точки зрения исследователя существенное
значение информация о противоопухолевой активности
19.исполнитель - приводится фамилия и инициалы исследователя,
получившего представляемые данные по противоопухолевой
активности и несущего ответственность за их достоверность.
20.ссылка - приводится ссылка на первичный документ (номер
лабораторного журнала, протокола, публикация или другое), из
которого извлечены приводимые данные по противоопухолевой
активности.
Данные в полях 1-5 предназначены для однозначной идентификации
вещества и настоятельно рекомендуются к заполнению
35
РЕЗУЛЬТАТЫ ИЗУЧЕНИЯ ПРОТИВООПУХОЛЕВОЙ АКТИВНОСТИ
НА ПЕРЕВИВАЕМЫХ ОПУХОЛЯХ
Идентификационный
номер БД
названия
шифр
организация
авторы
опухоль
место прививки
животное-хозяин
доза
растворитель
режим лечения
путь введения
УвПЖ
Уменьшение ПЖ
ТРО
Стимуляция Роста
Опухоли
излечение
дополнительные
сведения
исполнитель
ссылка
дата заполнения
36
РЕЗУЛЬТАТЫ ИЗУЧЕНИЯ ПРОТИВООПУХОЛЕВОЙ АКТИВНОСТИ
НА ИНДУЦИРОВАННЫХ ОПУХОЛЯХ
Идентификационный
номер БД
названия
шифр
организация
авторы
опухоль
канцерогенное
воздействие
животное-хозяин
доза
растворитель
режим лечения
путь введения
полные ремиссии
частичные ремиссии
стабилизация
рост опухолей
излечение
дополнительные
сведения
исполнитель
ссылка
дата заполнения
37
2.3. Подготовка данных по результатам изучения общей токсичности
Для формализованного представления результатов изучения общей
токсичности разработана следующая специальная таблица, отражающая
структуру соответствующего модуля компьютерной базы данных. Строки
таблицы соответствуют полям базы данных.
РЕЗУЛЬТАТЫ ИЗУЧЕНИЯ ОБЩЕЙ ТОКСИЧНОСТИ
Идентификационный
номер БД
Названия
Шифр
организация
Авторы
Животное
режим введения
вещества
способ введения
вещества
категория
токсической дозы
значение
токсической дозы
дополнительные
сведения
Исполнитель
Ссылка
дата заполнения
Таблица может быть заполнена в электронном или рукописном
варианте.
При этом рекомендуется придерживаться следующих правил.
38
Правила заполнения таблицы
«РЕЗУЛЬТАТЫ ИЗУЧЕНИЯ ОБЩЕЙ ТОКСИЧНОСТИ»
1. Идентификационный номер БД – приводится 7-значный единый
идентификационный номер вещества, присвоенный ему при регистрации
в Банке данных
2. названия – желательно ввести все известные исследователю названия
вещества
3. шифр – приводится шифр, присвоенный веществу авторами синтеза или
выделения из природного сырья
4. организация – приводится название организации, из которой вещества
поступило на изучение в НИИ ЭДиТО РОНЦ
5. авторы – приводится фамилия и инициалы химиков, получивших
вещество путем синтеза или выделения из природного сырья
6. животное - название вида животного с указанием линии, на котором
изучалась токсичность вещества
7. режим введения - приводится описание режима введения вещества
животному при изучении токсичности в формате
____________интервал между введениями Х число введений.
8. способ введения – приводится способ введения вещества, при котором
изучалась токсичность.
9. категория токсической дозы – указывается категория токсической дозы,
значение которой представлено в следующем поле данной записи –
10. значение токсической дозы – приводится значение токсической дозы
вместе с ее размерностью
11. дополнительные сведения - приводится не учтенная в вышеуказанных
полях, но имеющая с точки зрения исследователя существенное значение
информация об общей токсичности
39
12. исполнитель - приводится фамилия и инициалы исследователя,
получившего представляемые данные по токсичности и несущего
ответственность за их достоверность.
