Воробьев - Центр &quot

Фото
Воробьев Иван Иванович, к.х.н.
Заведующий лабораторией биоинженерии клеток млекопитающих
центра «Биоинженерия» РАН
Область интересов: Биоаналоги, рекомбинантные факторы
свертываемости крови, каталитические антитела, конъюгаты белков
с полисиаловыми кислотами
Контакты:
+7(916)6521478
[email protected]
Профессиональная деятельность:
август 2012 – наст. вр.
Заведующий лабораторией биоинженерии клеток млекопитающих центра
«Биоинженерия» РАН
сентябрь 2013 – наст. вр Доцент факультета фундаментальной медицины МГУ им. М.В.Ломоносова,
совместитель, Курс «Биофармацевтика».
1998 – наст. вр.
н.с. ИБХ РАН, лаб. биокатализа, совместитель
2007 – январь 2012
н.с. лаб. медицинской биотехнологии Гематологического Научного центра
МЗСР, совместитель
1997 – 1998
зам. главного редактора журнала «InterNet», ЗАО “Нетскейт”
Образование:
22.03.2006
2003-2005
1995-1997
1992-1994
1990 – 1995
Кандидат химических наук по специальности биохимия
Тема кандидатской диссертации: “Подходы к получению протеолитических
антител”. Научный руководитель: чл.-корр. РАН А.Г. Габибов
Образовательная программа “Онкоиммунология – третье тысячелетие”,
группа углубленной подготовки
аспирант МГУ им. Ломоносова, химический факультет, кафедра химии
природных соединений.
Научный руководитель: проф. А.М. Копылов
студент МГУ им. Ломоносова
Высший колледж химико-физической молекулярной биологии
студент МГУ им. Ломоносова,
Химический факультет, Кафедра химии природных соединений
Тема дипломной работы: Молекулярный анализ мобильного элемента
Burdock в геноме D.melanogaster. Научный руководитель: д.б.н. Н.А.
Чуриков, ИМБ РАН
Избранные публикации
1. Orlova NA, Kovnir SV, Hodak JA, Vorobiev II, Gabibov AG, Skryabin KG. Improved elongation factor1alpha-based vectors for stable high-level expression of heterologous proteins in Chinese hamster ovary
cells.// BMC Biotechnol. 2014 Jun 14;14:56.
2. Orlova NA, Kovnir SV, Vorobiev II, Gabibov AG, Vorobiev AI. Blood Clotting Factor VIII: From Evolution
to Therapy. // Acta Naturae. 2013 Apr;5(2):19-39.
3. Vorobiev I, Matskevich V, Kovnir S, Orlova N, Knorre V, Jain S, Genkin D, Gabibov A, Miroshnikov A.
Chemical polysialylation: Design of conjugated human oxyntomodulin with a prolonged anorexic effect in
vivo.// Biochimie. 2013 Feb;95(2):264-70. Epub 2012 Sep 27.
4. Orlova NA, Orlov AV, Vorobiev II. A modular assembly cloning technique (aided by the BIOF software
tool) for seamless and error-free assembly of long DNA fragments. // BMC Research Notes 2012, 5:303.
1
5. Orlova NA, Kovnir SV, Vorobiev II, Yuriev AS, Gabibov AG, Vorobiev AI. Stable Expression of
Recombinant Factor VIII in CHO Cells Using Methotrexate-Driven Transgene Amplification. // Acta
Naturae VOL. 4 № 1 (12) 2012. pp. 93-101
6. Orlova NA, Kovnir SV, Vorobiev II, Gabibov AG. Coagulation Factor IX for Hemophilia B Therapy.//
Acta Naturae 2012 VOL 4, № 2(13) pp.62-75
7. Orlova NA.&Vorobiev II. Human DNAseI production by the bacterial expression system. // International
J. Biotechnol & Biosci. ISSN-2231-0304, 2011. Vol 1 No 2 pp 154-163.
8. Matskevich VA, Orlova NA, Vorobiev II, Yuriev AS, Vorobiev AI. The use of molecular in silico docking
for selection of new optimal affinity ligand for purification of recombinant blood coagulation factor VIII.//
Mathematical Biology and Bioinformatics 2011.vol 6.№ 1.pp.14-22.
