Информационная таблица за период с 1.11. 11 по 1.11.12 .

Реклама
Информационная таблица за период с 1.11. 11 по 1.11.12 .
Лаборатория (группа): Цитометрии и Биокинетики
Раздел 1.
1. Число ВНЕШНИХ премий, наград, призовых мест, стипендий: __
1.
2.
3.
4.
Польщицин А.А,, Schlumberger company award 2012.
Польщицина И.В., стипендия Ученого Совета НГУ
Орлова Д.Ю., Премия для международных студентов. (2012 г., Университет им.
Масарика, г. Брно, Чехия).-Уровень международный.
Орлова Д.Ю., Победитель конкурса инновационных проектов Фонда содействия
развитию малых форм предприятий в научно-технической сфере по программе
"УМНИК" (2012 г., г. Новосибирск, Россия).-Уровень государственный.
2. Участие в Федеральных целевых программах, программах Президиума РАН, программах ОХНМ и др. отделений РАН, интеграционных программах СО РАН.
№
п/п
1
Организатор конкурса
Регистрационный номер
ФИО руководителя, организация
Чернышев А.В., ИХКГ
СО РАН
Сроки реализации
2010-2012
Министерство образования и науки Российской
Федерации
ФЦП №П1039
2
Министерство образования и науки Российской
Федерации
ФЦП №П422
Мальцев В.П., ИХКГ СО 2010-2012
РАН
3
Министерство образования и науки Российской
Федерации
ФЦП №14.740.11.0921
Чернышев А.В., ИХКГ
СО РАН
4
Министерство образования и науки Российской
Федерации
ФЦП №14.740.11.1194
Орлова Д.Ю., ИХКГ СО 2011-2012
РАН
5
Министерство образования и науки Российской
Федерации
ФЦП №14.740.11.1220
Строкотов Д.И., ИХКГ
СО РАН
2011-2012
6
Министерство образования и науки Российской
Федерации
ФЦП № 8804
Чернышев А.В., ИХКГ
СО РАН
2012-2013
7
Министерство образования и науки Российской
Федерации
ФЦП № 8752
Юркин М.А., ИХКГ СО
РАН
2012-2013
2011-2012
3. Число (кроме указанных в п. 2) ТЕКУЩИХ грантов __2__ , зарубежных контрактов ____, х/д ____
№
п/п
Организатор
конкурса
Регистрационный номер
ФИО руководителя, организация
Сроки реализации
1
РФФИ
№ 12-04-31083/12
Орлова Д.Ю., ИХКГ СО РАН
2012-2013
2
РФФИ
№ 12-04-00737/12
Мальцев В.П., ИХКГ СО РАН
2012-2014
4. Число защищенных докторских диссертаций: _
5. Число защищенных кандидатских диссертаций: __
1.
2.
3.
Строкотов Дмитрий Игоревич, Исследование оптических свойств мононуклеарных клеток, в том числе находящихся в процессе апоптоза, с целью их идентификации и характеризации по светорассеянию, 03.01.02. – биофизика, 2011 г. Учреждение Российской академии наук Института Биофизики Сибирского отделения
РАН, научный руководитель: к.ф.-м.н. Юркин Максим Александрович
Орлова
Дарья
Юрьевна,
КИНЕТИЧЕСКИЕ
ИССЛЕДОВАНИЯ
ПОВЕРХНОСТНЫХ И ВНУТРИКЛЕТОЧНЫХ ЛИГАНД-РЕЦЕПТОРНЫХ
ВЗАИМОДЕЙСТВИЙ С ПОМОЩЬЮ ПРОТОЧНОЙ ЦИТОМЕТРИИ И
ЛАЗЕРНОЙ СКАНИРУЮЩЕЙ МИКРОСКОПИИ, 03.01.02. – биофизика, 2011 г.
Учреждение Российской академии наук Института Биофизики Сибирского отделения РАН, научный руководитель: д.ф.-м.н. Мальцев Валерий Павлович
Orlova Darya Yurevna, Distribution function approach to kinetic study of ligandreceptor interactions by flow cytometry and confocal laser scanning microscopy, 2012,
Masaryk University, Brno, Czech Republic, PhD-thesis.
