И.А. Дятлов - Современные схемы диагностики бактериальных

. .
2015
,
.

1.
:
,
,
,
2.
,
.

1.
2.
2
:
2015
,
,
.
-
.
,
,
,
-
3
2015
1.
2.
-
-
-
-
4.
3.
5.
-
-
4
2015
–
–
5
2015
-
–
.
1
.
,
, RPMI,
–
,
.
:
–
.
:
.
2015
.
.
.
.
.
.
.
6
6
2015
(-)
(+)
Э
E. coli
Pseudomonas aeruginosa
7
Bacillus
Bac. antracis
Bac. subtilis
Bac.cereus
(var.antracoides)
,
.antracis
8
8
2015
Э
ЗЦ
ЗЦ
ЗЦ
2015
я4
ООО«
Э
Э
Э
–
–
-
9
26.09.2013
.
2015
я»

,

,
.C
.
.
.
.

Э
,
.
.
),
ё ,
ё ,
–
(
,
,
(
,
)
ё ,
,
)
(
,
(
,

.


.
10
2015
,
).
AmpC, OXA;
:
TEM, SHV, CTX-M,
VIM, IMP, KPC, OXA-48, NDM1;
(
)
-
,
(
(
,
.;
cmlA1, AdeR
OmpK36, OmpA;
)
-
-
-
NDM1
-
)
(
)
(
11
,
qnrA, qnrB, qnrS;
)
-
(
:
:
(
:
-
)
)
2015
:
-

-
(3




2016
–
12
;
,
(3-5
,
…


)
-
–
-S
)
–
–
-
,
2015
(
)
–
,
.
P. aeruginosa
,
.
.
(-)
,
13
,
.
–
:
.

,
-,
,
.

,
,
50%
.

.


.
14
.
–
2015
–




,
-
,
,




15
-
(
(
,
)–
)
-
(
)
.
2015
.
–
«
–
».
.
–
.(
Чувствительность для гриппа
гобычно около тлад


и
- 59%–93%
сновная
задача
–
поэтапная
замена
иммуносуспензионных тестов на более чувствительные
и удобные. Хранение 2 года при комн. температуре.
пробированы для С Э .
16
–1
10-20
)
1.
«
-
2.
3.
4.
5.
6.
7.
8.
9.
10.
17
-
1
V.cholerae O1»
«
-
cholerae tox+»
«
L.pneumophila 1».
«
spp.»
–
F1».
.
–
.
Listeria
«
.
-
H. influenzae
b,
S. pneumoniae,
N. meningitidis
A,
W 135.
4.
.
5.
.
1»
-
–
B,
я
.
, .
«
Legionella Pneumophila
V. 2.
«
Listeria monocytogenes»
3.
1.
-
я–
р
2015
«

,
»)


.
(1 %
.
.
.
342
178(!)
.
32
,
15000
.
282
416
.
18
2015
-
–
.
,,
,
,
.
,
(
19
)
(
).
-
.
\
.
ELISA,
RT(
-1
– 25
1
)
,
.,
-
.
100000
.
20
2015
1.
-
-
(
-
-
(
-
2.
«IPCR-BoNT/A»)
3.
4.
-
-
(
(
-
-
)
-
- )
E. coli O157: 7
«IPCR- E.COLI O157:H7»).
Listeria
(
«IPCR - L.
5.
monocytogenes
MONOCYTOGENES»).
-
6.
aeruginosa
AERUGINOSA»).
21
-
(
-
Pseudomonas
«IPCR - P.
2015
–
,
in vitro
.
•
•
•
.
.
FcIgG
-
«
-
»
.
22
2015
TTCTGAGTCTGACCTTACAGTCAGTCAA
TCATGGGACATACGAAAT
,
-
E. coli O157:H7
2012
E.coli O157:H7,
.
23
-
.
2015
100
.
1.
:
Bacillus anthracis (
-1
).
(
)
(
2.
(
3.
-2BF).
,
Escherichia coli
,
Staphylococcus aureus
(
24
)
«
-
»)
2015
(MALDI-TOF MS)

99%,
(
98%

93%).
,
(+)
30
,
.
,
,
.
Intens. [a.u.]

- 97%,
8000
«
»
6000
.
4000
2000
25
0
2000
4000
6000
8000
10000
12000
-

-


,

Luminex

26
2015
–

-
.
.
/

50
.
,
27
-
,
5-
,
2015
,
RT-PCR
O
В
ль М ш
Y. pestis
ь
П л
ль
.
ь
Yp_ypo2088_up
cga-gta-ggg-tta-ggt-ggg
Yp_ypo2088_low
ccg-tcc-aat-gca-tgt-tag-acc-a
Yp_ypo2088_Pr_up (ROX)tc-cat-ttc-atg-gcg-gta-ata-tcg-gga-(RTQ2)
B. anthracis
F. tularensis
28
sspE_up
agc-aaa-cgc-aca-atc-aga-ag
sspE_low
acg-tct-gtt-tca-gtt-gca-aat-tct-gta-cc
sspE_Pr_up
(FAM)ct-ggt-gct-agc-att-caa-agc-aca-aat-gct-BHQ1)
ISFtu5_up
gcc-gtg-tga-act-tta-ctt-tgg-t
ISFtu5_low
tcc-tcg-tgt-aca-gag-cga-atc
ISFtu5_Pr_up2
(R6G)ac-ggt-cgt-tgt-gta-aaa-atc-aac-cac-atc-(RTQ2)
2015
Francisella tularensis
Э
,
Chi1f
F. tularensis:
1–11 – GeneRulerTM 100 bp
Plus DNA Ladder;
2 – subsp. holarctica 15;
3 – subsp. holarctica 503;
4 – subsp. holarctica bv.
japonica Miura;
5 – subsp. holarctica bv.
japonica Jasoe;
6 – subsp. tularensis 8859;
7 – subsp. tularensis Schu;
8 – subsp. mediasiatica 120;
9 – subsp. mediasiatica 117;
10 – subsp. novicida Utah 112
29
.
.
2015
104: 4
(
-
,
).
(
В
з
30
).
з
з
я
я..
з
з
И я
я
www.obolensk.org
2015
«
-O104»
16Sr
RNA
pVCD
43332
stx 2
rfb104
fliCH4
31
 1, 5 – E.coli O104:H4
(
)
 2
– E.coli O104:H12
 3
– E.coli O157:H7
 4
– E.coli O104:H12
+ E.coli O157:H7
 L–
. .
2015
104: 4
 157 7
,
.
 104 4