9. Durova OM, Vorobiev II, Smirnov IV, Reshetnyak AV, Telegin GB, Shamborant OG, Orlova NA, Genkin
DD, Bacon A, Ponomarenko NA, Friboulet A, Gabibov AG. Strategies for induction of catalytic antibodies
toward HIV-1 glycoprotein gp120 in autoimmune prone mice. // Mol Immunol. 2009 Nov; 47(1):87-95.
10. Smirnov I.V., Vorobiev I.I., Knorre V.D., Gabibov A.G., Ponomarenko N.A., Friboulet A., Avalle B.,
Thomas D. The antiidiotypic approach to obtaining a proteolytic antibody. Dokl Biochem Biophys. 2008
May-Jun;420:105-7.
11. Bobik TV, Vorob'ev II, Ponomarenko NA, Gabibov AG, Miroshnikov AI. [Expression of human serum
albumin in metylotrophic yeast Pichia pastoris and its structural and functional analysis], Bioorg Khim.
2008 Jan-Feb;34(1):56-62. English version: pp 49-55.
12. Ponomarenko NA, Pillet D, Paon M, Vorobiev II, Smirnov IV, Adenier H, Avalle B, Kolesnikov AV, Kozyr
AV, Thomas D, Gabibov AG, Friboulet A. Anti-idiotypic antibody mimics proteolytic function of parent
antigen. Biochemistry. 2007 Dec 18;46(50):14598-609.
13. N. A. Ponomarenko, O. M. Durova, I.I. Vorobiev, A. A. Belogurov, A. G. Petrenko, G. B. Telegin, S. V.
Suchkov, V. K. Misikov, S. L. Kiselev, M. A. Lagarkova, V. M. Govorun, M. V. Serebryakova, B. Avalle,
P. Tornatore, A. Karavanov, H. C. Morse III, D. Thomas, A. Friboulet, A. G. Gabibov. Autoantibodies to
myelin basic protein catalyze site-specific degradation of their antigen. Proc Natl Acad Sci. USA. 2006 Jan
10;103(2):281-6. Epub 2005 Dec 30.
14. N.A. Ponomarenko, I.I. Vorobiev, E.S. Alexandrova, A.V. Reshetnyak, G.B. Telegin, S.V. Khaidukov, B.
Avalle, A. Karavanov, H.C.III Morse, D. Thomas, A. Friboulet, A.G. Gabibov. Induction of a ProteinTargeted Catalytic Response in Autoimmune Prone Mice: Antibody-Mediated Cleavage of HIV-1
Glycoprotein GP120. Biochemistry. 2006. Jan 10;45(1):324-330.
15. N.A. Ponomarenko, O.M. Durova, I.I. Vorobiev, A.A. Belogurov, G.B. Telegin, S.V. Suchkov, V.K.
Misikov, H.C. 3rd Morse, A.G. Gabibov. Catalytic activity of autoantibodies toward myelin basic protein
correlates with the scores on the multiple sclerosis expanded disability status scale. Immunol Lett. 2006
Feb 28;103(1):45-50. Epub 2005 Nov 4.
16. Ponomarenko NA, Durova OM, Vorobiev II, Aleksandrova ES, Telegin GB, Chamborant OG, Sidorik LL,
Suchkov SV, Alekberova ZS, Gnuchev NV, Gabibov AG. Catalytic antibodies in clinical and experimental
pathology: human and mouse models. J Immunol Methods. 2002 Nov 1;269(1-2):197-211.
17. Pillet D, Paon M, Vorobiev II, Gabibov AG, Thomas D, Friboulet A. Idiotypic network mimicry and
antibody catalysis: lessons for the elicitation of efficient anti-idiotypic protease antibodies. J Immunol
Methods. 2002 Nov 1;269(1-2):5-12.