13. ссылка - приводится ссылка на первичный документ (номер
лабораторного журнала, протокола, публикация или другое), из которого
извлечены приводимые данные по токсичности
Данные в полях 1-5 предназначены для однозначной идентификации
вещества и настоятельно рекомендуются к заполнению
Возможно также электронное представление формализованных данных
по результатам изучения биологической активности для ввода в Базу данных
формата ISISBase в виде таблицы Excel, в которой заголовки столбцов
соответствуют полям Базы данных и соответствующих таблиц формата
Word.
40
СЛОВАРИ (СПИСКИ ТЕРМИНОВ) ДЛЯ ИСПОЛЬЗОВАНИЯ ПРИ ФОРМАЛИЗАЦИИ
ДАННЫХ ПО РЕЗУЛЬТАТАМ ИЗУЧЕНИЯ БИОЛОГИЧЕСКОЙ АКТИВНОСТИ
ВЕЩЕСТВ
Линии клеток (поле «Линия клеток»)
A549
CaOv
Colo38
EMT-6
Jurkat
L-41
L5178Y
MCF-7
MOLT-4
MS melanoma
P388
P388/Adr
P3HR
T47D
LS174T
HCT-116
MeWo
SKOV3
DU145
Bro
Mel Z
Malme-3m
41
Единица измерения концентрации (поле «Размерность
концентрации»)
Ед/мл
мг/л
мг/мл
мкг/л
мкг/мл
мкМ
моль/л
Опухолевые модели (поле «опухоль»)
АГФ
аденокарцинома молочной железы Ca 755
аденокарцинома молочной железы CD8F1
аденокарцинома толстой кишки 26
АКАТОЛ
АКАТОН
альвеолярный рак печени RS-1
астроцитома анапластическая 10-20-4
астроцитома анапластическая 15-47
гепатома
гепатома 22а
гепатома 22с
гепатома Zajdela
гепатома асцитная крыс
глиобластома 101/8
глиома AC
ДМБА-индуцированная аденокарцинома молочной железы
ДМБА-индуцированная опухоль молочной железы
ДМГ-индуцированная опухоль толстой кишки
42
карцинома HK
карцинома Герена
карциносаркома Walker-256 (W-256)
лейкоз
лейкоз Frend
лейкоз L1210
лейкоз L1210/araC
лейкоз L1210/araU
лейкоз L1210/DDP
лейкоз L1210/сарколизин
лейкоз L299
лейкоз L309
лейкоз L37
лейкоз L5178Y
лейкоз L996
лейкоз La
лейкоз La/araC
лейкоз La/FU
лейкоз LeL
лейкоз LZ
лейкоз P388
лейкоз P388/винкристин
лейкоз Shay
лейкоз Граффи
лейкоз ИЛК
лейкоз Мазуренко
лейкоз мышей AKR спонтанный, 2-я генерация
лимфома
лимфома мышей AKR
лимфосаркома Плисса
43
ЛИО-1
ЛМЭК лимфогенно метастазирующая эмбриокарцинома
МАП
меланома
меланома B16
меланома Harding-Passey
меланома S-91 (Cloudman)
опухоль NK/Ly
опухоль желудка ОЖ-1
опухоль желудка ОЖ-5 - рак преджелудка ОЖ-5
опухоль молочной железы C3H
опухоль молочной железы мышей SHK спонтанная
опухоль яичника асцитная ОЯа
опухоль яичника ОЯК
опухоль яичника ОЯМ
опухоль яичника, индуцированная по методу Бискиндов
плазмацитома MOPC-21
плазмацитома MOPC-315
плазмацитома MOPC-315
плазмацитома MOPC-406
плазмацитома MOPC-406/DDP
плазмацитома MOPC-406a асцитная
плазмацитома MOPC-406s солидная
плоскоклеточный рак желудка ПРЖ
рак влагалища плоскоклеточный РВ
рак легкого M-25
рак легкого Льюис LLC
рак легкого РЛ-67
рак молочной железы F-24
рак молочной железы ВМР-П
44
рак молочной железы РМЖ
рак молочной железы РМК-1
рак предстательной железы R3327-H
рак предстательной железы R3327-MatLyLu
рак толстой кишки 38
рак шейки матки РШМ-1
рак шейки матки РШМ-5
РС-1
РСМ
саркома 180
саркома 298
саркома 37s
саркома 37а
саркома 45
саркома 45/допан
саркома 45/сарколиз.
