2013 - Институт Биофизики

ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ НАУКИ
ИНСТИТУТ БИОФИЗИКИ СИБИРСКОГО ОТДЕЛЕНИЯ
РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК
(ИБФ СО РАН)
УТВЕРЖДАЮ:
директор ИБФ СО РАН
академик РАН
________________А.Г. Дегерменджи
1 февраля 2014 года
ОТЧЕТ
О НАУЧНОЙ И НАУЧНО-ОРГАНИЗАЦИОННОЙ
ДЕЯТЕЛЬНОСТИ ЗА 2013 г.
Красноярск, 2014
Оглавление
1.
2.
3
3.1
3.2
3.3
3.4
4.
4.1
4.2
4.3
4.4
4.5
4.6
4.7
5.
6.
7.
7.1
7.2
7.3
7.4
8.
8.1
8.2
8.3
9
9.1
9.2
ЕЖЕГОДНЫЕ СТАТИСТИЧЕСКИЕ ДАННЫЕ
АННОТИРОВАННЫЙ ПЕРЕЧЕНЬ ВАЖНЕЙШИХ РЕЗУЛЬТАТОВ
ИССЛЕДОВАНИЙ ПО «БАЗОВЫМ ПРОЕКТАМ», ВЫПОЛНЕННЫХ В
2013 Г.
РЕЗУЛЬТАТЫ НИР ПО ПРОЕКТАМ С ЦЕЛЕВЫМ
ФИНАНСИРОВАНИЕМ РАН, СИБИРСКОГО ОТДЕЛЕНИЯ РАН И
ФЕДЕРАЛЬНЫХ ЦЕЛЕВЫХ ПРОГРАММ
Результаты научно-исследовательских работ по программам Президиума
РАН
Результаты научно-исследовательских работ по программам Президиума
СО РАН
Результаты работ молодых ученых, получивших финансирование по
научным темам, утвержденным постановлением Президиума СО РАН
Результаты, полученные в рамках федеральных целевых программ
СВЕДЕНИЯ О ТЕМАТИКЕ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ
Гранты РФФИ
Федеральные целевые программы
Программы Президиума РАН
Программы Президиума СО РАН
Региональная программа
Зарубежные гранты
Хоздоговоры
ПОДДЕРЖКА СТАЦИОНАРОВ
ПОДДЕРЖКА ВИВАРИЕВ
МЕЖДУНАРОДНАЯ ДЕЯТЕЛЬНОСТЬ ИНСТИТУТА
О деятельности Международного центра замкнутых экологических систем
(МЦ ЗЭС)
Зарубежные командировки сотрудников Института
Посещение Института зарубежными учеными
Информация о наличии контрактов и хоздоговоров с зарубежными
заказчиками
НАУЧНО-ОРГАНИЗАЦИОННАЯ ДЕЯТЕЛЬНОСТЬ
Общая информация о научно-организационной деятельности
Информация о присуждённых премиях в 2013 году
Образовательная деятельность, взаимодействие с вузовской наукой
ПУБЛИКАЦИИ ИНСТИТУТА В 2013 ГОДУ
Импакт-фактор (суммарный с указанием журналов)
Список публикаций
ПРИЛОЖЕНИЕ 1
ПРИЛОЖЕНИЕ 2
ПРИЛОЖЕНИЕ 3
ПРИЛОЖЕНИЕ 4
ПРИЛОЖЕНИЕ 5
2
стр.
3
5
11
11
16
22
25
27
27
29
29
30
31
31
31
33
39
42
42
43
46
46
49
49
49
49
51
51
52
59
65
69
70
71
ЕЖЕГОДНЫЕ СТАТИСТИЧЕСКИЕ ДАННЫЕ
ОБ ИНСТИТУТЕ СО РАН НА 01.12.2013 г.
1. Количество штатных работников − 189
2. Количество ставок научных работников – 80
3. Количество штатных научных сотрудников без степени − 7
4. Количество молодых сотрудников до 35 лет – 23
5. Аспирантура: очная – 5
6. Гранты отечественные:
6.1. РФФИ – 21
6.2. РГНФ – нет
6.3. Президентская программа поддержки ведущих научных школ – 1
6.4. Президентская программа поддержки молодых ученых − 1
6.5. Программы Президиума РАН – 5
6.6. Междисциплинарные интеграционные проекты СО РАН – 5
6.7. Интеграционные проекты СО РАН, выполняемые совместно со сторонними
организациями – 2
6.8. Экспедиционные гранты СО РАН – 1
6.9. Виварии и клеточные культуры – 1
6.10. Совет молодых ученых – 1
6.11. Лаврентьевский конкурс – нет
6.12. Региональная программа – 4
7. Зарубежные гранты – 1
8. Соглашения с зарубежными партнерами (контракты) – 2
9. Контракты, хоздоговоры (отечественные) – 6
10. Общий объем финансирования (тыс. руб.) – 110569,0
10.1. Бюджетное финансирование – 99149,0
10.2. Финансирование по проектам – 11420,0
10.2.1. Междисциплинарные интеграционные проекты – 2875,0
10.2.2. Интеграционные проекты со сторонними научными организациями − 2000,0
10.2.3. Проекты Программ Президиума РАН – 5000,0
10.2.5. Экспедиционные гранты − 960,0
10.2.6. Виварии и клеточные культуры – 470,0
10.2.7. Совет молодых ученых – 115,0
10.2.8. Лаврентьевский конкурс – нет
10.2.9. Региональные программы − 772,5
10.3. Внебюджетное финансирование – 12333,7
10.3.1. Гранты РФФИ – 7806,2
10.3.2. Проекты РГНФ – нет
10.3.3. Гранты по Президентской программе поддержки ведущих научных школ –
500,0
10.3.4. Гранты по Президентской программе поддержки молодых ученых − 1000,0
10.3.5. Зарубежные гранты − 1807,0
10.3.6. Соглашения с зарубежными партнерами (контракты)- 710,5
10.3.7. Контракты, хоздоговоры (отечественные) – 510,0
11. Число публикаций: 92, в т.ч.:
Монографии – 1
Учебники и учебные пособия – 1
Статьи в отечественных рецензируемых журналах – 32
Статьи в зарубежных журналах – 38
Статьи в отечественных сборниках – нет
3
Статьи в зарубежных сборниках – нет
Материалы отечественных конференций – 13
Материалы международных конференций – 7
12. Суммарный импакт-фактор публикаций − 75,004
13. Число патентов и заявок на изобретения за год – 5
14. Зарегистрированные программы для ЭВМ и базы данных – нет
15. Организация совещаний, конференций, научных школ − нет
16. Премии и награды − 4
4
2. АННОТИРОВАННЫЙ ПЕРЕЧЕНЬ ВАЖНЕЙШИХ РЕЗУЛЬТАТОВ
ИССЛЕДОВАНИЙ ПО «БАЗОВЫМ ПРОЕКТАМ», ВЫПОЛНЕННЫМ В 2013 Г.
В 2013 году начаты исследования по шести бюджетным проектам НИР Института
на период 2013-2016 гг. зарегистрированным в ФГНУ ЦИТиС с присвоением шифров
государственной регистрации. В рамках утвержденных планов НИР по проблемам
биофизики экосистем и физико-химической биологии получены следующие важнейшие
результаты:
Приоритетное направление VI.51. Экология организмов и сообществ
Проект VI.51.1.1. Экологические закономерности формирования потоков биологически
активных веществ, биогенных и токсичных элементов в трофических цепях водных
экосистем бассейна реки Енисей (координатор проекта д.б.н., проф. М.И. Гладышев).
В датированных кернах донных отложений озера Шира обнаружено неоднородное
распределение специфичного биомаркера, пигмента пурпурных серных бактерий окенона,
позволяющее реконструировать условия обитания пурпурных серных бактерий в озере в
последние ~4500 лет и повысить точность реконструкции климатически-обусловленных
изменений уровня воды в позднем голоцене по донным отложениям озера.
мкг г сух. веса -1
0
100
200 0
мкг г сух. веса -1
100
200
0
100
мкг г сух. веса
% от сух. веса
отн.единицы
200
0
10
20
30
0
200
400
600
-1
800
1000
5
145
1917
Нет данных
285
1628
425
565
Глубина, мм
845
840
985
1125
500
О
РХ
1265
1405
- 500
1545
-1000
1685
1825
1965
Примерный возраст
1207
705
Лютеин
Зеаксантин
Хл а
Органика
2105
2245
Окенон
-1500
- 2000
- 2500
2385
2525
Вертикальное распределение каротиноидов фототрофных организмов в донных
отложениях озера Шира.
5
Приоритетное направление VI.56. Физиология и биохимия растений, фотосинтез,
взаимодействие растений с другими организмами
Проект VI.56.1.4. Оценка устойчивости ценозов высших растений замкнутых
экологических систем, включающих человека, к выращиванию на питательных средах из
минерализованных органических отходов. (руководитель д.б.н. А.А. Тихомиров)
В Институте биофизики СО РАН разработана технология утилизации несъедобной
растительной биомассы, позволяющая длительное использование почвоподобного
субстрата без снижения его плодородия, которая будет использована для повышения
степени замкнутости массообменных процессов в биолого-технических системах
жизнеобеспечения человека.
Урожай редиса в зависимости от
способа внесения растительных
отходов (в расчете на сухую
биомассу).
Фотосинтез ценоза редиса в
зависимости от способа внесения
растительных отходов.
6
Приоритетное направление VI.57. Структура и функции биомолекул и
надмолекулярных комплексов. Протеомика. Биокатализ.
Проект VI.57.1.1. Биолюминесцентные системы различных светящихся организмов:
механизмы функционирования и применение в биолюминесцентном микроанализе.
(руководитель к.б.н. Е.С. Высоцкий)
Определена с разрешением 2.0 Å пространственная кристаллическая структура
светочувствительного Са2+-регулируемого фотопротеина беровина из ктенофор Beroe
abyssicola в апоформе, связанной с ионами кальция. Сравнение пространственной
структуры апоберовина с соответствующими конформационными состояниями
апообелина и апоакворина показало, что среднеквадратичные отклонения (RMSD) между
атомами основной цепи этих белков составляют соответственно 2,19 и 1,77 Å. Это
указывает на высокую структурную гомологию фотопротеинов из разных светящихся
организмов, хотя идентичность их аминокислотных последовательностей составляет всего
около 29%.
(А). Кристаллическая структура апоберовина из
Beroe abyssicola., связанного с ионами кальция (В).
Аминокислотная последовательность беровина.
Цветные цилиндры (А-H) соответствуют спиралям на панели (А). Цилиндры серого цвета I-IV
соответствуют «EF-hand» петлям.
7
Сравнение структуры апоберовина
(многоцветное изображение),
связанного с ионами кальция, со
структурами Ca2+-связанного
апообелина (показана светло-серым
цветом) и Ca2+-связанного
апоакворина (показана темно-серым
цветом). Ионы кальция показаны
шариками соответствующего
структуре цвета.
Приоритетное направление VI.61. Биофизика. Радиобиология. Математические
модели в биологии. Биоинформатика.
Проект: VI.61.1.1. Модельно-статистический анализ величины обратной связи между
вызванными глобальным потеплением изменениями в региональных экосистемах
(включая арктические), и глобальной температурой. (руководитель ак. А.Г.Дегерменджи)
Показано, что наблюдаемая динамика температуры большей части земной
поверхности с начала XX века может быть представлена в виде суммы двух слагаемых –
переключений климатических режимов в 1925/1926 и 1987/1988 годах и известных
квазипериодических климатических изменений (Южная осцилляция Эль-Ниньо и
Тихоокеанская декадная осцилляция).
Схема получения реконструкций поверхностной температуры для тропиков и средних
широт северного полушария с помощью очень простой линейной регрессионной модели.
8
Приоритетное направление VI.62. Биотехнология.
Проект VI.62.1.2. Разработка методических основ конструирования новых материалов и
создания новых технологий биолого-медицинского назначения с использованием
наноалмазов и маркерных биомолекул. (руководители ак. И.И. Гительзон, д.б.н. В.С.
Бондарь)
Сконструированы системы биохимической диагностики глюкозы и холестерина
посредством ковалентной пришивки соответствующих ферментов на наноалмазы.
Показано высокое совпадение данных при определении аналитов с использованием
автоматизированного биохимического анализатора Sapphire 400 (Niigata Mechatronics,
Japan) и диагностических систем МНА-ферменты. Результаты сравнительных испытаний
указывают на применимость созданных систем для определения этих веществ в сыворотке
крови человека in vitro.
E2
P1
Автоматический
биохимический
анализатор
Sapphire 400 (Japan)
А
в
б
т
и
о
о
а
м
х
н
а
и
а
т
м
и
и
л
и
ч
ч
з
е
е
а
с
с
т
к
к
о
и
и
й
NH
Системы
МНА- ферменты
С
М
р
E1
NH
analyte
NH
MND
Н
и
А
ф
с
т
е
е
р
м
м
ы
е
н
т
ы
En
Pn
colored
product
ХОЛЕСТЕРИН (ммоль/л)
ГЛЮКОЗА (ммоль/л)
7
11
Метод 2 (система МНА-ферменты)
Метод 2 (система МНА-ферменты)
P2
й
10
9
8
2
R = 0,9799
7
6
5
4
5
6
7
8
9
10
6
2
R = 0,9371
5
4
3
3
Метод 1 (анализатор Sapphire 400)
4
5
6
Метод 1 (анализатор Sapphire 400)
Корреляционные зависимости между двумя методами определения глюкозы и холестерина
в сыворотке крови человека: с помощью биохимического анализатора Sapphire 400
и систем диагностики на основе МНА и ферментов.
Прямая корреляция двух методов определения глюкозы и холестерина.
9
7
Приоритетное направление VI.62. Биотехнология
Проект VI.62.1.1. Фундаментальная основа и экспериментальное обоснование получения
и применения функциональных биоматериалов, композитов и конструкций на их основе
для реконструктивных биомедицинских технологий (руководитель д.б.н. Т.Г. Волова)
В Институте биофизики СО РАН с использованием мутантного штамма
C.eutrophus B-10646 оптимизированы параметры процесса биосинтеза трехкомпонентных
полимеров «Биопластотан» по общей продуктивности процесса и выходу продукта;
исследованы закономерности образования мономеров на комплексном углеродном
субстрате, содержащем основной ростовой субстрат и субстраты-предшественники,
необходимые для синтеза мономеров.
Динамики соотношения мономеров
различной структуры в полимерах
Блок-схема технологии синтеза
«Биопластотана» в хемостатнопериодической культуре C. eutrophus В10646
10
3. РЕЗУЛЬТАТЫ НИР ПО ПРОЕКТАМ С ЦЕЛЕВЫМ ФИНАНСИРОВАНИЕМ
РАН, СИБИРСКОГО ОТДЕЛЕНИЯ РАН И ФЕДЕРАЛЬНЫХ ЦЕЛЕВЫХ
ПРОГРАММ
3.1. Результаты научно-исследовательских работ по программам Президиума РАН
Проекты программы фундаментальных исследований Президиума РАН № 3
«Энергетические аспекты глубокой переработки ископаемого и возобновляемого
углеродсодержащего сырья»
Приоритетное направление VI.43. Экология организмов и сообществ.
Проект № 10 Исследование липидов черных илов на предмет их использования как сырья
для получения биотоплива.
Проведён хромато-масс-спектрометрический анализ проб, отобранных из осадков
правобережного цеха очистных сооружений г. Красноярска с февраля по октябрь.
Выполнены расчеты основных эксплуатационных характеристик биодизельного топлива,
полученного из осадков, и проведено их сравнение с требованиями европейских
стандартов для биодизельного топлива. Содержание длинноцепочечных кислот (20 и
более атомов С) было невелико и в сумме составляло 3-3.5 %. Обнаружен относительно
высокий вклад оксокислот: 9-оксо-18:0 и 10-гидрокси-16:0. Величины содержания почти
всех ЖК в осадках, собранных в разные месяцы, практически не отличались, за
исключением содержания 18:0, варьировавшим от 13.9 до 17.5 % от суммы ЖК.
Рассчитанные значения топливных характеристик биодизеля удовлетворяли требованиям
европейских стандартов по биодизельному топливу EN 14214, EN 14213. Получен патент
РФ «Способ получения биодизельного топлива из илов водоемов и/или осадков
канализационных очистных сооружений».
Сравнение эксплуатационных характеристик биодизеля, полученного из осадков
правобережных канализационных очистных сооружений г. Красноярска с требованиями
европейских стандартов по биодизельному топливу.
a
b
Характеристика
бодизель из осадков
КОС
Стандарты
Цетановое число
72.5 ± 0.24
не менее 51a
Йодное число
36.6 ± 1.19
не более 120a
Теплотворная
способность,
(MДж/кг)
37.0 ± 0.05
не менее 35b
Содержание
метиловых эфиров
ЖК (вес.%)
87.7± 3.84
не менее 96.5a
Европейский стандарт по биодизельному топливу EN 14214
Европейский стандарт по биодизельному топливу EN 14213
11
Проекты программы фундаментальных исследований Президиума РАН № 6
«Молекулярная и клеточная биология»
Приоритетное направление VI.46. Структура и функции биомолекул и
надмолекулярных комплексов.
Проект № 2 Молекулярные механизмы биолюминесценции различных светящихся
организмов.
С разрешением 1.72 и 1.3 Å определены кристаллические структуры двух
конформационных состояний (до и после реакции) мутанта обелина Y138F. Показано, что
замена Tyr ведет к потере молекулы воды в целентеразин-связывающей полости
активного фотопротеина. Однако, молекула воды появляется в Са2+-разряженной форме
после реакции в той же позиции, что и в соответствующей конформации обелина дикого
типа. Из совокупности структурных и биохимических данных сделано заключение, что
молекула воды участвует в каталитическом окислении субстрата и формировании
первичного эмиттера в биолюминесцентной реакции фотопротеинов.
(А). Кристаллическая структура мутанта обелина Y138F, связанная с субстратом
реакции, 2-гидропероксицелентеразином (слева) и стерео изображение активных
центров (справа) обелина дикого типа (показано зеленым цветом) и мутанта обелина
Y138F (показано желтым цветом). Молекулы воды (справа) показаны в виде шариков в
соответствии с цветом структуры. (Б). Кристаллическая структура Са2+-разряженной
формы мутанта обелина Y138F (слева) и стерео изображение активных центров Са2+разряженных форм (справа) мутанта обелина Y138F (показано синим цветом) и обелина
дикого типа (показано светло-коричневым цветом). Ионы кальция (слева) показаны в
виде шариков темно-серого цвета. Молекулы воды (справа) показаны в виде шариков в
соответствии с цветом структуры. (В). Кинетика биолюминесцентного сигнала обелина
дикого типа (слева) и мутанта обелина Y138F (справа).
12
Исследовано воздействие экзогенных органических соединений (этанола,
глицерина, ДМСО) и температуры (400С) на флуоресценцию разряженного фотопротеина
обелина. В спектрах флуоресценции обелина обнаружена «красная» компонента с
максимум 660 нм, которая появляется только при фотовозбуждении в интервале длин
волн 260÷300 нм. Ее вклад растет с увеличением температуры и концентрации экзогенных
соединений – спиртов, амфифильных растворителей.
Интенсивность флуоресценции, отн.ед.
200
"красный" пик
флуоресценции обелина
150
100
50
0
250
350
450
550
650
750
850
Длина волны, нм
Спектр флуоресценции разряженного фотопротеина обелина в присутствии
глицерина (0,36 M) при 20ºC. Длина волны возбуждения 280 нм.
Совместная иммобилизация компонентов ферментных систем светящихся
организмов в полимерные гели позволяет получить стабильные при хранении и
использовании ферментативные препараты, пригодные для проведения экспрессного
микроанализа степени биологического и химического загрязнения различных сред.
Проекты программы фундаментальных исследований Президиума РАН № 24
«Фундаментальные основы технологий наноструктур и наноматериалов
Приоритетное направление VI.47. Молекулярная генетика. Механизмы реализации
генетической информации. Биоинженерия.
Проект № 57. Биологические эффекты наноалмазов детонационного синтеза, как базовая
основа создания новых наноматериалов и нанотехнологий для биологии и медицины.
1. Системы биохимической диагностики глюкозы и холестерина созданы с
помощью ковалентной пришивки соответствующих ферментов на поверхность
активированных бензохиноном модифицированных наноалмазов (МНА). Испытания
показали высокое совпадение результатов определения аналитов в сыворотке крови
человека in vitro с использованием биохимического анализатора Sapphire 400 (Japan) и
диагностических систем МНА-ферменты. Коэффициент корреляции для двух методов
тестирования составил при определении глюкозы - 0.98, холестерина - 0.94.
