Шенкарев З.О. - Институт биоорганической химии

Сведения о научной работе Шенкарева З.О.
за период (2010 г. 2015 г.)
Публикации в рецензируемых журналах:
1. Shenkarev ZO, Lyukmanova EN, Paramonov AS, Shingarova LN, Chupin VV, Kirpichnikov
MP, Blommers MJJ, Arseniev AS. Lipid-Protein Nanodiscs as Reference Medium in
Detergent Screening for High-Resolution NMR Studies of Integral Membrane Proteins.
J.Am.Chem.Soc. (2010) 132(16):5628-5629
2. Shenkarev ZO, Paramonov AS, Lyukmanova EN, Shingarova LN, Yakimov SA, Dubinny
MA, Chupin VV, Kirpichnikov MP, Blommers MJJ, Arseniev AS. NMR Structural and
Dynamic Investigation of the Isolated Voltage-Sensing Domain of the potassium channel
KvAP: Implications for Voltage-Gating. J.Am.Chem.Soc. (2010) 132(16):5630-5637
3. Shenkarev ZO, Finkina EI, Nurmukhamedova EK, Balandin SV, Mineev KS, Nadezhdin
KD, Yakimenko ZA, Tagaev AA, Temirov YV, Arseniev AS, Ovchinnikova TV. Isolation,
structure elucidation, and synergistic antibacterial activity of a novel two-component
lantibiotic lichenicidin from Bacillus licheniformis VK21. Biochemistry. (2010)
49(30):6462-72.
4. Е.Н. Люкманова, М.А. Шулепко, З.О. Шенкарев, Д.А. Долгих, М.П. Кирпичников.
Продукция in vitro «трех-петельных» нейротоксинов из яда змей с высоким
содержанием дисульфидных связей. Проблемы и решения. Биоорг. хим. (2010), 36(2),
147-156.
5. Н.Ф. Хабибуллина, Е.Н. Люкманова, Г.С. Копеина, З.О. Шенкарев, А.С. Арсеньев,
Д.А. Долгих, М.П. Кирпичников. Разработка и оптимизация сопряженной
бесклеточной системы синтеза трансмембранного домена рецепторной тирозинкиназы
ErbB3. Биоорг. химия (2010), 36(5): 654–660.
6. Deev S., Shenkarev Z.O., Shestakova T., Chupakhin O., Rusinov V., Arseniev A. Selective
15N-Labeling and Analysis of 13C-15N J Couplings as an Effective Tool for Studying the
Structure and Azide-Tetrazole Equilibrium in a Series of Tetrazolo[1,5-b][1,2,4]triazines and
Tetrazolo[1,5-a]pyrimidines. J. Org. Chem. (2010) 75(24):8487-97.
7. С. Л. Деев, Т. С. Шестакова, О. С. Ельцов, И. А. Халымбаджа, А.А. Мусихина, З. О.
Шенкарев, М.И. Кодесс, В. Л. Русинов, О. Н. Чупахин “Синтез противовирусного
препарата «триазавирин» меченного изотопами 15N и 2H”. Статья в книге: Актуальные
проблемы органического синтеза и анализа. Институт органического синтеза УрО
РАН, Отпечатано в типографии “Уральский центр академического обслуживания”
Екатеринбург 2010. всего страниц 338, стр 3-8.
8. E.N. Lyukmanova, Z.O. Shenkarev, M.A. Shulepko, K.S. Mineev, D. D’Hoedt, I.E.
Kasheverov, S. Filkin, H. Janickova, V. Dolezal, D.A. Dolgikh, A.S. Arseniev, D. Bertrand,
V.I. Tsetlin, M.P. Kirpichnikov. NMR structure and action on nicotinic acetylcholine
receptors of water-soluble domain of human lynx1. J Biol Chem. (2011) 286(12):10618-27.
9. Shenkarev ZO, Balandin SV, Trunov KI, Paramonov AS, Sukhanov SV, Barsukov LI,
Arseniev AS, Ovchinnikova TV. Molecular Mechanism of Action of β-Hairpin
Antimicrobial Peptide Arenicin: Oligomeric Structure in Dodecylphosphocholine Micelles
and Pore Formation in Planar Lipid Bilayers. Biochemistry. (2011) 50(28):6255-65.
10. Т. С. Шестакова, И. А. Халымбаджа, С. Л. Деев, О. С. Ельцов, В. Л. Русинов, З. О.
Шенкарев, А. С. Арсеньев, О. Н. Чупахин “Синтез противовирусного препарата
«триазавирин» меченного изотопами 2H и 15N” Известия Академии наук. Серия
химическая, (2011) № 4 714-717
11. E.N. Lyukmanova, Z.O. Shenkarev, N.F. Khabibullina, G.S. Kopeina, M.A. Shulepko, A.S.
Paramonov, K.S. Mineev, R.V. Tikhonov, L.N. Shingarova, L.E. Petrovskaya, D.A. Dolgikh,
A.S. Arseniev, and M.P. Kirpichnikov. «Lipid-protein nanodiscs for cell-free production of
integral membrane proteins in a soluble and folded state: comparison with detergent micelles,
bicelles and liposomes» BBA – Biomembranes, 2012, 1818, 349–358
12. Е.Н. Люкманова, З.О. Шенкарев, Н.Ф. Хабибуллина, Д.С. Кульбацкий, М.А. Шулепко,
Л.Е. Петровская, А.С. Арсеньев, Д.А. Долгих, М.П. Кирпичников. «N-концевые
партнеры для эффективной продукции рецепторов сопряженных с G-белками в
бактериальных бесклеточных системах» (2012) Acta Naturae, Т. 4(15): 59-66.
13. Shenkarev ZO, Panteleev PV, Balandin SV, Gizatullina AK, Altukhov DA, Finkina EI,
Kokryakov VN, Arseniev AS, Ovchinnikova TV. Recombinant expression and solution
structure of antimicrobial peptide aurelin from jellyfish Aurelia aurita. Biochem Biophys Res
Commun. (2012) 429:63-9.
14. М.А. Шулепко, Е.Н. Люкманова, А.С. Парамонов, А.А. Лобас, З.О. Шенкарев, И.Е.
Кашеверов, В.И. Цетлин, Д.A. Долгих, A.С. Арсеньев, М.П. Кирпичников
"Нейромодулятор SLURP-1 человека: бактериальная продукция, взаимодействие с
мышечным
никотиновым
ацетилхолиновым
рецептором,
структура
и
конформационная гетерогенность в растворе" (2013) Биохимия, Т. 78(2): 276-285.
15. Shenkarev ZO, Lyukmanova EN, Butenko IO, Petrovskaya LE, Paramonov AS, Shulepko
MA, Nekrasova OV, Kirpichnikov MP, Arseniev AS. Lipid-protein nanodiscs promote in
vitro folding of transmembrane domains of multi-helical and multimeric membrane proteins.
BBA – Biomembranes, 2013, 1828, 776-784
16. Z.O. Shenkarev, A.S. Paramonov, E.N. Lyukmanova, A.K. Gizatullina, A.V. Zhuravleva,
A.A. Tagaev, Z.A. Yakimenko, I.N. Telezhinskaya, M.P. Kirpichnikov, T.V. Ovchinnikova,
and A.S. Arseniev. “Peptaibol Antiamoebin I Spatial Structure, Backbone Dynamics,
Interaction with Bicelles and Lipid-Protein Nanodiscs, and Pore Formation in Context of
Barrel-Stave Model.” Chem Biodivers. (2013). 10(5):838-63.