6. Число защищенных дипломов:_5_
1.
2.
3.
4.
5.
Польщицин А. А., Исследование оптических свойств агрегатов полимерных частиц и кинетики их формирования в реакциях агглютинации, степень магистра,
НГУ, д.ф.-м.н., профессор Мальцев В. П.
Польщицина Ирина Васильевна, Исследование изотонического гемолиза эритроцитов с помощью светорассеяния, на соискание степени магистра, НГУ, Чернышев А.В.
Москаленский Александр Ефимович, «Решение обратной задачи светорассеяния
для характеризации одиночных тромбоцитов с помощью сканирующего проточного цитометра», на соискание степени магистра физики, Новосибирский Государственный Университет, 2012 г., руководитель - д.ф.-м.н., профессор Мальцев
В.П.
Малых Наталья Юрьевна "Исследование кинетики морфологических изменений
ядер клеток HepG2 и лимфоцитов крови человека на начальных стадиях апоптоза"
на соискание степени бакалавра физики, Новосибирский Государственный Университет, 2012 г., руководитель – к.ф.-м.н. Орлова Д.Ю.
Чалов Игорь Александрович «Автоматизация управления положением струи в капилляре сканирующего проточного цитометра» на соискание степени бакалавра
физики, Новосибирский Государственный Университет, 2012 г., руководитель –
Гилев К.В.
7. Преподавание в ВУЗах:
1.
2.
3.
4.
5.
Гилев К.В. - "Информационные технологии в биомедицинских исследованиях",
ФФ НГУ, Кафедра биомедицинской физики, осенний семестр, продолжающийся
Гилев К.В. - "Информационные технологии в биомедицинских исследованиях",
ВКИ НГУ, Кафедра информационных технологий, весенний семестр, продолжающийся
Чернышев А.В., лекции, продолжающийся спецкурс "Биокинетика", осенний семестр, кафедра БиоМедФ, НГУ
Мальцев В.П., лекции, продолжающийся спецкурс «Измерения в биологии и медицине», два семестра, кафедра Биомедицинской физики НГУ
Некрасов В.М., лекции, продолжающийся спецкурс "Химическая кинетика и термодинамика", весенний семестр, кафедра БиоМедФ, НГУ
8. Официальное участие в ОРГАНИЗАЦИИ конференций и т.п.:
9. Организация и проведение экспедиций:
Раздел 2.
10. Опубликовано монографий, учебников и учебных пособий: _____
11. Опубликовано обзоров: ___
12. Патентов (получено): ___
13. Опубликовано препринтов: ____
14. Опубликовано научных статей в международных или зарубежных журналах: _4_
1.
2.
3.
4.
5.
K.V. Gilev, M.A. Yurkin, G.V. Dyatlov, A.V. Chernyshev, Valeri P. Maltsev An optimization method for solving the inverse Mie problem based on adaptive algorithm for
construction of interpolating database, Journal of Quantitative Spectroscopy & Radiative Transfer; DOI: 10.1016/j.jqsrt.2012.08.001 (2012)
G V Dyatlov, K V Gilev, M A Yurkin and V P Maltsev An optimization method with
precomputed starting points for solving the inverse Mie problem Inverse Problems Vol.
28, 045012, doi:10.1088/0266-5611/28/4/045012 (2012)
Konokhova A. I., Yurkin M. A., Moskalensky A. E., Chernyshev A. V., Tsvetovskaya
G. A., Chikova E. D., and Maltsev V. P. Light-scattering flow cytometry for identification and characterization of blood microparticles // Journal of Biomedical Optics 17,
057006 (2012)
Yu. G. Pichugin, K. A. Semiyanov, A. V. Chernyshev, I. G. Palchikova, L. V.