Прогнозируется возможность применения систем в научных исследованиях и целях
медицинской диагностики.
2. С помощью ковалентной иммобилизации радиоактивно меченного биомаркера
на наноалмазы сконструированы комплексы МНА-BSAI125, имеющие в сыворотке крови in
vitro средние размеры кластеров 63, 181 и 266 нм. В исследованиях in vivo показано, что
после внутривенного введения комплексов мышам основная часть радиоактивности (50%
и более) регистрируется в печени, отмечается тенденция к большему накоплению метки с
13
увеличением размеров комплексов. Около 15-25% радиоактивности выявляется в
селезенке, однако в этом органе наблюдается обратная тенденция к накоплению метки, по
сравнению с печенью.
3. Установлено in vitro, что МНА адсорбируют отдельные белковые фракции
сыворотки крови человека с разной эффективностью. Выявлена относительная
избирательность адсорбции в отношении β2- и γ-глобулинов. Прогнозируется
возможность применения МНА как нового адсорбента в технологиях гемодиализа и
плазмафереза и для получения отдельных белков крови в чистом виде.
4. Показано, что реакцией нуклеофильного присоединения на поверхность 1 мг
микросфер из 3-полигидроксибутирата можно ковалентно иммобилизовать от 70 до 150
мкг частиц МНА. Данные растровой электронной микроскопии указывают, что МНА
располагаются на поверхности микросфер в виде скоплений (агрегатов).
5. Показано, что в водных суспензиях МНА со средним размером кластеров 50, 110
и 320 нм стабильно функционируют как ограничители мощности оптического излучения.
Наблюдаемый эффект опосредован нелинейным рассеянием и нелинейным поглощением
излучения наночастицами.
Проекты программы фундаментальных исследований Президиума РАН № 30
«Живая природа: современное состояние и проблемы развития»
Приоритетное направление VI.43. Экология организмов и сообществ.
Проект № 15. Микробные сообщества стратифицированных озер Южной Сибири:
мониторинг и экологический прогноз.
По составу остатков зоопланктона и зообентоса в донных отложениях выявлено
принципиальное отличие экосистемы озера Шира (Хакасия) 4.5 тысячи лет назад от
современного состояния. Предположительно это был водоток с пресной водой.
Для озера Утичье-3 на основе сезонного мониторинга определен современный
видовой состав диатомовых водорослей как основа для реконструкции его состояния по
створкам диатомовых в донных отложениях.
Компоненты танатоценоза оз. Шира в
слое 240-245 см от начала керна (остатки
раковин и эфиппии кладоцер, моллюски р.
Valvata, остракода – ракушковые рачки,
головные капсулы личинок ручейников,
семена растений, фрагменты щетинок
кладоцер).
14
Фитопланктон озера Утичье-3:
доминирующие виды диатомовых и
стоматоцисты золотистых водорослей.
% клеток
с аномалиями
хромосом
частота
аберраций,
%
50
3
ниже ГХК
выше ГХК
45
40
метафаза
35
2
ана-телофаза
30
Бк/кг
25
20
1
15
10
5
0
0
1.2 Бк/кг
5 Бк/кг
0-45 км
100 Бк/кг
214 Бк/кг
305 Бк/кг
278 км
97 км
80 км
Красноярск-Есаулово Захаровка
Балчуг
380 Бк/кг 1467 Бк/кг 2682 Бк/кг
85 км
Атаманово
86 км
330 км
Стрелка
Расстояние от г.Красноярск, населенный пункт
Частота клеток с аномалиями хромосом (% от числа делящихся клеток, среднее
знач.±дов.инт., p<0.05) в апикальной корневой меристеме E.canadensis и содержание
техногенных радионуклидов в корнеобитаемом слое донных отложений (Бк/кг сух.
массы), собранных в р.Енисей, на разном удалении от источников радиационного и
химического загрязнения, вблизи указанных населенных пунктов. Расстояние указано
относительно г. Красноярск.
15
Содержание радионуклидов, кБк/кг
Приоритетное направление VI.43. Экология организмов и сообществ.
Проект № 16. Видовое разнообразие, продукционные и цитогенетические характеристики
макрофитной растительности реки Енисей в градиенте антропогенной (радиационной и
химической) нагрузки.
Радиоэкологические исследования р. Енисей показали, что в течение трех лет после
остановки реакторного производства на ГХК Росатома (в марте 2010 г.) техногенные
радионуклиды продолжают регистрироваться в биомассе макрофитов на удалении до 250
км от ГХК по течению реки. Впервые показано, что после остановки реакторного
производства на ГХК содержание техногенных радионуклидов с наведенной активностью
в биомассе макрофитов р.Енисей значительно снизилось, в то время как содержание 137Cs
- продукта ядерного распада, осталось на том же уровне, что и во время работы реактора.
Это свидетельствует о поступлении радиоцезия в биомассу макрофитов из донных
отложений, в которых накоплены значительные активности этого радионуклида.
Впервые достоверно установлена положительная корреляция (r2=0.94-0.96) частоты
хромосомных нарушений в делящихся клетках корней водного растения Elodea canadensis,
произрастающей в р.Енисей, c содержанием техногенных радионуклидов в
корнеобитаемом слое донных отложениях реки на участке протяженностью 330 км от
г.Красноярска.
3.2. Результаты научно-исследовательских работ по программам Президиума СО
РАН
Междисциплинарные интеграционные проекты
A)
численность, у.е.
возраст жертвы, годы
Приоритетное направление VI.50. Биофизика. Радиобиология. Математические модели
в биологии. Биоинформатика.
Междисциплинарный проект 21 Исследование закономерностей и тенденций развития
самоорганизующихся систем на примере веб-пространства и биологических сообществ.
Координатор проекта чл.-к. РАН А.М. Федотов, ИВТ СО РАН
№ гос. регистрации 01201272122
Построена модель экологической системы, учитывающая распределения численности
видов и средней массы особей по возрастам. Показано, что стационарные распределения
по численности для терминальных хищников и по средней массе для базовых видов
(продуцентов) не зависят от структуры экосистемы и могут использоваться, как
начальные значения в итерационном процессе нахождения стационарных распределений.
Получено распределение особей в случае популяции, допускающей каннибализм (озера с
окунем, как единственным видом рыбы).
возраст хищника, годы
B)
возраст, годы
Моделирование стационарного распределения моновидовой рыбной экосистемы. А)
двумерное нормальное распределение, описывающее интенсивность поедания молодняка
(жертвы) рыбами старшего возраста (хищники); B) пример стационарного
распределения численности популяции рыб, допускающих каннибализм по возрастам.
Приоритетное направление VI.43. Экология организмов и сообществ.
Междисциплинарный интеграционный проект № 34. Цикличность в биогеологических
седиментационных системах Центральной Азии на абсолютной временной шкале
голоцена: глобальный отклик солнечно-земных связей
Координатор проекта д.г.-м.н. И.А. Калугин, ИГМ СО РАН
№ гос. регистрации 131018113731
Исследована
динамика
седиментационного
потока
органического
и
неорганического углерода, азота, хлорофилла а и бактериохлорофилла а в оз. Шира в
период с октября 2012 г. по октябрь 2013 г. Показано, что минимальный поток всех
вышеперечисленных компонентов наблюдался в подледный период. В период открытой
воды, динамика осадочного процесса была схожей: поступление органики, карбонатных
материалов и хлорофилла а в донные отложения нарастало от весны к осени. В отличие от
16
0.4
0.3
0.25
0.2
Б
2012
2013
0.15
0.1
0.05
0
-0.05
-1
N, г м сут
2013
0
0.03
Хл а, мг м-2 сут-1
2012
0.1
0.05
2012
2013
Г
2012
2013
Д
2012
В
0.01
-0.01
1.4
1.2
1
0.8
0.6
0.4
0.2
0
-0.2
1.2
БХл а, мг м-2 сут-1
А
0.2
-2
-2
Снеорг, г м сут
-1
-2
Сорг, г м сут
-1
вышеуказанных компонентов, динамика осадочного потока пигментом пурпурных серных
бактерий бактериохлорофилла а была различной в 2012 и 2013 г. В 2013 г. отсутствовал
мощный весенний максимум, и в конце лета поток был значительно меньше, чем в 2012
году. Таким образом, показано, что продукция пурпурных серных бактерий может
существенно различаться по годам. Полученная оценка осадочных потоков может быть
полезна для интерпретации и расшифровки годичных слоев в кернах донных отложений.
1
2013
0.8
0.6
0.4
0.2
0
-0.2
март-май
май-июль
июльсентябрь
сентябрьоктябрь
13 м
октябрьмарт
15 м
март-май
май-июль
июльсентябрь
сентябрьоктябрь
20 м
Седиментационные потоки в оз. Шира (2012 и 2013 гг): А – углерод органический; Б –
углерод неорганический; В – азот; Г – хлорофилл а; Д – бактериохлорофилл а.
Приоритетное направление VI.43. Экология организмов и сообществ.
Междисциплинарный интеграционный проект № 56. Прогнозное моделирование и
междисциплинарные комплексные исследования многолетней динамики состояния
экосистем меромиктических озер Сибири
Координатор проекта ак. А.Г. Дегерменджи, ИБФ СО РАН
№ гос. регистрации 01201351507
Исследована связь между пространственной горизонтальной неоднородностью
профилей температуры и солености с пространственным распределением концентраций
фито- и зоопланктона в озере Шира. Анализ распределения флуоресцентных полей
показал роль зоны прибрежного примыкания термоклина в развитии фитопланктона. При
движении от центра озера к берегам глубинный пик концентрации фитопланктона (10 м),
достигая прибрежной зоны озера, частично размывается, и поднимается в верхние
горизонты (Рис. 1). Распределение зоопланктона (Рис. 2) имело высокий пик численности
17
у поверхности и слабо выраженный глубинный пик на глубине 8-9 м. К берегам
численность зоопланктона на данной глубине возрастала. Вероятно, стратегия пищевого
поведения зоопланктона тесно связана c эксплуатацией высокопродуктивных зон
прибрежного примыкания термоклина.
Радиальные гидрологические разрезы озера Шира. Зондирование выполнено от
центральной станции (N54°30.383’, E90°12.040’) к юго-восточному берегу (а, б, в) с
уклоном дна 6° и северо-восточному берегу (г, д, е) с уклоном дна 0.7°. Измеряемые
параметры: температура, °С (а, г); соленость, ppt (б, д); хлорофилл «а», мкг л-1 (в, е).
Рассеяние звукового сигнала в оз. Шира 4 августа 2012 г., 10:32:39. Желтый цвет
характеризует концентрацию зоопланктона.
18
Приоритетное направление VI.51. Биотехнология.
Междисциплинарный проект 71 . Магнитные эффекты в биологически значимых
системах.
Координатор проекта ак. Ю.Н. Молин, ИХКГ СО РАН
№ гос. регистрации 01201373877
В совместных исследованиях с ИХКГ СО РАН обнаружен эффект стимуляции
люминесценции мицелия светящегося гриба Neonothopanus nambi ионизирующим
излучением (Рис.). Предложена гипотеза, что стимуляция свечения связана с
радиационной генерацией радикалов в водной среде, окружающей и заполняющей
мицелий. На основании расчетов радиационных выходов радикалов и характерного вида
кинетик (наличие индукционного периода и фазы разгона) можно предполагать, что
облучение инициирует цепной процесс с участием активных форм кислорода. Например,
наблюдаемый эффект может быть опосредован инициацией цикла перекисного окисления
липидов. Высказано предположение: повышение свечения мицелия является внешним
проявлением запускаемого ионизирующим облучением цикла перекисного окисления
мембран с генерацией значительного количества активных форм кислорода; финальное,
резкое падение светопродукции (Рис.) и визуально наблюдаемая гибель гриба связаны с
нарушением работы мембранно-связанных ферментных комплексов в результате
окислительного повреждения мембраны.
400
Signal, a. u.
1- turn on
2- turn off
200
2
1
0
0
60
120 180 240 300 360 420 480 540 600 660 720 780
Time, min
Кинетика люминесценции фрагмента пленочного мицелия N. nambi до и после
воздействия ионизирующего излучения. Стрелками обозначены моменты включения
(маркер 1) и отключения (маркер 2) рентгеновского облучения образца.
Приоритетное направление VI.46 Структура и функции биомолекул и надмолекулярных
комплексов.
Междисциплинарный проект 139. Создание биолюминесцентных репортеров,
направленных на выявление низко- и ультранизкокопийных белков
Координатор проекта д.б.н. Л.А. Франк, ИБФ СО РАН
№ гос. регистрации 01201351508
Сконструированы два вектора – pFLAG-OmpA-14D5ab-Rm7 и pFLAG-14D5ab и
получен гибридный белок 14D5ab-Rm7 (химерное миниантитело к белку Е вируса
клещевого энцефалита - люцифераза Renilla) экспрессией в периплазматическое
пространство клеток E.coli BL21 RIPL либо в цитоплазму клеток Rosetta-gami2,
19
Áèî ëþ ì èí åñöåí öèÿ, î òí .åä.
соответственно. Показано, что экспрессия в цитоплазме E.coli Rosetta-gami2 обеспечивает
выход целевого белка 1 мг/г клеточной пасты с сохранением биоспецифического сродства
к молекуле-мишени (Кd гибрида=9х10-8 М; Кd исх. антитела=6х10-8 М).
Показано, при получении гибридов наноантитело-фотопротеин обелин
бактериальной экспрессией в виде телец-включения оба домена сохраняют свою
функциональную активность - сродство к молекуле-мишени (ФНО-альфа) и Са2зависимую биолюминесценцию. Аффинность гибрида обусловлена свойствами
наноантитела и полученная в ИХБФМ СО РАН их обширная библиотека является базой
для создания высокочувствительного иммуноанализа open-sandwich типа.
16000
12000
8000
4000
0
0.001
0.01
0.1
1
[14D5ab-Rm7], ì êÌ
Слева: 12.5% SDS-PAGE образцов, полученных при выделении гибридного белка 14D5abRm7-His6. в клетках E.coli штамм Rosetta-gami2: 1,2 – тотальные клеточные белки до и
после индукции; 3- цитоплазматическая фракция; 4 – препарат целевого белка после
очистки из цитоплазмы; 5 – стандартные белки. Стрелка показывает полосу целевого
гибридного белка.
Справа: Твердофазный анализ взаимодействия гибридного белка 14D5ab-Rm7, с
рекомбинантным белком Е вируса клещевого энцефалита.
Проекты партнерских фундаментальных исследований СО РАН на 2012-2014 годы
Приоритетное направление VI.43. Экология организмов и сообществ.
Партнерский проект № 8, выполняемый совместно с организациями УрО РАН.
Влияние глобального изменения температуры на биохимическое качество водных
беспозвоночных как кормовой базы рыб
Координатор проекта д.б.н. М.И. Гладышев, ИБФ СО РАН
№ гос. регистрации 01201373873
В озёрах различных климатических зон исследовано биохимическое качество
основных кормовых объектов молоди рыб - двух групп планктонных ракообразных,
Cladocera и Copepoda. Установлено, что различия в содержании докозагексаеновой
кислоты (ДГК, 22:6n-3), имеющей ключевое значение для формирования нервной системы
рыб, в кладоцерах и копеподах обусловлены в первую очередь их филогенетическими
особенностями, а не температурными различиями местообитаний. Впервые доказано, что,
вопреки существующим представлениям, и в холодных, и в тёплых озёрах копеподы
содержат существенно больше ДГК, чем кладоцеры, и, следовательно, имеют более
высокую биохимическую ценность как кормовые объекты для молоди рыб.
20
Корень 2
30
Bolshezemelskaya
tundra
Russia
25
20
Belarus
Ergaki mountains
15
10
Kamchatka
5
Корень 2
0
-5
-10
-15
-20
-20
-15
-10
-5
0
5
10
15
20
25
Корень 1
Результаты многомерного дискриминантного анализа жирнокислотного состава
Cladocera и Copepoda тёплых озёр (ТО) и холодных озёр (ХО). Кружки закрашенные –
Cladocera ТО, кружки пустые – Cladocera ХО, треугольники закрашенные – Copepoda
ТО, треугольники пустые – Copepoda ХО.
Приоритетное направление VI.43. Экология организмов и сообществ.
Партнерский проект № 4, выполняемый совместно с организациями Тайваня.
Структура и функции микробных сообществ в стратифицированных озерах Хакасии в
настоящем и прошлом: наблюдения и биофизические модели
Координатор проекта ак. А.Г. Дегерменджи
№ гос. регистрации 131017150309
На основе анализа натурных данных за период наблюдений с 2002 по 2013 гг.
выявлено, что межгодовые вариации глубины перемешивания водной толщи озера Шира
существенно определялись изменением подледного объема воды, который, в свою
очередь определялся разностью между уровнем поверхности озера и толщиной льда.
Показано, что в периоды роста уровня воды глубокие перемешивания миксолимниона
менее вероятны, а при снижении уровня воды – более вероятны. Полученная информация
будет использована при модернизации математической прогнозной модели и полезна при
палеолимнологических реконструкциях.
Высота поверхности над уровнем моря и характеристики стратификации озера Шира в
подледные периоды: высота поверхности над уровнем моря ( ); потенциальная энергия
стратификации (стабильность по Шмидту) ( ); вариации уровня нижней кромки льда
(ΔHL) ( ).
21
3.3. Результаты работы молодых ученых, получивших финансирование по научным
темам, утвержденным постановлением Президиума СО РАН от 13.01.2011 № 11 «О
выделении дополнительных ставок научным организациям СО РАН для зачисления
в штат молодых ученых
н.с. ИБФ СО РАН к.б.н. В.В. Красицкая
Тема: «Получение и изучение новых биолюминесцентных репортерных белков и
разработка мультипараметрического молекулярного микроанализа на их основе»
Основные результаты исследований:
1. Разработан способ определения однонуклеотидного полиморфизма (SNP) на
основе реакции удлинения праймера (PEXT) с последующим биолюминесцентным
твердофазным микроанализом продуктов. В качестве репортеров используются
светоизлучающие белки - обелины, обладающие разными характеристиками
биолюминесцентных реакций.
Показана перспективность способа на примере генотипирования полиморфизмов
генов, контролирующих свертывание крови и приводящих к тромбоэмболическим
заболеваниям: гена проакцелерина - пятого коагуляционного фактора (F5) по сайту 1691
G→A (R506Q), гена метилентетрагидрофолатредуктазы (MTHFR) по сайту 677 С→Т
(А223V), гена протромбина - коагуляционного фактора II (F2) по сайту 20210 G→A и гена
коагуляционного фактора VII (F7) по сайту 10976 G→A (R353Q).
Проведена оценка аналитических характеристик предложенного способа
генотипирования однонуклеотидного полиморфизма, а также показателей его затратности
в сравнении с коммерческим тестом НПО «Литех», основанным на технологии ПЦР в
реальном времени. Показано, что способ является высокочувствительным (для анализа
достаточно 10 фмоль ДНК матрицы), и в отличие от теста «Литех» не зависит от метода и
источника выделения геномной ДНК. Высокая воспроизводимость свидетельствует о
надежности метода. По трудозатратам метод не отличается от ПЦР в реальном времени.
Полученные результаты показывают пригодность метода для использования в практике
клинических лабораторий.
2. В рамках интеграционного проекта СО РАН №139:

Проведены исследования по получению слитых белков миниантителорепортерный белок обелин как потенциальных высокочувствительных меток для
использования в биолюминесцентном иммуноанализе. В качестве антитела использовали
миниантитела 93ms4 и 4MA2 к фактору некроза опухоли альфа (αФНО), представляющие
собой вариабельный домен легкой и тяжёлой цепи моноклонального антитела,
соответственно. ДНК фрагменты, кодирующие миниантитела были получены методом
фагового дисплея в ИХБФМ СО РАН. В ходе работы сконструированы плазмидные
вектора pET22-93ms4-Obe и pET22-4MA2-Obe, содержащие в одной рамке считывания:
ген миниантитела 93ms4 или 4MA2 и ген фотопротеина обелина. Правильность
конструкций подтверждена секвенированием. Полученный вектор обеспечивает под
контролем промотора лактозного оперона в клетках Е.coli (штамм BL21 CodonPlus (DE3)RIPL) высокий уровень синтеза гибридных белков 93ms4-Obe (MW = 35.7 кДа) и 4МА2Оbe (MW = 37.2 кДа), в виде телец включения. Оба белка обладают биолюминесцентной
активностью фотопротеинового домена. Проведен поиск условий очистки и рефолдинга
полученных гибридов для обеспечения аффинности домена миниантитела к αФНО
человека. Показано, что химерный белок 93ms4-Obe обладает большей аффинностью к
αФНО (Кафф = (5 ± 0,5) × 10-6 М-1), чем 4MA2-Obe и может быть использован в качестве
метки для разработки «open-sаndwich» анализа ФНОα человека.

