Г О У В П О Р О С СИ Й СК О - АР М ЯН С К И Й ( СЛ АВ ЯН С К И Й ) У Н И В Е РС И Т Е Т Со ст а в л ен в со о т в ет ст в и и с государственными требованиями к минимуму содержания и уровню подготовки в ып у ск н и к о в по направлению____________ и П о л о ж ен и е м « О б У М К Д Р АУ » . У Т В Е Р Ж Д АЮ : Ди р ек т о р и н ст и т у т а _ _ _ _ _ _ _ _ __________________________ Институт: Институт математики и высоких технологий Кафедра: Медицинская биохимия и биотехнология Автор(ы): доктор биол. наук, профессор Варданян Гаяне Саркисовна УЧЕБНАЯ ПРОГРАММА Дисциплина: Молекулярная эндокринология Специальность: 060601.65 Медицинская биохимия ЕРЕВАН ОБЪЯСНИТЕЛЬНАЯ ЗАПИСКА Программа адаптирована ко всему периоду обучения студентов по специальности «Медицинская биохимия», включает все новейшие данные в области «М Молекулярной эндокринологии». В связи с этим, структура программы скомпонована таким образом, чтобы студенты последовательно, начиная с изучения основ, переходили к более углубленному изучению наиболее важных и фундаментальных разделов современной эндокринологии и химии патологических процессов. Целый ряд частных вопросов метаболизма сознательно опущен в связи с тем, что с методической точки зрения только значительно увеличивают объем информации, который может быть легко усвоен специалистом-выпускником в случае его конкретной профессиональной ориентации самостоятельно без каких-либо за-труднений. Представленная программа состоит из следующих разделов: 1. Общая биохимия 2. Клиническая биохимия. 3. Химия патологических процессов. 4. Биоэнергетика. 5. Энзимология. 6. Методы биохимических исследований 7.Система гемостаза. В связи с этим представляется возможным в рамках медико-биологического факультета готовить специалистов-биохимиков, ориентированных на решение проблем медицинской патологии на базе современных знаний по биохимии и мо-лекулярной биологии, которые хорошо представляют вопросы теории, владеют основными методами биохимических исследований, способны планировать и грамотно решать различные медико-биологические проблемы. Целью практики является: знакомство с работой клинико-диагностической лаборатории, закрепление знаний и практических навыков по клинической биохимии, самостоятельное выполнение биохимических методик и анализ лабораторных показателей, применяемых для диагностики заболеваний. ЦЕЛЬ И ЗАДАЧИ ИЗУЧЕНИЯ БИОХИМИ Основной целью преподавания дисциплины «Биохимия» студентам, обучающимися по специальности «медицинская биохимия» является изучение организации метаболизма и его регуляции. Задачами раздела общей биохимии являются: 1. Знакомство со структурой, свойствами и функциями основных биомоле-кул. 2. Изучение путей метаболизма нуклеиновых кислот, белков, углеводов и липидов и их взаимосвязей. 3. Изучение этапов энергетического обмена, способов запасания и расходования метаболического топлива клетками. 4. Формирование представлений об основных принципах регуляции и их ме-ханизмах. "Молекулярная эндокринология" Основные принципы гормональной регуляции 1. Принципы нейроэндокринной регуляции. Иерархия между ЦНС, гипоталамусом, гипофизим и секреторными тканями-мишенями в формировании гормонального статуса организма и его биологических реакций. Механизмы обратной связи в нейроэндокринной системе. Основные гормоны гипоталамуса и гипофиза. Механизм действия кортиколиберина. Роль липопротеидов и тропных гормонов в регуляции синтеза стероидных гормонов из холестерина. Механизм образования тироксила и трийодтиронила. Рефлекторный механизм регуляции давления крови под действием ангиотензина и альдостерона. Роль ангиотензин-превращающего фермента (АПФ). 