Omelyanchyuk and V. P. Maltsev, Peculiarities of cytometrical methods of DNA content determination in the nucleus // Cell and Tissue Biology Volume 6, Number 3
(2012), 302-308, DOI: 10.1134/S1990519X12030091
Orlova D.Yu., Stixova L., Kozubek S., Gierman H.J., Sustackova G., Chernyshev A.V.,
Medvedev R.N., Legartova S., Versteeg R., Matula P., Stoklasa R., Bartova E. Ar-
6.
7.
8.
rangement of nuclear structures is not transmitted through mitosis but is identical in sister cells. // Journal of Cellular Biochemistry, v. 113, n. 11, pp. 3313–3329 (2012).
Liu C., Bi L., Panetta R.L., Yang P., and Yurkin M.A. Comparison between the pseudospectral time domain method and the discrete dipole approximation for light scattering
simulations // Opt. Express 20, 16763–16776 (2012).
Schmidt K., Yurkin M.A., and Kahnert M. A case study on the reciprocity in light scattering computations // Opt. Express 20, 23253–23274 (2012).
Šustáčková G., Kozubek S., Stixová L., Legartová S., Matula P., Orlova D. Yu., Bártová E.. Acetylation-dependent nuclear arrangement and recruitment of BMI1 protein
to UV-damaged chromatin. // Journal of cellular physiology, v. 227, n. 5, pp. 1838-50
(2012).
15. Опубликовано научных статей в российских журналах, входящих в список ВАК: 1
Пичугин Ю. Г., Семьянов К. А., Чернышев А. В., Пальчикова И. Г., Омельянчук Л. В.,
Мальцев В. П. Особенности цитометрических методов определения содержания ДНК в
ядре. Цитология. 54 (2) :185–190, 2012.
16. Статей в журналах, не входящих в список ВАК, книгах и трудах конференций
17. Сделано докладов на международных и зарубежных конференциях: ____
а именно:
полное название
конференции
Место и дата конференции
Тема доклада
Международная конференция «Обратные и
некорректные задачи
математической физики», посвященную 80летию со дня рождения
академика М. М. Лаврентьева
Международная молодежная научная школаконференцию "Теория
и численные методы
решения обратных и
некорректных задач"
50 Международная
Научная Студенческая
Конференция
5-12 августа
2012 г., г.
Новосибирск
Решение обратной задачи светорассеяния для
определения морфологических характеристик
биологических частиц с
помощью сканирующего
проточного
цитометра
Численный метод решения обратной задачи светорассеяния для характеризации эритроцитов
человека
устный
XXVII Congress of the
International Society for
Advancements of Cytometry
Лепциг, Германия, 23-27
июня 2012 г.
Исследование антигенантитело опосредованной агглютинации полимерных микросфер турбидиметрическим методом
Simultaneous determination of size and shape of
human blood platelets using light-scattering flow
cytometry
5-15 августа
2012 года, г.
Новосибирск
Новосибирск,
апрель 2012
вид доклада
авторы
докладчик
Юркин М.А.,
Гилев К.В.,
Строкотов
Д.И., Москаленский Д.И.,
Конохова
Д.И., и Мальцев В.П.
Гилев К.В.
Юркин М.А.
Мальцев В.П.
Гилев
К.В.
устный
Польщицин
А. А., Некрасов В. М.
Польщицин
А. А.
постер
Москаленский А.Е.,
Строкотов
Д.И., Некрасов В.М.,
Юркин М.А.,
Чернышев
А.В., Мальцев В.П.
Москаленский
А.Е.
устный
Гилев
К.В.
XXVII Congress of the
International Society for
Advancements of Cytometry
Лепциг, Германия, 23-27
июня 2012 г.
Optical super-resolution
with polarized lightscattering for precize characterization of nonspherical particles by flow
cytometry
постер
XXVII Congress of the
International Society for
Advancements of Cytometry
Лепциг, Германия, 23-27
июня 2012 г.
Identification and characterization of blood microparticles from light scattering
постер
IV Междунородная
молодежная школаконференция «Теория
и численные методы
решения обратных и
некорректных задач»
Новосибирск,
5-15 августа
2012 г.