17. Lyukmanova EN, Shulepko MA, Buldakova SL, Kasheverov IE, Shenkarev ZO,
Reshetnikov RV, Filkin SY, Kudryavtsev DS, Ojomoko LO, Kryukova EV, Dolgikh DA,
Kirpichnikov MP, Bregestovski PD, Tsetlin VI. Ws-LYNX1 Residues Important for
Interaction with Muscle-Type and/or Neuronal Nicotinic Receptors. (2013) J Biol Chem.
288(22):15888-15899.
18. Gizatullina AK, Finkina EI, Mineev KS, Melnikova DN, Bogdanov IV, Telezhinskaya IN,
Balandin SV, Shenkarev ZO, Arseniev AS, Ovchinnikova TV. Recombinant production and
solution structure of lipid transfer protein from lentil Lens culinaris. Biochem Biophys Res
Commun. (2013) 439(4):427-32.
19. Shestakova TS, Shenkarev ZO, Deev SL, Chupakhin ON, Khalymbadzha IA, Rusinov VL,
Arseniev AS. Long-range 1H-15N J couplings providing a method for direct studies of the
structure and azide-tetrazole equilibrium in a series of azido-1,2,4-triazines and
azidopyrimidines. J Org Chem. (2013) 78(14):6975-82.
20. И. А. Халымбаджа, Т. С. Шестакова, С. Л. Деев, В. Л. Русинов, О. Н. Чупахин, З. О.
Шенкарев, А. С. Арсеньев. Константы спин-спинового взаимодействия 13С—15N и
1H—15N в исследовании азидо-тетразольной таутомерии в ряду 2 азидопиримидинов.
Известия Академии наук. Серия химическая, 2013, № 2, 519-526
21. Шенкарев З.О., Люкманова Е.Н., Парамонов А.С., Пантелеев П.В., Баландин С.В.,
Шулепко М.А., Минеев К.С., Овчинникова Т.В., Кирпичников М.П., Арсеньев A.С.
“Липид-белковые нанодиски: новые возможности для структурно-функциональных
исследований водорастворимых мембраноактивных пептидов” Acta naturae (2014)
6:68-78.
22. Shenkarev Z.O., Gizatullina A.K., Finkina E.I., Alekseeva E.A., Balandin S.V., Mineev K.S.,
Arseniev A.S., Ovchinnikova T.V. Heterologous expression and solution structure of
defensin from lentil Lens culinaris. Biochem Biophys Res Commun. (2014) 451(2):252-257
23. Е. Н. Люкманова, М. А. Шулепко, М. Л. Бычков, З. О. Шенкарев, А. С. Парамонов, А.
О. Чугунов, A. С. Арсеньев, Д. А. Долгих, М. П. Кирпичников. Белки человека SLURP1 и SLURP-2, действующие на никотиновые ацетилхолиновые рецепторы, замедляют
пролиферацию клеток колоректальной аденокарциномы HT-29. (2014), Acta Naturae,
6(4): 58-65.
24. Berkut AA, Peigneur S, Myshkin MY, Paramonov AS, Lyukmanova EN, Arseniev AS,
Grishin EV, Tytgat J, Shenkarev ZO, Vassilevski AA. Structure of Membrane-Active Toxin
from Crab Spider Heriaeus melloteei Suggests Parallel Evolution of Sodium Channel Gating
Modifiers in Araneomorphae and Mygalomorphae. J Biol Chem. (2015) 90(1):492-504.
25. Lyukmanova EN, Shenkarev ZO, Shulepko MA, Paramonov AS, Chugunov AO, Janickova
H, Dolejsi E, Dolezal V, Utkin YN, Tsetlin VI, Arseniev AS, Efremov RG, Dolgikh DA,
Kirpichnikov MP. Structural Insight into Specificity of Interactions between Nonconventional Three-Finger Toxin WTX and Muscarinic Acetylcholine Receptors. J Biol
Chem. 2015 Aug 4. pii: jbc.M115.656595. [Epub ahead of print] PubMed PMID: 26242733.
Патенты и патентные заявки:
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
Aзизбекян РР, Овчинникова ТВ, Арсеньев АС, Рубин АБ, Кузнецова НИ, Тагаев АА,
Шенкарев ЗО, Погосян СИ, Кузин АИ, Трунов КИ, Якименко ЗА. Пептидный
антибиотик бактериального происхождения латероцин, подавляющий развитие
микроскопических водорослей. Патент РФ №2430966 от 10.10.2011
Овчинникова ТВ, Арсеньев АС, Баландин СВ, Нурмухамедова ЭК, Тагаев АА,
Темиров ЮВ, Финкина ЕИ, Шенкарев ЗО, Якименко ЗА. Пептид LanA2, выделенный
из бактерии Bacillus licheniformis VK21, обладающий антимикробным действием //
Патент РФ №2408604 от 12.08.2010
Овчинникова ТВ, Арсеньев АС, Баландин СВ, Нурмухамедова ЭК, Тагаев АА,
Темиров ЮВ, Финкина ЕИ, Шенкарев ЗО, Якименко ЗА Пептид LanA1, выделенный
из бактерии Bacillus licheniformis VK21, обладающий антимикробным действием //
Патент РФ №2408732 от 16.08.2010
Люкманова Е.Н., Шулепко М.А., Тихонов Р.В., Кашеверов И.Е., Цетлин В.И.,
Шенкарев З.О., Долгих Д.А., Кирпичников М.П. Рекомбинантная плазмидная ДНК
pET22b(+)/вд-Линкс1, кодирующая белок со свойствами Линкс1, и штамм бактерий
Escherichia coli BL21(DE3)/pET22b(+)/вд-Линкс1 – продуцент белка со свойствами
Линкс1 человека. Патент РФ № 2404246 от 20.11.2010.
Люкманова Е.Н., Шенкарев З.О., Кирпичников М.П., Арсеньев А.С. Способ
ренатурации мембранных белков. Патент РФ № 2500684 от 10.12.2013
Люкманова Е.Н., Хабибуллина Н.Ф., Шулепко М.А., Кульбацкий Д.С., Шенкарев
З.О., Долгих Д.А., Кирпичников М.П. Способ получения рекомбинантных белков в
бесклеточных системах синтеза. Патентная заявка РФ № 2012133162(052591) от
02.08.2012
Люкманова Е.Н., Шулепко М.А., Шенкарев З.О., Долгих Д.А., Кирпичников М.П.
Рекомбинантная плазмидная ДНК pET22b(+)/Сларп-2, кодирующая белок Сларп-2, и
штамм бактерий Escherichia coli BL21(DE3)/pET22b(+)/Сларп-2 – продуцент белка
Сларп-2 человека Заявка на патент РФ №2015109082(014406) от 16.03.2015г.
Тезисы докладов:
1. Трунов К.И., Шенкарев З.О., Парамонов А.С., Баурин П.В., Баландин С.В., Арсеньев
А.С., Овчинникова Т.В. «Исследование пространственной структуры и динамики
мембрано-активного антимикробного пептида ареницина-2 в воде и в мицеллах DPC
методами ЯМР-спектроскопии» XXII зимняя молодежная научная школа
«Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии»,
Москва, 2010, стр. 53.
2. Z.О. Shenkarev, E.N. Lyukmanova, A.S. Arseniev. Lipid-protein nanodiscs in highresolution NMR studies of integral membrane proteins and membrane active peptides.