2. Основные принципы регуляции метаболических процессов. Аллостерическая регуляция и регуляция метаболитами, регулируемые стадии многоступенчатых процессов. Разнообразие агонистов - нейромедиаторов и гормонов и их классификация по типу рецепторов, механизмам передачи сигнала в клетку, конечной мишени внутри клетки и временной шкале развития биологических эффектов. Регуляция активности ферментов путем изменения экспрессии их индуцибельных изоформ на примере действия тиреоидных гормонов. Рецепция внеклеточных сигналов 3. Зависимость суммарного биологического ответа к агонисту от его концентрации в крови и представленности рецепторов в клетках различных тканей. Регуляция фракции свободных и связанных агонистов в системе циркуляции. Способы измерения концентрации агониста в крови. 4. Сродство агониста к рецептору. Явление множественности рецепторов для одного агониста. Селективность агонистов по отношению к рецепторам различных типов на примере альфа- и бета-адренэргических рецепторов. Структура основных агонистов этих рецепторов. 5. Способы измерения связывания лиганда с рецептором в клеточных системах. Специфическое и неспецифическое связывание. Преимущество и недостатки стандартных методов Лайнуивера-Берка и Скэтчарда при определении параметров связывания. Измерение скоростей связывания и диссоциации лиганда. Выявление кооперативности связывания лиганда. Концентрационные зависимости связывания гормона с рецептором in vitro и биологического эффекта in vivo. Основные принципы внутриклеточной сигнализации 6. Многообразие механизмов, общие принципы и закономерности внутриклеточной передачи сигнала. Разные уровни биологических ответов. Внутриклеточные сигнальные сети и формирование баланса реакций. Особенности рецепции и проведения цветового зрительного сигнала, его трансформация в нервный импульс и формирование системного образа на уровне ЦНС. 7. Общие принципы организации и свойства сигнальных систем клетки. Модульная организация и поэтапная передача сигнала внутри клетки на примере МАР-киназных каскадов. Роль белок-белковых взаимодействий, адаптерные белки, специфические последовательности и домены, предназначенные для белок-белкового узнавания. Методы экспериментальной регистрации белок-белкоых взаимодействий в клетке (FRET, pull-down assay и др.). Эволюционный консерватизм наиболее значимых сигнальных каскадов. 8. Зависимость клеточных реакций от длительности действия сигнальных каскадов. Свободнорадикальный механизм выключения сигнальных каскадов с участием НАДФНоксидазы и тирозиновой фосфатазы. Каркасная организация сигнальных модулей и возможность переадресации сигнала на уровне каркасных белков. Проведение сигнала на мембранном и постмембранном уровнях 9. Основные типы мембранных рецепторов. Рецепторы-каналоформеры, рецепторы, ассоциированные с тримерными G-белками, тирозинкиназные рецепторы, рецепторы липопротеидов, рецепторы адгезии и межклеточного узнавания. 10. Механизмы передачи сигнала на уровне мембраны. Понятие о вертикальной и горизонтальной сигнализации. Рецепторы, ассоциированные с мембранными ионными каналами, как пример вертикальной сигнализации с развитием немедленного ответа. Рецепторы-каналоформеры. Регуляция активности ионных каналов. Основные пути переноса Са2+ и регуляции его концентрации в цитоплазме. Основные типы Са2+-каналов. Динамика изменения внутриклеточной концентрации Са2+ при действии агониста. 11. Взаимодействие рецепторов с адаптерными белками и горизонтальная переадресация сигнала на уровне мембраны. Концепция вторичных посредников и связанные с ними мембранные рецепторы в горизонтальной сигнализации. Кумулятивная функция вторичных посредников - возможность передачи сигнала от разных рецепторов к одному посреднику. Структура и механизмы действия основных вторичных посредников. Аденилат- и гуанилатциклазы, образование цАМФ и цГМФ. Роль окиси азота в активации гуанилатциклазы. 