Дальтон – единица измерения массы вещества, равная 1,661 x

реклама
Д
Дальтон – единица измерения массы вещества, равная 1,661 x 10–24 г,
используемая для измерения массы вирусов, клеток, хромосом, митохондрий,
рибосом, а также молекул ДНК, РНК и белков.
Дарвинизм – теория, согласно которой основными факторами
эволюции органического мира являются изменчивость, наследственность,
борьба за существование и естественный отбор.
Двухкратно вырожденная серия кодонов – серия кодонов,
состоящая из двух синонимичных триплетов.
Двухкратно вырожденный сайт – нуклеотидный сайт, в котором
одна из трех возможных замен является синонимичной.
Двухшаговая замена – замена двух из трех нуклеотидов в кодоне.
Делеция – хромосомная мутация, заключающаяся в выпадении части
хромосомы, размером от нескольких нуклеотидных пар до нескольких генов.
Бывает интеркалярная и терминальная (дефишенси).
Дем – локальная, географически изолированная и небольшая по
численности популяция, которая существует внутри вида в течение жизни
одного или двух поколений, а затем объединяется с другими подобными
популяциями.
Денатурация
–
конформационное
изменение
биологической
макромолекулы, приводящее к необратимой или обратимой утрате ее
способности к выполнению определенной биологической функции.
Дендрограмма
(кладограмма,
филогенетическое
дерево,
филограмма) – ветвящаяся диаграмма, отражающая родственные связи между
таксонами или генетическими макромолекулами и представляющая попытку
изобразить в историческом времени их истинные ветвления от предковых
форм.
Дефишенси – хромосомная мутация (разновидность делеции),
заключающаяся в выпадении терминальной части хромосомы, размером от
нескольких нуклеотидных пар до нескольких генов.
Дивергенция – расхождение в ходе эволюции признаков и свойств у
первоначально филогенетически близких групп организмов, возникающее
под действием естественного отбора.
Дивергенция последовательностей – процент различий между
последовательностями нуклеотидов двух связанных сегментов ДНК или
между последовательностями аминокислот двух связанных полипептидных
цепей.
Димер – молекула, состоящая из двух мономерных субъединиц.
Дискретность – свойство гена, заключающееся в том, что он состоит
из множества триплетов нуклеотидов.
Дискретные методы – группа методов построения дендрограмм
непосредственно
по
нуклеотидным
или
аминокислотным
последовательностям, а не с коэффициентами их сходства, полученными на
основе эволюционных дистанций.
Дистальные гены – гены, расположенные в хромосоме на достаточно
далеком расстоянии.
Дистанционно–матричные методы – группа методов построения
дендрограмм, в основе которых лежит принцип объединения наименее
отличающихся последовательностей или групп последовательностей на
основании коэффициентов их сходства.
Дистанция
Гришина
–
эволюционная
дистанция
между
аминокислотным последовательностям, учитывающая вариацию скорости
замен в сайтах
в соответствии с гамма распределением, а также частые
взаимные замены аргинина на лизин в процессе эволюции.
Дистанция Грэнтсема – дистанция, предназначенная для оценки
физико-химических
различий
взаимозаменяемых
аминокислот
и
учитывающая три параметра: полярность, объем аминокислот и состав
аминокислот (отношение атомных масс неуглеродных атомов, входящих в
концевые группы или кольца, к атомным массам углеродов боковой цепи).
Дистанция Джонса-Тэйлора-Торнтона – эволюционная дистанция
между аминокислотными последовательностями, вычисленная с помощью
одноименной матрицы.
Дистанция Джукса–Кантора – эволюционная дистанция между
нуклеотидными последовательностями, вычисленная одноименным методом.
Дистанция
аминокислотными
Дэйхофф
–
эволюционная
последовательностями,
дистанция
вычисленная
с
между
помощью
одноименной матрицы.
Дистанция
Кимуры
–
эволюционная
дистанция
между
аминокислотными или нуклеотидными последовательностями, вычисленная
одноименным методом.
