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Bogdanov Vavilov Institute of General Genetics, RAS, Moscow, Russia, e-mail: [email protected] Summary We performed the Þrst bioinformatical comparison of components of the cohesin complex in 10 eukaryotic species conventionally used as model organisms for studying the molecular bases of mitosis and meiosis. Cohesin proteins connect sister chromatids after DNA replication. They are partially different in somatic cells (SCC3, SA1/2, STAG1/2) and generative cells (REC11, STAG3), which undergo mitosis and meiosis, respectively. Cohesins play a signiÞcant role in the difference between these division types. Both somatic forms of mammalian stromalins, STAG1 and STAG2, differ from one another and from their meiotic paralog, STAG3, in all parameters studied, particularly, in secondary structure. To be able to perform additional functions in meiosis, cohesin STAG3 proteins acquire speciÞc structural features at their N- and C-ends, and this is their difference from meiotic REC8 cohesins formerly studied by us. Key words: eukaryotes, meiosis, SCC3/SA/STAG cohesin proteins, conserved motifs, in silico study.