Определение характеристик тромбоцитов крови
человека в модели
сплюснутого сфероида
по индикатрисам светорассеяния, измеренным с
помощью сканирующего
проточного цитометра
устный
IV Междунородная
молодежная школаконференция «Теория
и численные методы
решения обратных и
некорректных задач»
50-я юбилейная междунорадная студенческая конференция
«Студент и научнотехнический прогресс»
МЕТРОМЕД - 2011
Новосибирск,
5-15 августа
2012 г.
Характеризация микрочастиц крови по индикатрисе светорассеяния
методом глобальной оптимизации
устный
Новосибирск,
13-19 апреля
2012 г.
ISAC XXVII
International Congress
Leipzig,
Germany. 2327 June, 2012
Измерение объема и
формы тромбоцитов крови человека с помощью
сканирующего проточного цитометра
Исследование функций
распределения характеристик лимфоцитов
условно здорового донора и больного множественной миеломой во
время апоптоза с помощью сканирующей проточной цитометрии
Kinetic measurements of
the nuclear volume depletion during early stage of
apoptosis of lymphocytes
and HepG2 cells using
scanning flow cytometry
and confocal microscopy
50 Международная
Научная Студенческая
Конференция
Новосибирск,
апрель 2012
Исследование лизиса
эритроцитов в изотоническом водно-солевом
устный
СанктПетербург, 810 ноября
2011
Строкотов
Д.И., Москаленский А.Е.,
Некрасов
В.М., Юркин
М.А., Чернышев А.В.,
Мальцев В.П.
Конохова
А.И., Юркин
М.А., Москаленский А.Е.,
Чернышев
А.В., Мальцев В.П.
Москаленский А.Е.,
Конохова
А.И., Юркин
М.А., Некрасов В.М.,
Чернышев
А.В., Мальцев В.П.
Конохова
А.И., Юркин
М.А., Москаленский А.Е.,
Мальцев В.П.
Строкотов Д.И.
устный
Москаленский А.Е.
Москаленский
А.Е.
устный
Малых Н.Ю.,
Строкотов
Д.И., Долгих
Т.Ю., Домникова Н.П.,
Мальцев В.П.
Строкотов Д.И.
постерный
Malykh
N.Yu., Strokotov D.I., Dolgikh T.Yu.,
Domnikova
N.P., Orlova
D.Yu., Chernyshev A.V.,
Nekrasov
V.M.,
Medvedev
R.N., Maltsev
V.P.
Польщицина
И. В.
Malykh
N.Yu.
Конохова А.И.
Москаленский
А.Е.
Конохова А.И.
Польщи
цина И.
В.
растворе в присутствии
хлорида аммония
Analysis of binding diffusion in inhomogeneous
media by FRAP
Advanced Confocal Microscopy and Living
Cell Studies
Czech Republic, Brno,
16th-19th October, 2012
oral
The 56 Annual Meeting
of the Biophysical Society
USA, SanDiego, 25th 29th February< 2012
FRAP Analysis of Proteins
Diffusion and Binding in
Inhomogeneous Media
poster
Tacona-Photonics 2012
Bad Honnef,
Germany, 24–
26 October
2012
устный
ISAC XXVII International Congress
Leipzig, Germany, 23–27
June 2012
Challenges in simulation
of optical properties of
metallic nanoparticles using the discrete dipole approximation
Characterization of E. coli
morphology from light
scattering
стендов
ый
A.V. Chernyshev, D.Yu.
Orlova, E.
Bartova,
V.P.Maltsev
D.Yu. Orlova,
E. Ba´rtova,
V.P. Maltsev,
S. Kozubek,
A.V. Chernyshev
Yurkin M.A.
A.V.
Chernyshev
Konokhova
A.I., Yurkin
M.A., Gelash
A.A., and
Maltsev V.P.
Konokho
va A.I.
D.Yu.
Orlova
Yurkin
M.A.