Ampicillin R
Amoxicillin/
Clavulanic acid R
Piperacillin/
Sulbactam R
Piperacillin/
Tazobactam R*
Chloramphenicol S
Tetracyclin R
Streptomycin R
Cefuroxim R
Nalidixinsäure R
Cefuroxim-Axetil R
Ciprofloxacin S
Gentamicin S
32
Cefoxitin R
Cefotaxim R
Cetfazidim R
Cefpodoxim R
Imipenem S
Meropenem S
Amikacin S
Kanamycin S
Tobramycin S
Norfloxacin S
Nitrofurantoin S
Trimethoprim/
Sulfamethoxazol R
Fosfomycin S
-
E.coli –
.
104 4
2015
STEC
1.
2.
3.
4.
E.coli O157:H7
-
157),
104),
-
-
E.coli O157:H7 ( Э
-
-
E.coli O104:H4 ( Э
5.
E.coli
6.
-
157
104
(STEC MULTI-FL)
E.coli O157:H7
O104:H4
7.
O157:H7
D4
8.
9.
10.
(
-
-
«Э
157»
E.coli
E.coli
STEC-
O104:H4
E. coli O157: 7
«IPCR- E.COLI O157:H7»)
E.coli O157:H7
33
2015
-
2013
(
)
1
2
85-50
5 1-1
61-58
3
15573
EHEC2
– stx2, eae, rfb157, flicH7
(IonTorrent PFG) – MLST-
C
C
- eae, rfb157
– stx2+,
– MLST-
Stx2 typeC –
157 (+),
E.Coli O157:H7
,
34
157 +
Ы
MLST – 1
TW05359
Stx2 typeC.
E.Coli STEC
,
-
-
stx2 typeC
Staphylococcus aureus
(10% NaCl)
(
coaMLST-, agr-
SCCmec–
-
)
, spa-
-
(
Э
A
mec
16
ccr
SCCmec
Э
D, E
Э
.
14
j-
MALDI Biotyper
35
:
-
SCCmec
MRSA)
mecA
SCCmec
,
-
-
nuc, coa, femA –
S. aureus S. epidermidis
B
A
B,
A, B, C,
.
S. aureus
-
10
Staphylococcus
2012-2015 .
aureus,
, 2013
-
, 2014
, 2014
, 2014
-
, 2014
, 2014
,
-
2013, 2014
2015
,
, 2014
2012,2014,
2015
36
2015
,
, spa-
,
:
CC30, t2509, sea, tst





CC30, t122, sea, tst
CC12, t888, seb
CC15, t084, LukED
-
,
,
,
.
CC5, t002, sea, tst
CC22, t156, sec
37
,
2015
-
2013-2014
,
2013
30
t2509
-
,
2014
2014
12 t888
,
S 22
t156
,
2014
2014
2014
38
-
30 t122
5 t002
1
Э -A
Э -B
Э -C
Э -A
Э -A
Э -
223 (7
.
)
363
72
2
16
+
+
2 (1
+
)
145
38
+
+
378
58
+
+
46
2
+
1006
339
, spa-
,
Ё
–
2014 - CC15, t084, eta
2013 - CC15, t084 eta
2014 - CC8, t211, eta, MRSA
.
2015 - CC121, eta
2012 - CC121, t272 eta, etb
2014 - CC12, t156
2015 – CC15, eta; CC121, eta, etb
39
2015
Ё
,
,
S. aureus
.,
2012
.,
2013
2014
.
.
40
121 t272
Э
B
Э
15 t084
.
Э
8 t211
,
.
MRSA
12 t156
.
12 t084
.
№2
15
121
.
121
14
20
19
22
Э
.
27
.
2014
2015
,
.,
2014
2014
,
MRSA
.
Э
B
Э
.
67
52

S. ureus
30.


S. ureus ,
6-

, , ,
.
,
.
ё
4


,
41
, . .
S. ureus.
S. ureus MRSA CC8 t211 ,
.
,
2015
B.anthracis
NEW
NEW
2 .
NEW
NEW
6-8 . MP PCR RT
NEW
NEW
ИХ-тесты
1. Споры
егетат.
2.
.
.
ИХ-тест
NEW
15-20
.
PCR
NEW
егетативн.
NEW
MLVA, SNP,
NEW
NEW
R1 - 24 .
42
MALDI-TOF
MS - 3
ИХ-тесты
1. Споры
2.
егетат.
-
,
-
4-16 . «Obolensk R1» 24 .
2015