Был разработан биолюминесцентный анализ для детекции антител к основному
белку миелина (ОБМ) в биологических образцах. Показано, что появление
протеолитических анти-ОБМ аутоантител, является характерной чертой развития
рассеянного склероза. Для выявления этих аутоантител были получены коньюгаты 2'-F-Py
22
РНК аптамера, обладающего высокой аффинностью к анти-ОБМ аутоантителам,
(лаборатория химии РНК ИХБФМ СО РАН) и фотопротеина обелина. Показано в
модельных экспериментах, что коньюгат может быть использован как метка в
твердофазном микроанализе патологических аутоантител. Чувствительность анализа
составляет 1,56 нМ анти-ОБМ аутоантител. Полученные коньюгаты не теряют активности
при замораживании и при хранении при 8 °С в течение 3-х недель. Разработанный метод
анализа анти-ОБМ аутоантител является высокочувствительным, быстрым и простым в
исполнении. (Статья отправлена в печать).
3. В рамках гранта РФФИ №12-04-00753/13 были проведены исследования по
влиянию модификации С-конца фотопротеина обелина на его стабильность и
биолюминесцентную активность.
В результате работы было сконструировано два плазмидных вектора (pET19-OLY(GGS)3-Streptag и pET19-OLY-SA-Streptag), которые экспрессировали в клетках Е.coli
(штамм BL21 CodonPlus (DE3)-RIPL). Клетки синтезировали гибридный белок, состоящий
из фотопротеина обелина с С-конца у которого находится тирозин, линкер ((GGS)3 или
SA) и полипептид, афинный к стрептавидину (StreptagII). Белки были получены в чистом
виде и изучены их свойства. Гибриды стабильны (ICa free /ICa=4,5x10-6 для OLY-(GGS)3Streptag и 7,5x10-6 для OLY-SA-Streptag), обладают биолюминесцентной активностью
(38,14% от обелина дикого типа для OLY-(GGS)3-Streptag и 14,56% для OLY-SA-Streptag)
(Статья отправлена в печать).
Список публикаций:
1. Krasitskaya V.V., Burakova L.P., Frank L.A. Simultaneous determination of SNP
genotypes by photoprotein obelin and R. muelleri luciferase // abstract of the 17th International
Symposium on Bioluminescence and Chemiluminescence // Luminescence - 2012. V 27; N 2;
p.129-130.
2. Krasitskaya V.V., Korneeva S.I., Kudryavtsev A.N., Markova S.V., Stepanyuk G.A.,
Frank L.A. Ca2+-triggered coelenterazine-binding protein from Renilla as an enzyme-dependent
label for binding assay // Anal Bioanal Chem, 2011, V.401, P. 2573-2579
3. Krasitskaya V.V., Kudryavtsev A.N., Shimomura O., Frank L.A. Obelin mutants as
reporters in bioluminescent dual-analyte binding assay // Anal. Methods. 2013, V.5, P. 636-640.
4. Kudryavtsev A.N., Krasitskaya V.V., Petunin A.I., Burakov A.Y., Frank L.A.
Simultaneous Bioluminescent Immunoassay of Serum Total and IgG-Bound Prolactins // Anal
Chem. 2012, V 84(7), P. 3119-3124.
5. Красицкая В.В., Буракова Л.П., Пышная И.А., Франк Л.А. Выявление аллельных
вариантов гена с помощью биолюминесцентных репортеров // Биоорган. химия, 2012. Т.
38, № 3, с. 342-350.
6. Красицкая В.В., Буракова Л.П., Франк Л.А., И.А. Ольховский, Субботина Т.Н.
Использование биолюминесцентных репортеров при определении аллельных вариантов
полиморфизма фактора V Лейден. Клиническая лабораторная диагностика – 2012. № 9; с.
64-65.
Патент РФ: № 2497128, Франк Л.А., Кудрявцев А.Н., Красицкая В.В., Высоцкий
Е.С. «Способ одновременного определения двух аналитов биолюминесцентным
молекулярным микроанализом». Дата приоритета 30.12.2011, решение от 10.06.2013 г.
Подготовлены и отправлены в печать рукописи статей в 2013 г.
Eremeeva E.V., Burakova L.P., Krasitskaya V.V., Kudryavtsev A.N., Shimomura O.,
Frank L.A. Hydrogen-bond network between C-terminus and Arg from the first α–helix
stabilizes a photoprotein molecule // Photochem. Photobiol. Sci.
M.A. Vorobjeva, V.V. Krasitskaya, V.V. Timoshenko, A.A. Fokina, G.A. Nevinsky,
A.G. Venyaminova, L.A. Frank. RNA aptamer against autoantibodies associated with multiple
sclerosis and bioluminescent detection probe on its basis// Anal. Chem.
23
м.н.с. ИБФ СО РАН, к.б.н. М.Ю. Медведева
Тема: «Изучение механизмов накопления техногенных радионуклидов и тяжелых
металлов погруженными макрофитами реки Енисей»
1)Радиоактивное загрязнение макрофитов р.Енисей
В 2010-2012 гг. – в период после остановки ядерного реактора на ГХК (апрель 2010
г.) была измерена активность γ-излучающих радионуклидов в биомассе погруженных
макрофитов р.Енисей (F.antipyretica, P. lucens, B. kauffmanii, E. сanadensis). Пробы
растений отбирались на участке реки от ГХК (с.Атаманово, 5 км от ГХК) до устья
р.Ангара (с.Стрелка, 250 км от ГХК). Исследования показали, что вблизи ГХК удельные
активности долгоживущих радионуклидов 60Сo и 137Cs в течение трех лет после остановки
реактора оставались на одном уровне, удельные активности 65Zn, 54Mn, 58Co –
уменьшились и в 2012 г. стали ниже пределов обнаружения. Удельные активности
короткоживущих радионуклидов 24Na, 51Cr и 239Np в биомассе макрофитов не
регистрировалась уже через 4 месяца после остановки реактора. В биомассе макрофитов,
обитающих на значительном удалении от ГХК (с.Стрелка, 250 км от ГХК) удельная
активность 60Сo, 137Cs и 152Eu была в 2-4 раза ниже, чем вблизи ГХК. Таким образом,
долгоживущие техногенные радионуклиды продолжают регистрироваться в биомассе
макрофитов в течение трех лет после остановки ядерного реактора на ГХК как вблизи
комбината, так и на значительном расстоянии от него по течению р.Енисей. В пробах
макрофитов, собранных выше по течению от ГХК (г.Красноярск и п.Есаулово), из
техногенных радионуклидов регистрировался только 137Cs с удельной активностью на
уровне глобальных выпадений (до 2 Бк/кг).
Оценка миграционной способности радионуклидов в биомассе макрофитов
р.Енисей с использованием метода химического фракционирования выявила высокую
подвижность 40K и 54Mn, по сравнению с 137Cs, 152Eu и 241Am. Последние были прочно
связаны с биомассой макрофитов и находились, преимущественно, в составе минеральной
фракции. Радионуклиды 65Zn и 60Co по миграционной способности занимали
промежуточное положение.
2) Содержание стабильных элементов в макрофитах р.Енисей
В 2010 – 2012 гг. исследовалось содержание стабильных элементов в биомассе
макрофитов (F.antipyretica, P. lucens, B. kauffmanii, E. сanadensis) на участке р.Енисей от
г.Красноярска (п.Удачный) до ближней зоны влияния ГХК (р-он с.Атаманово и с.Б.Балчуг
– 88 и 98 км от ГХК, соответственно). Зарегистрировано повышенное содержание
большинства металлов (кроме Zn) в биомассе макрофитов из ближней зоны ГХК, по
сравнению с районами выше по течению реки от ГХК. Снижение содержания некоторых
тяжелых металлов (Co, Fe, Mn) в биомассе макрофитов из этого района после остановки
реактора свидетельствует о том, что тяжелые металлы поступают в реку Енисей не только
с промышленно-бытовыми сбросами г.Красноярска, но и с радиоактивными сбросами
ГХК.
С помощью метода химического фракционирования было показано, что
распределение стабильных элементов (Zn, Co, Sc, Sb, Eu, Cs, Fe) по фракциям биомассы
F.antipyretica и P.lucens было аналогично распределению их радиоактивных изотопов.
Предположено, что накопление радионуклидов макрофитами происходит по изотопному
механизму.
В результате ранжирования стабильных элементов по прочности их связывания с
биомассой макрофитов, были получены следующие ряды (в порядке убывания):
Fe>Cs>Eu>Sc>Sb>Co>Ca>Sr>Zn – для F.antipyretica; Cs >Fe >Eu >Sc >Sb >Co > Sr=Ca >Zn
– для P.lucens.
3) Виды-биоиндикаторы техногенного загрязнения
В исследуемый период после остановки реакторного производства на ГХК, два вида
погруженных макрофитов р.Енисей - F.antipyretica и E. сanadensis – характеризовались
24
высоким накоплением как техногенных радионуклидов (60Сo, 137Cs и 152Eu), так и
большинства исследуемых тяжелых металлов. Поскольку элодея канадская (E. сanadensis)
относится к числу массовых видов, вегетирующих на р.Енисей и также является удобным
объектом для цитогенетических исследований, мы рекомендуем этот вид в качестве видабиоиндикатора техногенного загрязнения р.Енисей.
4) Цитогенетические исследования апикальной корневой меристемы E. сanadensis
Для оценки степени негативного воздействия на биоту в исследуемых районах реки
Енисей, была определена частота выхода цитогенетических нарушений в апикальной
корневой меристеме элодеи из 10 районов (от г.Красноярска до 330 км вниз по течению
р.Енисей). Отмечено возрастание частоты и спектра хромосомных аберраций в меристеме
элодеи, начиная от района вблизи сбросов ГХК и до 250 км от ГХК вниз по течению реки.
Обнаружена положительная корреляция между частотой встречаемости аберрантных анателофаз в меристеме элодеи и суммой техногенных радионуклидов в донных отложениях
исследуемого района (r2=0.92, p˂0.05), а также с содержанием в них 137Cs (r2=0.96, p˂0.05).
Публикации 2011-2013 гг.:
1. Болсуновский А.Я., Медведева М.Ю., Александрова Ю.В.
Интенсивность
накопления радионуклидов в биомассе водных растений реки Енисей //Известия
Самарского научного центра РАН. Т.13. №1 (4). 2011. Самара. С.776-779.
2. Зотина Т.А., Трофимова Е.А., Медведева М.Ю., Болсуновский А.Я.
Биотестирование донных отложений р. Енисей с использованием водного растения Elodea
сanadensis// Известия Самарского научного центра РАН. 2013. Т.15. №3 (1). с.554 - 559.
3. Медведева М.Ю., Болсуновский А.Я., Зотина Т.А. Цитогенетические нарушения у
водного растения Elodea canadensis в зоне техногенного загрязнения р.Енисей //
Сибирский экологический журнал, 2013 – отправлено в печать.
4. Zotina T., Trofimova E., Medvedeva M., Bolsunovsky A. Use of submersed
macrophytes as indicators of radioactive pollution of the Yenisei River: biomonitoring and
toxicity tests. 20th International Conference on Environmental Indicators (ICEI 2013). 16-19
Sept 2013, Trier, Germany. P.29.
5. Bolsunovsky A., Medvedeva M. Comparative evaluation of the bioavailability of
uranium and artificial radionuclides in the ecosystem of the Yenisei River basin: The First
Russian-Nordic Symposium on Radiochemistry (RNSR-2013). 21-24 October 2013, Moskow,
Russia. P.114.
6. Bolsunovsky A., Medvedeva M. Aquatic plants as bioindicators of radioactive
contamination of the Yenisei River: The Second International Conference on Environmental
Pollution, Restoration and Management, 4-8 March 2013, Hanoi, Vietnam. P.93-94.
3.4. Результаты, полученные в рамках федеральных целевых программ
Федеральная целевая программа «Ведущие научные школы»
Проект: Природа свечения живых организмов Рук.: ак. Гительзон И.И.
Определены оптимальные условия роста светящихся грибов N. nambi и выявлены
стимуляторы и ингибиторы свечения; получен и изучен биотинилированный in vivo Са2+регулируемый фотопротеин обелин; разработан многокомпонентный реагент
«Энзимолюм», основанный на совместно иммобилизованных в крахмальный гель
биферментной системе светящихся бактерий НАДН:ФМН-оксидоредуктаза-люцифераза и
ее субстратах (миристиновый альдегид и НАДН). Разработаны способы увеличения
чувствительности реагента к действию токсических веществ, подобраны условия
проведения анализа, позволяющие определять содержание токсических веществ с
максимальной эффективностью, соответствующей или ниже их уровня ПДК; установлены
химические структуры двух аналогов люциферина светящихся червей F. heliota и брутто
формула люциферина.
25
Грант № МД-3112.2012.4 Президента Российской Федерации для
государственной поддержки молодых российских ученых (докторов наук) (2012-2013
гг).
Проект ориентирован на получение новых фундаментальных знаний, необходимых
для конструирования тканеинженерных систем на основе разрушаемых биополимеров и
несущих клетки, необходимых для оптимизации условий для восстановления
повреждений кожных покровов. По результатам предыдущего этапа для конструирования
тканеинженерных систем использован метод электростатического формования растворов
разрушаемых
сополимеров,
образованных
мономерами
бетаи
гамма
гидрокиспроизводными масляной кислоты (П(3ГБ/4ГБ). Для повышения адгезионнных
свойств на поверхность матриксов были нанесены белковые покрытия (фибрин и коллаген
1 типа), далее
матриксы были засеяны предкультивированными аллогенными
фибробластами и кератиноцитами. Полученные гибридные тканеинженрные системы
использованы для закрытия модельных дефектов кожных покровов у экспериментальных
животных. Планиметрические и гистологические исследования показали эффективность
применения разработанных тканеинженерных систем для восстановления раневых
дефектов.
26
4. СВЕДЕНИЯ О ТЕМАТИКЕ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ
4.1. Гранты РФФИ
№ Шифр гранта
1
11-04-00168-а
2
11-05-00246-а
3
11-05-00552-а
4
12-04-00131-а
5
12-04-00753-а
6
12-04-00915-а
7
12-05-00078-а
8
12-05-00298-а
9
12-05-00494-а
10
12-04-91153ГФЕН_а
11
13-04-01514-а
Название проекта
Годы
Вклад пищевых источников и
собственного синтеза в концентрацию
незаменимых полиненасыщенных
жирных кислот в биомассе организмов
различных трофических уровней в
речной экосистеме
Оценка потенциального воздействия
изменения климата на таксономическую
структуру и биохимический состав
зоопланктона тундровых и горных озер
Пигменты и ДНК фототрофных
микроорганизмов в донных отложениях
меромиктических озер Южной Сибири
как индикатор прошлых климатических
изменений
Особенности функционирования
целентеразин-зависимых
биолюминесцентных белков светящихся
организмов: сравнительные
исследования Са2+ - регулируемых
фотопротеинов класса Hydrozoa
Конструирование, получение и
изучение свойств гибридных белков
Са2+-регулируемого фотопротеина
обелина с биоспецифическими
полипептидами
Концентрирование радионуклидов и
тяжёлых металлов макромицетами в
связи с проблемой биоремедиации
антропогенно-загрязнённых территорий
(на примере бассейна р. Енисей)
Сравнительная оценка миграционной
способности урана и техногенных
радионуклидов в экосистеме бассейна
реки Енисей
Потенциальное влияние потепления
климата на продукцию незаменимых
полиненасыщенных жирных кислот
бентосным сообществом рек
Мониторинг ЧПП (чистой первичной
продукции) лесных экосистем юга
Красноярского края с помощью
наземных и спутниковых измерений
Структурные исследования кальцийрегулируемых фотопротеинов и
целентеразин-зависимых люцифераз
Криптофитовые флагелляты как
20112013
27
Отв.
исполнитель
Гладышев М.И.
20112013
Дубовская О.П.
20112013
Дегерменджи А.Г.
20122014
Высоцкий Е.С.
2012 2013
Франк Л.А.
2012 2014
Дементьев Д.В.
2012 2014
Болсуновский
А.Я.
2012 2014
Калачева Г.С.
2012 2013
Иванова Ю.Д.
2012 2013
Высоцкий Е.С.
2013-
Бархатов Ю.В.
12
13-04-01305-а
13
13-05-00429-а
14
13-04-00860-а
15
13-06-00060-а
16
13-05-00853-а
17.
13-04-98004р_сибирь_а
18.
13-05-98043р_сибирь_а
19.
13-04-98119р_сибирь_а
20.
13-04-98072р_сибирь_а
компонент вещественно-обменного
цикла хемоклина меромиктических озер
Воздействие трития на морские
светящиеся бактерии. Радиационный
гормезис и радиационная токсичность
Реконструкция состояния экосистем
озер Северо-Минусинской котловины
(Хакасия) в позднем голоцене по
донным отложениям
Поиск группы амфибионтных
насекомых, поставляющих наземным
консументам незаменимую
докозагексаеновую кислоту – ключевой
компонент нервных тканей
позвоночных
Анализ и оценка антропогенной
нагрузки с целью повышения
экологической безопасности при
развитии энергетики России (на
примере Красноярского края как
представительного региона)
Внутренние волны и их влияние на
биологические компоненты
меромиктического озера
Развитие комплекса методов
биоиндикации и биотестирования для
определения вклада радиационного
фактора в техногенное загрязнение
экосистемы реки Енисей
Условия хемогенного
минералообразования в озере Шира:
физико-химическое моделирование,
эксперименты и реконструкция по
донным отложениям
Глобальное и региональное
моделирование выбросов парниковых
газов из зоны вечной мерзлоты, включая
экспериментальную оценку.
Детоксикация растворов солей металлов
гуминовыми веществами.
Биолюминесцентный мониторинг.
2014
20132015
Кудряшева Н.С.
20132015
Рогозин Д.Ю.
20132015
Сущик Н.Н.
20132014
Печуркин Н.С.
20132015
Толомеев А.П.
20132014
Болсуновский
А.Я.
20132014
Рогозин Д.Ю.
20132014
Дегерменджи А.Г.
20132014
Кудряшева Н.С.
Конкурс на получение доступа к электронным научным информационным ресурсам
зарубежных издательств
Шифр гранта
Название проекта
Годы Отв. исполнитель
21. РФФИ
Доступ к электронным научным
2013 Дегерменджи А.Г.
№ 13-00-14201-ир информационным ресурсам
зарубежных издательств
28
Федеральные целевые программы.
Грант Президента Российской Федерации по государственной поддержке ведущих
научных школ РФ
Шифр
Название проекта
Годы
Отв.исполнитель
гранта
НШПрирода свечения живых организмов.
2012 Руководитель:
3951.2012.4
ак. Гительзон И.И.
Грант Президента Российской Федерации по государственной поддержке молодых
российских ученых
Шифр
Название проекта
Годы
Отв.исполнитель
гранта
МДРазработка тканевых эквивалентов кожи 2012- д.б.н. Шишацкая Е.И.
3112.2012.4
и раневых покрытий на основе
2013
полигидроксиалканоатов.
4.2.
4.3. Программы Президиума РАН
Энергетические аспекты глубокой переработки ископаемого и возобновляемого
углеродсодержащего сырья № 3
(координатор: академик РАН Моисеев И.И.)
Шифр гранта
Название проекта
Годы Отв. исполнитель
Проект 3.10
Исследование липидов черных илов на 2012- д.б.н. Гладышев М.И.,
предмет их использования как сырья
2014 лаб.
для получения биотоплива.
экспериментальной
гидроэкологии
Молекулярная и клеточная биология № 6
(координатор: академик РАН Георгиев Г.П.)
Шифр гранта
Название проекта
Годы Отв. исполнитель
Проект 6.8
Люциферазы и фотопротеины
2013- ак. Гительзон И.И.
различных светящихся организмов:
2017 к.б.н. Высоцкий Е.С.,
молекулярные механизмы
группа советника РАН;
функционирования и применение в
лаб. фотобиологии
микроанализе.
Фундаментальные основы технологий наноструктур и наноматериалов № 24
(координатор: академик РАН Алферов Ж.И.)
