Д Дальтон – единица измерения массы вещества, равная 1,661 x 10–24 г, используемая для измерения массы вирусов, клеток, хромосом, митохондрий, рибосом, а также молекул ДНК, РНК и белков. Дарвинизм – теория, согласно которой основными факторами эволюции органического мира являются изменчивость, наследственность, борьба за существование и естественный отбор. Двухкратно вырожденная серия кодонов – серия кодонов, состоящая из двух синонимичных триплетов. Двухкратно вырожденный сайт – нуклеотидный сайт, в котором одна из трех возможных замен является синонимичной. Двухшаговая замена – замена двух из трех нуклеотидов в кодоне. Делеция – хромосомная мутация, заключающаяся в выпадении части хромосомы, размером от нескольких нуклеотидных пар до нескольких генов. Бывает интеркалярная и терминальная (дефишенси). Дем – локальная, географически изолированная и небольшая по численности популяция, которая существует внутри вида в течение жизни одного или двух поколений, а затем объединяется с другими подобными популяциями. Денатурация – конформационное изменение биологической макромолекулы, приводящее к необратимой или обратимой утрате ее способности к выполнению определенной биологической функции. Дендрограмма (кладограмма, филогенетическое дерево, филограмма) – ветвящаяся диаграмма, отражающая родственные связи между таксонами или генетическими макромолекулами и представляющая попытку изобразить в историческом времени их истинные ветвления от предковых форм. Дефишенси – хромосомная мутация (разновидность делеции), заключающаяся в выпадении терминальной части хромосомы, размером от нескольких нуклеотидных пар до нескольких генов. Дивергенция – расхождение в ходе эволюции признаков и свойств у первоначально филогенетически близких групп организмов, возникающее под действием естественного отбора. Дивергенция последовательностей – процент различий между последовательностями нуклеотидов двух связанных сегментов ДНК или между последовательностями аминокислот двух связанных полипептидных цепей. Димер – молекула, состоящая из двух мономерных субъединиц. Дискретность – свойство гена, заключающееся в том, что он состоит из множества триплетов нуклеотидов. Дискретные методы – группа методов построения дендрограмм непосредственно по нуклеотидным или аминокислотным последовательностям, а не с коэффициентами их сходства, полученными на основе эволюционных дистанций. Дистальные гены – гены, расположенные в хромосоме на достаточно далеком расстоянии. Дистанционно–матричные методы – группа методов построения дендрограмм, в основе которых лежит принцип объединения наименее отличающихся последовательностей или групп последовательностей на основании коэффициентов их сходства. Дистанция Гришина – эволюционная дистанция между аминокислотным последовательностям, учитывающая вариацию скорости замен в сайтах в соответствии с гамма распределением, а также частые взаимные замены аргинина на лизин в процессе эволюции. Дистанция Грэнтсема – дистанция, предназначенная для оценки физико-химических различий взаимозаменяемых аминокислот и учитывающая три параметра: полярность, объем аминокислот и состав аминокислот (отношение атомных масс неуглеродных атомов, входящих в концевые группы или кольца, к атомным массам углеродов боковой цепи). Дистанция Джонса-Тэйлора-Торнтона – эволюционная дистанция между аминокислотными последовательностями, вычисленная с помощью одноименной матрицы. Дистанция Джукса–Кантора – эволюционная дистанция между нуклеотидными последовательностями, вычисленная одноименным методом. Дистанция аминокислотными Дэйхофф – эволюционная последовательностями, дистанция вычисленная с между помощью одноименной матрицы. Дистанция Кимуры – эволюционная дистанция между аминокислотными или нуклеотидными последовательностями, вычисленная одноименным методом. Дистанция состава – см. композиционная дистанция. Дистанция Тадзимы–Ней – эволюционная дистанция между нуклеотидными последовательностями, вычисленная одноименным методом. Дистанция Тамуры – эволюционная дистанция между нуклеотидными последовательностями, вычисленная одноименным методом. Дистанция Тамуры–Ней – эволюционная дистанция между нуклеотидными последовательностями, вычисленная одноименным методом. Дифференция дистанций – селекционный тест, заключающийся в сравнении и вычислении разницы значений несинонимичной и синонимичной дистанций, рассчитанных с помощью различных методов. ДНК – нуклеиновая кислота, мономером которой является нуклеотид, состоящий из азотистого основания (А, Г, Ц, Т), дезоксирибозы и остатка фосфорной кислоты. ДНК–полимераза – фермент, осуществляющий репликацию ДНК. ДНК-лигаза – фермент, осуществляющий соединение фрагментов вновь синтезированной цепи ДНК при репликации и репарации. Доза гена – количество копий данного гена в геноме. Домен – участок молекулы белка, имеющий надвторичную структуру, и выполняющий определенную функцию. Доминантный аллель – преобладающий аллель, фенотипически проявляющийся в гомо- и гетерозиготном состоянии при условии полного доминирования. Дрейф генов (генетико-автоматические процессы) – случайные колебания частот генов в малых популяциях. Дуплет кодонов – два кодона из шестикратно вырожденных серий, отличающиеся друг от друга нуклеотидами в третьем положении. Дупликация – хромосомная мутация, заключающаяся в удвоении участка хромосомы. Е Единица эволюционного времени – единица, равная времени (в млн. лет), необходимому для осуществления дивергенции последовательностей на 1%. Естественный отбор – постоянно протекающий в природе процесс, в ходе которого отбираются наиболее приспособленные к данным условиям существования особи и элиминируются наименее приспособленные. ЕIM–дистанция – эволюционная дистанция между аминокислотными последовательностями, вычисленная на основании модели равных вставок. З Закон Долло (закон необратимости эволюции) – закон, постулирующий необратимость эволюционного процесса в пределах одной видовой ветви. Закон Геккеля-Мюллера (биогенетический закон) – закон, формулирующийся следующим образом: онтогенез есть краткое и быстрое повторение (в закономерно измененном и сокращенном виде) филогенеза. Закон последовательности прохождения фаз развития - биологический закон, согласно которому фазы развития природной системы могут следовать лишь в эволюционно закрепленном порядке от относительно простого к сложному, а также возможно ускоренное прохождение фаз развития и эволюционно закрепленное их выпадение. Закон Харди–Вайнберга – закон, формулирующийся следующим образом: в идеальной популяции соотношение частот генов и генотипов доминантных и рецессивных гомозигот, гетерозигот является постоянной величиной из поколения в поколение. Закрытая рамка считывания – разновидность рамки считывания, при которой в иРНК содержатся кодоны преждевременной терминации, не позволяющие ей трансформироваться в белок. Замена оснований вращением – вариант трансверсии, при котором в обеих цепочках спаренных оснований разрываются их связи с сахарами (при сохранении водородной связи между самими основаниями), затем происходит поворот этой пары оснований и восстановление связи с сахарами. Запаздывающая (отстающая) цепь ДНК – вновь синтезируемая цепь ДНК, комплементарная лидирующей цепи. Затравка – см. праймер. Z-тест – статистический тест, используемый в молекулярной эволюции для определения достоверности результатов селекционных тестов в случае значительной длины сравниваемых последовательностей.