EUROMAR 2010, Magnetic Resonance Conference, Florence, Italy, (2010), р. 247.
3. E.N. Lyukmanova, G.S. Kopeina, N.F. Khabibullina, Z.O. Shenkarev, A.S. Paramonov, K.S.
Mineev, A.S. Arseniev, D.A. Dolgikh, M.P. Kirpichnikov. Cell-Free Production of
Membrane Proteins for NMR Studies. EUROMAR 2010, Magnetic Resonance Conference,
Florence, Italy, (2010), р. 211.
4. K.I. Trunov, Z.O. Shenkarev, A.S. Paramonov, P.V. Baurin, S.V. Balandin, T.V.
Ovchinnikova, A.S. Arseniev “Spatial Structure and Backbone Dynamics of Asymmetric
Dimer of β-Hairpin Antimicrobial Peptide Arenicin-2 in Membrane Mimicking
Environment” EUROMAR 2010, Magnetic Resonance Conference, Florence, Italy, (2010),
р. 407.
5. M.A. Shulepko, E.N. Lyukmanova, R.V. Tikhonov, A.S. Paramonov, Z.O. Shenkarev, A.S.
Arseniev, I.E. Kasheverov, D.A. Dolgikh, V.I. Tsetlin, M.P. Kirpichnikov. Production,
mutagenesis and NMR-study of non-conventional toxin WTX from Naja kaouthia. 35 FEBS
Congress, Goteborg, Sweden. (2010)
6. Шенкарев З.О., Парамонов А.С., Люкманова Е.Н.. Шингарова Л.Н., Арсеньев А.С.
Исследование изолированного вольт-сенсорного домена К+ канала KvAP в мицеллах
детергентов и липид-белковых нанодисках методами ЯМР-спектроскопии. XVIII
Международный Симпозиум Новые информационные технологии в медицине,
биологии, фармакологии и экологии, Гурзуф, Украина (2010), стр. 98-100.
7. Люкманова Е.Н., Шулепко М.А., Кашеверов И.Е., Шенкарев З.О., Минеев К.С.,
Филькин С.Я., Долгих Д.А.. Кирпичников М.П. Структурно-функциональные
исследования механизмов молекулярного действия эндогенного нейромодулятора
человека lynx1. XVIII Международный Симпозиум Новые информационные
технологии в медицине, биологии, фармакологии и экологии, Гурзуф, Украина (2010)
8. A.S. Arseniev, E.V. Bocharov, Z.O. Shenkarev, K.S. Mineev, A.S. Paramonov. Structure and
dynamics of bitopic and politopic membrane helical proteins. EUROMAR 2010, Magnetic
Resonance Conference, Florence, Italy, (2010), р. 19.
9. Алтухов Д.А., Трунов К.И., Гизатуллина А.К., Шенкарев З.О., Баландин С.В.,
Арсеньев А.С., Овчинникова Т.В. Исследование пространственной структуры
мембраноактивного пептида аурелина методами ЯМР-спектроскопии. 53-я научная
конференция МФТИ, 2010 год.
10. Шенкарев З.О. «Структура и функции антимикробных пептидов» (2010, 23 ноября)
Лекция на пленарном заседании 5-ой школы «Молекулярная биофизика и
биотехнология» на факультете молекулярной и биологической физики МФТИ в
рамках научной школы для молодежи «Использование научного и образовательного
потенциала национальных исследовательских университетов для обновления научных
и научно-педагогических кадров в области естественных наук». 2010 год.
11. E.N. Lyukmanova, N.F. Khabibullina, L.N. Shingarova, L.E. Petrovskaya, Z.O. Shenkarev,
A.S. Arseniev, D.A. Dolgikh, M.P. Kirpichnikov. LARGE-SCALE CELL-FREE
PRODUCTION OF MEMBRANE PROTEINS. (2011). 2nd Russian-Hellenic Symposium
with International Participation and Young Scientist’s School «Biomaterials and
nanobiomaterials: recent problems and safety issues». p. 46
12. Z.O. Shenkarev, E.N. Lyukmanova, A.S. Paramonov, A.S. Arseniev. LIPID-PROTEIN
NANODISCS – PROMISING MEDIUM FOR STABILIZATION IN SOLUTION AND
STRUCTURE-FUNCTIONAL STUDIES OF MEMBRANE BIOMOLECULES. (2011). 2nd
Russian-Hellenic Symposium with International Participation and Young Scientist’s School
«Biomaterials and nanobiomaterials: recent problems and safety issues». p. 46
13. А.П. Криволапова, Е.Н. Люкманова, З.О. Шенкарёв, М.А. Шулепко, И.Е. Кашеверов,
Д.А. Долгих, А.С. Арсеньев, В.И. Цетлин, М.П. Кирпичников. Структурнофункциональные исследования нейромодулятора lynx1 человека. XXIII Зимняя
международная молодежная научная школа «Перспективные направления физикохимической биологии и биотехнологии», Москва, Россия, (2011)
14. Алтухов Д.А., Трунов К.И., Гизатуллина А.К., Шенкарев З.О., Баландин С.В.,
Арсеньев А.С., Овчинникова Т.В. ИССЛЕДОВАНИЕ ПРОСТРАНСТВЕННОЙ
СТРУКТУРЫ АНТИМИКРОБНОГО ПЕПТИДА АУРЕЛИНА МЕТОДАМИ ЯМРСПЕКТРОСКОПИИ. XXIII Зимняя международная молодежная научная школа
«Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии»,
Москва, Россия, (2011)
15. Гизатуллина А.К., Минеев К.С., Шенкарев З.О., Финкина Е.И., Арсеньев А.С.,
Овчинникова Т.В. ИССЛЕДОВАНИЕ ПРОСТРАНСТВЕННОЙ СТРУКТУРЫ
ДЕФЕНСИНА
Lc-def
ИЗ
СЕМЯН
ЧЕЧЕВИЦЫ
МЕТОДАМИ
ЯМРСПЕКТРОСКОПИИ. XXIII Зимняя международная молодежная научная школа
«Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии»,
Москва, Россия, (2011)
16. Гизатуллина А.К, Богданов И.В, Минеев К.С, Шенкарев З.О, Мельникова
Д.Н,Финкина Е.И, Баландин С.В, Арсеньев А.С, Овчинникова Т.В. «Исследование
пространственной структуры липидтранспортирующего белка Lc-LTP2 из семян
чечевицы методами ЯМР-спектроскопии» 54-я научная конференция МФТИ (2011)
17. Алтухов Д.А., Арсеньев А.С., Люкманова Е.Н., Парамонов А.С., Шенкарев З.О.