12. Основные пути передачи сигнала через рецепторы, ассоциированные с G-белками плазматической мембраны. Общее строение семидоменных рецепторов. Механизм сопряжения рецептора с вторичными посредниками и эффекторными системами. Факторы регуляции обмена гуаниновых нуклеотидов и регуляция активности G-белков. Общая классификация и субъединичный состав мембранных G-белков. 13. Мономерные G-белки и их роль во внутриклеточной сигнализации. Ras как ключевой эффектор, его клеточные функции и биологическая роль в опухолевой трансформации. Регуляция ГТФ-азного цикла G-белков и факторы регуляции обмена гуаниловых нуклеотидов. Внутриклеточная сигнальные каскады и их эффекторы 14. Многообразие посттрансляционных модификаций и модифицируемых остатков белков. Конкурентная и множественная модификация белков. Фосфорилирование как основной путь передачи сигнала и эффекторных воздействий. цАМФ- и цГМФ-зависимые протеинкиназы, молекулярная организация и механизмы активации циклическими нуклеотидами. Каталитический механизм активации протеинкиназ и обеспечение специфичности узнавания субстрата. 15. Проведение сигнала через цитокиновые рецепторы как классический пример горизонтальной сигнализации. Общая классификация и структура рецепторов цитокинов. Механизмы активации и ассоциации активированных рецепторов, а также последующего проведения сигнала в цитоплазме с участием JAK/STAT белков. Регуляция транскрипции генов STAT-белками. Роль цитокинов в регуляции дифференцировки и миграции клеток при гематопоэзе. 16. Передача сигнала через хемокиновые рецепторы. Общая классификация цитокинов и их рецепторов. Роль фосфоинозитидного обмена и МАР-киназ в миграционном ответе клеток. Ведущая роль динамики актина в амебоидной подвижности и миозина в создании тянущих усилий при движении клеток. Роль малых G-белков Rho, Rac и Cdc42 в регуляции внутриклеточной динамики актина, перекрестная сигнализация между малыми G-белками. Роль микротрубочек в регуляции адгезивных контактов. 17. Сигнализация через тирозинкиназные рецепторы факторов роста. Общая структура сигнальных каскадов. Проведение сигнала с помощью белок-белковых и адаптерных взаимодействий с участием тирозинового фосфорилирования. Механизмы активации Ras, Raf и эффекторных МАР-киназ. 18. Сигнальная регуляция экспрессии генов через рецепторы BMP/TGFβ. Механизм активации рецепторов, участие Smad белков в дальнейшей передаче сигнала. Рецепторы и сигнализация через NF-κB. 19. Регуляция дифференцировки В-лимфоцитов и иммунного ответа. Структура Вклеточного антигенного рецептора (BCR) и роль гетеротримерной ассоциации мембранных иммуноглобулинов. Общий механизм дальнейшего проведения сигнала с участием нерецепторных тирозиновых киназ и фосфатаз, НАДФН-оксидазы и адаптерных белков. 20. Механизмы десенситизации мембранных рецепторов путем посттрансляционных модификаций и эндоцитоза. Убиквитинилирование и механизмы протеосомальной деградации белков. 21. Сигнализация через рецепторы клеточной адгезии. Механизм формирования, общая структура и сигнальные эффекты интегринов. Роль интегринов во взаимодействии клетки с внеклеточным матриксом и его связи с цитоскелетом. Общие и тканеспецифические эффекты периодического растяжения клеток как пример сигнализации от рецепторов клеточной адгезии. Индукция апоптоза при потере контактов. Активация NO-синтазы и биологический эффект NO в сосудах под действием потока крови и напряжения сдвига. 22. Рецепторы межклеточной адгезии – кадгерины, селектины, эфрины. Механизм действия кадгеринов и их сопряжение с цитоскелетом. Роль рецепторов межклеточной адгезии в активации оксидативного стресса в нейтрофилах и роста нервных окончаний. 