Дистанция состава – см. композиционная дистанция.
Дистанция
Тадзимы–Ней
–
эволюционная
дистанция
между
нуклеотидными последовательностями, вычисленная одноименным методом.
Дистанция
Тамуры
–
эволюционная
дистанция
между
нуклеотидными последовательностями, вычисленная одноименным методом.
Дистанция
Тамуры–Ней
–
эволюционная
дистанция
между
нуклеотидными последовательностями, вычисленная одноименным методом.
Дифференция дистанций – селекционный тест, заключающийся в
сравнении
и
вычислении
разницы
значений
несинонимичной
и
синонимичной дистанций, рассчитанных с помощью различных методов.
ДНК – нуклеиновая кислота, мономером которой является нуклеотид,
состоящий из азотистого основания (А, Г, Ц, Т), дезоксирибозы и остатка
фосфорной кислоты.
ДНК–полимераза – фермент, осуществляющий репликацию ДНК.
ДНК-лигаза – фермент, осуществляющий соединение фрагментов
вновь синтезированной цепи ДНК при репликации и репарации.
Доза гена – количество копий данного гена в геноме.
Домен – участок молекулы белка, имеющий надвторичную структуру,
и выполняющий определенную функцию.
Доминантный аллель – преобладающий аллель, фенотипически
проявляющийся в гомо- и гетерозиготном состоянии при условии полного
доминирования.
Дрейф генов (генетико-автоматические процессы) – случайные
колебания частот генов в малых популяциях.
Дуплет кодонов – два кодона из шестикратно вырожденных серий,
отличающиеся друг от друга нуклеотидами в третьем положении.
Дупликация – хромосомная мутация, заключающаяся в удвоении
участка хромосомы.
Е
Единица эволюционного времени – единица, равная времени (в млн.
лет), необходимому для осуществления дивергенции последовательностей на
1%.
Естественный отбор – постоянно протекающий в природе процесс, в
ходе которого отбираются наиболее приспособленные к данным условиям
существования особи и элиминируются наименее приспособленные.
ЕIM–дистанция – эволюционная дистанция между аминокислотными
последовательностями, вычисленная на основании модели равных вставок.
З
Закон
Долло
(закон
необратимости
эволюции)
–
закон,
постулирующий необратимость эволюционного процесса в пределах одной
видовой ветви.
Закон
Геккеля-Мюллера
(биогенетический
закон)
–
закон,
формулирующийся следующим образом: онтогенез есть краткое и быстрое
повторение (в закономерно измененном и сокращенном виде) филогенеза.
Закон
последовательности
прохождения
фаз
развития
-
биологический закон, согласно которому фазы развития природной системы
могут следовать лишь в эволюционно закрепленном порядке от относительно
простого к сложному, а также возможно ускоренное прохождение фаз
развития и эволюционно закрепленное их выпадение.
Закон Харди–Вайнберга – закон, формулирующийся следующим
образом: в идеальной популяции соотношение частот генов и генотипов
доминантных и рецессивных гомозигот, гетерозигот является постоянной
величиной из поколения в поколение.
Закрытая рамка считывания – разновидность рамки считывания,
при которой в иРНК содержатся кодоны преждевременной терминации, не
позволяющие ей трансформироваться в белок.
Замена оснований вращением – вариант трансверсии, при котором в
обеих цепочках спаренных оснований разрываются их связи с сахарами (при
сохранении
водородной
связи
между
самими
основаниями),
затем
происходит поворот этой пары оснований и восстановление связи с
сахарами.
Запаздывающая (отстающая) цепь ДНК – вновь синтезируемая
цепь ДНК, комплементарная лидирующей цепи.
Затравка – см. праймер.
Z-тест – статистический тест, используемый в молекулярной
эволюции для определения достоверности результатов селекционных тестов
в случае значительной длины сравниваемых последовательностей.
Скачать