Шифр гранта
Название проекта
Годы Отв. исполнитель
Проект
Наноалмазы детонационного синтеза - 2013- ак. Гительзон И.И.
24.57
базовая основа конструирования новых 2015 д.б.н. Бондарь В.С.,
систем адресной доставки
группа советника РАН;
лекарственных препаратов и
лаб.
биохимической диагностики
нанобиотехнологии и
биолюминесценции
Живая природа: современное состояние и проблемы развития № 30
(координатор: академик РАН Павлов Д.С.)
Шифр гранта
Название проекта
Годы Отв. исполнитель
Проект
Биоиндикация и биотестирование
2013- д.б.н.
30.5.
степени антропогенной нагрузки на
2014 Болсуновский А.Я.,
экосистему среднего участка реки
лаб. радиоэкологии
Енисей с использованием разных видов
водных растений.
Проект
Анализ изменений структуры
2013- академик РАН
30.8.
планктонных сообществ в экосистемах 2014 Дегерменджи А.Г.,
соленых озер Северо-Минусинской
к.ф.-м.н. Рогозин Д.Ю.,
29
котловины (Хакасия) в позднем
голоцене.
лаб. биофизики
экосистем
4.4. Программы Президиума СО РАН
Междисциплинарные интеграционные проекты
Шифр гранта Название проекта
Годы Отв. исполнитель
№ 21
Исследование закономерностей и
2012- Координатор проекта:
тенденций развития
2014 чл.-к. Федотов А.М.,
самоорганизующихся систем на примере
ИВТ СО РАН
веб-пространства и биологических
отв. исполнитель:
сообществ
д.ф.-м.н. Барцев С.И.,
лаб. теоретической
биофизики
№ 34
Цикличность в биогеологических
2012- Координатор проекта:
седиментационных системах
2014 д.г.-м.н. Калугин И.А.,
Центральной Азии на абсолютной
ИГМ СО РАН
временной шкале голоцена: глобальный
отв. исполнитель:
отклик солнечно-земных связей
к.ф.-м.н. Рогозин Д.Ю.,
лаб. биофизики
экосистем
№ 56
Прогнозное моделирование и
2012- Координатор проекта:
междисциплинарные комплексные
2014 ак. Дегерменджи А.Г.,
исследования многолетней динамики
лаб. биофизики
сосотояния экосистем меромиктических
экосистем
озер Сибири
№ 71
Магнитные эффекты в биологически
2012- Координатор проекта:
значимых системах
2014 ак. Молин Ю.Н.,
ИХКГ СО РАН
отв. исполнитель:
д.б.н. Бондарь В.С.,
лаб.
нанобиотехнологии и
биолюминесценции
№ 139
Создание биолюминесцентных
2012- Координатор проекта:
репортеров, направленных на выявление 2014 д.б.н. Франк Л.А.,
низко- и ультранизкокопийных белков
лаб. фотобиологии,
ИБФ СО РАН
Интеграционные проекты со сторонними научными организациями
Шифр гранта
Название проекта
Годы
Отв.исполнитель
№8
Влияние глобального изменения
2012- отв. исполнитель:
(УрО РАН)
температуры на биохимическое качество 2014 д.б.н. Гладышев М.И.,
водных беспозвоночных как кормовой
лаб.
базы рыб.
экспериментальной
гидроэкологии
№4
Структура и функции микробных
2013- отв. исполнитель:
(Тайвань)
сообществ в стратифицированных озерах 2015 акад. РАН
Хакасии в настоящем и прошлом:
Дегерменджи А.Г.,
наблюдения и биофизические модели.
лаб. биофизики
экосистем
30
4.5. Региональная программа Красноярского фонда поддержки научной и научнотехнической деятельности
1. РФФИ- Региональный конкурс СИБИРЬ № 13-04-98004-р_сибирь_а.
Проект: «Развитие комплекса методов биоиндикации и биотестирования для определения
вклада радиационного фактора в техногенное загрязнение экосистемы реки Енисей», рук.:
д.б.н. Болсуновский А.Я., лаб. радиоэкологии.
2. РФФИ- Региональный конкурс СИБИРЬ № 13-05-98043-р_сибирь_а.
Проект: «Условия хемогенного минералообразования в озере Шира: физико-химическое
моделирование, эксперименты и реконструкция по донным отложениям», рук.: к.ф.-м.н.
Рогозин Д.Ю., лаб. биофизики экосистем.
3. РФФИ- Региональный конкурс СИБИРЬ № 13-04-98119-р_сибирь_а.
Проект: «Глобальное и региональное моделирование выбросов парниковых газов из зоны
вечной мерзлоты, включая экспериментальную оценку», рук.: академик РАН
Дегерменджи А.Г., лаб. биофизики экосистем.
4. РФФИ- Региональный конкурс СИБИРЬ № 13-04-98072-р_сибирь_а.
Проект: «Детоксикация растворов солей металлов гуминовыми веществами.
Биолюминесцентный мониторинг», рук.: д.ф.-м.н. Кудряшева Н.С., лаб. фотобиологии.
4.6. ЗАРУБЕЖНЫЕ КОНТРАКТЫ И ГРАНТЫ
Фин. организация;
Название проекта
шифр гранта
Контракт № 353001156
Радиоэкологические
Федеральное Агентство
исследования водной
защиты населения Швей- экосистемы реки Енисей
царской Конфедерации,
г. Шпиц, Швейцария.
Контракт № 17941
Характеристика
Международное агентство радиоактивных частиц
по атомной энергии
р. Енисей и оценка их
(МАГАТЭ)
потенциального влияния
г. Вена, Австрия.
на экосистему реки
методами
биотестирования
Международный грант № Специальное моделиро263076
вание биологического
Институт космической
загрязнения бытового
медицины и физиологии отсека применительно к
(MEDES),
космическим условиям
г. Тулуза, Франция.
4.7. ХОЗДОГОВОРЫ
Заказчик
1. ОАО «ТомскНИПИнефть», г. Томск
Тема: Апробации методики определения
токсичности питьевых, поверхностных, подземных,
морских и сточных вод, водяных растворов
отдельных веществ и их смесей по изменению
уровня биолюминесценции светящихся бактерий
Photobacterium phosphoreum для анализа водных
вытяжек из почв и донных отложений.
31
Годы
Отв. исполнитель
25.02.201331.12.2013
д.б.н.
А.Я.Болсуновский,
лаб. радиоэкологии
29.07.201328.07.2014
д.б.н.
А.Я.Болсуновский,
лаб. радиоэкологии
01.06.2011 - д.б.н.,
31.12.2013
А.А.Тихомиров,
лаб. управления
биосинтезом
фототрофов
номер
договора
№
ОИ-13298
17.06.201331.08.2013
отв. исполнитель
к.б.н. Родичева Э.К.
лаб.
нанобиотехнологии
и
биолюминесценции
2. ЗАО «Белый Яр, Красноярский край.
Тема: Исследование и оценка качества кормов для
крупного рогатого скота.
3. ЗАО «Искра Ленина», Красноярский край.
Тема: Исследование и оценка качества кормов для
крупного рогатого скота.
4. ЗАО «Светлолобовское», Красноярский край.
Тема: Исследование и оценка качества кормов для
крупного рогатого скота.
5. ЗАО «Сибирь-1», Красноярский край.
Тема: Исследование и оценка качества кормов для
крупного рогатого скота.
6. ФГАОУ ВПО « Сибирский федеральный
университет», г. Красноярск.
Тема: Подготовка и санитарно-химические
исследования биосовместимых природных
полимеров, способных к деструкции,
предназначенных для разработки изделий для
реконструктивной медицины
32
№ 1301
15.10.201315.11.2013
№ 1302
15.10.201315.11.2013
№ 1303
15.10.201315.11.2013
№ 1304
15.10.201315.11.2013
№ 2069/13
17.10.201331.05.2014
к.б.н. Калачева Г.С.,
лаб. аналитической
химии
к.б.н. Калачева Г.С.,
лаб. аналитической
химии
к.б.н. Калачева Г.С.,
лаб. аналитической
химии
к.б.н. Калачева Г.С.,
лаб. аналитической
химии
д.б.н. Волова Т.Г.,
лаб.
хемоавтотрофного
биосинтеза
5. ПОДДЕРЖКА СТАЦИОНАРОВ
Средства были получены на поддержку стационара ИБФ СО РАН на озере Шира.
Основные результаты исследований, проведенных на стационаре
Физико-химический мониторинг, гидрофизические и модельные исследования
Исследована связь между пространственной горизонтальной неоднородностью
профилей температуры и солености с пространственным распределением концентраций
фито- и зоопланктона в озере Шира. Анализ распределения флуоресцентных полей
показал роль зоны прибрежного примыкания термоклина в развитии фитопланктона. При
движении от центра озера к берегам глубинный пик концентрации фитопланктона (10 м),
достигая прибрежной зоны озера, частично размывается, и поднимается в верхние
горизонты (Рис. 1). Распределение зоопланктона (Рис. 2) имело высокий пик численности
у поверхности и слабо выраженный глубинный пик на глубине 8-9 м. К берегам
численность зоопланктона на данной глубине возрастала. Вероятно, стратегия пищевого
поведения зоопланктона тесно связана c эксплуатацией высокопродуктивных зон
прибрежного примыкания термоклина.
Радиальные гидрологические разрезы озера Шира. Зондирование выполнено от
центральной станции (N54°30.383’, E90°12.040’) к юго-восточному берегу (а, б, в) с
уклоном дна 6° и северо-восточному берегу (г, д, е) с уклоном дна 0.7°. Измеряемые
параметры: температура, °С (а, г); соленость, ppt (б, д); хлорофилл «а», мкг л-1 (в, е).
33
Рассеяние звукового сигнала в оз. Шира 4 августа 2012 г., 10:32:39. Желтый цвет
характеризует концентрацию зоопланктона.
0.4
0.3
-1
Б
2012
2013
0.1
0.05
0
-1
-0.05
-2
Снеорг, г м сут
0.2
0.05
0.03
N, г м сут
2013
0
0.15
Хл а, мг м-2 сут-1
2012
0.1
0.25
2012
2013
Г
2012
2013
Д
2012
В
0.01
-0.01
1.4
1.2
1
0.8
0.6
0.4
0.2
0
-0.2
1.2
БХл а, мг м-2 сут-1
А
0.2
-2
-2
Сорг, г м сут
-1
Исследована динамика седиментационного потока органического и неорганического
углерода, азота, хлорофилла а и бактериохлорофилла а в оз. Шира в период с октября
2012 г. по октябрь 2013 г.
1
2013
0.8
0.6
0.4
0.2
0
-0.2
март-май
май-июль
июльсентябрь
сентябрьоктябрь
13 м
октябрьмарт
15 м
март-май
май-июль
июльсентябрь
сентябрьоктябрь
20 м
Седиментационные потоки в оз. Шира в 2012 г и 2013 г: А – углерод органический; Б
– углерод неорганический (карбонаты); В – азот ; Г – хлорофилл а; Д –
бактериохлорофилл а.
34
Показано, что минимальный поток всех вышеперечисленных компонентов
наблюдался в подледный период. В период открытой воды, динамика осадочного
процесса была схожей: поступление органики, карбонатных материалов и хлорофилла а в
донные отложения нарастало от весны к осени. В отличие от вышеуказанных
компонентов, динамика осадочного потока пигментом пурпурных серных бактерий
бактериохлорофилла а была различной в 2012 и 2013 г. В 2013 г. отсутствовал мощный
весенний максимум, и в конце лета поток был значительно меньше, чем в 2012 году.
Таким образом, показано, что продукция пурпурных серных бактерий может существенно
различаться по годам. Полученная оценка осадочных потоков может быть полезна для
интерпретации и расшифровки годичных слоев в кернах донных отложений.
Палеолимнологические исследования
В датированных донных отложениях озера Шира методом высокоэффективной
жидкостной хроматографии оценено вертикальное распределение каротиноидов,
являющихся биомаркерами фототрофных организмов, населявших озеро в прошлом.
Показано, что распределение окенона, характерного пигмента пурпурных серных
бактерий, по глубине осадков неравномерное, что указывает на обратимые изменения
характера стратификации озера Шира, происходившие в последние ~4500 лет (Рис. 4).
Пик концентрации окенона в слоях около 110-130 мм (примерно 1945-1970 гг.) указывает
на сильно выраженные меромиктические свойства озера в тот период. Причинами
изменения режима стратификации могут являться изменения уровня и солености воды в
озере.
мкг г сух. веса -1
0
100
200 0
мкг г сух. веса -1
100
200
0
100
мкг г сух. веса
% от сух. веса
отн.единицы
200
0
10
20
30
0
200
400
600
-1
800
1000
5
145
1917
Нет данных
285
1628
425
565
Глубина, мм
845
840
985
1125
500
О
РХ
1265
1405
- 500
1545
-1000
1685
1825
1965
Примерный возраст
1207
705
Лютеин
Зеаксантин
Хл а
Органика
2105
2245
Окенон
-1500
- 2000
- 2500
2385
2525
Вертикальное распределение каротиноидов фототрофных организмов в донных
отложениях озера Шира.
Биологические исследования
Продолжены исследования вертикальных распределения криптофитовых водорослей
(фитофлагеллят) и инфузорий пелагиали озера Шира. Показано, что в осенне-зимний
период сообщество криптофитовых водорослей, представленных видами Cryptomonas
salina и Cryptomonas sp., не формирует четко выраженного пика численности и
распространено по всему миксолимниону, составляя не более 80 кл/мл в своих
максимальных значениях. Глубинный максимум, характерный для весенне-летнего
периода развития популяции, в осенне-зимний период отсутствует. Однако средние
35
концентрации по всей водной толще озера в зимний период были достаточно высокими
(до 50 кл/мл), что сравнимо с численностью криптофитовых водорослей во время
весеннего максимума и существенно превосходят летние значения численности.
Инфузории пелагиальной зоны озера Шира осенью и зимой 2012-2013 годов, также
как и в весенне-летний период, были представлены видами Cyclidium sp. и Strombidium sp.
Их максимальная численность наблюдалась в сентябре 2012 года в зоне, близкой к
хемоклину (10-12 м) и достигала до 20 кл/мл, что, на порядок ниже максимальных летних
значений. Среднее значение концентрации инфузорий по всей водной толще также было
низким и составляло около 10 кл/мл. В более холодное время года инфузории практически
отсутствовали в озере.
кл/мл
20
40
кл/мл
60
80
100
0
0
0
2
2
4
4
6
6
глубина, м
глубина, м
0
8
10
30
8
10
10
12
12
14
14
04.09.2012
04.09.2012
16
20
16
24.10.2012
24.10.2012
16.03.2013
a)
b)
Вертикальное распределение численности криптофитовых водорослей (а) и
инфузорий (b) в пелагиальной зоне озера Шира в осенне-зимние месяцы 2012-2013 годов.
90
80
криптофитовые водоросли
70
инфузории
кл/мл
60
50
40
30
20
10
03
.2
01
3
16
.
10
.2
01
2
24
.
09
.2
01
2
04
.
08
.2
01
2
04
.
07
.2
01
2
08
.
26
.
05
.2
01
2.
0
Средняя концентрация в водной толще пелагиальной зоны озера Шира
криптофитовых водорослей и инфузорий за годовой период 2012-2013 годов.
Перечень интеграционных и других проектов, выполненных с
использованием стационара:
Интеграционные и партнерские проекты СО РАН:
Проект 4. Биоразнообразие, структура сообществ и метагеномика микроорганизмов
соленых озер Хакасии, Сибирь
36
Проект 34. Цикличность в биогеологических седиментационных системах
Центральной Азии на абсолютной временной шкале голоцена: глобальный отклик
солнечно-земных связей
Проект 56. Прогнозное моделирование
и междисциплинарные комплексные
исследования многолетней динамики состояния экосистем меромиктических озер Сибири
Программы фундаментальных исследований РАН
Биологическое разнообразие. Подпрограмма 1. Проект 15. «Микробные сообщества
стратифицированных озер Южной Сибири: мониторинг и экологический прогноз»
Другие проекты:
РФФИ №13-05-00853 (Внутренние волны и их влияние на биологические
компоненты меромиктического озера)
РФФИ 13-05-00429-а (Реконструкция состояния экосистем озер СевероМинусинской котловины (Хакасия) в позднем голоцене по донным отложениям)
РФФИ 13-04-01514-а (Криптофитовые флагелляты как компонент вещественнообменного цикла хемоклина меромиктических озер)
РФФИ 11-05-00552-а (Пигменты и ДНК фототрофных микроорганизмов в донных
отложениях меромиктических озер Южной Сибири как индикатор прошлых
климатических изменений)
Количество человеко*дней, отработанных в отчетном году на стационаре
сотрудниками институтов СО РАН, других организаций, студентами,
школьниками, аспирантами и иностранными учеными;
Институт биофизики СО РАН – 180
Институт физики СО РАН – 8
Институт леса СО РАН - 6
Институт геологии и минералогии СО РАН – 18
Институт вычислительного моделирования СО РАН – 28
Лимнологический институт СО РАН – 11
Сибирский федеральный университет – 23
Иркутский государственный университет: 24
Итого: 284
Перечень публикаций в рецензируемых журналах, в которых нашли
отражение результаты, полученные при работе на стационаре в 2013 году
Kalugin I., Darin A., Rogozin D., Tretyakov G. (2013) Seasonal and centennial cycles of
carbonate mineralisation during the past 2500 years from varved sediment in Lake Shira, South
Siberia. // Quaternary International. V. 290-291C., P. 245-252.
Баранов В.И., Голенко Н.Н., Компаниец Л.А., Пака В.Т., Якубайлик Т.В.
Пространственно-временная изменчивость основных характеристик озера Шира в сезоне
2011-2012 гг. // Вестник Бурятского государственного университета. Математика,
Информатика, 9/2013. С. 148-156.
Дарьин А. В., Калугин И. А., Максимов М. А., Третьяков Г. А., Ракшун Я. В.
Сканирующий рентгенофлуоресцентный микроанализ годовых слоев в образцах донных
осадков оз. Шира // Известия РАН. Серия Физическая, 2013, т. 77, № 2, с. 207–209.
Объекты интеллектуальной собственности:
Патент на изобретение № 2495451 (приоритет изобретения 29.03.2012 г.) «Способ
определения вертикального распределения и размерной структуры зоопланктона в
водоеме». Авторы: Задереев Е.С., Толомеев А.П.
Материалы конференций
Darin A., Kalugin I., Maksimiva N., Markovich T., Rogozin D., Rakshun Y., Zizak I.,
Darin F., Sorokoletov D. Geochemical indicators of climate change in the annual layers of
37
bottom sediments lake Shira (South Siberia). 13th International Multidisciplinary scientific
Geoconference SGEM 2013, 16-22 June 2013, Albena, Bulgaria. Conference proceedings. 637642.
Tolomeev, A.P. The corrected body length of amphipods measured on digital images //
XVth international colloquium on Amphipoda, September 2-7 2013, Szczawnica, Poland
Zadereev E., Prokopkin I., Bukina E. The effect of climatic and biotic factors on the
stratification and the food web of the meromictic lake Shira (Russia: South Siberia): comparative
model analysis //32th Congress of the International Society of Limnology, August 4-9, 2013,
Budapest. Hungary, P. 284
Белолипецкий В.М., Генова С.Н. Дегерменджи А.Г., Рогозин Д.Ю. Многолетняя
динамика вертикальной термохалинной структуры озера Шира // Тезисы докл.
Международной научной конференции «Методы создания, исследования и
идентификации математических моделей», посвященной 85-летию со дня рождения А.С.
Алексеева. Новосибирск, 10-13 октября 2013 г. С. 19.
Якубайлик Т.В., Компаниец Л.А. Модельный анализ полей течений неглубокого
стратифицированного водоема. Международная конференция «Информационновычислительные технологии и математическое моделирование (ИВТ&ММ)». Кемерово,
23-30 июня 2013 г.
Якубайлик Т.В., Компаниец Л.А. Трехмерная численная модель исследования
ветровых течений в озере Шира на основе пакета GETM. Тезисы докладов
Международной научной конференции «Методы создания, исследования и
идентификации математических моделей». Новосибирск. Академгородок, 10-13 октября
2013 г. Новосибирск, 2013, с. 104.
ФИНАНСОВЫЙ ОТЧЕТ
Общие траты – 960000 рублей
В том числе
Оплата труда с начислениями (Ст 211 + Ст.213 ) – 350619 рублей на надбавки к
заработной плате работникам стационара .
