Лекция № 12 Строение р неорганических р молекул «Неорганическая Н химия» ((под. ред. акад. Ю Ю.Д.Третьякова), ДТ ) т.11 Ю.Д.Третьяков, А.В.Шевельков, В.В.Еремин – материалы лекций Молекулы - сложные Последний кадр из лекции профессора Ады Йонат «View into the ribosomal exit tunnel», Нобелевская премия по химии в 2009 г. (VIII биофизический конгресс, Будапешт автор фото – А.А.Семенова) Будапешт, А А Семенова) «Рибосома — важнейший немембранный органоид живой клетки сферической или слегка эллипсоидной формы, диаметром 100—200 ангстрем, состоящий из большой и малой субъединиц. субъединиц Рибосомы служат для биосинтеза белка из аминокислот по заданной матрице на основе генетической информации предоставляемой матричной информации, РНК, или мРНК.» (Википедия) Водородная связь Для водородной связи необходимо наличие двух полярных ковалентных связей, в образовании одной из которых участвует атом водорода, а другой электроотрицательный атом (кислород, азот, галоген). Водородная связь считается ключевым взаимодействием в супрамолекулярной химии. Она определяет структуру б белков, двойной й й спирали ДНК, ДНК воды и льда, супрамолекулярных ансамблей, б й полимеров, оказывает влияние на свойства многих растворов. Энергия меняется в широких пределах - от 5 до 100 кДж/моль, однако обычно водородная связь намного слабее б ковалентных связей. й В зависимости от энергии, водородная связь имеет различный характер - от чисто электростатического (слабые связи) до преимущественно ковалентного (сильные связи). Клатраты 6 5 Cl2 * 46 H2O 6.5 4 Химический «наномускул» Жан – Мари Лен, супрамолекулярные соединения Странные кристаллические структуры Prof. Dan Shechtman (Израиль) Интерметаллиды – Квазикристаллы (Нобелевская премия по химии - 2011) 6 Направленность связи Роль центрального атома BF3 F плоский B треугольник F F N NF3 F F F тригональная пирамида ClF3 F Cl F T-образная молекула F (O N O)+ нитроил р – катион O N 135 ° диоксид азота O N O – 115 °O нитрит – анион Гибридные орбитали (sp3) «Нано»?углерод у р д TEM наблюдение J.Iijima (Nature,1991) коаксиальных многостенных нанотрубок с различными внутренними диаметрами и числом оболочек с различной хиральностью. 2 ((sp p) Л.В.Радушкевич, ду , В.М.Лушкинович. у О структуре углерода, образующегося при термическом разложении окиси углерода на железе ЖФХ (1952) Гибридизация и локализация Ограничения «Выбор» молекулами геометрии Молекулярная геометрия Положения метода Гиллеспи Расположение небольшого числа электронных пар на поверхности сферы 2 пары 3 пары 4 пары Тригон. бипирамида Октаэдр р 5 пар 6 пар пентагон. бипирамида 7 пар СЧ = L + E стерическое р подел. д неподел. д число э.п. э.п. Тригональная бипирамида аксиальные позиции экваториальные позиции PF5 экваториальное положение акс. P —— F неподеленных пар энергетически 1 577 Å 1,577 предпочтительней экв. P —— F 1,53 Å SF4 SF4 •• S 90 аксиал. НП : S 90 экватор. НП Применения метода Гиллеспи H • • H H C N H H H H CH4 NH3 HCH = 109,5 109,5 HNH = 107,3 107,3 •• • • O H H H2O HOH = 104,5 104,5 Изоэлектр. р ряд р д молекул у С4 Число Структура (q) неподелен- молекул ных пар n 2 0 линейная 3 0 3 1 Пример g 2 BeH2, CO2, MgCl SO3, BF3 плоская тригональная SO2, O3 •• изогнутая С4 Число ( ) неподелен(q) ных пар 4 0 4 4 1 Структура молекул тетраэдрическая .. П Пример СН4, CF4, SO42NH3, PF3, AsCl3 тригонально-пирамидальная .. .. 2 H2O, H2S SF2 изогнутая Alqq-nnEn СЧ Число q неподеленных пар n 5 0 5 Структура молекул Пример PF5, PCl5, AsF5 тригональная бипирамидальная 1 SF4 .. искаженная тетраэдрическая Alqq-nnEn СЧ Число q неподеленных пар n 5 2 Структура молекул Пример .. ClF3 .. Т-образная .. .. 5 3 .. линейная й XeF2, I3- IF2- Alqq-nnEn СЧ Число q неподеленных пар n 6 0 Структура молекул Пример SF6 октаэдрическая 6 1 IF5 квадратная пирамидальная .. Alqq-nnEn СЧ Число q неподеленных пар n 6 2 Структура молекул Пример .. XeF4, IF4.. квадратная F F F 1870 S 101.50 87.50 Cl 87.50 F F F SF4 Искаженный тетраэдр F ClF3 Эффект неодинаковых атомов CH3Cl H-C-H 110.5 110 5o H - C - Cl 108.55o 108 Вместо 109.5o в идеальном тетраэдре C 121.70 этилен 115.80 H H C H H H 116.60 121.70 122.10 C .. O 122.10 формальдегид H F F F 91.80 CH3 P 122.20 F O F F 90.60 S F 124.90 F Наименее ЭО группы в эквивалентной позиции (как НП) Дополнения Ограничения р метода Гиллеспи Если говорить строго... Хиральность аланин а - центр; б - ось; в плоскость; г -винтовая пов-сть; д - топологич. связь;; А,, В,, С,, D разл. атомы или группы атомов, М атом металла, L лиганд