18. Представлено докладов на международных и зарубежных конференциях (имеется в
виду случаи, когда в числе авторов доклада есть сотрудник нашего Института, но
докладчик из другой организации): ____
19. Сделано докладов на Всероссийских конференциях: ____
20. Представлено докладов на Всероссийских конференциях (тот же случай, что и в
п.18): ____
21. Тезисов докладов на международных и зарубежных конференциях: ____
1.
Гилев К.В., Юркин М.А., Мальцев В.П. "Численный метод решения обратной задачи светорассеяния для характеризации эритроцитов человека" Тезисы докладов
четвертой международной молодежной научной школы-конференции "Теория и
численные методы решения обратных и некорректных задач" Новосибирск, Академгородок, 5-15 августа 2012 года, с.45
2.
Moskalensky A. E., Strokotov D. I., Nekrasov V. M., Yurkin M.A., Chernyshev A.V.,
and Maltsev V. P. Simultaneous determination of size and shape of human blood platelets using light-scattering flow cytometry //ISAC XXVII International Congress Program. Leipzig, Germany, 23-27 June, 2012, p.177
3.
Strokotov D. I., Moskalensky A. E., Nekrasov V. M., Yurkin M.A., Chernyshev A.V.,
and Maltsev V. P. Optical super-resolution with polarized light-scattering for precise
characterization of non-spherical particles by flow cytometry //ISAC XXVII International Congress Program. Leipzig, Germany, 23-27 June, 2012, p.171
4.
Konokhova A. I., Yurkin M.A., Moskalensky A. E., Chernyshev A.V., and Maltsev V.
P. Identification and characterization of blood microparticles from light scattering
//ISAC XXVII International Con-gress Program. Leipzig, Germany, 23-27 June, 2012,
p.178
5.
Юркин М.А., Гилев К.В., Строкотов Д.И., Москаленский А.Е., Конохова А.И.,
Мальцев В.П. Решение обратной задачи светорассеяния для определения морфологических характеристик биологических частиц с помощью сканирующего про-
6.
7.
8.
9.
10.
11.
12.
точного цитометра //Тезисы докладов международной конференции «Обратные и
некорректные задачи математической физики». Но-восибирск, 2012, с. 257
Москаленский А.Е., Конохова А.И., Юркин М.А., Некрасов В.М., Чернышев А.В.,
Мальцев В.П. Определение характеристик тромбоцитов крови человека в модели
сплюснутого сфероида по индикатрисам светорассеяния, измеренным с помощью
сканирующего проточного цитометра //Тезисы докладов IV международной молодежной школы-конференции «Теория и численные методы решения обратных и
некорректных задач». Новосибирск, 2012, с. 86
Конохова А.И., Юркин М.А., Москаленский А.Е., Некрасов В.М., Чернышев А.В,
Мальцев В.П. Характеризация микрочастиц крови по индикатрисе светорассеяния
методом глобальной опти-мизации //Тезисы докладов IV международной молодежной школы-конференции «Теория и численные методы решения обратных и
некорректных задач». Новосибирск, 2012, с. 70
Москаленский А.Е. Измерение объема и формы тромбоцитов крови человека с
помощью скани-рующего проточного цитометра //Материалы 50-й Международной научной студенческой кон-ференции «Студент и научно-технический прогресс»: Физические методы в естественных науках. Новосиб. гос. ун-т. Новосибирск, 2012, с. 19
Malykh N.Yu., Strokotov D.I., Dolgikh T.Yu., Domnikova N.P., Orlova D.Yu., Chernyshev A.V., Nekrasov V.M., Medvedev R.N., Maltsev V.P. Kinetic measurements of
the nuclear volume depletion during early stage of apoptosis of lymphocytes and
HepG2 cells using scanning flow cytometry and confocal microcsopy. ISAC XXVII International Congress. Leipzig, Germany. 23-27 June, 2012. p.172.
Малых Н.Ю., Строкотов Д.И., Долгих Т.Ю., Домникова Н.П., Мальцев В.П. Исследование функций распределения характеристик лимфоцитов условно здорового донора и больного множественной миеломой во время апоптоза с помощью
сканирующей проточной цитометрии. // Сборник научных трудов международной
научной конференции «МЕТРОМЕД - 2011» - 8-10 ноября 2011, Санкт-Петербург.