«Исследование взаимодействия токсина VSTx1 с вольт-сенсорным доменом
потенциалозависимого К+ канала KvAP методами ЯМР-спектроскопи» 54-я научная
конференция МФТИ (2011)
18. A.S. Paramonov, Z.O. Shenkarev, D.A. Altukhov, E.N. Lyukmanova, L.N. Shingarova, A.S.
Arseniev. Investigation of the Structure and Dynamics of the Isolated Voltage-Sensing
Domain of the K+ channel KvAP by NMR: Implications for Voltage-Gating. 36 FEBS
Congress, Torino, Italy. (2011) FEBS JOURNAL 278(1) SI p.472
19. T.V. Ovchinnikova, Z.O. Shenkarev, S.V. Balandin, K.I. Trunov, A.S. Paramonov, , S.V.
Sukhanov, L.I. Barsukov, A.S. Arseniev. Oligomeric structure in DPC micelles and pore
formation in planar lipid bilayers give the insight into molecular mechanism of antimicrobial
action of β-hairpin peptide arenicin. 36 FEBS Congress, Torino, Italy. (2011) FEBS
JOURNAL 278(1) SI p.124
20. Shulepko M, Lyukmanova E, Shenkarev Z, Mineev K, D'Hoedt D, Kasheverov, I, Filkin S,
Krivolapova A, Janickova H, Dolezal V, Dolgikh D, Arseniev A, Bertrand D, Tsetlin V,
Kirpichnikov M. Structure-functional investigations and mechanism of action of watersoluble domain of human Lynx1. 36 FEBS Congress, Torino, Italy. (2011) FEBS JOURNAL
278(1) SI p. 129
21. N.F. Khabibullina, E.N. Lyukmanova, Z.O. Shenkarev, A.S. Paramonov, K.S. Mineev, A.S.
Arseniev, D.A. Dolgikh, M.P.Kirpichnikov. Different approaches for effective cell-free
synthesis of integral membrane proteins with different topologies in a soluble form. 36 FEBS
Congress, Torino, Italy. (2011) FEBS JOURNAL 278(1) SI p. 112
22. А.С. Арсеньев, Э.В. Бочаров, З.О. Шенкарев, К.С. Минеев, А.С. Парамонов, К.Д.
Надеждин, О.В. Бочарова, Е.Н. Люкманова, М.П. Кирпичников. Структурная биология
мембранных белков. V Российский симпозиум «Белки и пептиды», Петрозаводск,
Россия, (2011). Стр. 44.
23. Lyukmanova, E.N., Shenkarev, Z.O., Shulepko, M.A., Mineev, K.S., D’Hoedt, D.,
Kasheverov, I.E., Filkin, S.Y., Krivolapova, A.P., Janickova, H., Dolezal, V., Dolgikh, D.A.,
Arseniev, A.S., Bertrand, D., Tsetlin, V.I., Kirpichnikov, M.P. WATER-SOLUBLE
DOMAIN OF HUMAN LYNX1: NMR STRUCTURE, ACTION ON ACETYLCHOLINE
RECEPTORS AND COMPARISON WITH THREE-FINGER NEUROTOXINS. 23rd
Biennial Meeting of the International Society for Neurochemistry, Athens, Greece. (2011) J.
Neurochem., 118(suppl.1), р. 60-61.
24. Shenkarev, Z.O., Chugunov, A.O., Balandin, S.V., Panteleev, P.V., Altukhov, D.A., Trunov,
K.I., Gizatullina, A.K., Kokryakov, V.N., Efremov, R.G.,Arseniev, A.S.,Ovchinnikova, T.V.
MEMBRANE-ACTIVE PEPTIDE AURELIN FROM JELLYFISH AURELIA AURITA
COULD ACT AS A K+ CHANNEL BLOCKER. NMR AND COMPUTER MODELING
STUDY. 23rd Biennial Meeting of the International Society for Neurochemistry, Athens,
Greece. (2011) J. Neurochem., 118(suppl.1), р. 80.
25. Tsetlin, V.I., Utkin, Y.N., Kasheverov, I.E., Shelukhina, I.V., Lyukmanova, E.N., Shenkarev,
Z.O., Filkin, S.Y., Bertrand, D. EXOGENOUS TOXINS AND ENDOGENOUS
PROTOTOXINS INTERACTING WITH NICOTINIC ACETYLCHOLINE RECEPTORS.
23rd Biennial Meeting of the International Society for Neurochemistry, Athens, Greece.
(2011) J. Neurochem., 118(suppl.1), р. 261.
26. Е.Н. Люкманова, Н.Ф. Хабибуллина, З.О. Шенкарев, А.С. Арсеньев, Д.А. Долгих, М.П.
Кирпичников. БЕСКЛЕТОЧНАЯ ПРОДУКЦИЯ МЕМБРАННЫХ БЕЛКОВ В
СИСТЕМЕ ТРАНСКРИПЦИИ-ТРАНСЛЯЦИИ. XIX Международный Симпозиум
Новые информационные технологии в медицине, биологии, фармакологии и экологии,
Гурзуф, Украина (2011), Стр. 302-303.
27. З.О. Шенкарев, Е.Н.Люкманова, А.С. Парамонов, А.С. Арсеньев. ЛИПИД-БЕЛКОВЫЕ
НАНОДИСКИ – ПЕРСПЕКТИВНАЯ СРЕДА ДЛЯ СТАБИЛИЗАЦИИ В РАСТВОРЕ И
СТРУКТУРНО-ФУНКЦИОНАЛЬНЫХ
ИССЛЕДОВАНИЙ
ИНТЕГРАЛЬНЫХ
МЕМБРАННЫХ БЕЛКОВ И МЕМБРАНОАКТИВНЫХ ПЕПТИДОВ. XIX
Международный Симпозиум Новые информационные технологии в медицине,
биологии, фармакологии и экологии, Гурзуф, Украина (2011), Стр. 304-305.
28. М.А. Шулепко, Е.Н. Люкманова, А.А. Лобас, З.О. Шенкарев, А.А.Парамонов, И.Е.
Кашеверов, Д.А. Долгих, М.П. Кирпичников. БАКТЕРИАЛЬНАЯ ПРОДУКЦИЯ
БЕЛКА SLURP1, АЛЛОСТЕРИЧЕСКОГО МОДУЛЯТОРА НИКОТИНОВОГО
АЦЕТИЛХОЛИНОВОГО РЕЦЕПТОРА ЧЕЛОВЕКА. XIX
Международный
Симпозиум Новые информационные технологии в медицине, биологии, фармакологии
и экологии, Гурзуф, Украина (2011)
29. Шестакова T.С., Деев С.Л., Чупахин O.Н., Русинов В.Л. Шекарев З.O., Арсеньев A.С.
КОНСТАНТЫ СПИН-СПИНОВОГО ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ 13С-15N – НОВЫЙ
ПОДХОД В ИССЛЕДОВАНИИ СТРУКТУРЫ ТЕТРАЗОЛОВ И АЗИДОТЕТРАЗАЛЬНОГО РАВНОВЕСИЯ. XIX Менделеевский съезд по общей и прикладной
химии, Волгоград, Сентябрь 2011.
30. Шенкарев З.О. «Липид-белковые нанодиски: новые возможности для биомедицинских
приложений» 5-ая Биотехнологическая выставка-ярмарка РосБиоТех-2011, Пленарный
доклад
на
Международной
научно-практической
конференции:
“НАНОБИОМАТЕРИАЛЫ:
СОВРЕМЕННЫЕ
ДОСТИЖЕНИЯ
И
ТОКСИКОЛОГИЧЕСКИЕ ВОПРОСЫ БЕЗОПАСНОСТИ» Стр. 33.
31. Алтухов Д.А., Парамонов А.С., Шенкарев З.О., Люкманова Е.Н., Шингарова Л.Н.,
Арсеньев А.С., Овчинникова Т.В. «Исследование взаимодействия токсина VSTx1 с
вольт-сенсорным доменом потенциалозависимого K+ канала KvAP методами ЯМРспектроскопии» Научная конференция по биоорганической химии и биотехнологии “X
чтения памяти академика Юрия Анатольевича Овчинникова” Москва-Пущино. 2011,
Том. 1, стр. 5.