Прочие выплаты (ст. 212) – 4700 рублей на суточные расходы
Услуги связи (ст. 221) – 1280 рублей на оплату телефонных переговоров.
Услуги по содержанию имущества (ст. 225) – 66518 рублей (4751 рублей – оплата
услуг по обработке территории стационара от клещей, 7225 рублей – оплата услуг по
вывозу мусора, 53902 рублей – оплата услуг по обслуживанию электрических сетей на
стационаре).
Прочие услуги (Ст. 226) – 351458 рублей (267951 руб. – оплата услуг по
круглосуточной охране стационара; 78120 рублей – оплата услуг по бытовому
обеспечению работы стационара в летнее время)
Увеличение стоимости основных средств (Ст.310) – 82619 рублей (46700 руб. –
автономная метеостанция, 20104 руб. - прибор T-FLOW для борьбы с водорослями, 3865 –
триммер, 11950 – насадка к мотору).
Увеличение стоимости материальных запасов (Ст.340) – 102805 рублей (16048
руб. – картриджи для химических анализов, 35932 руб. – ГСМ, 26756 – запчасти для
автомобиля ЛУАЗ, 24069 – расходные материалы для ремонта и бытового обслуживания
стационара)
38
6. ПОДДЕРЖКА ВИВАРИЕВ
1.
В 2013 г. по программе было выделено 470 000 руб.
Структура расходов: куда именно были потрачены деньги.
Заработная плата и начисления на выплаты по оплате труда – 29,7 %
Услуги связи – (местная и междугородняя связь)- 1 %
Транспортные услуги (командировка) – 6 %
Затраты на приобретение оборудования (шейкер-термостат, фотокамера для
документирования колоний и люминесценции грибов) – 37,5 %
Затраты на приобретение расходных материалов (питательные среды, реактивы и
расходные материалы для экспериментальных работ, канцелярские товары) – 19,5 %
Прочее (научно-исследовательские работы по идентификации грибов на основе
молекулярно-биологических методов) – 6,3 %
Прочие выплаты –
Гранты, полученные для работы по темам с использованием вивариев.
a.Грант «Биолюминесцентные биотехнологии» (рук. Осаму Шимомура), договор №
11. G34.31.0058 между Министерством образования и науки РФ, Федеральным
государственным
автономным
образовательным
учреждением
высшего
профессионального образования «Сибирский федеральный университет» (СФУ) и
ведущим ученым, 2011-2013.
b.
Грант Президента Российской Федерации НШ-3951.2012.4. «Научная школа
академика И.И. Гительзона», 2012-2013.
c.Интеграционный проект СО РАН №71
d.
Грант «Разработка научно-технических основ создания экспрессной
биолюминесцентной тест-системы для оценки токсичности наноматериалов» в рамках
ФЦП «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научнотехнологического комплекса России на 2007-2013 годы», номер госконтракта
14.513.11.0123, шифр заявки «2013-1.3-14-513-0119-037», 2013.
e.Грант Министерства образования и науки Российской Федерации в рамках ФЦП
«Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» на 2009 – 2013 годы по
теме «Биолюминесцентные сенсоры для определения токсичности на основе
микрофлюидной технологии», соглашение № 14.А18.21.1911, 2012-2013.
2.
3.
Важнейшие результаты, полученные при использовании виварных
животных:
А) Проведены работы для уточнения систематической принадлежности 3
коллекционных культур светящихся грибов на основе молекулярно-биологических
методов (совместно с БИН РАН). В результате этой работы 2 штамма светящихся грибов
отнесены к роду Armillaria, у выделенного в тропических лесах о.Борнео светящегося
гриба не удалось определить таксономическое положение, требуется провести адаптацию
методики для получения надежного результата.
Б) Для пополнения Коллекции проведен сбор опят различных видов в окрестностях
Красноярска, скомплектован гербарий и получено 10 чистых культур мицелия.
Установлено, что все чистые культуры обладают свечением. Разработан регламент
получения биомассы мицелия грибов в стационарной и погруженной культуре.
39
Интенсивность
люминесценции мицелия
N.nambi на твердых средах
Интенсивность
люминесценции мицелия
P.stipticus на твердых средах
Интенсивность
люминесценции мицелия
A.borealis на твердых средах
Обозначение: 1 – картофельно-сахарозный агар (PS), 2 – картофельно-глюкозный
агар (PG), 3 – агар Сабуро (Sab), 4 – фунгальный агар (F), 5 – агар с солодовым и
дрожжевым экстрактом (YM), 6 – солодовый агар (M).
В) Продолжены работы по изготовлению биотестов на основе светящихся бактерий,
которые используется для оценки: загрязненности воды в реках и озерах Сибири,
токсичности вновь синтезируемых медицинских препаратов, оценки радиотоксичности
водных образцов. Продолжены работы по производству КРАБов (комплектов реактивов)
для фундаментальных и прикладных исследований.
4.
Основные публикации: статьи, патенты.
1.
А. П. Пузырь, А. Е. Буров, С. Е. Медведева. Внеклеточная
биолюминесценция метаболитов мицелия cветящегося гриба Panellus stipticus
(IBSO_2301) при росте на агаризованной среде. //ДАН, 2013, том 448, № 4, с. 487–489.
2.
В. С. Бондарь, Э. К. Родичева, С. Е. Медведева, Н. А. Тюлькова, А. Б.
Тяглик, Б. А. Шпак, академик И. И. Гительзон. О механизме свечения гриба
Neonothopanus nambi. //ДАН, 2013, том 449, № 2, с. 223–227.
3.
Puzyr A.P., Burov A.E., Bondar V.S. Source of light emission in a luminous
mycelium of the fungus Panellus stipticus // Journal of Research in Biology, 2013, Vol.3, No.3,
pp.900-905.
4.
S. Medvedeva, E. Rodicheva, A. Puzyr, V. Bondar. Peculiarities of luminescence
of glowing fungi at the cultivation on the solid media of different composition and in submerged
culture /BIT’s 3-rd Annual World Congress of Microbes, Wuhan, China, July 30-August 1,
2013, P.248.
40
5.
Medvedeva S.E., Rodicheva E.K., Puzyr A.P., Bondar V.S., Melnikov A.R.,
Kobzeva T.V., Karogodina T.Y., Zikirin S.B., Stass D.V. Spectral and kinetic properties of
bioluminescence from luminous fungus N. nambi: Routes to its biological, chemical, and
physical activation and relation to plausible mechanism of luminescence // Recent Advances in
Health and Medical Sciences (4th RAHMS), Pafos, Cyprus, June 6-12, 2013, p.72.
6.
Kobzeva T.V., Karogodina T.Y., Zikirin S.B., Stass D.V., Puzyr A.P., Medvedeva
S.E., Bondar V.S. Spin trapping in the study of the mechanism of bioluminescence of luminous
fungus Neonothopanus nambi // Recent Advances in Health and Medical Sciences (4th
RAHMS), Pafos, Cyprus, June 6-12, 2013, p.90.
7.
S.Medvedeva, K.Artemenko, A.Krivosheenko, A.Rusinova, E.Rodicheva,
A.Puzyr, V.Bondar. Peculiarities of Luminescence of Luminous Higher Fungi at the Cultivation
on the Solid Media of Different Composition and in Submerged Culture //Microorganisms 2013
(в печати)
Представлено на конференциях:
1. S. Medvedeva, E. Rodicheva, A. Puzyr, V. Bondar. Peculiarities of luminescence of
glowing fungi at the cultivation on the solid media of different composition and in submerged
culture /BIT’s 3-rd Annual World Congress of Microbes, Wuhan, China, July 30-August 1,
2013.
2. Medvedeva S.E., Rodicheva E.K., Puzyr A.P., Bondar V.S., Melnikov A.R., Kobzeva
T.V., Karogodina T.Y., Zikirin S.B., Stass D.V. Spectral and kinetic properties of
bioluminescence from luminous fungus N. nambi: Routes to its biological, chemical, and
physical activation and relation to plausible mechanism of luminescence // Recent Advances in
Health and Medical Sciences (4th RAHMS), Pafos, Cyprus, June 6-12, 2013.
3. Kobzeva T.V., Karogodina T.Y., Zikirin S.B., Stass D.V., Puzyr A.P., Medvedeva S.E.,
Bondar V.S. Spin trapping in the study of the mechanism of bioluminescence of luminous
fungus Neonothopanus nambi // Recent Advances in Health and Medical Sciences (4th
RAHMS), Pafos, Cyprus, June 6-12, 2013.
41
7. МЕЖДУНАРОДНАЯ ДЕЯТЕЛЬНОСТЬ ИНСТИТУТА
7.1. О деятельности Международного центра замкнутых экологических систем (МЦ
ЗЭС)
В 2013 году завершены работы по выполнению международного проекта
BIOcontamination Specific Modelling in HAbitats Related to Space (BIOSMHARS) в рамках
Международной Европейской программы FP7. Работы выполнялись совместно с
Бельгийским ядерным центром, французским Институтом космической биологии и
медицины (г. Тулуза), финским Научно-исследовательским институтом (г. Тампере),
финским университетом ( г. Суоми) и ИМБП РАН.
В январе 2013 г. в г. Москве было проведено координационное совещание по
организации и научным проблемам, которые необходимо было решить в рамках
масштабного микробиологического эксперимента в компартменте БИОС-3 согласно
задачам проекта BIOSMHARS. Проф. Тихомиров выступил с докладом по подготовке
компартмента БИОС-3 к предстоящим экспериментам по проекту. С.н.с. Мануковский
Н.С. принял участие в обсуждении микробиологических аспектов методики подготовки к
микробиологическим экспериментам в БИОС-3. Были обсуждены методические и
технические вопросы изучения и контроля непатогенных микроорганизмов разных видов
в запланированных экспериментах. На основании результатов данного координационного
совещания были согласованы сроки и состав участников предстоящего эксперимента,
намеченного на февраль – март 2013 года. В эти сроки состоялся международный
микробиологический эксперимент в БИОС-3, участниками которого были от России ИБФ
СО РАН и ИМБП РАН, а иностранными участниками являлись ученые из финского
Научно-исследовательского института
(г. Тампере) и Университета Восточной
Финляндии (г. Суоми). В этом эксперименте на ИБФ СО РАН была возложена
ответственность за выполнение оперативных микробиологических анализов, научно
техническое обеспечение работ в системе БИОС-3. В процессе выполнения работ были
получены совместные микробиологические результаты с использованием непатогенной
микрофлоры, поставленной ИМБП РАН с Международной космической станции. Были
выполнены эксперименты по влиянию пространственных и временных характеристик на
распределение микрофлоры внутри компартмента БИОС-3. Эти экспериментальные
данные послужили основой для дальнейшего моделирования распределения микрофлоры
внутри помещений с учетом ее видовых особенностей и заданных параметров
окружающей среды. Над построением эти моделей в настоящее время работают финские
ученые из НИИ г. Тампере. По завершению построения этих моделей планируется серия
публикаций в рейтинговых научных журналах. Весь объем запланированных в БИОС-3
исследований был полностью выполнен. В мае 2013 г. в Брюсселе состоялось финальное
координационное совещание по данному проекту, где были подведены общие итоги
научно-технических работ по проекту BIOSMHARS. Отчетный доклад по части работ
проекта, за которую ответствен ИБФ СО РАН сделал руководитель проекта от ИБФ СО
РАН проф. Тихомиров А.А. В докладе были подведены общие итоги работы по проекту,
отмечены наиболее важные научные и технические вопросы, которые потребовалось
решить в ходе реализации проекта. В результате обсуждения этого доклада участники
совещания констатировали, что ИБФ СО РАН полностью выполнил поставленные перед
ним задачи, включая научные, технические и организационные вопросы. На данном
совещании рассматривались также вопросы по дальнейшему развитию исследований,
начатых в проекте BIOSMHARS. ИБФ СО РАН (докл. Тихомиров А.А.) предложил
развитие начатых микробиологических исследований с использованием более
усложненной инфраструктуры БИОС-3, приближающейся к реальной инфраструктуре
системы жизнеобеспечения(СЖО) космического назначения. В частности, было
предложено ввести в будущие эксперименты звено высших растений для оценки его роли
в микробиологическом пейзаже СЖО. Данное предложение с интересом было встречено
42
участниками совещания и зафиксировано как одно из наиболее перспективных вариантов
подготовки будущего совместного международного проекта в рамках новой программы
FP8.
В процессе выполнения второго этапа работ по гранту BIOSMHARS в 2013 году
ИБФ СО РАН получил от Европейского Союза финансовую поддержку в размере около
42000 ЕВРО, а общий объем финансовой поддержки за время выполнения проекта (20122013гг) составил около 98000 ЕВРО. В результате работы над проектом BIOSMHARS
ИБФ СО РАН создал компьютизированную систему контроля параметров среды в БИОС3 с возможностью их наблюдения через Internet заинтересованными организациями как в
России, так и за рубежом. Установлены и развиты научные контакты с новыми
европейскими партнерами. Намечены пути дальнейшего сотрудничества в рамках
создания новых совместных грантов в рамках открывающейся в 2014 году Европейской
программы FP8.
В июне 2013 года белорусской стороной утверждено решение о создании
совместной российско-белорусской лаборатории по инновационным процессам на базе
лаборатории фотосинтеза и минерального питания Института экспериментальной
ботаники НАН Белоруссии (Постановление № 243 Бюро Президиума НАН Беларуси).
Данная лаборатория создана в ответ на соответствующее постановление № 95 Бюро
биологических наук РАН о создании такой лаборатории при ИБФ СО РАН (зав. лаб. проф.
Тихомиров А.А.). Так как белорусская сторона утвердила создание данной лаборатории
практически годом позднее, то в оставшийся период 2013 года было решено план
совместных работ сосредоточить на поиске подходящих партнеров для совместных работ.
В конце ноября – начале декабря 2013 года по приглашению китайской стороны
состоялся визит делегации ИБФ СО РАН в количестве шести человек во главе с
директором ИБФ СО РАН академиком Дегерменджи А.Г. в Пекинский аэрокосмический
университет, где развернуто строительство системы жизнеобеспечения. Целью визита
является участие в работе международного совещания по замкнутым экосистемам и
обсуждение возможностей широкомасштабного научного сотрудничества в области
искусственных экологических систем. Подписан ряд документов, включая Соглашение о
создании совместной научной лаборатории по тематике замкнутых экосистем.
В целом, 2013 год для Международного Центра явился годом активных научных
контактов с европейскими партнерами, запланировано расширение контактов с
китайскими исследователями, окончательно документально оформлено сотрудничество с
белорусскими учеными.
7.2. Зарубежные командировки сотрудников Института
За отчетный период сотрудники Института принимали участие в международных
конференциях и совместных работах с зарубежными коллегами. Ниже приводится список
сотрудников, выезжавших в зарубежные командировки:
БАРЦЕВ С.И. (1955 г.р.), зав. лаб., д.ф.-м.н.:
- КНР, г. Пекин (28 ноября- 12 декабря 2013 г.), рабочее совещание и обсуждение
перспектив сотрудничества по тематике замкнутых систем обеспечения в Пекинском
аэрокосмическом университете.
БОЛСУНОВСКИЙ А.Я. (1953 г.р.), зав. лаб., д.б.н.:
- Вьетнам, г. Ханой (4-12 марта 2013 г.), Международная конференция по
загрязению, восстановлению и управлению окружающей среды.
- Австрия, г. Вена (18- 25 ноября 2013 г.), Международное совещание МАГАТЭ по
поведению радиоактивных частиц в окружающей среде.
БОЯНДИН А.Н. (1976 г.р.), к.б.н., н.с.:
- Греция, о. Крит, г. Ираклион (5- 15 мая 2013 г.), Международная конференция
BIONANOTOX-2013.
БУРАКОВА Л.П. (1969 г.р.), н.с.:
43
- КНР, г. Пекин (4 июля- 4 октября 2013 г.), проведение исследований по
кристаллизации Са-регулируемого фотопротеина беровина в рамках совместного проекта
РФФИ-ГФЕН в Институте биофизики Китайской академии наук.
ВОЛОВА Т.Г. (1945 г.р.), д.б.н., зав. лаб.:
- Греция, о. Крит, г. Ираклион (5- 15 мая 2013 г.), Международная конференция
BIONANOTOX-2013.
ВЫСОЦКИЙ Е.С. (1952 г.р.), зав. лаб., к.б.н.:
- Нидерланды, семинар лаборатории биохимии в Университете г. Вагенингена с
15 по 20 января 2013 года.
- КНР, г. Пекин (4- 11 июля 2013 г.), обсуждение и планирование совместных работ
по проекту РФФИ-ГФЕН в Институте биофизики Китайской академии наук.
ГИТЕЛЬЗОН И.И. (1928 г.р.), академик РАН, советник РАН:
- Вьетнам, г.г. Хошимин, Нячанг (13 ноября- 8 декабря 2013 г.), экспедиционная
поездка в тропические леса Вьетнама для сбора светящихся грибов; снятия и постановки
образцов в пресных водах Вьетнама.
ГЛАДЫШЕВ М.И. (1959 г.р.), д.б.н., зам. директора:
- Германия, г. Берлин (1- 16 июля 2013 г.), сбор проб зоопланктона по проекту
партнерских фундаментальных исследований СО РАН «Влияние глобального изменения
температуры на биохимическое качество водных беспозвоночных как кормовой базы
рыб».
- Венгрия, г. Будапешт (4- 9 августа 2013 г.), 32-й Конгресс международного
общества лимнологии SIL.
ДЕГЕРМЕНДЖИ А.Г. (1947 г.р.), академик РАН, директор:
- КНР, г. Пекин (28 ноября- 12 декабря 2013 г.), рабочее совещание и обсуждение
перспектив сотрудничества по тематике замкнутых систем обеспечения в Пекинском
аэрокосмическом университете.
ДЕГЕРМЕНДЖИ Н.Н. (1947 г.р.), н.с.:
- КНР, г. Пекин (28 ноября- 12 декабря 2013 г.), рабочее совещание и обсуждение
перспектив сотрудничества по тематике замкнутых систем обеспечения в Пекинском
аэрокосмическом университете.
ЕРЕМЕЕВА Е.В. (1983 г.р.), к.б.н., н.с.:
- Нидерланды, работа по совместному проекту и защита диссертации в
Университете г. Вагенингена (01.08.2012-31.01.2013 г.).
ЕСИМБЕКОВА Е.Н. (1969 г.р.), к.б.н., н.с.:
- Германия, г. Трир (14- 20 сентября 2013 г.), 20-я Международная конференция
по индикаторам состояния окружающей среды.
ЗАДЕРЕЕВ Е.С. (1972 г.р.), к.б.н., ученый секретарь:
- Польша, г. Варшава (20-23 февраля 2013 г.), совещание в Варшавском аграрном
университете по проекту ТЕМПУС «Экологическое управление для экологического
образования».
ЗОТИНА Т.А. (1972 г.р.), к.б.н., с.н.с.:
- Германия, г. Трир (16- 20 сентября 2013 г.), 20-я Международная конференция
по индикаторам состояния окружающей среды.
ИВАНОВА Ю.Д. (1968 г.р.), к.т.н., н.с.:
- Турция, г. Кемер (8- 18 июня 2013 г.), 3-й Международный Географический
Симпозиум.
- Франция, г. Тулуза (27- 31 октября 2013 г.), Международная конференция по
экологическому моделированию.
КОРМИЛЕЦ О.Н. (1981 г.р.), к.б.н., с.н.с.:
- Венгрия, г. Будапешт (4- 9 августа 2013 г.), 32-й Конгресс международного
общества лимнологии SIL.
КРАТАСЮК В.А. (1952 г.р.), в.н.с., д.б.н.:
44
- Германия, г. Трир (14- 20 сентября 2013 г.), 20-я Международная конференция
по индикаторам состояния окружающей среды.
КУДРЯШЕВА Н.С. (1959 г.р.), д.ф.-м.н., в.н.с.:
- Норвегия, г. Тромсо (16- 20 июня 2013 г.), 38-й Международный
Спектроскопический Симпозиум.
МЕДВЕДЕВА С.Е. (1944 г.р.), к.б.н., с.н.с.:
- КНР, г. Ухань (25 июля- 8 августа 2013 г.), участие в 3-м Международном
конгрессе по микробам «Microbes-2013» и Симпозиуме по микологии ISM-3.
МАНУКОВСКИЙ Н.С. (1949 г.р.), с.н.с., к.б.н.:
- КНР, г. Пекин (28 ноября- 12 декабря 2013 г.), рабочее совещание и обсуждение
перспектив сотрудничества по тематике замкнутых систем обеспечения в Пекинском
аэрокосмическом университете.