- С.210-212.
Yurkin M.A. Challenges in simulation of optical properties of metallic nanoparticles
using the discrete dipole approximation // AIP Conf. Proc. 1475: 98–100.
Konokhova A.I., Yurkin M.A., Gelash A.A., and Maltsev V.P. Characterization of E.
coli morphology from light scattering // ISAC XXVII International Congress, 23–27
June 2012, Leipzig, Germany, pp. 204–205.
22. Тезисов докладов на Российских конференциях: ____
Раздел 3.
КИНЕТИЧЕСКИЕ ИССЛЕДОВАНИЯ ПОВЕРХНОСТНЫХ И
ВНУТРИКЛЕТОЧНЫХ ЛИГАНД-РЕЦЕПТОРНЫХ ВЗАИМОДЕЙСТВИЙ. Константы скорости прямой и обратной реакции лиганд-рецептор, а также коэффициент
диффузии лигандов в среде с неизвестным (произвольным) пространственным распределением неподвижных рецепторов (сайтов связывания) могут быть найдены разработанным методом восстановления флуоресценции после фотообесцвечивания (FRAP) с
использованием интегральных преобразований пространственно-разрешенных кинетических экспериментальных данных без нахождения полного решения исходной системы дифференциальных реакционно-диффузионных уравнений. Метод был применен
для характеризации подвижности и реакционности белков (Hp1 и с-Myc) в ядрах живых клеток фибробластов мышиных эмбрионов (Suv), измеренных на конфокальном
микроскопе Leica TCS SP5X.
D. Yu. Orlova, E. Bártová, V. P. Maltsev, S. Kozubek, and A. V. Chernyshev. A nonfitting
method using a spatial sine window transform for inhomogeneous effective-diffusion measurements by FRAP. Biophysical Journal. Vol. 100(2), pp. 507 – 516, 2011.
ИССЛЕДОВАНИЕ
СВЕТОРАССЕИВАЮЩИХ
СВОЙСТВ
МИКРОЧАСТИЦ КРОВИ. Измерялись индикатрисы светорассеяния от всех частиц
пробы, среди которых в том числе были микрочастицы крови, тромбоциты, полистирольные микросферы размером 1 и 2 мкм.
На рисунке приведено распределение измеренных сигналов по двум параметрам,
Suv_Hp1b
Suv_c-Myc
6
-1
k-, 10 s
-2
-2
k-, 10 s
-1
5
4
3
2
1
0
Suv_Hp1b
Suv_c-Myc
5
4
3
2
1
0
1
2
-8
3
2
D, 10 cm /s
4
5
0
1
2
-1
Ak+, 10 1/s
3
4
причем каждой точке соответствует одна измеренная частица. В параметрах интегралов
по интенсивности светорассеяния хорошо выделяются сигналы, полученные от 1 и
2 мкм полистирольных микросфер и от тромбоцитов. Как принято в большинстве стандартных методик выделения микрочастиц из пробы по сигналам светорассеяния, на
первом этапе на цитограмме в параметрах SSC-FSC выделяется область, границы которой по соответствующим параметрам ограничивается сверху параметрами полистирольных микросфер диаметром 1 мкм. На втором этапе все частицы, попавшие в выделенную область, обычно разделяются по флуоресценции (микрочастицы предварительно окрашиваются соответствующими флуоресцентными метками). В нашей работе мы
не используем флуоресцентные метки для выделения микрочастиц крови.
Представляют интерес две задачи:
- отделение микрочастиц от всех других частиц в крови по светорассеянию (без
использования флуоресценции, как это принято во всех известных на данный момент
исследованиях микрочастиц крови методами проточной цитометрии);
- определение параметров микрочастиц крови (решение обратной задачи светорассеяния).
