К созданию &quot

Характеристика на Деева Игоря Евгеньевича.
Краткая биография:
1995-2001 – студент Московского Физико-Технического Института
2001-2003 - аспирант Московского Физико-Технического Института
Июнь 2003 – защитил кандидатскую диссертацию
2004-2011 – научный сотрудник ИБХ РАН
C 2011 - старший научный сотрудник ИБХ РАН
Научные публикации в реферируемых журналах:
1. Clathrin-mediated endocytosis and adaptor proteins.
Popova NV, Deyev IE, Petrenko AG.
Acta Naturae. 2013 Jul;5(3):62-73.
2. Structural determinants of the insulin receptor-related receptor activation by
alkali.
Deyev IE, Mitrofanova AV, Zhevlenev ES, Radionov N, Berchatova AA, Popova NV,
Serova OV, Petrenko AG.
J Biol Chem. 2013 Nov 22;288(47):33884-93.
3. Analysis of structural determinants of alkali sensor IRR positive cooperativity.
Popova NV, Deyev IE, Petrenko AG.
Dokl Biochem Biophys. 2013 May-Jun;450:160-3
4. Insulin receptor-related receptor as an extracellular pH sensor involved in the
regulation of acid-base balance.
Petrenko AG, Zozulya SA, Deyev IE, Eladari D.
Biochim Biophys Acta. 2013 Oct;1834(10):2170-5.
5. Deficient Response to Experimentally Induced Alkalosis in Mice with the
Inactivated insrr Gene.
Deyev IE, Rzhevsky DI, Berchatova AA, Serova OV, Popova NV, Murashev AN, Petrenko
AG.
Acta Naturae. 2011 Oct;3(4):114-7.
6. Association of adaptor protein TRIP8b with clathrin.
Popova NV, Deyev IE, Petrenko AG.
J Neurochem. 2011 Sep;118(6):988-98.
7. Insulin receptor-related receptor as an extracellular alkali sensor.
Deyev IE, Sohet F, Vassilenko KP, Serova OV, Popova NV, Zozulya SA, Burova
EB, Houillier P, Rzhevsky DI, Berchatova AA, Murashev AN, Chugunov AO, Efremov RG,
Nikol'sky NN, Bertelli E, Eladari D, Petrenko AG.
Cell Metab. 2011 Jun 8;13(6):679-89.
8. Association of the subunits of the calcium-independent receptor of α-latrotoxin.
Serova OV, Popova NV, Petrenko AG, Deyev IE.
Biochem Biophys Res Commun. 2010 Nov 26;402(4):658-62. Epub 2010 Oct 29.
9. Regulation of CIRL-1 proteolysis and trafficking.
Deyev IE, Petrenko AG.
Biochimie. 2010 Apr;92(4):418-22. Epub 2010 Jan 25.
10. Novel GPS-containing G protein-coupled receptor from Monosiga brevicollis.
Serova OV, Deyev IE, Petrenko AG.
Dokl Biochem Biophys. 2009 Jul-Aug;427:191-4. No abstract available. Russian
11. Dissociation of the subunits of the calcium-independent receptor of alphalatrotoxin as a result of two-step proteolysis.
1
Krasnoperov V, Deyev IE, Serova OV, Xu C, Lu Y, Buryanovsky L, Gabibov AG,
Neubert TA, Petrenko AG.
Biochemistry. 2009 Apr 14;48(14):3230-8.
12. Analysis of proteins interacting with TRIP8b adapter.
Popova NV, Plotnikov AN, Ziganshin RKh, Deyev IE, Petrenko AG.
Biochemistry (Mosc). 2008 Jun;73(6):644-51.
13. Identification of proteins in complexes with alpha-latrotoxin receptors.
Serova OV, Popova NV, Deev IE, Petrenko AG.
Bioorg Khim. 2008 Nov-Dec;34(6):747-53. Russian.
14. Interaction of calcium-independent latrotoxin receptor with intracellular adapter
protein TRIP8b.