МОГИЛЬНАЯ О.А. (1955 г.р.), к.б.н., с.н.с.:
- КНР, г. Ухань (25 июля- 8 августа 2013 г.), участие в 3-м Международном
конгрессе по микробам «Microbes-2013» и Симпозиуме по микологии ISM-3.
НАТАШИН П.В. (1988 г.р.), м.н.с.:
- Китай, г. Пекин (06.11.2012- 30.05.2013), выполнение совместных работ по
проекту РФФИ-ГФЕН_а в Институте биофизики Китайской академии наук.
НИКОЛАЕВА Е.Д. (1982 г.р.), к.б.н., н.с.:
- Греция, о. Крит, г. Ираклион (5- 15 мая 2013 г.), Международная конференция
BIONANOTOX-2013.
САЛТЫКОВ М.Ю. (1986 г.р.), к.ф.-м.н., м.н.с.:
- Франция, г. Тулуза (27- 31 октября 2013 г.), Международная конференция по
экологическому моделированию.
СЕЛИВАНОВА М.А. (1986 г.р.), инженер:
- Ирландия, г. Дублин (31 августа- 7 сентября 2013 г.), 40-я ежегодная встреча
Европейского общества радиационных исследований.
СОМОВА Л.А. (1942 г.р.), д.б.н., в.н.с.:
- Турция, г. Кемер (8- 18 июня 2013 г.), 3-й Международный Географический
Конгресс.
СУЩИК Н.Н. (1970 г.р.) д.б.н., зам. директора:
- Венгрия, г. Будапешт (4- 9 августа 2013 г.), 32-й Конгресс международного
общества лимнологии SIL.
ТИРРАНЕН Л.С. (1938 г.р.) д.б.н., с.н.с.:
- КНР, г. Пекин (6- 14 января 2013 г.), Пекинский аэрокосмический университет,
обсуждение перспектив совместных работ по тематике замкнутых систем
жизнеобеспечения.
ТИХОМИРОВ А.А. (1947 г.р.), д.б.н., зав. лаб.:
- Бельгия, г. Брюссель (22- 30 мая 2013 г.), Международный ядерный центр,
презентация финального отчета по международному проекту BIOSMHARS в рамках
Программы FP7.
- КНР, г. Пекин (28 ноября- 12 декабря 2013 г.), рабочее совещание и обсуждение
перспектив сотрудничества по тематике замкнутых систем обеспечения в Пекинском
аэрокосмическом университете.
ТИХОМИРОВА Е.Г. (1949 г.р.), вед. инженер:
- Бельгия, г. Брюссель (22- 30 мая 2013 г.), Международный ядерный центр,
презентация финального отчета по международному проекту BIOSMHARS в рамках
Программы FP7.
ТОЛОМЕЕВ А.П. (1972 г.р.), к.б.н., с.н.с.:
- Польша, г. Щавница (1- 10 сентября 2013 г.), 15-я Международная конференция
по Амфиподам.
УШАКОВА С.А. (1945 г.р.), к.б.н., с.н.с.:
45
- КНР, г. Пекин (28 ноября- 12 декабря 2013 г.), рабочее совещание и обсуждение
перспектив сотрудничества по тематике замкнутых систем обеспечения в Пекинском
аэрокосмическом университете.
ШИШАЦКАЯ Е.И. (1974 г.р.), в.н.с., д.б.н.:
- Япония, г. Йокогама (7- 13 октября 2013 г.), Всемирный бизнес-форум по
биотехнологии.
ШУМИЛОВА А.А. (1989 г.р.), инженер:
- Греция, о. Крит, г. Ираклион (5- 15 мая 2013 г.), Международная конференция
BIONANOTOX-2013.
7.3. Посещение Института зарубежными учеными
С 27 февраля – 8 марта 2013 года для выполнения работ по международному
гранту № 263076 «BIOcontamination Specific Modeling in HAbitats Related to Space»
(«BIOSMHARS» -Специальное моделирование биологического загрязнения бытового
отсека применительно к космическим условиям) Седьмой рамочной программы (раздел
FP7 Space 2010-1) Европейской Комиссии приглашены сотрудники Университета
Восточной Финляндии:
- ПАСАНЕН Перти Олави, профессор;
- ХЕЛСТЕН Аннина, научный сотрудник.
С 26 августа – 6 сентября 2013 г. проведено обсуждение результатов работ и
перспективных планов по Российско- Швейцарскому контракту № 353001156
«Радиоэкологические исследования экосистемы реки Енисей» с участием:
- КЛЕМТ Экехард, профессор Технического университета г. Вейнгартен, ФРГ;
- РОЛЛИН Стефан Лео, научный сотрудник Федеральной лаборатории г.
Шпица, Швейцария.
7.4. Краткие результаты деятельности по контрактам и хоздоговорам с зарубежными
заказчиками
1. Контракт с Федеральным агентством защиты населения Швейцарии № 353001156
“Radioecological investigations of the Yenisei River aquatic ecosystem”
(«Радиоэкологические исследования водной экосистемы реки Енисей»).
Зарубежный научный центр: Федеральное Агентство защиты населения Швейцарской
Конфедерации, г. Шпиц, Швейцария.
Координаторы работ:
д-р Марио Бюргер, зав. лабораторией радиохимии Федеральной Лаборатории г. Шпица,
Швейцария.
Болсуновский А.Я., д.б.н., зав. лабораторией радиоэкологии ИБФ СО РАН, Красноярск;
Даты начала и окончания контракта: 25.02.2013- 31.12.2013
Результаты:
В 2013 году продолжалась работа по контракту №353001156 с федеральной
Лабораторией г. Шпица (Швейцария) на тему «Радиоэкологические исследования водной
экосистемы реки Енисей». Эта работа продолжается в течение нескольких лет. Основной
целью контракта в 2013 году было проведение отбора проб экосистемы реки Енисей на
расстоянии в 1000 км от Красноярска по течению реки с участием ученых Швейцарии и
Германии. Отбор проб был успешно проведен в конце августа - начале сентября 2013
года. Были отобраны пробы воды, водных растений и донных отложений экосистем рек
Енисея и Подкаменная Тунгуска. Был отобран керн донных отложений с рекордной для
реки Енисей длиной в 147 см. В настоящее время проводятся аналитические исследования
проб.
46
2. Контракт с Международным агентством по атомной энергии (МАГАТЭ, Австрия)
№ 17941 «Характеристика радиоактивных частиц р. Енисей и оценка их
потенциального влияния на экосистему реки методами биотестирования»
Зарубежный научный центр: Международное агентство по атомной энергии (МАГАТЭ),
г. Вена, Австрия.
Координаторы работ:
д-р Сергей Фесенко, научный секретарь Лаборатории МАГАТЭ г. Вена, Австрия
Болсуновский А.Я., д.б.н., зав. лабораторией радиоэкологии ИБФ СО РАН, Красноярск;
Даты начала и окончания контракта: 29.07.2013 - 28.07.2014
Результаты:
Контракт с МАГАТЭ (Вена, Австрия) на тему «Характеристика радиоактивных
частиц р. Енисей и оценка их потенциального влияния на экосистему реки методами
биотестирования» заключен только в конце июля 2013 года и отчет по контракту
планируется в июле 2014 года. В настоящее время идет анализ ранее полученных
многолетних данных ИБФ СО РАН и ИГМ СО РАН по радиоактивным частицам реки
Енисей.
3. Международный грант № 263076 «BIOcontamination Specific Modeling in HAbitats
Related to Space» («BIOSMHARS» - Специальное моделирование биологического
загрязнения бытового отсека применительно к космическим условиям) Седьмой
рамочной программы (раздел FP7 Space 2010-1) Европейской Комиссии.
Зарубежный научный центр: Институт космической медицины и физиологии - Institut de
medecine et de physiologie spatiales (MEDES), 1 avenue Jean Poulhès, 31 403 Toulouse cedex
4, France (Тулуза, Франция);
Координаторы работ:
Одрэ Бертье (Audrey Berthier), руководитель проекта, инженер биомедицины Института
космической медицины и физиологии (г. Тулуза, Франция);
Тихомиров А.А., д.б.н., зав. лабораторией управления биосинтезом фототрофов ИБФ СО
РАН, Красноярск;
Даты начала и окончания гранта: 01.06.2011 - 31.12.2013.
Результаты:
В 2013 году завершены работы по выполнению международного проекта
BIOcontamination Specific Modelling in HAbitats Related to Space (BIOSMHARS) в рамках
Международной Европейской программы FP7. Работы выполнялись совместно с
Бельгийским ядерным центром, французским Институтом космической биологии и
медицины (г. Тулуза), финским Научно-исследовательским институтом (г. Тампере),
финским университетом ( г. Суоми) и ИМБП РАН.
В январе 2013 г. в г. Москве было проведено координационное совещание по
организации и научным проблемам, которые необходимо было решить в рамках
масштабного микробиологического эксперимента в компартменте БИОС-3 согласно
задачам проекта BIOSMHARS. Были обсуждены методические и технические вопросы
изучения и контроля непатогенных микроорганизмов разных видов в запланированных
экспериментах. На основании результатов данного координационного совещания были
согласованы сроки и состав участников предстоящего эксперимента, намеченного на
февраль – март 2013 года. В эти сроки состоялся международный микробиологический
эксперимент в БИОС-3, участниками которого были от России ИБФ СО РАН и ИМБП
РАН, а иностранными участниками являлись ученые из финского Научноисследовательского института (г. Тампере) и Университета Восточной Финляндии (г.
Суоми). В процессе выполнения работ были получены совместные микробиологические
результаты с использованием непатогенной микрофлоры, поставленной ИМБП РАН с
Международной космической станции. Были выполнены эксперименты по влиянию
47
пространственных и временных характеристик на распределение микрофлоры внутри
компартмента БИОС-3.
В результате работы над проектом BIOSMHARS ИБФ СО РАН создал
компьютизированную систему контроля параметров среды в БИОС-3 с возможностью их
наблюдения через Internet заинтересованными организациями как в России, так и за
рубежом.
48
8. НАУЧНО-ОРГАНИЗАЦИОННАЯ ДЕЯТЕЛЬНОСТЬ
8.1. Общая информация о научно-организационной деятельности
Работа Ученого совета Института
За отчетный период состоялось 13 заседаний Ученого совета, на которых
обсуждались вопросы научной и научно-организационной деятельности Института,
включая утверждение и принятие планов и отчетов НИР; планов проведения
экспедиционных исследований, исследований, поддержанных грантами научных фондов.
Заслушивались и обсуждались научные сообщения и научные доклады; отчеты о научных
командировках; вопросы подготовки кадров; участия Института в конкурсах
фундаментальных работ СО РАН и РАН; информация о финансировании и перспективах
Института и др.
Работа диссертационного совета
В отчетном году функционировал диссертационный совет Д 003.007.01; проведены
защиты 1-ой докторской и 2-х кандидатских диссертаций, из которых 1 кандидатская
диссертация проведена с отрицательным решением по результатам защиты.
Научные кадры и аспирантура.
Численность Института биофизики по состоянию на 01.12.2013 года составила 189
человек, из них научных работников - 80, в том числе 2 академика, 17 докторов наук и 54
кандидата наук, штатных молодых сотрудников в возрасте до 35 лет - 23 человека,
штатных научных сотрудников без степени - 6 человек.
В очной аспирантуре обучается 5 аспирантов, в заочной - нет. В 2013 году принято в
очную аспирантуру 2 человека. Окончил аспирантуру 1 человек с представлением
диссертационной работы. Отчислены 2 человека по собственному желанию.
8.2. Список сотрудников института, удостоенных в 2013г. правительственных и
научных наград и премий.
Гительзон Иосиф Исаевич (советник РАН, академик РАН) - Почетное звание «Почетный
гражданин Красноярского края» (Закон Красноярского края № 5-1538 от 20.09.2013)
Задереев Егор Сергеевич (учёный секретарь Института биофизики СО РАН, к.б.н.) победитель конкурса научных блогов «Лента Мёбиуса», организатор конкурса
Электронное издание «НАУКА И ТЕХНОЛОГИИ РОССИИ – STRF.ru»
Кузьмина Анна Михайловна (аспирант) – Государственная премия Красноярского края
в области профессионального образования для молодых ученых за высокие результаты в
научных разработках, направленных на социально-экономическое развитие края.
Колмакова Олеся Владимировна (аспирант, лаборант) - премия «За вклад в развитие
науки Сибири», учреждённая ОАО АКБ «Международный финансовый клуб»
8.3. Образовательная деятельность, взаимодействие с вузовской наукой
Наличие
Количество
Название вуза
факультета, для которого институт является
базовым:
Институт фундаментальной
биотехнологии
биологии
и 1
филиала вуза в институте
Научно-образовательного
центра
по НОЦ «Енисей»
подготовке
высококвалифицированных
49
Сибирский
федеральный
университет (СФУ)
СФУ
специалистов
НОЦ
««Замкнутые
космические
экосистемы»
совместных кафедр с вузами
3
1
совместных лабораторий с вузами
совместной
научной
инфраструктуры: 1
экспериментальных
стендов,
полигонов,
информационно-коммуникационных сетей и
т.д.
других
образовательных
учреждений,
созданных с участием научных учреждений
СО РАН (указать вид учреждения)
Сибирский
государственный
аэрокосмический
университет им. Ак.
Решетнева (СибГАУ)
СФУ
СибГАУ
СФУ
Перечень проектов, выполняемых совместно с вузами в рамках ФЦП
Сумма
финансирования
Вид (направление)
(если институт
Название проекта
Вуз
конкурса
головной по
проекту),
тыс. руб.
Природа свечения живых
организмов
НШ-64987.2010.4
Ведущие научные
школы
СФУ
500
Число студентов 3-5 курсов и (отдельно) магистрантов обучающихся на
совместных кафедрах - 125 (48)
Число студентов, выполняющих дипломные работы или магистерские диссертации
непосредственно в Институте под руководством научных сотрудников - 31
Сколько научных сотрудников участвуют Общее число
Доктора
Кандидаты
в работе со студентами, магистрантами и
наук
наук
аспирантами:
- преподают в вузах
- руководят дипломными проектами,
магистерскими диссертациями
- руководят аспирантами
23
25
5
14
50
11
8
3
7
12
17
2
7
9. ПУБЛИКАЦИИ ИНСТИТУТА В 2013 ГОДУ
9.1. Импакт-фактор ИБФ СО РАН за 2013 г.
журнал
Авиакосмическая и экологическая медицина
Агрохимия
Бюллетень экспериментальной биологии и
медицины
Вестник КГПУ
Вестник КрасГАУ
Вестник СибГАУ
Врач аспирант
Доклады АН (Biochem. Biophys.)
Доклады АН (Earth Sci.)
Доклады АН (Biol.)
Журнал СФУ. Биология
Известия Самарского научного центра РАН
Исследование Земли из космоса
Клеточная трансплантология и тканевая инженерия
Перспективные материалы
Письма в ЖТФ
Turchzaninowia
Физика твердого тела
Химия в интересах устойчивого развития
Электрохимия
Advances in Space Research
Analytical and Bioanalytical Chemistry
Analytical Methods
Applied Optics
Artificial Cells, Nanomedicine and Biotechnology
BBA Proteins and Proteomics
Bioresource Technology
ChemBioChem
Contemporary Problems of Ecology
Current Biotechnology
Environmental Monitoring and Assessment
Freshwater Biology
Insect Science
International Biodeterioration & Biodegradation
Journal of Biomaterials and Nanobiotechnology
Journal of Environmental Radioactivity
Journal of Materials Science: Materials in Medicine
Journal of Natural History
Journal of Photochemistry and Photobiology B
Journal of Polymers and the Environment
Journal of Quantitative Spectroscopy and Radiative
Transfer
Journal of Research in Biology
Macromolecular Symposia
Photochemical & Photobiological Sciences
51
импакт
0
0
0,341
количество
1
1
1
сумма
0
0
0,341
0
0
0
0
0,322
0,392
0
0
0
0
0
0
1,524
0
0,769
0
0,547
1,183
3,659
1,855
1,689
0,854
3,733
4,750
3,740
0,137
0
1,592
3,933
1,786
2,059
0
2,119
2,141
0,778
3,110
1,495
2,380
1
1
1
1
7
1
1
4
2
2
1
1
1
1
1
1
1
5
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
0
0
0
0
2,254
0,392
0
0
0
0
0
0
1,524
0
0,769
0
0,547
5,915
3,659
1,855
1,689
0,854
3,733
4,750
3,740
0,137
0
1,592
3,933
1,786
2,059
0
2,119
2,141
0,778
3,110
1,495
2,380
0
0,913
2,923
1
1
1
0
0,913
2,923
Polymer Science. Series A.
Procedia Environmental Sciences
Prostaglandins & other Lipid Mediators
Quaternary International
Research in Microbiology
Spectrochimica Acta, Part A: Molecular &
Biomolecular Spectroscopy
Theoretical and Applied Climatology
Water Research
Zoological Studies
Итого
0,669
0
2,422
1,962
2,889
2,000
1
3
1
1
1
1
0,669
0
2,422
1,962
2,889
2,000
1,759
4,655
1,260
1
1
1
70
1,759
4,655
1,260
75,004
Количество научных сотрудников – 80
Средний импакт-фактор на научного сотрудника – 0.937
Количество статей на научного сотрудника – 0.875
9.2 Список публикаций
Книги и монографии
Учебное пособие «Современные аппаратура и методы исследования биологических
систем» // Коллектив авторов под ред. Сински Э.Дж. и Воловой Т.Г. / Рекомендовано
УМО по классическому университетскому образованию. - Красноярск: СФУ. - 2013.- 482
с.
Volova T.G., Shishatskaya E.I., Sinskey A.J. Degradable Polymers: Production,
Properties, Applications // Nova Science Pub. Inc. (NY, USA). 2013. – 30 п.л.
Статьи в отечественных рецензируемых журналах
Baron A.V., Puzyr A.P., Baron I.I., Bondar V.S. Effects of modified detonation
nanodiamonds on the biochemical composition of human blood // Bull. Exp. Biol. Med. – 2013.
- V. 154. - P. 781-784.
Белобаба А.Г., Маслий А.И., Гусев А.А., Тихомиров А.А., Куденко Ю.А.,
Трифонов С.В. Выделение хлорида натрия из растворов минерализации экзометаболитов
человека и растительных отходов применительно к замкнутым экосистемам // Химия в
интересах устойчивого развития.- 2013. - № 3. - С. 291-297.
Болсуновский А.Я., Дегерменджи А.Г. Сравнение миграционной способности
урана и техногенных радионуклидов в донных отложениях реки Енисей // Доклады АН. 2013. - Т. 448. - № 5. - С. 571-575.
Бондарь В.С., Ронжин Н.О., Мамаева Е.С., Барон А.В., Гительзон И.И.
Многоразовые системы биохимической диагностики на основе наноалмазов // ДАН. –
2013. - Т. 448. - С. 722-725.
Бондарь В.С., Родичева Э.К., Медведева С.Е., Тюлькова Н.А., Тяглик А.Б., Шпак
Б.А., Гительзон И.И. О механизме свечения гриба Neonothopanus nambi // ДАН. – 2013. Т. 449. - С. 223-227.
Бондарь В.С., Пузырь А.П., Горева А.В., Буров А.Е. Конструирование
композиционных материалов на основе наноалмазов и разрушаемых биополимеров //
Journal of Siberian Federal University. Biology. – 2013. - V. 6. - P. 163-174.
Гладышев М.И., Дубовская О.П. Рецензия на монографию А.А. Протасова
«Жизнь в гидросфере. Очерки по общей гидробиологии» // Journal of Siberian Federal
University. Biology. - 2013.- 6, № 1.- С. 108-111.
Гладышев М.И., Сущик Н.Н., Махутова О.Н., Дубовская О.П., Бусева Ж.Ф.,
Фефилова Е.Б., Семенченко В.П., Калачёва Г.С., Кононова О.Н., Батурина М.А.
Различия жирнокислотного состава кладоцер и копепод холодных и тёплых озёр //
Доклады АН. – 2013. – 451, № 2. – С. 221–224.
52
Гордеев С.К., Коноплева Р.Ф., Чеканов В.А., Корчагина С.Б., Беляев С.П.,
Голосовский И.В., Денисов И.А., Белобров П.И. Особенности изменения
электросопротивления углеродных нанокомпозитов на основе наноалмазов при
нейтронном облучении // Физика твердого тела. – 2013. – Т. 55. – Вып. 7. – С. 1380-1385.