18. Gabibov A.G., Ponomarenko N.A., Vorobiev I.I., Alexandrova E.S., Reshetnyak A.V., Grigorieva O.V.,
Friboulet A., Thomas D., Pillet D., Paon M., Demin A.V., Gnuchev N.V., Telegin G.B., Malishkin K.A.,
Genkin D.D. Antibody proteases: Induction of catalytic response. Biochemistry (Moscow). 2002. Т. 67. №
10. С. 1168-1179..
19. Vorobiev I.I., Ponomarenko N.A., Alexandrova E.S., Murashev A.N., Demin A.V., Shuster A.M.,
Martyanov V.A., Kostromina T.I., Bairamashvili D.I., Gabibov A.G., Miroshnikov A.I. Highly effective
process of human growth hormone production. // Biotechnology (Moscow).-2005.-№5.-P.44-48
Патенты
1. Орлова Н.А., Ковнир С.В., Воробьев И.И. Экспрессионный плазмидный вектор для
гетерологичной экспрессии рекомбинантных белков, высокочастотной интеграции и усиленной
амплификации экспрессионной кассеты в клетках млекопитающих, бицистронная мРНК, способ
получения стабильных линий продуцентов рекомбинантных белков с использованием указанного
2
2.
3.
4.
5.
6.
7.
8.
9.
10.
11.
12.
13.
вектора, способ получения рекомбинантных белков. Патент РФ 2488633. Приоритет от
16.11.2011
Орлова Н.А., Ковнир С.В., Воробьев И.И., Юрьев А.С., Воробьев А.И. Экспрессионная
генетическая
конструкция
рOptivec/F8BDD,
кодирующая
рекомбинантный
фактор
свертываемости крови VIII человека с делецией В домена и клеточная линия DG OV F8BDD 18,
продуцирующая рекомбинантный фактор свертываемости крови VIII человека с делецией В
домена. // Патент РФ № 2429294. Приоритет от 23.10.2009
Пономаренко Н.А., Шамборант О.Г., Сурина Е.А., Смирнов И.В., Мирошников А.И., Воробьев
И.И., Шустер А. М., Мартьянов В.А. Способ очистки рекомбинантного фактора VIIa человека //
Патент РФ № 2429008. Приоритет от 22.09.2010.
Орлова Н.А., Воробьев И.И., Звягин И.В., Шендер В.О. Нетранскрибируемый плазмидный вектор
pBL-T для клонирования сложных геномных последовательностей и многомодульной сборки
генно-инженерных конструкций (варианты), и набор, содержащий указанный вектор // Патент
РФ № 2507266, Приоритет от 16.11.2011
Орлова Н.А., Воробьев И.И. Экспрессионная плазмида, содержащая фрагмент ДНК, кодирующий
белок-предшественник дезоксирибонуклеазы I человека, бактерия E. coli - продуцент белкапредшественника дезоксирибонуклеазы I человека, Способ получения рекомбинантной
дезоксирибонуклазы I человека и Способ получения конъюгатов полиэтиленгликоля и
рекомбинантной дезоксирибонуклазы I человека. // Патент РФ № 2502803, Приоритет от
20.05.2011
Воробьев И.И., Орлова Н.А., Колядко В.Н. Слитый белок тиоредоксина и домена 4 инфестина,
способ его получения, экспрессионная плазмидная ДНК, кодирующая слитый белок, и бактерия
рода Escherichia coli, трансформированная такой плазмидной ДНК. // Патент РФ № 2528251,
Приоритет от 07.12.2012
Орлова Н.А., Воробьев И.И. Усакин Л.А., Шендер В.О. Плазмидный вектор рHYP с повышенной
сегрегационной стабильностью для экспрессии рекомбинантного белка, бактерия – продуцент
предшественника рекомбинантного белка и способ получения рекомбинантного белка.// Патент
