Поиск консервативных аминокислотных остатков для белков GroEL и CroES

Поиск консервативных аминокислотных
остатков для белков GroEL и CroES
Скоморохова Е.Б.
Научный руководитель:
д.ф. м.н. Галзитская О. В.
Институт белка РАН
г. Санкт-Петербург
2016
Строение комплекса шаперонов
GroEL-GroES
https://lookfordiagnosis.com/mesh_info.php?term=Chaperonin+60&lang=1
Классификация шаперонов hsp60
Шапероны
Группа 1
GroEL
Hsp10
Hsp60
Группа 2
RuBisCoсвязывающий
белок
термосома
и термофильный
фактор 55,
TF55 архей
TriC
или CCT
цитозоля
эукариот
Механизм действия
шаперонов GroEL-GroES
http://enews.membs.org/Detailing-the-Molecular-Structure-of-Mitochondrial-Protein-folding-Machines
План работы:
1.Поиск в базе данных аминокислотных последовательностей
белков hsp60 и hsp10, принадлежащих представителям
основных доменов живой природы: животные, растения,
грибы, протисты, эубактерии и археи
План работы:
1.Поиск в базе данных аминокислотных последовательностей
белков hsp60 и hsp10, принадлежащих представителям
основных доменов живой природы: животные, растения,
грибы, протисты, эубактерии и археи
2. Очистка и структурирование данных, выравнивание
План работы:
1.Поиск в базе данных аминокислотных последовательностей
белков hsp60 и hsp10, принадлежащих представителям
основных доменов живой природы: животные, растения,
грибы, протисты, эубактерии и археи
2. Очистка и структурирование данных, выравнивание
3. Поиск консервативных аминокислотных остатков
План работы:
1.Поиск в базе данных аминокислотных последовательностей
белков hsp60 и hsp10, принадлежащих представителям
основных доменов живой природы: животные, растения,
грибы, протисты, эубактерии и археи
2. Очистка и структурирование данных, выравнивание
3. Поиск консервативных аминокислотных остатков
4. Межгрупповой и внутригрупповой анализ
амминокислотного состава
План работы:
1.Поиск в базе данных аминокислотных последовательностей
белков hsp60 и hsp10, принадлежащих представителям
основных доменов живой природы: животные, растения,
грибы, протисты, эубактерии и археи
2. Очистка и структурирование данных, выравнивание
3. Поиск консервативных аминокислотных остатков
4. Межгрупповой и внутригрупповой анализ
амминокислотного состава
Поиск последовательностей белков
Hsp60
Bacteria
401
Archaea
94
Protists
163
Fungi
281
Algae
63
Plants
284
Animals
445
Total Number of Hsp60 Proteins
1731
Спасибо за внимание!