Дао Ти Ван, Мануковский Н.С., Гительзон И.И. Хемилюминесценция
культивируемых грибов Вьетнама // ДАН. – 2013. - Т.448. - С.349-350.
Дао Ти Ван, Мануковский Н.С., Гительзон И.И. Хемилюминесценция
базедиальных грибов тропического леса Южного Вьетнама // ДАН. – 2013. - Т.450. С.348-351.
Дементьев Д.В., Мануковский Н.С., Болсуновский А.Я., Александрова Ю.В.
Накопление техногенных радионуклидов разными видами макромицетов в лабораторных
условиях // Известия Самарского научного центра Российской академии наук. 2013. Т. 15.
№ 3(2). С. 712-715.
Еремеева Е.В., Маркова С.В., Высоцкий Е.С. Высокоактивный BRET-репортер на
основе “желтого” мутанта люциферазы Renilla muelleri // ДАН. Биохимия. Биофизика. –
2013. – V. 450. – P. 1-5.
Зоркина Т.М.,. Жукова В.М, Кутькина Н.В., Жукова Е.Ю., Кононова Н.А..
Мониторинг растительности засоленных лугов на основе наземных и спутниковых
методов в условиях Койбальской степи (Хакасия) // Вестник Красноярского
государственного педагогического университета им. В.П. Астафьева.- 2013.- № 3. [25].- C.
229-234.
Зотина Т.А., Трофимова Е.А., Болсуновский А.Я., Анищенко О.В. Эффективность
трофического переноса радиоактивных и стабильных изотопов металлов к рыбамбентофагам р. Енисей // Journal of Siberian Federal University. Biology. 2013. № 6 (1). С.
96-107.
Зотина Т.А., Трофимова Е.А., Медведева М.Ю., Болсуновский А.Я.
Биотестирование донных отложений р. Енисей с использованием водного растения
Elodea сanadensis // Известия Самарского научного центра РАН. 2013. 15, 3 (1): 554-559.
Зотина Т.А. Находка бразильской элодеи Egeria densa Planch. (Hydrocharitaceae) в
реке Енисей // Turchzaninowia. - 2013.- 16 (4)- С. 1-2.
Калачёва Г.С., Гладышев М.И., Сущик Н.Н., Дубовская О.П., Шулепина С.П.,
Агеев А.В. Продукция полиненасыщенных жирных кислот зообентосом в реках с разной
температурой воды // Доклады АН. – 2013. – 453, № 5. – С. 567–570.
Колмакова О.В. Современные методы определения видоспецифичных
биогеохимических функций бактериопланктона // Journal of Siberian Federal University.
Biology. – 2013. – Т. 6, № 1. – С. 73-95.
Колягин Г.А., Корниенко В.Л., Куденко Ю.А., Тихомиров А.А., Трифонов С.В.
Электросинтез пероксида водорода из кислорода в газодиффузионном электроде в
растворах минерализованных экзометаболитов // Электрохимия. - 2013.- Т. 49.- № 10.- С.
1120-1124.
Михеев Г.М., Пузырь А.П., Ванюков В.В., Могилева Т.Н., Бондарь В.С. Влияние
размерного фактора наноалмазов в суспензиях на оптическое ограничение мощности и
нелинейное рассеяние лазерного излучения // Письма в ЖТФ. – 2013. - Т. 39. - С. 1-10.
Михеева Г.А., Сомова Л.А. Влияние полифункционального биопрепарата на
продуктивность овощных культур // Агрохимия.- 2013.- № 5.- С. 76-82.
Пузырь А.П., Буров А.Е., Медведева С.Е. Внеклеточная люминесценция
метаболитов мицелия Panellus stipticus (IBSO 2301) при росте на агаризованной среде //
ДАН. - 2013.- Т. 448. - № 4.- С. 487-489.
Римацкая Н.В., Сутормин О.С., Иванова Г.В., Денисова Т.С., Кратасюк В.А.
Биолюминесцентный практикум для формирования исследовательской компетентности
школьников // Вестник СибГАУ. – 2012. – № 6(46). – С. 167-170.
53
Сидько А.Ф., Ботвич И.Ю., Письман Т.И., Шевырногов А.П. Спектральнополяризационные характеристики растительных покровов на территории Красноярского
края по наземным дистанционным измерениям // Исследование Земли из космоса.- 2013.№ 2.- С. 3-11.
Soukhovolsky V.G., Ivanova Yu.D. Estimation of Forest-Stand Net Primary Productivity
Using Fraction Phytomass Distribution Model // Contemporary Problems of Ecology, 2013, Vol.
6, No. 7, pp. 699–706.
Сысоева О.В., Тирранен Л.С., Ушакова С.А., Калачева Г.С. Зависимость
микробиоты почвоподобного субстрата от способа обработки соломы пшеницы // Вестник
КрасГАУ.- 2013.- № 3.- С. 91-96.
Ушакова С.А., Величко В.В., Тихомиров А.А., Головко Т.К., Табаленкова Г.Н.,
Анищенко О.В. Использование ионообменных субстратов для оптимизации условий
минерального питания растений применительно к системам жизнеобеспечения //
Авиакосмическая и экологическая медицина.- 2013.- Т. 47.- № 3.- С. 38-42.
Шевырногов А.П., Чернецкий М.Ю., Высоцкая Г.С. Многолетние тренды NDVI и
температуры на юге Красноярского края // Исследование Земли из космоса.- 2012.- № 6.С. 77-87.
Шишацкая Е.И., Николаева Е.Д., Шумилова А.А., Шабанов А.В., Волова Т.Г.
Культивирование и дифференцировка мультипотентных мезенхимальных клеток костного
мозга на носителях из резорбируемого БИОПЛАСТОТАНА // Клеточная
трансплантология и тканевая инженерия. – 2013. – Т. 8. – № 1. – C. 57-65.
Шишацкая Е.И., Жила Н.О., Николаева Е.Д., Сырвачева Д.А., Сински Э.Дж. Синтез
и исследование сополимеров 3-гидроксибутирата / 4-гидроксибутирата // Перспективные
материалы. – 2013. – № 3. – C. 20-26.
Шишацкая Е.И., Винник Ю.С., Маркелова Н.М., Шагеев А.А., Камендов И.В.,
Старосветский С.И., Хоржевский В.А., Перьянова О.В., Шумилова А.А. Исследование
остеопластических свойств резорбируемого поли-3-гидроксибутирата in vivo на моделях
хронического остеомиелита // Врач аспирант. – 2013. – № 1.1.(56). – С. 127-132.
Статьи в зарубежных рецензируемых журналах
Alieva, R.R., Belogurova, N.V. Petrova, A.S., Kudryasheva, N.S. Fluorescence
properties of Ca2+ independent discharged obelin and its application prospect // Anal. Bioanal.
Chem. – 2013. – V. 405. – No.10. – P. 3351-3358.
Bartsev S.I. Optimal design of biological life support systems: criteria and problems //
Current Biotechnology. - 2013.- No. 2.- P. 2008-216.
Bartsev S.I. Similarity and reduction of complexity of ecosystem models // Procedia
Environmental Sciences. – 2012.– V. 13.– P. 316-323.
Bartsev S.I., Degermendzhi, A.G., Okhonin V.A., Saltykov M.Y.An Integrated Approach
to the Assessment of an Ecological Impact of Industrial Products and Processes // Procedia
Environmental Sciences. – 2012.– V.13.– P. 837-846.
Bartsev S.I., Pochekutov A.A., Shchemel A.L. The Main Influencing Factors to be
Represented in a Mathematical Model of Soil Respiration // Procedia Environmental Sciences. –
2012.– V. 13.– P. 829-836.
Bartsev S.I., Pochekutov A.A. A continual model of soil organic matter transformations
for predicting soil forming dynamics inside higher plant CELSS // Adv. Space Res.- 2013.- V.
51.- P. 789-796.
Boyandin A.N., Prudnikova S.V., Karpov V.A., Ivonin V.N., Korobohina K., Filipenko
M.L., Volova T.G., Sinskey A.J. Microbial degradation of polyhydroxyalkanoates in tropical
soils // Macromol. Symposium.– 2012.– V. 320.– P. 38-42.
Boyandin A.N., Prudnikova S.V., Karpov V.A., Ivonin V.N., Đỗ Ngọc Lanh, Nguyễn Thị
Hoài, Lê Thị Mỹ Hiệp, Filipenko M.L., Volova T.G., Gitelson I.I. Microbial degradation of
54
polyhydroxyalkanoates in tropical soils // International Biodeterioration & Biodegradation.–
2013.– V. 83.– P. 77-84.
Eremeeva E.V., Natashin P.V., Song L., Zhou Y., van Berkel W.J., Liu Z.J., Vysotski
E.S. Oxygen activation of apo-obelin-coelenterazine complex // Chembiochem.– 2013.– V. 14.–
No. 6.– P. 739-745.
Eremeeva E.V., Markova S.V., van Berkel W.J., Vysotski E.S. Role of key residues of
obelin in coelenterazine binding and conversion into 2-hydroperoxy adduct // J. Photochem.
Photobiol. B.– 2013.– V. 127.– P. 133-139.
Eremeeva E.V., Markova S.V., Frank L.A., Visser A.J., van Berkel W.J., Vysotski E.S.
Bioluminescent and spectroscopic properties of His-Trp-Tyr triad mutants of obelin and aequorin
// Photochem. Photobiol. Sci. – 2013.– V. 12.– No.6.– P. 1016-1024.
Esimbekova E., Kondik A., Kratasyuk V. Bioluminescent enzymatic rapid assay of water
integral toxicity // Environmental Monitoring and Assessment.– 2013.– V. 185.– No.7.– P. 59095916.
Fefilova E., Dubovskaya O., Kononova O., Khokhlova L. A comparative survey of the
freshwater copepods of two different regions of the Central Palaearctic: European and Siberian
// Journal of Natural History.– 2013.– 47.– P. 805-819.
Gladyshev M.I., Sushchik N.N., Makhutova O.N. Production of EPA and DHA in
aquatic ecosystems and their transfer to the land // Prostaglandins & other Lipid Mediators.2013.- 107.- P. 117-126.
Goreva A.V., Shishatskaya E.I., Kuzmina A.M., Volova T.G., Sinskey A.J.
Microparticles prepared from biodegradable polyhydroxyalkanoates as matrix for encapsulation
of cytostatic drug // Journal of Materials Science: Materials in Medicine.– 2013.– V. 24.– № 8.–
P. 1905-1915.
Kalugin I., Darin A., Rogozin D., Tretyakov G. Seasonal and centennial cycles of
carbonate mineralisation during the past 2500 years from varved sediment in Lake Shira,
South Siberia // Quaternary International.- 2013.- V. 290-291.- P. 245-252.
Kamnev A.A., Tugarova A.V., Selivanova M.A., Tarantilis P.A., Polissiou M.G.,
Kudryasheva N.S. Effects of americium-241 and humic substances on Photobacterium
phosphoreum: bioluminescence and diffuse reflectance FTIR spectroscopic studies //
Spectrochim. Acta A: Mol. Biomol. Spectrosc.– 2013.– V. 100.– P. 271-275.
Kartushinsky A.V., Sidorenko A.Y. Analysis of the variability of temperature gradient in
the ocean frontal zones based on satellite data // Adv. Space Res.- 2013.- V. 52 (8).- P. 14671475.
Kolmakova A.A., Gladyshev M.I., Kalachova G.S., Kravchuk E.S., Ivanova E.A.,
Sushchik N.N. Amino acid composition of epilithic biofilm and benthic animals in a large
Siberian river // Freshwater Biology. – 2013.- 58.- P. 2180–2195.
Krasitskaya V.V., Kudryavtsev A.N., Shimomura O., Frank L.A. Obelin mutants as
reporters in bioluminescent dual-analyte binding assay // Anal. Methods.– 2013.– V. 5.– P. 636640.
Makhutova O.N., Protasov A.A., Gladyshev M.I., Sylaieva A.A., Sushchik N.N.,
Morozovskaya I.A., Kalachova G.S. Feeding spectra of bivalve mollusks Unio and Dreissena
from Kanevskoe Reservoir, Ukraine: are they food competitors or not? // Zoological Studies.2013.- V.52, art. No. 56. – P. 1-10.
Prudnikova S.V., Boyandin A.N., Kalacheva G.S., Sinskey A.J. Degradable
polyhydroxyalkanoates as herbicide carriers // Journal of Polymers and the Environment.–
2013.– V. 21.– P. 675-682.
Puzyr A.P., Burov A.E., Bondar V.S. Source of light emission in a luminous mycelium of
the fungus Panellus stipticus // J. Res. Biol. – 2013. - V. 3. - P. 900-905.
Ronzhin N.O., Baron A.V., Mamaeva E.S., Puzyr A.P., Bondar V.S. Nanodiamond-based
tests systems for biochemical determination of glucose and cholesterol // J. Biomat. Nanobiotech.
– 2013. - V. 4. - P. 242-246.
55
Selivanova M.A., Mogilnaya O.A., Badun G.A., Vydryakova G.A., Kuznetsov A.M.,
Kudryasheva N.S. Effect of tritium on luminous marine bacteria and enzyme reactions // Journal
of Environmental Radioactivity.– 2013.– V. 120.– P. 19-25.
Shishatskaya E.I., Kamendov I.V., Starosvetsky S.I., Vinnik Yu.S., Markelova N.N.,
Shageev A.A., Khorzhevsky V.A., Peryanova O.V., Shumilova A. An in vivo study of
osteoplastic properties of resorbable poly-3-hydroxybutyrate in models of segmental osteotomy
and chronic osteomyelitis // Artificial Cells, Nanomedicine and Biotechnology.– 2013.– V. 41.–
№ 3. (DOI: 10.3109/21691401.2013.816312)
Shklavtsova E.S., Ushakova S.A., Shikhov V.N., Anishchenko O.V. Tolerance of chufa
(Cyperus esculentus L.) plants, representing the higher plant compartment in bioregenerative life
support systems, to super-optimal air temperatures // Advances in Space Research.- 2013.- V.
51.- P. 124-132.
Sid`ko A.F., Botvich I.Yu., Pisman T.I., Shevyrnogov A.P. A study of spectral –
polarization characteristics of plant canopies using land-based remote sensing // Journal of
Quantitative Spectroscopy and Radiative Transfer.- 2013.- № 129.- P. 109 -117.
Stepanyuk G.A., Liu Z.J., Burakova L.P., Lee J., Rose J., Vysotski E.S., Wang B.C.
Spatial structure of the novel light-sensitive photoprotein berovin from the ctenophore Beroe
abyssicola in the Ca2+-loaded apoprotein conformation state // Biochim Biophys Acta – Proteins
and Proteomics. – 2013.– V. 1834.– No.10.– P. 2139-2146.
Sushchik N.N., Kuchkina A.Y., Gladyshev M.I. Fatty acid content and composition of
sediments from Siberian eutrophic water bodies: implications for biodiesel production // Water
Research.– 2013.– 47.– P. 3192-3200.
Sushchik N.N., Yurchenko Y.A., Gladyshev M.I., Belevich O.E., Kalachova G.S.,
Kolmakova A.A. Comparison of fatty acid contents and composition in major lipid classes of
larvae and adults of mosquitoes (Diptera: Culicidae) from a steppe region // Insect Science.2013.- 20.- P. 585–600.
Ushakova S.A., Tikhomirov A.A., Shikhov V.N., Gros J-B., Golovko T.K., Dal’ke I.V.,
Zakhozhii I.G.. Tolerance of wheat and lettuce plants grown on human mineralized waste to high
temperature stress //Advances in Space Research. – 2013.- V. 51.- P. 2075-2083.
Vanyukov V., Mogileva T., Mikheev G., Puzir A., Bondar V., Svirko Yu. Size effect on
the optical limiting in suspensions of detonation nanodiamond clusters // Appl. Opt. – 2013. - V.
52. - P. 4123-4130.
Varotsos C.A., Franzke C.L.E., Efstathiou M.N., Degermendzhi A.G. Evidence for two
abrupt warming events of SST in the last century // Theoretical and Applied Climatology.2013.- С. 1-10. DOI 10.1007/s00704-013-0935-8.
Velichko V.V., Tikhomirov A.A., Ushakova S.A., Tikhomirova N.A., Shihov V.N.,
Tirranen L.S., Gribovskaya I.A. Production characteristics of the "higher plants-soil-like
substrate" system as an element of the bioregenerative life support system //Advances in Space
Research.- 2013.- V. 51.- P. 115-123.
Volova T.G., Zhila N.O., Shishatskay E.I., Mironov P.V., Vasil’ev A.D., Sukovatyi A.G.,
Sinskey A. J. The Physicochemical Properties of Polyhydroxyalkanoates with Different
Chemical Structures // Polymer Science, Ser. A. 2013. – V. 55. – No. 7. – P. 427-437.
Volova T., Kiselev E., Shishatskaya E., Zhila N., Boyandin A., Syrvacheva D.,
Vinogradova O., Kalacheva G., Vasiliev A., Peterson I. Cell growth and PHA accumulation
from CO2 and H2 of a hydrogen-oxidizing bacterium, Cupriavidus eutrophus В-10646 //
Bioresource Technology. – 2013. –V. 146. – P. 215-222.
Volova T., Zhila N., Kalacheva G., Brigham C., Sinskey A. J. The effects of the
intracellular poly(3-hydroxybutyrate) reserves on physiological-biochemical properties and
growth of Ralstonia eutropha // Research in Microbiology. 2013. – V. 164. – P. 164-171.
56
Материалы отечественных конференций
Болсуновский А.Я., Медведева М.Ю., Карпов А.Д. Сравнительная оценка
биодоступности урана и техногенных радионуклидов в экосистеме бассейна реки Енисей
// Материалы IV Международной конференции «Радиоактивность и радиоактивные
элементы в среде обитания человека», 4-8 июня 2013 года, г. Томск. С. 106-108.
Коноплев Д.Ю., Картушинский А.В. Программное обеспечение для анализа
изменчивости поверхностной солености океана по спутниковым данным // Молодежь и
наука: сб. матер. Х Всероссийской научно-технической конференции с международным
участием, посвященной 385-летию со дня основания г. Красноярска [Электронный ресурс]
/отв. ред. О.А.Краев - Красноярск: Сибирский федеральный университет. 2013. 4 с.
http://conf.sfu-kras.ru/sites/mn2013/thesis/s044/s044-019.pdf
Ларько А.А., Шевырногов А.П., Иванова Ю.Д. Нелинейные тренды чистой
первичной продукции растительности на территории юга Красноярского края по
спутниковым данным // Материалы третьей национальной конференции с
международным участием «Математическое моделирования в экологии». 2013. С. 159160.
Ларько А.А., Иванова Ю.Д., Кукоба Н.А. Влияние высотой тональности на горные
леса Западного Саяна // Материалы третьей национальной конференции с
международным участием «Математическое моделирования в экологии». 2013. С. 161162.
Медведева М.Ю., Болсуновский А.Я. Хромосомные аберрации в корневой
меристеме Elodea сanadensis в зоне радиоактивного загрязнения реки Енисей (ГХК,
Росатом) // Материалы IV Международного экологического конгресса «Экология и
безопасность жизнедеятельности промышленно-транспортных комплексов» (ELPIT-2013),
18-22 сентября 2013 г., г. Тольятти. Т. 2. C. 133-139.
Медведева М.Ю., Болсуновский А.Я. Цитогенетические исследования водного
макрофита Elodea сanadensis в зоне влияния Горно-химического комбината // Материалы
IV Международной конференции «Радиоактивность и радиоактивные элементы в среде
обитания человека», 4-8 июня 2013 года, г. Томск. С. 355-358.
Зотина Т.А., Трофимова Е.В., Медведева М.Ю., Болсуновский А.Я.
Биотестирование донных отложений р.Енисей с использованием водного растения Elodea
Canadensis // Материалы IV международной конференции «Радиоактивность и
радиоактивные элементы в среде обитания человека. г. Томск, 4-8 июня 2013 г. С. 207211;
Зотина Т.А., Трофимова Е.В., Болсуновский А.Я. Накопление техногенных
радионуклидов ихтиофауной в зоне радиационного загрязнения р. Енисей // Материалы IV
международной конференции «Радиоактивность и радиоактивные элементы в среде
обитания человека. г. Томск, 4-8 июня 2013 г. С. 211-214
Дементьев Д.В., Мануковский Н.С., Болсуновский А.Я., Александрова Ю.В.