32. Гизатуллина А.К., Богданов И.В., Минеев К.С., Шенкарёв З.О., Мельникова Д.Н.,
Финкина Е.И., Баландин С.В., Арсеньев А.С., Овчинникова Т.В. «ПОЛУЧЕНИЕ И
ИССЛЕДОВАНИЕ ПРОСТРАНСТВЕННОЙ СТРУКТУРЫ РЕКОМБИНАНТНЫХ
ЛИПИД-ТРАНСПОРТИРУЮЩИХ БЕЛКОВ ЧЕЧЕВИЦЫ» Научная конференция по
биоорганической химии и биотехнологии “X чтения памяти академика Юрия
Анатольевича Овчинникова” Москва-Пущино. 2011, Том. 1, стр. 15.
33. Парамонов А.С., Шенкарев З.О., Люкманова Е.Н., Арсеньев А.С. «СТРУКТУРНЫЕ
ИССЛЕДОВАНИЯ МЕМБРАННЫХ БЕЛКОВ И МЕМБРАНОАКТИВНЫХ
ПЕПТИДОВ В СОСТАВЕ ЛИПИД-БЕЛКОВЫХ НАНОДИСКОВ» Научная
конференция по биоорганической химии и биотехнологии “X чтения памяти
академика Юрия Анатольевича Овчинникова” Москва-Пущино. 2011, Том. 2, стр. 51.
34. Хабибуллина
Н.Ф.,
Люкманова
Е.Н.,
Шенкарев
З.О.
«МЕМБРАНОМОДЕЛИРУЮЩИЕ СРЕДЫ ДЛЯ БЕСКЛЕТОЧНОЙ ПРОДУКЦИИ
МЕМБРАННЫХ БЕЛКОВ: МИЦЕЛЛЫ ДЕТЕРГЕНТОВ, БИЦЕЛЛЫ, ЛИПОСОМЫ И
ЛИПИД-БЕЛКОВЫЕ НАНОДИСКИ» Научная конференция по биоорганической
химии и биотехнологии “X чтения памяти академика Юрия Анатольевича
Овчинникова” Москва-Пущино. 2011, Том. 2, стр. 73.
35. V.I. Tsetlin, E.N. Lyukmanova, Z.O. Shenkarev, M.A. Shulepko, K.S. Mineev, D. D’Hoedt,
I.E. Kasheverov, S.Yu. Filkin, A.P. Krivolapova, H. Janickova, V. Dolezal, D. A. Dolgikh,
A.S. Arseniev, D. Bertrand, V.I. Tsetlin, M.P. Kirpichnikov. Common features and
differences between the snake venom neurotoxins and prototoxin Lynx1 in their spatial
structures and action on nicotinic acetylcholine receptors. Nicotinic Acetylcholine Receptors
2011. A Wellcome Trust Scientific Conference. 2011, 18-21 May, Cambridge, UK.
36. Z.O. Shenkarev, E.N. Lyukmanova, A.S. Paramonov, A.S. Arseniev. Lipid-protein
nanodiscs: alternative tool for production, stabilization, structure-functional studies and
delivery of membrane biomolecules. 3rd Russian-Hellenic Symposium with International
Participation and Young Scientist’s School «Biomaterials and nanobiomaterials: recent
problems and safety issues». 2012, p.36.
37. E.N. Lyukmanova, M.A. Shulepko, I.O. Butenko, Z.O. Shenkarev, A.S. Paramonov, D.A.
Dolgikh, M.P. Kirpichnikov. CELL-FREE PRODUCTION OF VOLTAGE-SENSING
DOMAIN FROM HUMAN NAV1.4 CHANNEL FOR FUNCTIONAL AND
STRUCTURAL STUDIES. 3rd Russian-Hellenic Symposium with International
Participation and Young Scientist’s School «Biomaterials and nanobiomaterials: recent
problems and safety issues». 2012
38. Н.Ф.Хабибуллина, Е.Н.Люкманова, М.А.Шулепко, Д.С.Кульбацкий, З.О.Шенкарев,
Д.А.Долгих, М.П.Кирпичников. “Бесклеточная продукция мембранных белков: новые
возможности для медицины будущего”, Научная конференция “Молекулярная и
клеточная биология: прикладные аспекты”, Москва, 2012 г., стр.41-42
39. Д.С. Кульбацкий, Н.Ф. Хабибуллина, М.А. Шулепко, З.О. Шенкарев, Е.Н. Люкманова,
Д.А. Долгих. Рекомбинантная продукция мускаринового ацетилхолинового рецептора
человека, белка семейства GPCR, в функционально активной форме. Научная
конференция “Молекулярная и клеточная биология: прикладные аспекты”, Москва,
2012 г., стр.18-19.
40. Д.С. Кульбацкий, Н.Ф. Хабибуллина, М.А. Шулепко, З.О. Шенкарев, Е.Н. Люкманова,
Д.А. Долгих. Рекомбинантная продукция мускаринового ацетилхолинового рецептора
человека, белка семейства GPCR, в функционально активной форме. XXIV Зимняя
международная молодежная научная школа «Перспективные направления физикохимической биологии и биотехнологии», Москва, Россия, (2012).
41. З.О.Шенкарев, Липид-белковые нанодиски: новые возможности для структурнофункциональных исследований мембранных белков. XXIV Зимняя международная
молодежная научная школа «Перспективные направления физико-химической
биологии и биотехнологии», Москва, Россия, (2012)
42. Гизатуллина А.К, Богданов И.В, Минеев К.С, Шенкарев З.О, Мельникова Д.Н,
Финкина Е.И, Баландин С.В, Арсеньев А.С, Овчинникова Т.В. «Пространственная
структура рекомбинантого липид-транспортирующего белка из семян чечевицы Lens
culinaris” XXIV Зимняя международная молодежная научная школа «Перспективные
направления физико-химической биологии и биотехнологии», Москва, Россия, (2012)
43. Алтухов Д.А., Парамонов А.С., Шенкарев З.О., Шингарова Л.Н., Люкманова Е.Н.,
Арсеньев
А.С.,
«Механизм
взаимодействия
вольт-сенсорного
домена
потенциалозависимого K+ канала KvAP с токсином VSTx1 в мицеллах DPC/LDAO»
XXIV Зимняя международная молодежная научная школа «Перспективные
направления физико-химической биологии и биотехнологии», Москва, Россия, (2012)
44. T.V. Ovchinnikova, Z.O. Shenkarev, S.V. Balandin, P.V. Panteleev, E.I. Finkina, A.S.
Paramonov, D.A. Altukhov, A.K. Gisatulina, V.N. Kokryakov, A.S. Arseniev “Novel
antimicrobial peptides from marine invertebrates” New Antimicrobials Project 2nd
Workshop: “New Compounds & New Strategies for Antimicrobials” University of Trieste,
Italy, 25-26.5.2012
45. М.Ю. Мышкин, А.К. Гизатуллина, З.О. Шенкарев, А.С. Парамонов, Е.Н. Люкманова,
М.А. Шулепко, А.С. Арсеньев. "Исследование пространственной структуры
фрагментов β2-адренергического рецептора методом гетероядерной ЯМРспектроскопии". Научная школа-конференция "Методы магнитного резонанса в
современной физике: теория и практическое использование", Долгопрудный, Россия
(2012).