Popova NV, Plotnikov A, Deev IE, Petrenko AG.
Dokl Biochem Biophys. 2007 May-Jun;414:149-51. Russian.
15. Effect of changes in ambient pH on phosphorylation of cellular proteins.
Deev IE, Vasilenko KP, Kurmangaliev EZh, Serova OV, Popova NV, Galagan YS,
Burova EB, Zozulya SA, Nikol'skii NN, Petrenko AG.
Dokl Biochem Biophys. 2006 May-Jun;408:184-7. Russian.
16. oct-genes and oct-proteins.
Deev IE, Polianovskiĭ OL.
Mol Biol (Mosk). 2004 Jan-Feb;38(1):48-55. Review. Russian.
17. Regulation of human oct-1 gene transcription involves two promotors.
Zhenilo SV, Deev IE, Serov SM, Polianovskiĭ OL.
Genetika. 2003 Feb;39(2):280-5. Russian.
18. Spliced oct-1 gene mRNA isoforms with untranslated exons and a deletion in the
region coding for the POU-specific domain.
Deev IE, Zhenilo SV, Polianovskiĭ OL.
Mol Biol (Mosk). 2003 Jan-Feb;37(1):139-46. Russian.
19. Regulation of oct-1 gene transcription is different in lymphoid and non-lymphoid
cells.
Zhenilo S, Deyev I, Serov S, Polanovsky O.
Biochimie. 2003 Jul;85(7):715-8.
20. Subforms of transcription factor Oct-1 synthesized in lymphocytes.
Pankratova EV, Deev IE, Zhenilo SV, Anfalova TV, Polianovskiĭ OL.
Mol Biol (Mosk). 2001 Sep-Oct;35(5):816-23. Russian.
21. Tissue-specific splicing of 5'-exons of the Oct-1 transcription factor gene.
Pankratova EV, Deev IE, Polianovskiĭ OL.
Mol Biol (Mosk). 2001 Jan-Feb;35(1):34-41. Russian.
22. Tissue-specific isoforms of the ubiquitous transcription factor Oct-1.
Pankratova EV, Deyev IE, Zhenilo SV, Polanovsky OL.
Mol Genet Genomics. 2001 Oct;266(2):239-45.
Гранты:
1. РФФИ №13-04-01359 (руководитель), 2013-2015
2. МКБ (руководитель), 2014-2017
2
Достижения:
1) Открыт эндогенный тирозинкиназный рецептор IRR, ранее считавшейся "сиротским"
рецептором, как сенсор внеклеточной щелочной среды (Deyev et al., 2006). IRR явился
первым известным метаботропным рецептором слабощелочной среды. Показано, что, в
отличие от своих близких гомологов рецепторов инсулина и инсулин-подобного фактора
роста, а также EGFR, IRR активируется при обработке клеток средой с рН >7,9. Активация
pH-зависимая с величиной полуэффекта около рН 8.3 и насыщением при рН>9.0, и имеет
положительную кооперативность (коэффициент Хилла около 2-3) (Deyev et al., 2011).,
Активация IRR приводит к фосфорилированию каскадных сигнальных белков (IRS-1, AKT1) и вызывает изменения в цитоскелете клеток (Deyev et al., 2011).
Используя животные модели удалось показать, что происходит активация IRR в почках
живой крысы в условиях экспериментального алкалоза, вызванного путем инъекции
раствора бикарбоната в кровь животному. С использованием линии мышей с нокаутом по
гену IRR показано, что IRR вовлечен в регуляцию кислотно-щелочного баланса в организме.
Нокаутные мыши, в отличие от мышей дикого типа не способны экскретировать избыток
бикарбоната в мочу (Deyev et al., 2011) и компенсируют алкалоз за счет повышения
концентрации СО2 в крови (Deyev et al., 2011). Было установлено, что нокаутные мыши при
бикарбонатной нагрузке имеют пониженную экспрессию маркеров бета-вставочных клеток
почки.