Накопление техногенных радионуклидов макромицетами в лабораторных условиях //
Материалы IV Международной конференции «Радиоактивность и радиоактивные
элементы в среде обитания человека». Томск 4 – 8 июня 2013 г. Томск, Изд-во Томского
политехнического университета, 2013, С. 177-180.
Печуркин Н.С., Козелепов И.Н., Сомова Л.А. К оценке антропогенного давления
энергетики на окружающую среду (на примере Красноярского края как представительного
региона России) // Моделирование неравновесных систем–2013. Материалы 16
Всероссийского семинара 4-6 октября 2013 года. Красноярск. 2013.С. 107-113.
Сидько А.Ф., Ботвич И.Ю., Письман Т.И., Шевырногов А.П. Исследование
поляризационных свойств сельскохозяйственных культур по наземным дистанционным
измерениям // Фундаментальные и прикладные проблемы науки. Материалы VIII
Международного симпозиума. Москва. 2013. С. 135 – 142.
57
Трофимова Е.А., Зотина Т.А., Болсуновский А.Я. Оценка эффективности переноса
техногенных радионуклидов между компонентами трофических сетей р. Енисей //
Геохимия живого вещества: Материалы Международной молодежной школы-семинара
(Томск, 2-5 июня 2013 г.). Томск: Изд-во Томского политехнического университета, 2013.
С. 178-180.
Шуваев А.Н., Печуркин Н.С. Особенности логистической аппроксимации при
описании роста микроорганизмов // Моделирование неравновесных систем–2013.
Материалы 16 Всероссийского семинара 4-6 октября 2013 года. Красноярск. 2013. С. 192196.
Тезисы докладов на международных конференциях
Медведева М.Ю., Болсуновский А.Я. Цитогенетические исследования Elodea
canadensis в зоне влияния Горно-химического комбината Росатома. Тезисы
Международной конференции студентов и молодых ученых, 17-19 апреля 2013 г., г.
Алматы, Казахстан. С. 311-312.
Bolsunovsky A., Medvedeva M. Aquatic plants as bioindicators of radioactive
contamination of the Yenisei River. Abstract of the 2nd International Conference on
Environmental Pollution, Restoration and Management, 4-8 March 2013, Hanoi, Vietnam. P. 9394.
Bolsunovsky A., Medvedeva M. Comparative evaluation of the bioavailability of
uranium and artificial radionuclides in the ecosystem of the Yenisei River basin. Abstracts of the
First Russian-Nordic Symposium on Radiochemistry (RNSR-2013). 21-24 October 2013,
Moskow, Russia. P. 114.
Ivanova Yu., Larko A., Shevyrnogov A. Analysis of non-linear trends in the values of the
net primary production of mountain forests of the Western Sayan Mountains (South Siberia) //
Ecological Modelling for Ecosystem Sustainability - ISEM 2013. France, Toulouse, October 2831, 2013. P. 213.
Pechurkin N.S. Somova L.A. The risk of deadlock development of our technological
civilization: from social and economic to ecological instability. // 3rd International Geography
Symposium. Kemer, Antalya – Turkey, 9-14 June.Conference Proceedings. 2013. P. 213.
Somova L.A., Mikheeva G.A., Pechurkin N.S. Managed microbiocenoses for practical
applications // 3rd International Geography Symposium. Kemer, Antalya – Turkey, 9-14 June.
Conference Proceedings. 2013. P. 253.
Zotina T., Trofimova E., Medvedeva M., Bolsunovsky A. Use of submersed macrophytes
as indicators of radioactive pollution of the Yenisei River: biomonitoring and toxicity tests. 20 th
International Conference on Environmental Indicators (ICEI 2013). 16-19 Sept 2013, Trier,
Germany. P. 29
58
Приложение 1
Табл. 1
Сведения о выполнении научно-исследовательских работ институтами СО РАН по областям и направлениям науки в 2013 году
Номер
направления*
1
VI.51.
VI.56.
VI.57.
Наименование
Наименование программ
направления
фундаментальных
фундаментальных
исследований СО РАН
исследований
(по Программе)
2
3
Экология организмов и Экологические основы
сообществ
динамики разнообразия
животного мира
Северной и
Центральной Азии:
биоценотический и
популяционнотаксономический
аспекты
Физиология и биохимия
Молекулярные,
растений, фотосинтез,
клеточные и экологовзаимодействие растений физиологические
с другими организмами
механизмы роста,
развития, устойчивости
и продуктивности
растений
Структура и функции
биомолекул и
надмолекулярных
комплексов, протеомика,
биокатализ
Структурнофункциональная
протеомика
надмолекулярных
комплексов,
обеспечивающих
стабильность генома и
59
Институтыисполнители
Результаты
(в привязке к ожидаемым результатам по Программе)
4
5
Институт
В датированных кернах донных отложений озера
биофизики СО Шира обнаружено неоднородное распределение
РАН
специфичного биомаркера, пигмента пурпурных
серных бактерий окенона, позволяющее
реконструировать условия обитания пурпурных
серных бактерий в озере в последние ~4500 лет и
повысить точность реконструкции климатическиобусловленных изменений уровня воды в позднем
голоцене по донным отложениям озера.
Институт
В Институте биофизики СО РАН разработана
биофизики СО технология утилизации несъедобной растительной
РАН
биомассы, позволяющая длительное использование
почвоподобного субстрата без снижения его
плодородия, которая будет использована для
повышения степени замкнутости массообменных
процессов в биолого-технических системах
жизнеобеспечения человека.
Институт
Определена с разрешением 2.0 Å пространственная
биофизики СО кристаллическая структура светочувствительного
РАН
Са2+-регулируемого фотопротеина беровина из
ктенофор Beroe abyssicola в апоформе, связанной с
ионами кальция. Сравнение пространственной
структуры апоберовина с соответствующими
конформационными состояниями апообелина и
экспрессию
генетической
информации
VI.61.
Биофизика,
радиобиология,
математические модели в
биологии,
биоинформатика
Молекулярногенетические,
биофизические,
экосистемные и
биосферные процессы:
информационные
системы,
экспериментальнокомпьютерный анализ и
моделирование
VI.62.
Биотехнология
Фундаментальные
основы биотехнологий
создания средств
терапии и диагностики
заболеваний
VI.62.
Биотехнология
Фундаментальные
основы биотехнологий
60
апоакворина показало, что среднеквадратичные
отклонения (RMSD) между атомами основной цепи
этих белков составляют соответственно 2,19 и 1,77 Å.
Это указывает на высокую структурную гомологию
фотопротеинов из разных светящихся организмов,
хотя идентичность их аминокислотных
последовательностей составляет всего около 29%.
Институт
Ученые Института биофизики СО РАН вместе с
биофизики СО коллегами из Греции и Великобритании установили,
РАН
что глобальные изменения температуры Земли в
последнее столетие происходили не плавно, а
скачками. Показано, что в наблюдаемой динамике
температуры большей части земной поверхности с
начала XX века было два скачка: в 1925-1927 и 19871989 годах. Вариация температуры воздуха последнего
столетия по настоящее время описываются суммой
этих двух скачков температуры и известных
климатических осцилляций (Южная осцилляция ЭльНиньо и Тихоокеанская декадная осцилляция).
Открытие меняет существующие представления об
изменении климата, которые базируются на
представлении о плавном и постоянном увеличении
температуры из-за парникового эффекта.
Институт
В Институте биофизики СО РАН с использованием
биофизики СО мутантного штамма C.eutrophus B-10646
РАН
оптимизированы параметры процесса биосинтеза
трехкомпонентных полимеров «Биопластотан» по
общей продуктивности процесса и выходу продукта;
исследованы закономерности образования мономеров
на комплексном углеродном субстрате, содержащем
основной ростовой субстрат и субстратыпредшественники, необходимые для синтеза
мономеров.
Институт
Сконструированы системы биохимической
биофизики СО диагностики глюкозы и холестерина посредством
создания средств
терапии и диагностики
заболеваний
РАН
ковалентной пришивки соответствующих ферментов
на наноалмазы. Показано высокое совпадение данных
при определении аналитов с использованием
автоматизированного биохимического анализатора
Sapphire 400 (Niigata Mechatronics, Japan) и
диагностических систем МНА-ферменты. Результаты
сравнительных испытаний указывают на
применимость созданных систем для определения
этих веществ в сыворотке крови человека in vitro.
* Номер направления исследований Программы фундаментальных научных исследований государственных академий наук на 2013–2020
годы
61
Табл. 2. Индикаторы эффективности реализации Программы
2013 год
Индикатор
Единица
измерения
план
фактическое исполнение
1
2
3
4
Количество публикаций в ведущих
российских и международных журналах
по результатам исследований,
полученным в процессе реализации
Программы
единиц*
70
71
Количество публикаций в мировых
научных журналах, индексируемых в базе
данных "Сеть науки" (WEB of Science)
единиц
45
49
Доля исследователей в возрасте до 39 лет
в общей численности исследователей
%
35%
40%
зарегистрированных патентов в России
единиц
2
4
зарегистрированных патентов за
рубежом
единиц
0
0
Внутренние затраты на исследования и
разработки (на одного исследователя)
тыс.руб.
1100
1270,9
Число охраняемых объектов
интеллектуальной собственности:
* Этот показатель является о ориентировочным, так как оценить все публикуемые работы, не входящие в WEB of Science и рецензируемые
журналы, крайне затруднительно.
62
Номер направления
Отделение РАН
Табл. 3. Исследования, проводимые в 2013 году в рамках Программы фундаментальных научных исследований государственных академий
наук на 2013–2020 годы
1
Биол.
наук
Биол.
наук
2
VI.51.
Биол.
наук
VI.57.
Биол.
наук
VI.61.
Биол.
наук
VI.62.
VI.56.
Наименование
направления
фундаментальных
исследований (по
Программе)
3
Экология организмов
и сообществ
Физиология и
биохимия растений,
фотосинтез,
взаимодействие
растений с другими
организмами
Структура и функции
биомолекул и
надмолекулярных
комплексов,
протеомика,
биокатализ
Биофизика,
радиобиология,
математические
модели в биологии,
биоинформатика
Биотехнология
Количество
программ
фундаментальных
исследований СО
РАН
Общее
Законч
количест енные
во
Проекты в рамках
фундаментальных
программ Президиума
РАН
Общее
Закончен
количество ные
Разделы финансирования
Проекты в рамках
Проекты в рамках
фундаментальных
базового
программ отделений
финансирования
РАН
Общее
Закончен Общее
Законч
количество ные
количество енные
Проекты в рамках
интеграционных
программ СО
РАН
Общее
Законч
количест енные
во
4
8
5
-
6
3
7
-
8
-
9
-
10
1
11
-
12
4
13
-
1
-
-
-
-
-
1
-
-
-
3
-
1
-
-
-
1
-
1
-
2
-
-
-
-
-
1
-
1
-
4
-
1
-
-
-
2
-
1
-
63
Номер направления*
Отделение РАН
Табл. 4
Исследования, проводимые в 2013 году ИБФ СО РАН по научным направлениям Программы фундаментальных научных исследований
государственных академий наук на 2013-2020 годы за счет внебюджетных источников
Наименование направления
фундаментальных
исследований (по
Программе)
Количество
программ
фундаментальн
ых
исследований
СО РАН
Общее Законч
количе енные
ство
Внебюджетные источники
Государственны Контракты с
е контракты
российскими
заказчиками
Гранты РФФИ и
РГНФ
Зарубежные
гранты
Общее
количе
ство
Законч
енные
Общее
количе
ство
Законч
енные
Общее
количе
ство
Законч
енные
Общее
количе
ство
Законч
енные
12
13
1
Биологич
еских
наук
Биологич
еских
наук
2
VI.51.
3
Экология организмов и
сообществ
4
7
5
-
6
13
7
4
8
-
9
-
10
-
11
-
VI.56.
-
-
-
-
1
1
-
Биологич
еских
наук
VI.57.
2
-
5
2
-
-
Биологич
еских
наук
Биологич
еских
наук
VI.61.
Физиология и биохимия
растений, фотосинтез,
взаимодействие растений с
другими организмами
Структура и функции
биомолекул и
надмолекулярных
комплексов, протеомика,
биокатализ
Биофизика, радиобиология,
математические модели в
биологии, биоинформатика
Биотехнология
1
-
3
1
-
2
-
-
-
-
VI.62.
64
Международные
проекты и
соглашения с
зарубежными
партнерами
Общее Законч
количе енные
ство
14
2
15
1
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
6
5
-
-
Приложение 2
1 Подано заявок в РФ*
2 Получено положительных решений по
заявкам на выдачу охранных документов РФ*
или свидетельств о регистрации
3 Получено охранных документов
(свидетельств о регистрации) в РФ**, в том
числе в рамках выполнения НИОКР по
государственным контрактам
4 Прекращено поддержание охранных
документов в силе в РФ**
5 Количество охранных документов,
действующих в РФ**
6 Подано заявок за рубежом
- в том числе в странах СНГ
7 Получено охранных документов за рубежом
- в том числе в странах СНГ
8 Прекращено поддержание охранных
документов в силе за рубежом
- в том числе в странах СНГ
9 Количество охранных документов,
действующих за рубежом
- в том числе в странах СНГ
10 Продано лицензий в РФ***
11 Продано лицензий за границу***
- в том числе в страны СНГ***
12 Заключено договоров об отчуждении
исключительного права***
13 Численность патентной службы***
65
1
4
15
2
Базы данных
Топологии
интеграль-ных
микросхем
Ноу-хау
Программы для
ЭВМ
Товарные знаки
Промышленные
образцы
Селекционные
достижения
Полезные модели
Показатели
Изобретения
№ п/п
СВЕДЕНИЯ
о создании, правовой охране и реализации
объектов интеллектуальной собственности в 2013 г.
в Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биофизики СО РАН
Табл. 1
Объекты интеллектуальной
собственности
Табл. 2
Сведения о патентном подразделении
Название патентной
службы
Фамилия, имя, отчество
руководителя
Телефон
Электронная почта
Фамилия, имя, отчество
Телефон
Электронная почта
Фамилия, имя, отчество
Телефон
Электронная почта
Фамилия, имя, отчество
Телефон
Электронная почта
Фамилия, имя, отчество
Телефон
Электронная почта
Сотрудники:
Ермолаева Ксения Сергеевна
(391)249-42-69
Инженер
Ермолаева К.С.
(подпись)
66
Авторские свидетельства, патенты
Волова Т.Г. Способ получения сополимера 3-гидроскимасляной-4-гидроксимасляной
кислоты // Патент РФ № 2484140. Опубликовано 10.06.2013, Бюлл. № 16. – 7 с.
Волова Т.Г., Шишацкая Е.И. Долговременное гербицидное средство для грунтового
применения // Положительное решение от 08 мая 2013 г. о выдаче патента РФ на изобретение
по заявке № 2012116166.
Гладышев М.И., Кучкина А.Ю., Сущик Н.Н. Способ получения биодизельного топлива
из илов водоемов и/или осадков канализационных очистных сооружений // Патент РФ №
2487920: МПК C10G 3/00, C10L 5/40, C11C 3/04, C02F 1/00. Заявитель и патентообладатель
Сибирский федеральный университет, Институт биофизики СО РАН. - № 2011147907/04 заявл.
24.11.2011. Опубликовано 20.07.2013, Бюлл. № 20. - 7 с.
Франк Л.А., Красицкая В.В. Кудрявцев А.Н., Высоцкий Е.С. Способ одновременного
определения двух аналитов биолюминесцентным молекулярным микроанализом // Патент РФ
№ 2497128 от 10. 06 2013.
Маркова С.В., Буракова Л.П., Высоцкий Е.С. Укороченная мутантная люцифераза из
Metridia longa для применения в качестве биолюминесцентного репортера в живых клетках //
Патент РФ № 2012122098 от 20.10.2013 г.
67
Сведения о результатах научно-технической деятельности, созданных при выполнении научно-исследовательских, опытно-конструкторских
и технологических работ гражданского назначения по государственным контрактам и грантам в 2012 г.
Табл. 3
№ Организация- Наименование
п/п исполнитель результата
научнотехнической
деятельности
(РНТД)
1
-
2
-
3
-
Регистрационный
номер объекта
интеллектуальной
собственности –
РНТД
(номер, который
присваивается
при подаче
заявки в
Роспатент) и дата
подачи заявки в
Роспатент
4
-
Форма
охраны,
полученных
РНТД
Наименование
научноисследовательской,
опытноконструкторской и
технологической
работы
гражданского
назначения, в
рамках которой
получен РНТД
5
-
Регистр.
номер гос.
контракта/
гранта
6
-
7
-
Директор ИБФ СО РАН
Академик РАН
Дата
регистрации
контракта/гранта
и срок действия
Объем
прав
Российской
Федерации
на РНТД
8
-
9
-
А.Г. Дегерменджи
68
Объем прав
юридических
(физических)
лиц на РНТД
10
-
Приложение 3.
Форма 1
Сведения о деятельности коммерческих и других организаций,
в число учредителей которых входят институты или научные центры СО РАН
Название организации с
указанием
организационно№№
правовой формы,
п/п
дата учреждения.
Выделить созданные по
217 – ФЗ.
1
-
Учредители
(указать всех
учредителей, включая
физических лиц),
процентная доля
участия учредителей
2
Директор ИБФ СО РАН
Ученый секретарь ИБФ СО РАН
3
-
Почтовый адрес
организации,
ф.и.о. и телефон
руководителя
4
-
Числен-ность
(чел.)
штатная /
внештатная
Продукция
(специализация)
5
-
6
-
Взаимоотношения между
организацией и
институтом-учредителем
(аренда производственных
площадей, аренда
производственных
мощностей, привлечение к
работе сотрудников
института и др.)
7
-
_____________ А.Г. Дегерменджи
_____________ Е.С. Задереев
Форма 2
Сведения о коммерческих и других организациях, работающих на базе научно-технического задела институтов СО РАН
Форма участия института
Название организации с
Почтовый адрес
(лицензионное соглашение,
указанием
Институт-разработчик с
№№
организации,
Продукция
передача ноу-хау, совместное
организационно-правовой
указанием названия
п/п
ф.и.о. и телефон
(специализация)
производство и другие
формы,
разработки
руководителя
оформленные договором
дата учреждения
отношения)
1
2
3
4
5
6
Директор ИБФ СО РАН
Ученый секретарь ИБФ СО РАН
_____________ А.Г. Дегерменджи
_____________ Е.С. Задереев
69
Приложение 4.
Форма рекламного описания технологии, продукции или услуги
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
8.
9.
10.
Заголовок
Характеристика
Иллюстрация и подпись к иллюстрации
Технико-экономические преимущества
Области применения
Уровень практической реализации
Патентная защита
Коммерческие предложения
Ориентировочная стоимость
Контактная информация
Составитель:
___________________________________________________________________
(должность, фамилия, имя, отчество,
___________________________________________________________________
тел., эл. почта)
____________________________
(подпись)
Директор ИБФ СО РАН
_____________ А.Г. Дегерменджи
70
Приложение 5.
Отчет Института биофизики СО РАН о выполненных НИОКР в рамках федеральных целевых, ведомственных
и региональных программ (проектов) в 2013 году
№№
п/п
1
1
1.1.
1.1.1.
…
№№
ФЦП
(согласно
перечню
ФЦП *)
ФЕДЕРАЛЬНЫЕ ЦЕЛЕВЫЕ ПРОГРАММЫ
Наименование программы, подпрограммы, проекта
Заказчик
Головной
(дата, № утверждающего документа, срок действия)
исполнитель
2
3
4
Объем работ
(тыс. руб.)
Примечание
5
6
7
Головной
исполнитель
Объем работ
(тыс. руб.)
Примечание
4
5
6
Программа
Подпрограмма
Проект
Итого по Программе
№№
п/п
1
1
1.1..
…
ВЕДОМСТВЕННЫЕ ПРОГРАММЫ
Наименование программы, подпрограммы, проекта
Заказчик
(дата, № утверждающего документа, срок действия)
2
3
Программа
Проект
Итого по Программе
71
№№
п/п
1
1
1.1...
…
РЕГИОНАЛЬНЫЕ ПРОГРАММЫ
Наименование программы, подпрограммы, проекта
Заказчик
(дата, № утверждающего документа, срок действия)
2
3
Головной
исполнитель
Объем работ
(тыс. руб.)
Примечание
4
5
6
Программа
Проект
Итого по Программе
Директор ИБФ СО РАН
Ученый секретарь ИБФ СО РАН
_____________ А.Г. Дегерменджи
_____________ Е.С. Задереев
72