46. Гизатуллина А.К., Минеев К.С., Шенкарев З.О. , Финкина Е.И., Арсеньев А.С.,
Овчинникова Т.В. - Исследование пространственной структуры дефенсина Lc-def из
семян чечевицы семейства Lens culinaris методами ЯМР-спектроскопии. 55
Конференция МФТИ, Долгопрудный, Россия(2012)
47. Гизатуллина А.К., Минеев К.С., Шенкарев З.О. , Финкина Е.И., Арсеньев А.С.,
Овчинникова Т.В. - Исследование пространственной структуры дефенсина Lc-def из
семян чечевицы семейства Lens culinaris методами ЯМР-спектроскопии. Научная
школа-конференция "Методы магнитного резонанса в современной физике: теория и
практическое использование", Долгопрудный, Россия (2012).
48. Шенкарев З.О. «Мембраноактивные антимикробные пептиды - прототипы новых
антибиотических препаратов» пленарная лекция на Всероссийской молодежной
научной школе «Проблемы медицинской биоинформатики» в рамках фестиваля науки
на факультете молекулярной и биологической физики МФТИ и 55-й Конференции
МФТИ, Долгопрудный, Россия, 2012.
49. Деев С. Л., Шестакова Т.С., Халымбаджа И.А., Русинов В.Л., Шенкарев З.О.,
Арсеньев А.С., Чупахин О.Н. «Включение изотопов 15N в структуру азоло[5,1c][1,2,4]триазинов и азоло[1,5-a]пиримидинов как подход в исследовании строения и
химических трансформаций полиазотистых гетероциклов // Всероссийская
конференция «Органический синтез: химия и технология», Сборник тезисов У-16,
Екатеринбург, 2012.
50. М.Ю. Мышкин, А.К. Гизатуллина, З.О. Шенкарев, А.С. Парамонов, Е.Н. Люкманова,
М.А. Шулепко, А.С. Арсеньев. "Исследование пространственной структуры
фрагментов β2-адренергического рецептора методом гетероядерной ЯМРспектроскопии". XXV Зимняя международная молодежная научная школа
«Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии»,
Москва, Россия, (2013).
51. З.О. Шенкарев. "Липид-белковые нанодиски – перспективная среда для ренатурации и
структурно-функциональных исследований мембранных белков". XXV Зимняя
международная молодежная научная школа «Перспективные направления физикохимической биологии и биотехнологии», Москва, Россия, (2013).
52. А.C. Парамонов, З.О. Шенкарев, Е.Н. Люкманова, Л.Н. Шингарова, А.С. Арсеньев
«Проблема формирования пространственной структуры мембранных белков in vitro:
ЯМР спектроскопия как способ «визуализации» интермедиатов фолдинга». XXV
Зимняя международная молодежная научная школа «Перспективные направления
физико-химической биологии и биотехнологии», Москва, Россия, (2013).
53. M. Shulepko, E. Lyukmanova, A. Paramonov, M. Myshkin, Z. Shenkarev, A. Arseniev, D.
Dolgikh, M. Kirpichnikov. Cell-Free Production and NMR-study of Voltage-Sensing
Domain of human Nav 1.4. 38 FEBS Congress, St.Peterburg, Russia. (2013)
54. Арсеньев А.С., Минеев К.С., Парамонов А.С., Надеждин К.Д., Дубинный М.А.,
Лессовой Д.М., Бочаров Э.В., Шенкарев З.О., Гончарук С.А., Бочарова О.В. ЯМР
взгляд на спираль-спиральные взаимодействия в трансмебранных белках и их влияние
на функцию. VI Российский Симпозиум «Белки и пептиды», Уфа, 2013.
55. Шулепко М.А., Люкманова Е.Н., Шенкарев З.О., Парамонов А.С., Минеев К.С.,
Кудрявцев Д.Ю., Кашеверов И.Е., Чугунов А.О., Арсеньев А.С., Ефремов Р.Г., Цетлин
В.И., Долгих Д.А., Кирпичников М.П.. «Эндогенные нейромодуляторы человека
LYNX1 и SLURP1: новые аспекты молекулярного действия». XXVI Зимняя
международная молодежная научная школа «Перспективные направления физикохимической биологии и биотехнологии», Москва, Россия, (2014) стр. 100.
56. А.C. Парамонов, З.О. Шенкарев, Е.Н. Люкманова, М.А. Шулепко, Л.Н. Шингарова,
А.С. Арсеньев «Исследование механизмов регуляции работы потенциалозависимых
ионных каналов методами спектроскопии ЯМР». XXVI Зимняя международная
молодежная научная школа «Перспективные направления физико-химической
биологии и биотехнологии», Москва, Россия, (2014) стр. 19.
57. М.Ю. Мышкин, Е.Н. Люкманова, А.С. Парамонов, М.А. Шулепко, Д.С. Кульбацкий,
А.А. Беркут, А.А. Василевский, З.О. Шенкарев, М.П. Кирпичников, А.С. Арсеньев.
«Исследование пространственной структуры потенциалочувствительного домена из 2й псевдосубъединицы канала Nav1.4 человека». XXVI Зимняя международная
молодежная научная школа «Перспективные направления физико-химической
биологии и биотехнологии», Москва, Россия, (2014) стр. 32.
58. Гизатуллина А.К., Минеев К.С., Богданов И.В., Шенкарёв З.О., Мельникова Д.Н.,
Финкина Е.И., Баландин С.В., Арсеньев А.С., Овчинникова Т.В. «Исследование
структуры липид-транспортирующего белка Lc-LTP2 из семян чечевицы Lens culinaris
в комплексе с молекулами лизолипида LPPG методами ЯМР-спектроскопии» XXVI
Зимняя международная молодежная научная школа «Перспективные направления
физико-химической биологии и биотехнологии», Москва, Россия, (2014) стр. 9.
59. Гизатуллина А.К., Шенкарев З.О., Парамонов А.С., Мышкин М.Ю., Якименко З.A.,
Фикина Е.И., Овчинникова Т.B., Арсеньев А.С. «ПРОСТРАНСТВЕННАЯ
СТРУКТУРА И МЕХАНИЗМ ДИМЕРИЗАЦИИ В МЕМБРАНОПОДОБНОМ
ОКРУЖЕНИИ ПЕПТИДНОГО АНТИБИОТИКА ЛАТЕРОЦИДИНА.» XXII
Международная Конференция Новые информационные технологии в медицине,
биологии, фармакологии и экологии, Гурзуф, Украина (2014), Стр. 69-70.
60. Paramonov A.S. Shenkarev Z.O. Lyukmanova E.N. Shingarova L.N. Shulepko M.A.
Kirpichnikov M.P. Arseniev A.S. «NMR study of the interaction between voltage-sensing
domain of potassium KvAP channel with gating modifier toxin VSTx1» EUROMAR 2014,
Abstracts. Zurich, Switzerland, р. 311.
61. Z. Shenkarev, D. Kulbatskii1, A. Paramonov, E. Lyukmanova, M. Myshkin, M. Shulepko,
M. Kirpichnikov, A. Arseniev «NMR investigation of isolated voltage-sensing domain of
human Nav1.4 channel in detergent micelles» EUROMAR 2014, Abstracts. Zurich,
Switzerland, р. 308.