саркома M-1
саркома АK
саркома Иосида
саркома Йенсена
саркома ССК
саркома Таращанской
саркома шейки матки СШМ
фибросаркома MC-11
хлоролейкоз Shay
эпендимома анапластическая 14-4-4
эпендимома анапластическая 14-60-4
Эрлиха опухоль асцитная
Эрлиха опухоль солидная
45
Животные, на которых проводили эксперимент по изучению
противоопухолевой активности или токсичности (поле «животноехозяин»)
кошки беспородные
кролики беспородные
крысы
крысы August
крысы Buffalo
крысы Copenhagen
крысы F1
крысы Fisher
крысы Lewis
крысы Sprague-Dawley
крысы Wistar
крысы беспородные
морские свинки беспородные
мыши
мыши A
мыши a/b
мыши AFB
мыши AFB x C57
мыши AKR
мыши AKR/y
мыши ALB x CBA
мыши Asn
мыши BALB/c
мыши BDF1
мыши C3H
мыши C3HA
мыши C57Bl
46
мыши C57Bl x CBA
мыши C57Bl/6
мыши C57Bl/6j
мыши CBA
мыши CBA x C57Bl/6j
мыши CBA/2
мыши CBA/2 x CC57Bl/6j
мыши CBA/y
мыши CC57Bl
мыши CC57Br
мыши CD2F1
мыши CDA
мыши CDF1
мыши CH3
мыши CH3A
мыши DBA
мыши DBA/2
мыши DBA/8
мыши F1
мыши T6T6
мыши беспородные
собаки Bigl
собаки беспородные
хомячки золотистые
хомячки сирийские
Локализация опухоли (поле «место прививки»)
внутрибрюшинная
внутримышечная
подкожная
47
Растворитель (поле «растворитель»)
физиологический раствор
крахмальный клейстер
вода дистиллированная
ацетон
бикарбонат натрия
вода
вода дистиллированная + Tween-80 + спирт
вода дистиллированная + Tween-80 + спирт
вода дистиллированная + спирт
глюкоза
ДМСО
ДМСО + вода дистиллированная
ДМСО + натрия бикарбонат
ДМСО + спирт + физиологический раствор
ДМСО + физиологический раствор
карбоксиметилцеллюлоза
масло
масло косточковое
масло оливковое
масло подсолнечное
масло растительное
масло сезамовое
ПВП
ПВП + физиологический раствор
пиридоксин
спирт
спирт + бикарбонат натрия
спирт + крахмальный клейстер
спирт + физиологический раствор
48
суспензия в физиологическом растворе
физиологический раствор + глицерин
физиологический раствор + крахмал
физиологический раствор + спирт
физиологический раствор с подщелачиванием 2 %-ным раствором
бикарбоната натрия
неразведенный экстракт
Путь (способ) введения вещества (поле «путь введении»)
внутрибрюшинно
внутривенно
внутримышечно
накожно
перорально
подкожно
Схема введения вещества (поле «режим лечения»)
24 час х 5
24 час х 6
24 час х 10
24 час х 11
24 час х 12
24 час х 15
24 час х 18
24 час х 20
24 час х 21
48 час х 2
48 час х 4
48 час х 5
48 час х 6
49
48 час х 7
48 час х 8
48 час х 9
48 час х 10
72 час х 10
96 час х 2
Однократно
Категория токсической дозы (поле «категория токсической дозы»)
LD50
LD100
LD90
MTD
TD
Получить в электронном виде полный текст настоящих Методических
рекомендаций,
Базу
данных
формата
ISISBase
для
заполнения
«Электронного паспорта» вещества и таблицы для ввода данных по
результатам изучения биологической активности в формате Word, а также
любые консультации по подготовке данных к вводу в Базу данных по
противоопухолевым веществам можно у ведущего научного сотрудника
лаборатории химического синтеза Галины Николаевны Апрышко,
Тел. 8-499-612-80-86, 8-910-470-42-57,
E-mail: [email protected]
50