2) Используя метод автофосфорилирования in vitro была показана степень вовлеченности в
рН чувствительность рецептора IRR его различных доменов (L1, C и L2 домены), которые
находятся во внеклеточной части рецептора (Deyev et al., 2013). Также были обнаружены
пять аминокислотных остатков в первых двух доменах (L1 и C), играющие огромную роль в
рН-активации рецептора (Deyev et al., 2013). Замена всех этих аминокислот и третьего
домена L2 приводит к уменьшению активности IRR примерно в 10 раз, причем вклад
различных аминокислот неравномерен и невелик, а именно в случае каждой отдельной
точечной мутации активность уменьшается на 5-20 процентов. Более того, кривые рНактивации различных химерных и мутантных конструкций существенно отличаются от
кривой активации IRR. В частности, сильно уменьшается или пропадает кооперативность
активации, а рН, при котором наблюдается полуэффект (то есть половина значения от
максимальной детектируемой активации), сильно сдвигается в щелочную сторону (с 8.5 до
9.0-9.1) (Deyev et al., 2013).
Планируемое направление исследований:
Тирозинкиназные рецепторы играют ключевую роль в развитии и жизнедеятельности
организма. На данный момент известно несколько десятков тирозинкиназных рецепторов и
их лигандов. Семейство тирозинканазных рецепторов привлекает огромное внимание
исследователей, прежде всего из-за того, что они играют ключевую роль в регуляции роста и
деления клеток, в процессах клеточного метаболизма, а также в связи с тем, что некоторые
тирозинкиназные рецепторы непосредственно связаны с процессами злокачественных
перерождений клеток, то есть в канцерогенезе.
Данный проект посвящен поиску и обнаружению тирозинкиназных рецепторов, являющихся
сенсорами внеклеточного рН, как щелочного, так и кислого. На данный момент, кроме
рецептора IRR (cенсора щелочного рН) мы обнаружили еще два тирозинкиназных рецептора,
активирующихся при изменении рН среды. Оба рецептора не являются гомологами
рецептора IRR – это рецепторы MET (или c-MET) и TrkA. У них известны пептидные
лиганды – фактор роста гепатоцитов (HGF) и нервный фактор роста (NGF), соответственно.
Нами показано, что рецепторы фосфорилируются при повышении рН внеклеточной среды до
3
7.8, и они более чувствительны к щелочному рН, чем рецептор IRR. Оба белка
экспрессируются в органах и тканях, в которых есть щелочные жидкости (так например, в
печени, где есть щелочная желчь (bile)). Мы собираемся сделать с этими рецепторами
аналогичные эксперименты, которые мы делали с рецептором IRR. Так на данный момент
мы обнаружили, что при активации этих рецепторов щелочным рН фосфорилируются
внутриклеточные белки, вовлеченные в процессы передачи сигнала тирозинкиназных
рецепторов. Планируется детально изучить пути передачи сигнала и клеточный ответ,
вызываемый активацией этих рецепторов при обработке щелочью различных клеток,
выделенных их организма (например, в гепатоцитах). На сегодняшний день требуется еще
много усилий для описания физиологической роли этих рецепторов в организме.
Также, нам удалось найти алгоритм, предсказывающий является ли тирозинкиназный
рецептор сенсором щелочной среды или нет. Данная компьютерная программа была
разработана китайскими коллегами и успешно апробирована нами на семействе рецептора
инсулина из различных животных (лягушка, мышь и т.д.). На данный момент мы
предсказали еще, как минимум, 5 тирозинкиназных рецепторов, которые потенциально
могут являться сенсорами щелочной внеклеточной среды. Скоро мы приступим к
экспериментальной проверке активации предсказанных рецепторов под действием щелочи.
Основной целью данного проекта является обнаружение тирозинкиназных рецепторов,
активирующихся при изменении рН внеклеточной среды, мы планируем показать, что
активация щелочной средой не является уникальным свойством рецептора IRR. Результаты
этой работы могут значительно дополнить представления о функционировании
тирозинкиназных рецепторов в организме.
4