62. Z. Shenkarev, E. Lyukmanova, A. Paramonov, M. Shulepko, K. Mineev, S. Balandin, P.
Panteleev, T. Ovchinnikova, M. Kirpichnikov, A. Arseniev «Lipid-protein nanodiscs provide
environment for structure-functional studies of water-soluble membrane-active peptides»
EUROMAR 2014, Abstracts. Zurich, Switzerland, р. 314.
63. E. Lyukmanova, Z. Shenkarev, A. Paramonov, A. Berkut, M. Myshkin, E. Grishin, A.
Arseniev, A. Vassilevski «Spatial structure and interaction with phospholipid membranes of
a sodium channel gating modifier toxin Hm-3» EUROMAR 2014, Abstracts. Zurich,
Switzerland, р. 317.
64. М.Ю. Мышкин, А.С. Парамонов, З.О. Шенкарев, Д.С. Кульбацкий, Е.Н. Люкманова,
А.А. Беркут, А.А. Василевский, А.С. Арсеньев «Исследование пространственной
структуры и мембранной активности токсина Hm-3 из яда паука Heriaeus melloteei».
Доклад на XXI международной научной конференции студентов аспирантов и
молодых ученых «Ломоносов – 2014», Москва, Россия (2014), стр 59.
65. M.Yu. Myshkin, E.N. Lyukmanova, A.S. Paramonov, D.S. Kulbatskii, M.A. Shulepko, A.S.
Arseniev, Z.O. Shenkarev «Divide and conquer approach to structural NMR studies of
voltage-gated sodium channels». Biomembranes 2014, Dolgoprudny, Russia (2014) p127128.
66. Paramonov A.S., Shenkarev Z.O., Shingarova L.N., Lyukmanova E.N., ArsenievA.S.
«Structural and thermodynamic characteristics of membrane protein folding process by NMR
spectroscopy» Biomembranes 2014, Dolgoprudny, Russia (2014) p134-135.
67. Gizatullina A.K., Myshkin M.Yu., Paramonov A.S., Shulepko M.A., Lyukmanova E.N.,
Shenkarev Z.O., Arseniev A.S. «Cell-free production and NMR study of the isolated TMhelical fragments from the human β2-adrenergic receptor» Biomembranes 2014,
Dolgoprudny, Russia (2014) p101-102.
68. A.S.Paramonov, E.N.Lyukmanova, Z.O.Shenkarev, M.Yu. Myshkin, D.S.Kulbatskii,
M.A.Shulepko, M.P.Kirpichnikov, A.S.Arseniev, Structural NMR study of the isolated
voltage- sensing domain from the second pseudosubunit of human sodium channel Nav1.4 ,
FEBS Journal 281 (Suppl. 1) (2014) p382, FEBS-EMBO Conference 2014, Paris, France
69. E. N. Lyukmanova, Z. O. Shenkarev, A. S. Paramonov, M. A. Shulepko, K. S. Mineev, T. V.
Ovchinnikova, M. P. Kirpichnikov, A. Arseniev «Lipid–protein nanodiscs open new
possibilities for NMR study of the interactions between water-soluble peptides and lipid
membranes» FEBS Journal 281 (Suppl. 1) (2014) p201-202, FEBS-EMBO Conference 2014,
Paris, France
70. D. Kulbatskii, E. N. Lyukmanova, Z. Shenkarev, M. A. Shulepko, D. Dolgikh, M. P.
Kirpichnikov «New N-terminal fusion tags for milligram-scale cell-free production of
GPCRs» FEBS Journal 281 (Suppl. 1) (2014) p205, FEBS-EMBO Conference 2014, Paris,
France
71. M. A. Shulepko, A. S. Paramonov, Z. O. Shenkarev, K. S. Mineev, D. S. Kudryavtsev, I. E.
Kasheverov, M. S. Thomsen, A. Arseniev, D. A. Dolgikh, V. I. Tsetlin, M. P. Kirpichnikov,
E. N. Lyukmanova «Endogenous human neuromodulators Lynx1 and Slurp1: structure,
function and mechanism of action» FEBS Journal 281 (Suppl. 1) (2014) p279, FEBS-EMBO
Conference 2014, Paris, France
72. Z. O. Shenkarev, E. N. Lyukmanova, A. S. Paramonov, L. N. Shingarova, M. A. Shulepko,
M. P. Kirpichnikov, A. Arseniev «Molecular mechanism of the interaction between gating
modifier toxin VSTx1 and voltage-sensing domain of potassium KvAP channel revealed by
NMR spectroscopy» FEBS Journal 281 (Suppl. 1) (2014) p377, FEBS-EMBO Conference
2014, Paris, France
73. A. Berkut, M. Myshkin, S. Peigneur, A. S. Paramonov, E. N. Lyukmanova, Z. Shenkarev, J.
Tytgat, A. Arseniev, E. Grishin, A. Vassilevski «Structure and function of a sodium channel
gating modifier from the crab spider Heriaeus melloteei» FEBS Journal 281 (Suppl. 1)
(2014) p382, FEBS-EMBO Conference 2014, Paris, France
74. З.О. Шенкарев «Липид-белковые нанодиски - многофункциональная среда для
бесклеточной продукции, ренатурации и структурно-функциональных исследований
мембранных белков и пептидов» Международная конференция по биоорганической
химии, биотехнологии и бионанотехнологии, посвященная 55-летию Института
биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова
Российской академии наук и 80-летию со дня рождения академика Ю.А. Овчинникова,
Москва, Россия (2014).
75. А.К. Гизатуллина, З.О. Шенкарев, А.С. Парамонов, М.Ю. Мышкин, З.A. Якименко,
Е.И. Финкина, Т.B. Овчинникова, А.С. Арсеньев «Исследование структуры и
механизма димеризации пептидного антибиотка латероцидина методами ЯМРспектроскопии» Международная конференция по биоорганической химии,
биотехнологии
и
бионанотехнологии,
посвященная
55-летию
Института
биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова
Российской академии наук и 80-летию со дня рождения академика Ю.А. Овчинникова,
Москва, Россия (2014) Acta naturae, Спецвыпуск № 1, 2014, стр 21.
76. Д.С. Кульбацкий, М.А. Шулепко, Е.Н. Люкманова, З.О. Шенкарев, М.П. Кирпичников
«Продукция нейротоксина VSTx1 в бесклеточной белоксинтезирующей системе»
Международная конференция по биоорганической химии, биотехнологии и
бионанотехнологии, посвященная 55-летию Института биоорганической химии им.
академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук и 80летию со дня рождения академика Ю.А. Овчинникова, Москва, Россия (2014) Acta
naturae, Спецвыпуск № 1, 2014, стр 33.
77. Kudryavtsev DS, Buldakova SL, Shulepko MA, Paramonov AS, Shenkarev ZO, Mineev KS,
Kasheverov IE, Arseniev AS, Dolgikh DA, Kirpichnikov MP, Bregestovski PD,
Lyukmanova EN, Tsetlin VI «Binding sites for Lynx1 and SLURP1, endogenous modulators
of neuronal and non-neuronal nicotinic receptors» 4th International Symposium on Nonneuronal Acetylcholine, 3rd Annual Meeting of the LOEWE-Research Focus Non-neuronal
Cholinergic Systems. Giessen, August 28-30, 2014, p 62.
78. З.О. Шенкарев «Потенциал-зависимые катионные каналы: от структуры отдельных
доменов до механизмов работы и регуляции» XXVII Зимняя международная
молодежная научная школа «Перспективные направления физико-химической
биологии и биотехнологии», Москва, Россия, (2015).