23. Ядерные и цитоплазматические рецепторы. Механизм действия стероидных гормонов. Коактиваторный и корепрессорный механизмы регуляции генной транскрипции. Орфановые рецепторы. Регуляция транспорта Na+ в почках альдостероном как пример стероидной регуляции физиологических функций. 24. Структура липопротеидов низкой плотности и их гормоноподобные эффекты. Рецепторы липопротеинов. Рецептор-опосредованный метаболизм ЛНП. Сигнальная регуляция клеточных и физиологических реакций 25. Внеклеточные сигналы и рецепторы, участвующие в регуляции клеточной подвижности. Флагеллярный и амебоидный типы движения клеток. Явление хемотаксиса. Функционирование специализированных хеморецепторов вертикального типа на примере бактериального хемотаксиса, двухкомпонентная передача фосфо-сигнала с участием гистидиновых протеинкиназ. Механизмы адаптации к широкому диапазону концентрации хемоаттрактанта и регистрации ее малых изменений. Усиление сигнала за счет кластеризации рецептора. 26. Внутриклеточные механизмы направленной миграции на примере амебоидного хемотаксиса слизевика Dyctiostelium. Роль G-белковых мембранных рецепторов, PI3киназы и фосфоинозитидного обмена в поляризации клетки и регистрации градиента хемоаттрактанта. Регуляция обмена фосфатидилинозитолфосфатов, роль фосфатаз PTEN и SHIP. 27. Особенности хемотаксиса эукариотических клеток. Примеры направленной миграции клеток в организме. Механизмы ангиогенеза и роста сосудов. Рецепторы клеточной навигации. Направленная миграция клеток крови в очаг воспаления, хоуминг и миграция прогениторных клеток в очаги повреждения и ишемии. Биологические эффекты гипоксии. Миграция опухолевых клеток и явление эпителиально-мезенхимальной трансформации (ЭМТ). Структура и регуляция межклеточных контактов. Метастазирование как комбинация обратимого ЭМТ, направленной миграции и выживания опухолевых клеток. Различные стратегии движения клетки в 3-мерном матриксе. 28. Сигнальные механизмы направленной миграции клеток. Рецептор урокиназы как представитель гликозилфосфатидилинозитол (GPI)-заякоренных мембранных белков и его вероятная роль в инициации внеклеточного протеолиза и активации внутриклеточной сигнализации. Возможные механизмы индукции синтеза матриксных протеинкиназ и направленной миграции при активации урокиназой различных каскадов МАР-киназ, и трансактивации рецептора EGF. ТЕМАТИЧЕСКИЙ ПЛАН ЛЕКЦИЙ И ПРАКТИЧЕСКИХ ЗАНЯТИЙ ПО БИОХИМИИ (раздел «ОБЩАЯ БИОХИМИЯ»), 5 и 6 семестры № п/п 3. Тема Предмет, задачи 1. и методы биохимии. 2. Аминокислоты, пептиды, белки. Ферменты Количество часов лекций Количество часов практи-ческих заня-тий 5 семес 2 3 10 18 8 15 4. Витамины 4 6 5. Структура и обмен нуклеиновых кислот Внешний обмен белка Промежуточный обмен белка 6 6 2 3 8 Итого: 40 часов 9 Итого: 60 часов 6. 7. 6 семестр Зачет 6 семестр 8. 9. 10. 11. 12. Углеводы и 10 обмен углеводов. Липиды и обмен 8 липидов. Взаимосвязь 2 обменов веществ. 25 Биологическое окисление. 6 10 Гормональная регуляция обмена веществ. 8 15 Итого: 34 час Итого: 85 час. Экзамен 25 10 УЧЕБНАЯ ПРОГРАММА ПО БИОХИМИИ (Раздел – ОБЩАЯ БИОХИМИЯ) СОДЕРЖАНИЕ ЛЕКЦИЙ Тема 12. Гормональная регуляция обмена веществ. 1. Понятие о гормональной регуляции. Связь с нервной и внутриклеточной систе-мами регуляции. 2.Классификация гормонов по химической структуре. 3.Механизмы действия гормонов. Рецепторы, вторичные посредники. 4.Рилизинг –факторы гипоталамуса. 5.Тропные гормоны гипофиза. Соматотропный гормон. 6.Гормоны щитовидной и паращитовидных желез. 7. Гормоны поджелудочной железы. 8. Катехоламины. 