Кордюкова

Тема курсовой работы для ___1______ студента _2-3__курса ФББ МГУ
Число приглашаемых студентов
Тьютор
снс
Кордюкова Лариса Валентиновна
Звание и/или должность.
Фамилия.
.
Имя, отчество (полностью, чтобы студент знал как обращаться)
.
При необходимости, укажите также супервайзера и/или других руководителей
.
где работает1
.
БХФ ИИН иифарготаморх
ББФ или БХФ ИИН
отдел или лаборатория
.
тетьлукаф или тутитсни йогурД
2
.
укажите какой
.
куратор из НИИ ФХБ или ФББ
.
как связаться: e-mail [email protected]
.
тел. 939-54-08 корпус A. комн. 335, 336 . удобное время 16-18 ч
.
.Тема работы: Анализ аминокислотных последовательностей и пост-трансляционных модификаций
компонентов оболочки вируса гриппа разных штаммов, подтипов и типов. Выявление
закономерностей первичной (третичной) структуры, коррелирующих с различиями в ацилировании
С-концевого участка трансмембранного гликопротеина гемагглютинина остатками жирных кислот.
Характер работы (уточните; например: бионженерия; культуры клеток; анализ генома человека; программирование)
____________________________________________________________________ яаньлатнемирепскэ
хыннад заб зи йетсоньлетаводелсоп хынтолсиконима зиланА
акитамрофниоиб
___________________________________________________________________ розбо йынрутаретил
Аннотация, литература для введения в проблематику
Вирион вируса гриппа имеет липопротеиновую оболочку, состоящую из липидов клеточной
плазматической мембраны и специфических белков вируса. Мажорный гликопротеин оболочки
гемагглютинин является трансмембранным компонентом, включающим большой гликозилированный
эктодомен, трансмембранный участок (26-28 аминокислотных остатков=аа) и внутривирионный
(цитоплазматический) хвост (11 аа). В то время как эктодомен гемагглютинина несет на себе
антигенные детерминанты, осуществляет прикрепление вириона к мембране клетки, а также
инициирует процесс слияния вирусной оболочки с мембраной клеточной эндосомы,
1
2
Фактически, а не по штатному расписанию
В этом случае требуется (1) куратор - сотрудник НИИ ФХБ или ФББ; (2) утверждение тьютора деканатом
трансмембранный домен необходим для завершения процесса слияния мембран. Кроме того,
трансмембранный и цитоплазматический домены (вместе обозначаемые как С-концевой сегмент
гемагглютинина) обеспечивают «связь» с основным структурным компонентом вириона –
матриксным белком М1, прилегающим к вирусной мембране изнутри. Такая связь обеспечивает
структурную целостность дочерних вирионов, «выпочковывающихся» с плазматической мембраны
клетки. Химическая и структурная основа этой связи неясна.
С-концевой сегмент гемагглютинина всех штаммов всех подтипов и типов вируса гриппа
включает крайне консервативные остатки цистеина, ацилированные высшими жирными кислотами.
Таких цистеинов - три у штаммов вируса гриппа типа А, два – у вируса гриппа типа В и 1 – у вируса
гриппа типа С. Точная функция жирнокислотных остатков пока неясна. Предполагается, что они
могут «улучшать» процесс слияния мембран, а также играть структурную роль: например,
ориентировать целую молекулу гемагглютинина относительно оболочки вириона. Наиболее
интересной может быть гипотеза о том, что ацильные остатки (все или некоторые из них)
осуществляют структурную «связь» гемагглютинина с матриксным белком М1.
Экспериментально, с использованием методов масс-спектрометрии, показано, что С-концевой
сегмент гемагглютинина ацилирован преимущественно двумя разновидностями жирнокислотных
остатков: пальмитатами (16 атомов углерода) и стеаратами (18 атомов углерода). (Два
дополнительных атома углерода в составе остатка стеариновой кислоты делают его значительно
более гидрофобным.) Интересно, что процентное соотношение пальмитат/стеарат примерно
одинаково у разных штаммов внутри одного подтипа вируса гриппа типа А и существенно
различается у разных подтипов (всего известно 16 подтипов гемагглютинина вируса гриппа типа А,
из них нами исследованы 4). У гемагглютинина вируса гриппа типа В не обнаружено стеаратов, зато
у вируса гриппа типа С стеараты доминируют.
Задача: Проанализировать аминокислотные последовательности разных штаммов разных
подтипов и типов гемагглютинина (сделать выравнивание) и попытаться выявить закономерности,
коррелирующие с процентом пальмитатов/стеаратов у тех штаммов, у которых этот процент
экспериментально определен. Предсказать возможный процент пальмитатов/стеаратов у штаммов
неисследованных подтипов.
Возможный вариант (или следующий этап): Проанализировать аминокислотные
последовательности разных штаммов разных подтипов и типов матриксного белка М1 – найти
корреляции с процентом пальмитатов/стеаратов у гемагглютинина.