Список грантов, научных контрактов и договоров, в выполнении которых
участвовал претендент, с указанием его конкретной роли.
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
8.
Грант Президента РФ «Молодой Кандидат» № МК-8404.2010.4 «Липид-белковые
нанодиски – перспективная среда для ренатурации и структурно-функциональных
исследований мембранных белков и мембраноактивных пептидов». Роль претендента:
Руководитель
Проект РФФИ №10-04-01752 «Реконструированные липопротеиновые частицы
высокой плотности – среда для ренатурации и структурных исследований
интегральных мембранных белков и мембраноактивных пептидов». Роль претендента:
Руководитель
Проект РФФИ № 14-04-01270 «Исследование молекулярных механизмов
взаимодействия пептидных лигандов с мембранными рецепторами в средах на основе
липид-белковых нанодисков». Роль претендента: Руководитель
Программа Президиума РАН “Молекулярная и клеточная биология” (2007 г.— по
настоящее время) Роль претендента: Ответственный исполнитель.
Программа Президиума РАН “Молекулярная и клеточная биология” Грант на новые
группы (2015-2016 гг) Роль претендента: Руководитель.
Государственный контракт №02.740.11.0298 от 07.07.2009 тема: «Физикохимическое исследование взаимодействия антимикробных биомолекул с клеточными
мембранами». Роль претендента: Ответственный исполнитель.
Государственный контракт № 8043 от 20.07.2012 «Физико-химическое исследование
взаимодействия биологически активных пептидов с клеточными мембранами». Роль
претендента: Ответственный исполнитель.
Государственный контракт № 8789 от 04.10.2012 «Биоинженерия и структурнофункциональные исследования потенциалочувствительных доменов К+ каналов –
мишеней для терапии заболеваний сердечнососудистой и нервной систем человека»
Роль претендента: Руководитель.
Сведения о личном участии претендента в научных мероприятиях
1. Пленарные устные доклады на конференциях:







Шенкарев З.О. «Структура и функции антимикробных пептидов» Лекция на
пленарном заседании 5-ой школы «Молекулярная биофизика и биотехнология» на
факультете молекулярной и биологической физики МФТИ в рамках научной школы
для молодежи «Использование научного и образовательного потенциала
национальных исследовательских университетов для обновления научных и научнопедагогических кадров в области естественных наук». 2010 год.
Шенкарев З.О. «Липид-белковые нанодиски: новые возможности для биомедицинских
приложений» 5-ая Биотехнологическая выставка-ярмарка РосБиоТех-2011, Пленарный
доклад
на
Международной
научно-практической
конференции:
“НАНОБИОМАТЕРИАЛЫ:
СОВРЕМЕННЫЕ
ДОСТИЖЕНИЯ
И
ТОКСИКОЛОГИЧЕСКИЕ ВОПРОСЫ БЕЗОПАСНОСТИ».
Шенкарев З.О. «Мембраноактивные антимикробные пептиды - прототипы новых
антибиотических препаратов» пленарная лекция на Всероссийской молодежной
научной школе «Проблемы медицинской биоинформатики» в рамках фестиваля науки
на факультете молекулярной и биологической физики МФТИ и 55-й Конференции
МФТИ, Долгопрудный, Россия, 2012.
З.О.Шенкарев, Липид-белковые нанодиски: новые возможности для структурнофункциональных исследований мембранных белков. XXIV Зимняя международная
молодежная научная школа «Перспективные направления физико-химической
биологии и биотехнологии», Москва, Россия, (2012)
З.О. Шенкарев. "Липид-белковые нанодиски – перспективная среда для ренатурации и
структурно-функциональных исследований мембранных белков". XXV Зимняя
международная молодежная научная школа «Перспективные направления физикохимической биологии и биотехнологии», Москва, Россия, (2013).
З.О. Шенкарев «Липид-белковые нанодиски - многофункциональная среда для
бесклеточной продукции, ренатурации и структурно-функциональных исследований
мембранных белков и пептидов» Пленарный доклад на Международной конференции
по биоорганической химии, биотехнологии и бионанотехнологии, посвященная 55летию Института биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А.
Овчинникова Российской академии наук и 80-летию со дня рождения академика Ю.А.
Овчинникова, Москва, Россия (2014).
З.О. Шенкарев «Потенциал-зависимые катионные каналы: от структуры отдельных
доменов до механизмов работы и регуляции» XXVII Зимняя международная
молодежная научная школа «Перспективные направления физико-химической
биологии и биотехнологии», Москва, Россия, (2015).
2. Секционные устные доклады на конференциях:



Шенкарев З.О., Парамонов А.С., Люкманова Е.Н.. Шингарова Л.Н., Арсеньев А.С.
Исследование изолированного вольт-сенсорного домена К+ канала KvAP в мицеллах
детергентов и липид-белковых нанодисках методами ЯМР-спектроскопии. XVIII
Международный Симпозиум Новые информационные технологии в медицине,
биологии, фармакологии и экологии, Гурзуф, Украина (2010), стр. 98-100.
Z.O. Shenkarev, E.N. Lyukmanova, A.S. Paramonov, A.S. Arseniev. LIPID-PROTEIN
NANODISCS – PROMISING MEDIUM FOR STABILIZATION IN SOLUTION AND
STRUCTURE-FUNCTIONAL STUDIES OF MEMBRANE BIOMOLECULES. (2011).
2nd Russian-Hellenic Symposium with International Participation and Young Scientist’s
School «Biomaterials and nanobiomaterials: recent problems and safety issues». p. 46
З.О. Шенкарев, Е.Н.Люкманова, А.С. Парамонов, А.С. Арсеньев. ЛИПИД-БЕЛКОВЫЕ
НАНОДИСКИ – ПЕРСПЕКТИВНАЯ СРЕДА ДЛЯ СТАБИЛИЗАЦИИ В РАСТВОРЕ И

СТРУКТУРНО-ФУНКЦИОНАЛЬНЫХ
ИССЛЕДОВАНИЙ
ИНТЕГРАЛЬНЫХ
МЕМБРАННЫХ БЕЛКОВ И МЕМБРАНОАКТИВНЫХ ПЕПТИДОВ. XIX
Международный Симпозиум Новые информационные технологии в медицине,
биологии, фармакологии и экологии, Гурзуф, Украина (2011), Стр. 304-305.
Z.O. Shenkarev, E.N. Lyukmanova, A.S. Paramonov, A.S. Arseniev. Lipid-protein
nanodiscs: alternative tool for production, stabilization, structure-functional studies and
delivery of membrane biomolecules. 3rd Russian-Hellenic Symposium with International
Participation and Young Scientist’s School «Biomaterials and nanobiomaterials: recent
problems and safety issues». 2012, p.36.
Педагогическая деятельность:
1. Под руководством Шенкарева З.О. были выполнены 3 бакалаврских и 4 магистерских
работы.
Бакалавры: Алтухов Д.А. (2010), Бутенко И.О. (2011), Мышкин (2012)
Магистры: Соложенкин О.И. (2010), Гизатуллина А.К. (2011), Алтухов Д.А. (2012),
Мышкин (2014)
В 2014 году (13.11.2014.) Шенкаревым З.О. защищена диссертация «Структурнофункциональное состояние мембранных белков и мембраноактивных пептидов по данным
ЯМР-спектроскопии» на соискание ученой степени доктора физико-математических наук
по специальности 03.01.02 – биофизика».