9. Стероидные гормоны. РАБОЧАЯ ПРОГРАММА ПО БИОХИМИИ, РАЗДЕЛ «КЛИНИЧЕСКАЯ БИОХИМИЯ», 8 семестр В процессе изучения клинической биохимии решаются следующие задачи: 1. Познакомить студентов с принципами, понятиями и объемом биохимических исследований в лабораторной диагностике 2. Показать зависимость между нарушением структуры, функций органов и их биохимическими показателями в плазме крови 3. Выявить основные закономерности нарушений белкового, липидного, угле-водного обменов при заболеваниях человека 4. Изучить биохимические маркеры заболеваний печени, поджелудочной железы, почек, сердечно-сосудистой системы 5. Изучить наследственные и средовые факторы нарушений порфиринового об-мена 6. Познакомить студентов с биохимическими способами оценки нарушений вод-ноэлектролитного обмена и кислотно-щелочного равновесия ТЕМАТИЧЕСКИЙ ПЛАН ЛЕКЦИЙ И ПРАКТИЧЕСКИХ ЗАНЯТИЙ ПО РАЗДЕЛУ «КЛИНИЧЕСКАЯ БИОХИМИЯ» № п/п . Тема Количество часов практиче-ских занятий 1 Принципы клинической лабораторной диагностики 2 4 Биохимические исследования 2 заболеваниях печени 6 20 3 Белки плазмы крови 2 4 4 Нарушения порфиринового об- мена 2 4 5 Биохимическая диагностика заболеваний поджелудочной же- лезы 2 4 6 Сахарный диабет 4 8 Заболевания 7 системы 10. Количество часов лекций при сердечно-сосудистой 6 16 8 Заболевания почек 4 8 9 Водно-электролитный обмен 4 8 Кислотно-щелочной баланс 2 0 ИТОГО 34 68 Литература 1. Баркаган З.С., Момот А.П. Диагностика и контролируемая терапия нарушений гемостаза.- М.: «Ньюдиамед».-2001.-296 С. . 2. Биохимическая фармакология. Учебное пособие для вузов /под ред. П.В.Сергеева. – М.: Наука, 1982. 3. Биохимические основы патологических процессов. Под редакцией Е.С.Северина. – М.,Медицина, 2000.-304 С. 4. Биохимические основы патологических процессов: Учебное пособие /Под ред. Е.С.Северина.-М.: Медицина, 2000.- 394 С. 5. Бородин Е.А.. Биохимический диагноз (физиологическая роль и диагностическое значение биохимических компонентов крови и мочи) в 2-х частях. – Благовещенск, 1991. 6. Бышевский А.Ш., Галян С.Л., Терсенов О.А. Биохимические сдвиги и их оценка в диагностике патологических состояний.-М.: «Медицинская книга», 2002. – 320с. 7. Зайчик А.Ш., Чурилов Л.П. Основы патохимии. – СПб.: ЭЛБИ-СПб., 2001. – 688 8. Иванов Е.П. Руководство по гемостазиологии.- Минск.-1991-302 С. 9. Камышников В.С. Справочник по клинико-биохимической лабораторной диагностике: в 2 т. - Мн.: Беларусь.-2000.- 958 С. 10. Клинико-диагностическое значение лабораторных показателей / Долгов В., Морозова В., Марцишевская Р. и др.– М.: "Лабинформ", "Центр", 1995. 11. Клиническая биохимия /Под редакцией В.А.Ткачука.-М.:ГЭОТАР-МЕД. -2002.-360 с. 12. Мак-Мюррей У. Обмен веществ у человека. – М.: Мир, 1980. 13. Марри Р., Греннер Д., Мейс П. Биохимия человека. – М.: Мир, 1993. 14. Маршал В.Д. Клиническая биохимия/Пер с англ.-СПб.: Издательство «Бином-Невский диалект»-2000.-368 с. 15. Мусил Я. Основы биохимии патологических процессов. – М.: Медицина, 1985.– 432 с. 16. Ньюсхолм Э., Старт К."Регуляция метаболизма".-М.: Мир.-1977.- 87 c. 17. Розен В.В Основы эндокринологии. – М.: Высшая школа, 1987. 18. Уильямс Б., Уилсон К. Методы практической биохимии. М.: Мир, 1978. 19. Цыганенко А.Я., Жуков В.И., Мясоедов В.В., Завгородний И.В. Клиническая биохимия (учебное пособие для студентов медицинских вузов).-М.: Триада –Х.-2002.-504 с. Все разделы курса обеспечены методическими пособиями, программами семинаров и коллоквиумов, задачами для самоконтроля и тест-контролями для проверки знаний. МАТЕРИАЛЬНО-ТЕХНИЧЕСКОЕ ОБЕСПЕЧЕНИЕ преподавания дисциплины «Биохимия» 1. Таблицы 2. Компьютерные программы, презентации. 3. Лабораторное оборудование (спектрофотометры, колориметры, центрифуги ит.д.), химическая посуда. 4. Лабораторные животные, биоматериал (сыворотка крови). Рабочая программа обсуждена и утверждена на заседании кафедры молекулярно-клеточной биологии и медицинской биохимии