РФ № 2496877, Приоритет от 15.12.2011
Орлова Н.А., Воробьев И.И., Мацкевич В.А., Звягин И.В.Экспрессионная плазмида, содержащая
фрагмент ДНК, кодирующий мутеин [C112S] лёгкой цепи энтерокиназы человека, бактерия E. coli
- продуцент белка-предшественника мутеина [C112S] лёгкой цепи энтерокиназы человека, способ
получения рекомбинантного мутеина [C112S] лёгкой цепи энтерокиназы человека,
рекомбинантный мутеин [C112S] лёгкой цепи энтерокиназы человека.// Патент РФ № 2495934,
Приоритет от 30.05.2011
Орлова Н.А., Воробьев И.И. Плазмида для экспрессии в клетках бактерии рода Escherichia
предшественника рекомбинантного фрагмента тканевого активатора плазминогена (ТАП)
человека (Ретеплазы), бактерия, принадлежащая к роду Escherichia, - продуцент предшественника
рекомбинантного фрагмента ТАП человека (Ретеплазы) или [-1]метионил-фрагмент ТАП
человека (Ретеплазы), предшественник рекомбинантного фрагмента ТАП человека (Ретеплазы),
способ получения предшественника рекомбинантного фрагмента ТАП человека (Ретеплазы) //
Патент РФ № 2495933, Приоритет от 30.05.2011
Орлова Н.А., Воробьев И.И. Экспрессионная плазмидная ДНК p6E-tTF, кодирующая
внеклеточный и трансмембранный домены тканевого фактора человека и штамм E.coli
BL21[DE3]/p6E-tTF – продуцент рекомбинантного тканевого фактора человека // Патент РФ №
2426780. Приоритет от 05.11.2008
Мирошников А. И., Воробьев И.И., Пономаренко Н.А., Смирнов И.В. Рекомбинантная
плазмидная ДНК PET32M/MTRX-RHIL-11, кодирующая интерлейкин-11 человека, способ ее
получения и штамм Escherichia Coli BL21(DE3)/PET32M/MTRX-RHIL-11 – продуцент
рекомбинантного интерлейкина-11 человека // Патент РФ № 2426787. Приоритет от 18.06.2009
Орлова Н.А., Ковнир С.В., Воробьев И.И. Экспрессионная плазмидная ДНК pCID-PROC,
кодирующая протеин С человека, и клеточная линия DG-CID-PROC-1, продуцирующая
рекомбинантный протеин С человека. Патент РФ 2469093. Приоритет от 19.12.2008
Орлова Н.А., Ковнир С.В., Воробьев И.И. Штамм гибридных культивируемых клеток мыши
Sp2/0Ag14-SpBcG/APC-15/A3 - продуцент моноклональных антител, специфичных к протеину С
3
человека, моноклональное антитело, специфичное к протеину С человека и иммуносорбент для
сорбции протеина С человека, содержащий моноклональное антитело. Патент РФ 2455360
приоритет от 15.02.2011.
14. Орлова Н.А., Ковнир С.В., Воробьев И.И. Штамм гибридных культивируемых клеток Mus
musculus – продуцент моноклональных антител, специфичных к протеину С человека
(варианты)// Патент РФ 2445365 приоритет от 03.11.2010
15. Воробьев И.И., Пономаренко Н.А., Мирошников А.И., Смирнов И.В. Способ очистки
рекомбинантного интерферона β-1b // Патент РФ 2392282. Бюл. "Изобретения. Полезные
модели", № 17, 2010
16. Воробьев А. И., Мирошников А. И., Габибов А.Г., Воробьев И.И., Пономаренко Н.А.,
Шамборант О. Г., Шустер А.М., Мартьянов В.А. Рекомбинантная плазмидная ДНК, кодирующая
последовательность белка фактора VII человека, линия клеток ВНК/F7, трансформированная
плазмидной ДНК.// Патент РФ 2337965. Приоритет 2006.07.08.