В критерии Вальда–Вольфовитца для определения зависимости регрессионных
остатков используется количество серий отклонений k – наборов последовательных отклонений zi одного знака или, грубо говоря, количество пересечений между экспериментальной и теоретической кривой. Это число равно n/2 для абсолютно независимых
отклонений, где n= 512– число точек в экспериментальной индикатрисе. С усилением
зависимости между последовательными отклонениями число k уменьшается. Для несферических частиц это число должно быть значительно меньше, чем для сферических,
что объясняется неприменимость теории Ми при решении обратной задачи для первых.
В качестве второго параметра разделения частиц на сферические и несферические
можно взять сумму квадратов отклонений (СКО) экспериментального сигнала от теоретической кривой, которая для несферических частиц должна быть больше чем для
сферических.
1.0
микрочастицы
0.9
0.8

0.7
несферические
частицы
0.6
0.5
0.4
0.3
0
25
50
75
100
125
150
175
200
k
0.01
несферические
частицы
СКО
1E-3
микрочастицы
1E-4
1E-5
0
50
100
k
150
200
110
100
количество частиц
90
80
70
60
50
40
30
20
10
0
0.2
0.4
0.6
0.8
1.0
а, мкм
1.2
1.4
1.6
среднее
1,41
дисперсия 0.03
количество частиц
60
40
20
0
1.34
1.36
1.38
1.40
1.42
1.44
1.46
1.48
показатель преломления
1.50
1.52
1.54
По этим данным было построено распределение по размеру. Видно, что нижняя
граница по размеру, которая равна 0.5 мкм размыта. Это можно объяснить тем, что для
частиц с отношением сигнал-шум близким к 1 точность определения размера компенсируется завышением показателя преломления. Поэтому для того, чтобы исключить эти
данные при построении распределения микрочастиц по показателю преломления, выбирались частицы, размер которых > 0.5 мкм. По полученным распределениям видно,
что с увеличением размера число микрочастиц уменьшается. Распределение по показателю преломления достаточно широкое, но его среднее лежит в области, характерной
для показателей преломления клеток крови.
Konokhova A.I., Yurkin M.A., Moskalensky A.E., Chernyshev A.V., Tsvetovskaya G.A.,
Chikova E.D., and Maltsev V.P. Light-scattering flow cytometry for identification and characterization of blood microparticles // J. Biomed. Opt. 17, 057006 (2012); DOI:
10.1117/1.JBO.17.5.057006.
Раздел 4.
Разработан алгоритм решения обратной задачи светорассеяния для частиц
сложной формы с использованием базы данных. Данный подход позволяет
определять по светорассеянию характеристики частиц, для которых использование оптимизационных методов не представляется возможным в
виду больших вычислительных затрат при решении прямой задачи светорассеяния. Предложены три варианта решения обратной задачи. Продемонстрирована адекватность работы алгоритма при характеризации сферических частиц, тромбоцитов крови и бактерии кишечной палочки.
Адаптивная база данных
Решение обратной задачи светорассеяния
для частиц сложной формы с использованием баз данных различных типов
Характеризация E.coli
Характеризация тромбоцитов
XL10-GOLD
XL2-Blue
100
mean
2.49
st. dev. 0.69
microscope
microscope
MPV
SD
PDW
300
Counts
mean
1.99
st. dev. 0.48
200
Неактивированные
Активированные
400
100
c)
10.0 fl
5.7 fl
14 fl
MPV
SD
PDW
d)
9.4 fl
5.3 fl
10 fl
200
100
0
300
0
600
mean
2.20
st. dev. 0.53
mean: 2.83
st. dev.: 0.70
400
SFC
0
200
1
2
3
4
5
Length l, m
6
7
8
0
5
10
15
500
SFC
100
0
20
25
30
0
5
10
Volume, fl
Counts
200
0
1
2
3
4
5
Length l, m
6
7
8
15
20
25
30
Volume, fl
Mean
SD
3.5
1.6
5
6
e)
Mean
SD
f)
2.3
1.1
250
0
1
2
3
4
Aspect ratio 
7
8 1
2
3
4
5
Aspect ratio 
6
7
8
Скачать