17. Воробьев А. И., Мирошников А. И., Габибов А. Г., Воробьев И. И., Костромина Т. И.,
Пономаренко Н. А., Бобик Т. В., Ажигирова М. А., Карякин А. В., Коротаев Г. К., Препарат
рекомбинантного человеческого сывороточного альбумина и способ его получения.// Патент
РФ 2337966 Приоритет 2006.07.08.
18. Габибов А.Г., Пономаренко Н.А., Воробьев И.И., Демин А.В., Мартьянов В.А., Шустер А.М.,
Байрамашвили Д.И., Мирошников А.И. Рекомбинантная плазмидная ДНК pES6-1, кодирующая
полипептид интерферон бета-1b человека, и штамм Escherichia coli BDEES6 - продуцент
рекомбинантного интерферона бета-1b человека. // Патент РФ 2261913. Приоритет 2005.10.10
19. Габибов А.Г., Пономаренко Н.А., Воробьев И.И., Демин А.В., Мартьянов В.А., Шустер А.М.,
Байрамашвили Д.И., Мирошников А.И. Рекомбинантная плазмидная ДНК PES3-7, кодирующая
полипептид с последовательностью гранулоцитарного колониестимулирующего фактора
человека, и штамм Escherichia Coli BL21(DE3)/PES3-7 - продуцент рекомбинантного
гранулоцитарного колониестимулирующего фактора человека. // Патент РФ 2260049.
Приоритет 2005.09.10
20. Габибов А.Г., Пономаренко Н.А., Воробьев И.И., Демин А.В., Мартьянов В.А., Шустер А.М.,
Байрамашвили Д.И., Мирошников А.И. Рекомбинантная плазмидная ДНК PES4-4, кодирующая
полипептид интерферон альфа-2B человека, и штамм Escherichia Coli BDEES4 - продуцент
рекомбинантного интерферона альфа-2B человека. // Патент РФ 2258081. Приоритет 2005.08.10
21. Габибов А.Г., Пономаренко Н.А., Воробьев И.И., Демин А.В., Мартьянов В.А., Шустер А.М.,
Байрамашвили Д.И., Мирошников А.И. Рекомбинантная плазмидная ДНК pES1-6, кодирующая
полипептид соматотропин и штамм Escherichia coli BL21(DE3)/pES1-6 – продуцент
рекомбинантного соматотропина. // Патент РФ 2233879. Приоритет 2004-08-10.
22. A.G. Gabibov, A.V. Kolesnikov, N.A. Ponomarenko, E.S. Alexandrova, I.I. Vorobiev, A.V. Demin.
Method for Producing Catalytic Antibodies (Variants), Antigens for Immunization and Nucleotide
Sequence. 2002. // Patent application WO 2002/086058.
Утвержденные производственные регламенты
Шендер В.О., Назарова Т.Л., Воробьев И.И., Орлова Н.А., Голубев Е.А., Дьякова М.В., Юрьев А.С.
Производство препарата “Неоваскулген” (активное вещество – сверхскрученная плазмидная ДНК
pCMV-VEGF165)//Опытно-промышленный регламент ОПР 01897529-06-10.
Участие в разработке зарегистрированных лекарственных средств:
Название
Гормон
человека
Производитель Функции
роста ЗАО Генериум
Штамм-продуцент, процессы выделения и очистки, включая
рефолдинг и ферментативный процессинг предшественника,
отдельные методы контроля качества
4
Г-КСФ
ИФН-бета
ЗАО Генериум
ЗАО Генериум
Фактор
ЗАО Генериум
свертывания крови
VIIa
Плазмида pCMV- ОАО ИСКЧ
VEGF165
(Неоваскулген)
Процессы выделения и очистки, включая рефолдинг
Процессы выделения и очистки, включая рефолдинг в
мицеллах
Часть процесса очистки
Штамм-продуцент, получение банков штамма-продуцента,
процессы ферментации, выделения и очистки, методы контроля
качества,
состав
готового
лекарственного
средства,
тестирование стабильности при хранении
5